MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Moorella thermoacetica ATCC 39073 chromosome

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007644	AAGGAA	2	12	302	313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007644	TAAATA	2	12	11181	11192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007644	GGCCCT	2	12	51476	51487	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007644	TCAATA	2	12	67731	67742	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_007644	CCCAGG	2	12	134003	134014	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007644	GGCCCA	2	12	134299	134310	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007644	CCGGCC	2	12	134654	134665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_007644	CGGAGC	2	12	150660	150671	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007644	CTTTTT	2	12	164885	164896	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_007644	TTTGCC	2	12	166266	166277	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007644	AGGTGA	2	12	168330	168341	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007644	CCCCTG	2	12	186314	186325	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_007644	AAGGAG	2	12	204102	204113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007644	ATTTCC	2	12	206849	206860	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007644	GTACCG	2	12	207846	207857	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007644	CGAAGC	2	12	216463	216474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007644	GCCACC	2	12	221035	221046	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_007644	ACAAAT	2	12	236166	236177	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_007644	CCGGGG	2	12	238732	238743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007644	CTGGAG	2	12	247160	247171	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_007644	GAAAAA	2	12	288367	288378	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007644	GAAAAA	2	12	305772	305783	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007644	GGAAAC	2	12	352586	352597	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_007644	CCCGGC	2	12	359651	359662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_007644	TAGCTG	2	12	375926	375937	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_007644	GGGAAG	2	12	393395	393406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007644	TTTTAC	2	12	394340	394351	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_007644	CTGCGT	2	12	415547	415558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007644	GGGAAG	2	12	426693	426704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007644	CCCTGG	2	12	475050	475061	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007644	ATTCGG	2	12	506808	506819	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_007644	TTTAAA	2	12	521316	521327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007644	ATATAA	2	12	570366	570377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007644	GTATCA	2	12	572263	572274	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_007644	CGTATC	2	12	582323	582334	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007644	TATTCA	2	12	693847	693858	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_007644	TATTGC	2	12	704638	704649	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_007644	CGGTGA	2	12	715847	715858	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007644	AGAGGT	2	12	733466	733477	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007644	CTTTTT	2	12	751106	751117	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_007644	TTAATT	2	12	768358	768369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007644	ATGAAA	2	12	787110	787121	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007644	TTCTTG	2	12	846164	846175	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_007644	ACCGGG	2	12	848482	848493	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007644	GTTTTG	2	12	905910	905921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007644	GGGCCG	2	12	930434	930445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007644	CCAGGG	2	12	959141	959152	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007644	TTGGAA	2	12	961514	961525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007644	CTATTA	2	12	961575	961586	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_007644	TACTAT	2	12	975574	975585	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_007644	TATTTT	2	12	987460	987471	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007644	CGAAGA	2	12	1044711	1044722	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_007644	TTCCAG	2	12	1045833	1045844	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007644	GCAGCG	2	12	1047149	1047160	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007644	GTTGCT	2	12	1062193	1062204	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_007644	GGACAG	2	12	1071716	1071727	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007644	ATTAAA	2	12	1160187	1160198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007644	TCAATG	2	12	1216026	1216037	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_007644	ATCCTG	2	12	1275220	1275231	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007644	AAAATA	2	12	1278456	1278467	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007644	GGAAAG	2	12	1308193	1308204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007644	GTAAAT	2	12	1325139	1325150	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007644	CCGGCA	2	12	1340134	1340145	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007644	CCTGGG	2	12	1392402	1392413	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007644	CGAAGC	2	12	1399650	1399661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007644	ATGCCA	2	12	1420794	1420805	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007644	TCCAGT	2	12	1442875	1442886	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007644	CTAAAA	2	12	1470571	1470582	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_007644	TAAAAA	2	12	1485443	1485454	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007644	GCCGGC	2	12	1486968	1486979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007644	GCCTTA	2	12	1487233	1487244	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007644	ATGAAA	2	12	1494035	1494046	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007644	TAAATC	2	12	1527051	1527062	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_007644	GTTAAA	2	12	1532560	1532571	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007644	GTTTTT	2	12	1551792	1551803	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007644	GCAAAG	2	12	1614813	1614824	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_007644	GGCTTC	2	12	1645943	1645954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007644	CTACCC	2	12	1651917	1651928	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_007644	GCCTTT	2	12	1656082	1656093	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007644	GTTGCT	2	12	1771419	1771430	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_007644	ATAGCC	2	12	1854412	1854423	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007644	TAAAAA	2	12	1854529	1854540	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007644	TTCCCC	2	12	1938681	1938692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_007644	TTTTTA	2	12	2032016	2032027	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007644	GCCCCC	2	12	2053948	2053959	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
86	NC_007644	GCCCCT	2	12	2058315	2058326	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_007644	CCGGCG	2	12	2062263	2062274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_007644	CAGGGC	2	12	2069866	2069877	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007644	ATTTTA	2	12	2087806	2087817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007644	CTTTGC	2	12	2089339	2089350	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007644	GCTTCG	2	12	2126423	2126434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007644	TTAAAT	2	12	2133158	2133169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007644	GACCTG	2	12	2172438	2172449	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007644	CCAATA	2	12	2182528	2182539	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007644	CGGGCC	2	12	2182806	2182817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_007644	TTAAAT	2	12	2197197	2197208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007644	CGGTCC	2	12	2241170	2241181	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007644	GGACGG	2	12	2242415	2242426	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_007644	CCGAAA	2	12	2245317	2245328	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007644	CACGTC	2	12	2248111	2248122	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_007644	CCGGAC	2	12	2299005	2299016	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007644	GGAAAA	2	12	2309284	2309295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007644	TTATTT	2	12	2317461	2317472	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007644	TACGCT	2	12	2323105	2323116	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007644	ATGTTT	2	12	2367369	2367380	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007644	ATGATA	2	12	2367558	2367569	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007644	TTATTT	2	12	2370066	2370077	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007644	AGCCGC	2	12	2403851	2403862	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007644	TCCTGC	2	12	2406357	2406368	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007644	TTTACC	2	12	2410443	2410454	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007644	AAATAA	2	12	2458196	2458207	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007644	TCCTTT	2	12	2458275	2458286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007644	TTCCCG	2	12	2472510	2472521	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007644	TTTTTA	2	12	2532691	2532702	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007644	CCACCG	2	12	2534129	2534140	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_007644	TCCTGT	2	12	2548352	2548363	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007644	GAGAAA	2	12	2582878	2582889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007644	CTTTTC	2	12	2592082	2592093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.