MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 7448 chromosome

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007332	AAACA	2	10	151	160	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007332	ATATA	2	10	1715	1724	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007332	AATAA	2	10	9095	9104	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007332	TATAA	2	10	17060	17069	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007332	AAAAT	2	10	18419	18428	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007332	AATTA	2	10	21218	21227	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007332	AATTA	2	10	23582	23591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007332	TAAAT	2	10	26889	26898	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007332	TTTTG	2	10	37842	37851	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007332	TAAAT	2	10	45021	45030	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007332	TAATT	2	10	66328	66337	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007332	TTGTT	2	10	82673	82682	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007332	TAAAA	2	10	87378	87387	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007332	ACTTG	2	10	87517	87526	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007332	AATTA	2	10	96538	96547	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007332	TTTAT	2	10	99785	99794	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007332	TTTAA	2	10	101303	101312	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007332	TTTTA	2	10	102968	102977	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007332	TAAAA	2	10	103013	103022	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007332	TATAA	2	10	106704	106713	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007332	TTAAA	2	10	110493	110502	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007332	TTTAA	2	10	110521	110530	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007332	AATTT	2	10	111106	111115	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007332	ATAAA	2	10	122685	122694	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007332	AGGTA	2	10	125250	125259	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007332	TAAAA	2	10	126273	126282	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007332	TTTAA	2	10	136922	136931	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007332	GATTT	2	10	137757	137766	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007332	ATTTA	2	10	138184	138193	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007332	AAATA	2	10	154309	154318	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007332	TTAAA	2	10	163434	163443	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007332	TAATT	2	10	163546	163555	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007332	AATTT	2	10	165577	165586	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007332	AATTT	2	10	166926	166935	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007332	ATATT	2	10	167051	167060	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007332	GTGTT	2	10	173575	173584	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007332	TTGTT	2	10	184549	184558	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007332	AAATT	2	10	189379	189388	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007332	TTAAT	2	10	194775	194784	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007332	TTTAT	2	10	195148	195157	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007332	ATAAA	2	10	195169	195178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007332	TTTGT	2	10	200736	200745	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007332	ATGAA	2	10	201622	201631	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007332	TTTTA	2	10	201673	201682	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007332	TAAAA	2	10	205122	205131	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007332	AAATT	2	10	209343	209352	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007332	ATTAT	2	10	221902	221911	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007332	TATTT	2	10	234010	234019	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007332	TTATT	2	10	241688	241697	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007332	ATTAA	2	10	260312	260321	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007332	ATATT	2	10	266028	266037	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007332	AAAAT	2	10	266243	266252	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007332	CATAT	2	10	268906	268915	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007332	AATCA	2	10	278150	278159	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_007332	CAAGA	2	10	278217	278226	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_007332	AGCGG	2	10	285482	285491	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_007332	ATTTT	2	10	294347	294356	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007332	ATTTT	2	10	294445	294454	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007332	AAAGA	2	10	304233	304242	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007332	TAATT	2	10	304330	304339	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007332	ATAAA	2	10	324312	324321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007332	CAAAG	2	10	325519	325528	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_007332	TAAAA	2	10	335418	335427	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007332	TTTAA	2	10	339768	339777	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007332	ATTTA	2	10	346126	346135	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007332	ACTTA	2	10	349024	349033	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_007332	ATTTT	2	10	350745	350754	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007332	AAAAT	2	10	352896	352905	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007332	TCAAA	2	10	354662	354671	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_007332	ATTGT	2	10	354678	354687	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007332	TAATT	2	10	362028	362037	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007332	TAACT	2	10	364544	364553	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_007332	GCTTT	2	10	366852	366861	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_007332	ACCAA	2	10	373058	373067	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_007332	TATTT	2	10	388325	388334	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007332	AAAAT	2	10	389816	389825	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007332	TACTA	2	10	392886	392895	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_007332	AAATT	2	10	392978	392987	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007332	AAGTA	2	10	403867	403876	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007332	TTAAT	2	10	406221	406230	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007332	TTAAA	2	10	408073	408082	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007332	AAAAT	2	10	411992	412001	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007332	TAATT	2	10	414230	414239	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007332	GTAAT	2	10	416302	416311	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007332	TTTAA	2	10	420883	420892	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007332	TTCTT	2	10	420912	420921	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_007332	AAATT	2	10	420926	420935	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007332	AAACT	2	10	421025	421034	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_007332	TATAA	2	10	421056	421065	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007332	TTTTC	2	10	421389	421398	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_007332	TTTGG	2	10	421503	421512	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007332	ATTAT	2	10	426628	426637	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007332	TAAAT	2	10	426640	426649	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007332	TTTCT	2	10	429313	429322	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_007332	TAATT	2	10	429391	429400	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007332	TTAAT	2	10	430158	430167	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007332	ATTTT	2	10	432319	432328	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007332	AGAAA	2	10	433044	433053	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007332	TTAAA	2	10	444547	444556	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007332	TAAAA	2	10	446175	446184	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007332	AAATT	2	10	446245	446254	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007332	AATTT	2	10	448081	448090	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007332	TAGTT	2	10	454597	454606	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007332	TTTAA	2	10	454687	454696	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007332	ATGAA	2	10	474491	474500	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007332	AATTT	2	10	477595	477604	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007332	TTAAA	2	10	487854	487863	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007332	TTAAT	2	10	487902	487911	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007332	ATTAT	2	10	487959	487968	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007332	TCAAA	2	10	488289	488298	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_007332	AAAAT	2	10	489497	489506	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007332	TAATC	2	10	490417	490426	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_007332	ATAAA	2	10	490455	490464	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007332	AATGA	2	10	490523	490532	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007332	ATTCT	2	10	490736	490745	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_007332	TATTT	2	10	492300	492309	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007332	TTATT	2	10	501522	501531	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007332	AAACA	2	10	503651	503660	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_007332	TTTTA	2	10	503690	503699	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007332	AAACA	2	10	509533	509542	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_007332	TATAA	2	10	517080	517089	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007332	ATTAA	2	10	517138	517147	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007332	TTTAA	2	10	517186	517195	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007332	TTGCT	2	10	527000	527009	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_007332	ATTTT	2	10	527208	527217	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007332	TAAAT	4	20	529254	529273	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007332	AAATA	2	10	538993	539002	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007332	TCAAA	2	10	559385	559394	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007332	ATTTT	2	10	559513	559522	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007332	AAAAT	2	10	568760	568769	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007332	AATTT	2	10	569003	569012	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007332	ATCTA	2	10	569875	569884	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_007332	AATTT	2	10	570038	570047	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007332	TTTGG	2	10	570133	570142	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007332	TTAAT	2	10	570777	570786	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007332	ATATT	2	10	572249	572258	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007332	AATAA	2	10	572932	572941	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007332	ATTAG	2	10	573026	573035	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007332	AACTA	2	10	573769	573778	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_007332	TTGAT	2	10	583371	583380	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007332	AATTT	2	10	584625	584634	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007332	TAAAT	2	10	587483	587492	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007332	ATGGT	2	10	588493	588502	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007332	ATTAT	2	10	589826	589835	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007332	ATTAC	2	10	598994	599003	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_007332	TAATT	2	10	605322	605331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007332	TATAA	2	10	607769	607778	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007332	TATAA	2	10	624244	624253	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007332	TTTTC	2	10	625387	625396	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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164	NC_007332	ATTTA	2	10	688937	688946	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_007332	ATAAA	2	10	689077	689086	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_007332	TAAAA	2	10	691473	691482	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_007332	ATATT	2	10	749994	750003	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_007332	ATATT	2	10	753930	753939	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_007332	TTGTT	2	10	757039	757048	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_007332	ATTAA	2	10	758645	758654	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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207	NC_007332	TATAA	2	10	874789	874798	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
208	NC_007332	ATTTA	2	10	886703	886712	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
209	NC_007332	TTTTA	2	10	894516	894525	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
210	NC_007332	TAACA	2	10	894531	894540	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
211	NC_007332	TTTTC	2	10	901115	901124	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
212	NC_007332	TGTTT	2	10	901802	901811	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
213	NC_007332	CACGA	2	10	902287	902296	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.