MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 7448 chromosome

Total Repeats: 411

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007332	TAAA	2	8	106	113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007332	TAAA	2	8	1697	1704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007332	TAAA	2	8	9134	9141	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007332	ATTT	2	8	9159	9166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007332	ATTT	2	8	17029	17036	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007332	ATAA	6	24	17066	17089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007332	ACCA	2	8	18730	18737	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007332	ATTA	2	8	32740	32747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007332	AAAT	2	8	32826	32833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007332	TAAG	2	8	36435	36442	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007332	ATTT	2	8	36508	36515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007332	AGTA	2	8	46206	46213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007332	AATA	2	8	66349	66356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007332	GGTG	2	8	72987	72994	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007332	ATCA	2	8	73299	73306	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007332	CTAA	2	8	73505	73512	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007332	CATA	2	8	77925	77932	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007332	ATTT	2	8	78054	78061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007332	AAAT	2	8	78246	78253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007332	AAAT	2	8	87316	87323	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007332	TTTA	2	8	87464	87471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007332	AGTT	2	8	87528	87535	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007332	TTAT	2	8	87584	87591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007332	CTTT	2	8	87766	87773	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007332	ATCA	2	8	89777	89784	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_007332	TATT	2	8	96435	96442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007332	AATT	2	8	96675	96682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007332	AATT	2	8	101439	101446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007332	ATTT	2	8	103069	103076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007332	ATAA	2	8	110423	110430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007332	ATTT	2	8	110546	110553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007332	CTAC	2	8	110702	110709	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007332	ATTT	2	8	116698	116705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007332	TTTA	2	8	116713	116720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007332	TAAA	2	8	122090	122097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007332	AAAG	2	8	122212	122219	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007332	AAAT	2	8	125216	125223	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007332	TTAA	2	8	125226	125233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007332	GTTT	2	8	125896	125903	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007332	ATTA	2	8	125950	125957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007332	CATC	2	8	126110	126117	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007332	TTAA	2	8	126223	126230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007332	GAAA	2	8	131803	131810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007332	AAAT	2	8	136849	136856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007332	TTAA	2	8	137816	137823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007332	TTTA	2	8	138428	138435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007332	AAAC	2	8	138551	138558	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007332	TGAT	2	8	138608	138615	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007332	CCAA	2	8	139168	139175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007332	AAAT	2	8	139176	139183	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007332	AATT	2	8	139578	139585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007332	TATT	2	8	140348	140355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007332	TTTA	2	8	140868	140875	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007332	CTTG	2	8	141105	141112	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_007332	ATAA	2	8	141219	141226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007332	AATT	2	8	141518	141525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007332	TTTA	2	8	141643	141650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007332	TAAA	2	8	142617	142624	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007332	ACAA	2	8	148853	148860	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007332	ATTA	2	8	150908	150915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007332	TAAT	2	8	152879	152886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007332	TAAT	2	8	152889	152896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007332	ATTT	2	8	154555	154562	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007332	TATG	2	8	154575	154582	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007332	TAAT	2	8	155990	155997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007332	TTAA	2	8	158151	158158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007332	ATAA	2	8	158210	158217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007332	TTAT	2	8	160678	160685	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007332	ATGT	2	8	161002	161009	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007332	TTAA	2	8	161056	161063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007332	AACA	2	8	161134	161141	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007332	TAAT	2	8	161183	161190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007332	ACAA	2	8	163503	163510	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007332	TAAA	2	8	165270	165277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007332	CTTT	2	8	165984	165991	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007332	TTTG	2	8	166974	166981	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007332	ATTA	2	8	168593	168600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007332	CTTT	2	8	170883	170890	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007332	TTAG	2	8	172391	172398	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007332	TAAT	2	8	172438	172445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007332	TAAT	2	8	173504	173511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007332	TTAA	2	8	176426	176433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007332	ATTA	2	8	185847	185854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007332	TAAT	2	8	194806	194813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007332	TTTA	2	8	195027	195034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007332	TAAA	2	8	195104	195111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007332	TTAA	2	8	195158	195165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007332	TGAA	2	8	200719	200726	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007332	TGAA	2	8	201956	201963	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007332	ATTT	2	8	207670	207677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007332	ATTT	2	8	217135	217142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007332	TTAT	3	12	220867	220878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007332	AAAT	2	8	221695	221702	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007332	TAAA	2	8	221839	221846	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007332	ATTT	2	8	221931	221938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007332	ATTT	2	8	241672	241679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007332	AAGA	2	8	241707	241714	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007332	GCAA	2	8	243011	243018	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_007332	TAAA	2	8	245410	245417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007332	ATTA	2	8	257069	257076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007332	AATT	2	8	257078	257085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007332	TAAA	2	8	259746	259753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007332	AAAT	2	8	259823	259830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007332	ATTT	2	8	259837	259844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007332	ATAA	2	8	259961	259968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007332	AATT	2	8	260055	260062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007332	TAAA	2	8	260087	260094	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007332	TTTA	2	8	260691	260698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007332	ATTT	2	8	262899	262906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007332	ATAA	2	8	264625	264632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007332	TAAT	2	8	264647	264654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007332	TGTT	2	8	265359	265366	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007332	TTGT	2	8	265589	265596	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007332	GTAA	2	8	265775	265782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007332	TTTC	2	8	266205	266212	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_007332	TATT	2	8	266365	266372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007332	AATT	2	8	266528	266535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007332	TAAT	2	8	266855	266862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007332	TAAT	2	8	266865	266872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007332	CAAG	2	8	277949	277956	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_007332	ATTA	2	8	281937	281944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007332	AATT	2	8	281946	281953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007332	ATTT	2	8	285382	285389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007332	TTTC	2	8	285408	285415	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_007332	GGAA	2	8	287491	287498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007332	CTAA	2	8	287549	287556	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_007332	CCTT	2	8	304138	304145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007332	TGAA	2	8	304395	304402	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007332	ATAA	2	8	307074	307081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007332	AATT	2	8	309930	309937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007332	TTAT	2	8	309938	309945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007332	ATTT	2	8	309952	309959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007332	ATTT	2	8	312177	312184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007332	TTAA	2	8	331768	331775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007332	TTAT	2	8	335124	335131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007332	AATT	3	12	335346	335357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007332	AAAT	2	8	339469	339476	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007332	TATT	2	8	339668	339675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007332	ATTA	2	8	339715	339722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007332	AATT	2	8	347003	347010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007332	AGGC	2	8	347050	347057	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_007332	CAAA	2	8	348972	348979	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_007332	ATTT	2	8	348992	348999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007332	ACAA	2	8	352937	352944	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_007332	TAAA	2	8	353136	353143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007332	TATT	2	8	353324	353331	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007332	TCAT	2	8	353506	353513	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_007332	AAAG	2	8	353823	353830	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007332	AATT	2	8	353876	353883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007332	TATT	2	8	353970	353977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_007332	TAAT	2	8	358172	358179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.