MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome

Total Repeats: 170

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007295	TA	4	8	17129	17136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007295	TA	3	6	17218	17223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007295	TA	3	6	20235	20240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007295	AG	3	6	66295	66300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007295	GT	3	6	82950	82955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007295	TA	3	6	82968	82973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007295	AT	3	6	89681	89686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007295	TA	3	6	96341	96346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007295	AC	3	6	103940	103945	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007295	AT	3	6	109652	109657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007295	AT	4	8	109774	109781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007295	TA	3	6	110082	110087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007295	AG	3	6	110156	110161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007295	AT	3	6	120619	120624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007295	TA	3	6	122084	122089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007295	TA	3	6	132909	132914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007295	TA	3	6	133411	133416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007295	GT	3	6	133815	133820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007295	TG	3	6	134717	134722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007295	AG	3	6	135348	135353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007295	TA	3	6	136413	136418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007295	TA	3	6	136492	136497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007295	AT	3	6	143421	143426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007295	AT	3	6	147023	147028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007295	AT	3	6	153840	153845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007295	AT	3	6	156211	156216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007295	TA	3	6	166126	166131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007295	TA	4	8	166302	166309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007295	TA	3	6	167532	167537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007295	TC	3	6	170211	170216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007295	AT	3	6	181844	181849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007295	TA	3	6	187352	187357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007295	AT	3	6	187711	187716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007295	TA	3	6	200265	200270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007295	AT	3	6	220799	220804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007295	TA	3	6	235768	235773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007295	TA	3	6	251195	251200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007295	AT	3	6	255241	255246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007295	AT	3	6	255262	255267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007295	TA	3	6	255539	255544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007295	CA	3	6	257364	257369	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007295	AT	3	6	273882	273887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007295	AT	3	6	280490	280495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007295	AG	3	6	290927	290932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007295	TA	3	6	298640	298645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007295	AG	3	6	319390	319395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007295	AC	3	6	322028	322033	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007295	TG	3	6	338187	338192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007295	AG	4	8	338618	338625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007295	CT	3	6	342332	342337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007295	AT	3	6	342426	342431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007295	AT	3	6	344800	344805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007295	AT	3	6	344821	344826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007295	AT	3	6	345629	345634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007295	TA	3	6	348652	348657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007295	TA	3	6	357082	357087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007295	TA	3	6	357106	357111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007295	TG	3	6	363293	363298	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007295	AT	3	6	363324	363329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007295	AT	3	6	372385	372390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007295	GA	11	22	372841	372862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007295	TG	3	6	373156	373161	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007295	AT	3	6	373225	373230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007295	AT	3	6	373396	373401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007295	TA	3	6	379175	379180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007295	AT	3	6	381724	381729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007295	TA	3	6	381965	381970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007295	TA	3	6	381989	381994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007295	AT	3	6	385162	385167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007295	AT	4	8	385284	385291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007295	TA	3	6	385580	385585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007295	TA	3	6	385639	385644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007295	TA	3	6	398893	398898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007295	AT	4	8	401480	401487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007295	TA	3	6	404982	404987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007295	TA	3	6	412758	412763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007295	TA	3	6	412771	412776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007295	TA	3	6	412785	412790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007295	TA	3	6	413683	413688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007295	TG	3	6	416165	416170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007295	AG	3	6	416468	416473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007295	TA	3	6	416623	416628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007295	GC	3	6	416631	416636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_007295	AT	3	6	417723	417728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007295	TA	3	6	417934	417939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007295	AT	3	6	418111	418116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007295	TA	3	6	434013	434018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007295	AT	3	6	471362	471367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007295	GA	4	8	471766	471773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007295	TA	3	6	472409	472414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007295	TA	16	32	477537	477568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007295	AT	3	6	479796	479801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007295	AT	3	6	485626	485631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007295	CA	3	6	487164	487169	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_007295	AT	3	6	487270	487275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007295	AT	3	6	487295	487300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007295	GA	23	46	487678	487723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007295	GA	3	6	488162	488167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007295	GA	3	6	488263	488268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007295	CG	3	6	488335	488340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_007295	TA	3	6	491998	492003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007295	TA	3	6	492325	492330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007295	AT	3	6	513756	513761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007295	AT	3	6	516377	516382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007295	AT	3	6	521890	521895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007295	TA	4	8	526892	526899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007295	TC	3	6	530623	530628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_007295	CA	3	6	530869	530874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007295	TA	3	6	539439	539444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007295	GA	20	40	582107	582146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007295	TA	3	6	600551	600556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007295	TA	3	6	600571	600576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007295	GA	3	6	600749	600754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007295	AG	3	6	624348	624353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007295	TA	3	6	647583	647588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007295	AT	3	6	648185	648190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007295	AT	3	6	655143	655148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007295	TA	3	6	658041	658046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007295	AT	3	6	667939	667944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007295	AT	3	6	704390	704395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007295	AG	3	6	704720	704725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007295	AT	3	6	707902	707907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007295	TA	3	6	709440	709445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007295	TA	3	6	709514	709519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007295	TA	3	6	719936	719941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007295	AT	3	6	725242	725247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007295	TA	3	6	727192	727197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007295	AT	3	6	728675	728680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007295	AT	3	6	728721	728726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007295	GT	3	6	728823	728828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007295	AT	3	6	731155	731160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007295	TA	3	6	733102	733107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007295	AT	3	6	734585	734590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007295	AT	3	6	734616	734621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007295	GT	3	6	734732	734737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007295	AT	3	6	755761	755766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007295	AT	3	6	758016	758021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007295	AT	3	6	758088	758093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007295	TA	3	6	761572	761577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007295	TA	3	6	764768	764773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007295	CG	3	6	775882	775887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007295	AT	3	6	783174	783179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007295	AT	3	6	800203	800208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007295	AT	3	6	810100	810105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007295	TA	3	6	816832	816837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007295	CA	5	10	817222	817231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_007295	AT	3	6	817288	817293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007295	TA	3	6	817389	817394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007295	TA	3	6	820963	820968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007295	AT	3	6	821437	821442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007295	GT	3	6	829313	829318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007295	AT	3	6	837770	837775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007295	AT	3	6	838223	838228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.