MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome

Total Repeats: 3943

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007295	AAAT	2	8	133860	133867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_007295	CAA	2	6	133890	133895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_007295	TAA	2	6	133902	133907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_007295	ATT	2	6	133909	133914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_007295	TTCC	2	8	133919	133926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
506	NC_007295	ATT	2	6	133985	133990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_007295	GAT	3	9	134016	134024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_007295	TAT	2	6	134040	134045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_007295	ATC	2	6	134077	134082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_007295	TTA	2	6	134087	134092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_007295	AGT	2	6	134104	134109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_007295	AGA	3	9	134110	134118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_007295	GTT	2	6	134123	134128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_007295	TCT	2	6	134183	134188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_007295	TAT	2	6	134205	134210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_007295	T	6	6	134236	134241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_007295	CTTGAT	2	12	134250	134261	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
518	NC_007295	AATT	2	8	134262	134269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_007295	TTA	2	6	134324	134329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_007295	TAA	2	6	134334	134339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_007295	TAT	2	6	134340	134345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_007295	A	6	6	134410	134415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_007295	TGACTT	2	12	134612	134623	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
524	NC_007295	CTT	2	6	134634	134639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_007295	TGT	2	6	134680	134685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_007295	T	6	6	134707	134712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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528	NC_007295	T	7	7	134729	134735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_007295	T	6	6	134739	134744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_007295	TAA	2	6	134838	134843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_007295	CTT	2	6	134861	134866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_007295	TATT	2	8	135031	135038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_007295	CAA	2	6	135056	135061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_007295	GAT	2	6	135078	135083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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539	NC_007295	CAA	2	6	135167	135172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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541	NC_007295	A	7	7	135243	135249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_007295	AAT	2	6	135341	135346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_007295	AG	3	6	135348	135353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_007295	ATC	2	6	135387	135392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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549	NC_007295	T	7	7	135573	135579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_007295	GCAA	2	8	135730	135737	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
551	NC_007295	CTTG	2	8	135789	135796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
552	NC_007295	ATAA	2	8	135903	135910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_007295	ACT	2	6	135937	135942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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559	NC_007295	TAT	2	6	136193	136198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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562	NC_007295	TTA	2	6	136265	136270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_007295	T	6	6	136281	136286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_007295	TTTA	2	8	136327	136334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_007295	GAG	2	6	136339	136344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_007295	T	7	7	136372	136378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_007295	TA	3	6	136413	136418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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569	NC_007295	T	8	8	136442	136449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_007295	T	6	6	136453	136458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_007295	T	6	6	136481	136486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_007295	TA	3	6	136492	136497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_007295	T	6	6	136500	136505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_007295	A	6	6	136512	136517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_007295	A	6	6	136535	136540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_007295	TAT	2	6	137147	137152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_007295	AGGCAA	2	12	137203	137214	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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583	NC_007295	A	6	6	137307	137312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_007295	T	7	7	143414	143420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_007295	TAAAT	2	10	143431	143440	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_007295	TAT	2	6	143457	143462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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600	NC_007295	A	8	8	143563	143570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_007295	A	7	7	143572	143578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_007295	T	6	6	143596	143601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_007295	A	6	6	143603	143608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_007295	TAG	2	6	143625	143630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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606	NC_007295	GGT	2	6	145608	145613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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610	NC_007295	T	6	6	145678	145683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_007295	T	7	7	145708	145714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_007295	AAG	2	6	145726	145731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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614	NC_007295	T	8	8	145765	145772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_007295	A	6	6	145783	145788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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618	NC_007295	ATT	2	6	145824	145829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_007295	T	6	6	145832	145837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_007295	A	7	7	145872	145878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_007295	TTTAAA	2	12	145881	145892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_007295	T	7	7	145895	145901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_007295	TTG	2	6	145906	145911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_007295	T	7	7	145939	145945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_007295	TCT	2	6	145966	145971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_007295	T	6	6	147015	147020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_007295	AT	3	6	147023	147028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_007295	AAATA	2	10	147029	147038	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_007295	A	6	6	147043	147048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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632	NC_007295	GCT	2	6	147219	147224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_007295	AAT	2	6	147225	147230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_007295	ATTT	2	8	147275	147282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_007295	TTTAAT	2	12	147283	147294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_007295	TATG	2	8	147295	147302	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
637	NC_007295	A	7	7	147308	147314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_007295	ATT	2	6	147326	147331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_007295	T	9	9	147330	147338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_007295	TAA	2	6	147349	147354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_007295	TAA	2	6	147357	147362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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