MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma synoviae 53

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007294	ATTAA	2	10	11786	11795	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007294	AAAGT	2	10	25782	25791	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007294	ATTTT	2	10	25894	25903	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007294	TATTT	2	10	26041	26050	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007294	TTTTC	2	10	26053	26062	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_007294	AAAAT	2	10	27171	27180	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007294	TAAAA	2	10	30133	30142	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007294	AAAAT	2	10	41377	41386	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007294	TATTT	2	10	41830	41839	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007294	AGTTA	2	10	56502	56511	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007294	CTTTT	2	10	57699	57708	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_007294	TTTGC	2	10	57824	57833	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007294	AAGGA	2	10	67199	67208	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007294	ACAAA	2	10	67415	67424	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007294	AATTA	2	10	68201	68210	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007294	TAAAA	2	10	72899	72908	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007294	ACATT	2	10	72917	72926	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_007294	ATTTT	2	10	74130	74139	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007294	AACAT	2	10	78659	78668	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007294	TGAAT	2	10	88014	88023	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007294	TAAAT	2	10	91930	91939	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007294	TATAA	2	10	91991	92000	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007294	TAAGC	2	10	103946	103955	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_007294	TTGAT	2	10	105709	105718	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007294	TAAAT	2	10	129424	129433	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007294	AAATT	2	10	140615	140624	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007294	TTTTA	2	10	154361	154370	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007294	AAGTG	2	10	154588	154597	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007294	ATTAA	2	10	156450	156459	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007294	TTAAA	2	10	166222	166231	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007294	AGCTT	2	10	173086	173095	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_007294	TTATT	2	10	174511	174520	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007294	AATGA	2	10	176724	176733	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007294	TAGAT	2	10	177561	177570	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007294	TAAAA	2	10	177870	177879	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007294	AAAAG	2	10	178118	178127	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007294	TGTCA	2	10	185346	185355	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_007294	TTTTA	2	10	185366	185375	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007294	AACAA	2	10	198866	198875	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_007294	TTTTA	2	10	291817	291826	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007294	TAAAA	2	10	292115	292124	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007294	TTAAA	2	10	295830	295839	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007294	TGATG	2	10	302941	302950	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007294	ATTTT	2	10	303672	303681	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007294	ATTTT	2	10	303870	303879	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007294	TAATT	2	10	304351	304360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007294	TATTG	2	10	304832	304841	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007294	TAATT	2	10	305433	305442	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007294	TTTAA	2	10	307573	307582	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007294	ATTTT	2	10	307833	307842	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007294	ACAAA	2	10	308048	308057	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_007294	AAAAT	2	10	308998	309007	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007294	TAATT	2	10	315825	315834	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007294	ATTTT	2	10	315887	315896	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007294	AGTTT	2	10	317085	317094	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007294	TATTT	2	10	317274	317283	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007294	ACCAA	2	10	318304	318313	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_007294	ATTTT	2	10	318462	318471	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007294	ATTTT	2	10	318768	318777	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007294	AGTTT	2	10	318871	318880	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007294	CAAAA	2	10	318931	318940	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_007294	CGTTT	2	10	319744	319753	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_007294	TTTAA	2	10	320340	320349	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007294	TATAA	2	10	325859	325868	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007294	ATTGA	2	10	326140	326149	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007294	ACAAA	2	10	326645	326654	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_007294	TTTTG	2	10	327673	327682	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007294	AAATT	2	10	332048	332057	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007294	AATTA	2	10	352481	352490	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007294	TTAAA	2	10	366361	366370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007294	AATTA	2	10	366380	366389	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007294	TTTAT	2	10	372337	372346	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007294	TAATA	2	10	383067	383076	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007294	ATTTT	2	10	385776	385785	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007294	TAAAA	2	10	424551	424560	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007294	TATTT	2	10	426436	426445	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007294	TTAAA	2	10	463445	463454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007294	TTTTG	2	10	467973	467982	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007294	ATAAA	2	10	473698	473707	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007294	GATCT	2	10	477274	477283	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_007294	GCACT	2	10	477416	477425	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_007294	AATAA	2	10	486439	486448	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007294	AGGCT	2	10	486922	486931	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_007294	AGTCC	2	10	488406	488415	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_007294	GCTTG	2	10	488444	488453	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_007294	ATTTC	2	10	488601	488610	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_007294	AAGAA	2	10	488648	488657	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007294	TATAT	2	10	492417	492426	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007294	TTAAA	2	10	498465	498474	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007294	AATTA	2	10	498484	498493	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007294	ATAAA	2	10	499388	499397	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007294	TTTAA	2	10	504675	504684	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007294	TTTTA	2	10	504788	504797	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007294	AATTA	2	10	505421	505430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007294	ATTTT	2	10	533138	533147	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007294	AATCA	2	10	537855	537864	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_007294	TTTGT	2	10	549425	549434	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007294	ATTTA	2	10	549659	549668	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007294	ATTTA	2	10	549729	549738	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007294	TAATT	2	10	554529	554538	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007294	ATATA	2	10	573651	573660	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007294	ATAAA	2	10	579366	579375	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007294	ATTTT	2	10	596958	596967	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007294	AAATG	2	10	603352	603361	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007294	TAATT	2	10	603641	603650	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007294	AAAAT	2	10	609729	609738	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007294	ATTTT	2	10	635619	635628	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007294	TTAAA	2	10	635715	635724	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007294	ATTAA	2	10	637072	637081	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007294	AATAA	2	10	637305	637314	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007294	GTTTT	2	10	638662	638671	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007294	AAGCC	2	10	647879	647888	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_007294	ATTAA	2	10	653427	653436	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007294	TACTT	2	10	655774	655783	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_007294	TATTT	2	10	659849	659858	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007294	TTTTC	2	10	664573	664582	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_007294	CGTAG	2	10	665280	665289	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_007294	CACGA	2	10	665556	665565	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_007294	TTGTA	2	10	666629	666638	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007294	ATTTA	2	10	666665	666674	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007294	AAAAT	2	10	668681	668690	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007294	TTATA	2	10	672116	672125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007294	ATATA	2	10	690546	690555	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007294	ATTTT	2	10	692411	692420	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007294	ATAAA	2	10	699898	699907	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007294	TAATT	2	10	710280	710289	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007294	TTATT	2	10	710290	710299	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007294	TATTT	2	10	712078	712087	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007294	TATAT	2	10	713463	713472	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007294	TTTAA	2	10	738194	738203	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007294	TATAA	2	10	763995	764004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007294	GTTTT	2	10	774059	774068	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007294	TTTTC	2	10	777685	777694	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_007294	CGTAG	2	10	778391	778400	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_007294	CACGA	2	10	778667	778676	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_007294	TTGTA	2	10	779740	779749	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007294	ATTAA	2	10	780635	780644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.