MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 232 chromosome

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006360	TAATTT	2	12	7765	7776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006360	AAGAAA	2	12	33799	33810	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006360	AAAATT	2	12	61552	61563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006360	CAGTGA	2	12	66609	66620	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_006360	TGGTTT	2	12	91334	91345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006360	CATATT	2	12	99683	99694	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_006360	TTTCAT	2	12	120260	120271	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_006360	AAAAAT	2	12	126764	126775	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006360	TGAAGT	2	12	130329	130340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006360	TTGAAA	2	12	130552	130563	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006360	TTATAA	2	12	131042	131053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006360	ACTTAA	2	12	151100	151111	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_006360	TTAAAA	2	12	168114	168125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006360	AATTAA	2	12	171561	171572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006360	TTATTT	2	12	171631	171642	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006360	TATAAA	2	12	186275	186286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006360	AAAAAT	2	12	206236	206247	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006360	ATTTTT	2	12	228680	228691	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006360	CAAATA	2	12	254450	254461	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_006360	AATTTT	2	12	258577	258588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006360	TATAAT	2	12	260060	260071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006360	AAAATT	2	12	282364	282375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006360	ATTATA	2	12	285676	285687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006360	GTTTTT	2	12	285827	285838	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006360	ATTATA	2	12	288046	288057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006360	TTTAAA	2	12	296147	296158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006360	TTTAAA	2	12	296388	296399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006360	TTGCCT	2	12	304852	304863	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_006360	ATTATA	2	12	309116	309127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006360	TTAAAT	2	12	330816	330827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006360	ATCAAT	2	12	350153	350164	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_006360	ACCTTG	2	12	358816	358827	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_006360	AATTTA	2	12	359003	359014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006360	TAAAAA	2	12	360279	360290	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006360	ATAAAA	2	12	366029	366040	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006360	TTATAA	2	12	407451	407462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006360	TCAAGA	2	12	411331	411342	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_006360	TATAAA	2	12	416833	416844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006360	TTAATT	2	12	422713	422724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006360	AAATTT	2	12	424503	424514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006360	CAAAAC	2	12	424691	424702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006360	TATAAT	2	12	428486	428497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006360	TAATAT	2	12	464448	464459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006360	ATAAAA	2	12	467565	467576	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006360	AATTTA	2	12	482369	482380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006360	ATTTTT	2	12	482788	482799	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006360	TAAAAA	2	12	482834	482845	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006360	ATTTAA	2	12	491222	491233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006360	TTTTAA	2	12	493395	493406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006360	TTATTT	2	12	493408	493419	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006360	TTATAT	2	12	504058	504069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006360	CAAATT	2	12	506885	506896	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_006360	GATTTT	2	12	525579	525590	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006360	ATTTTT	2	12	570047	570058	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006360	AAATAA	2	12	604984	604995	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006360	TCAAAG	2	12	605177	605188	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_006360	TTTAAA	2	12	606418	606429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006360	TGAATT	2	12	610330	610341	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006360	TTTATA	2	12	633480	633491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006360	TAAAAA	2	12	633806	633817	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006360	ATTTTT	2	12	634178	634189	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006360	AGTTTT	2	12	634199	634210	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006360	GTTTTT	2	12	637284	637295	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006360	ATTTTT	2	12	687033	687044	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006360	ATATTT	2	12	687882	687893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006360	TAATTT	2	12	707925	707936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006360	CATATT	2	12	731949	731960	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_006360	TTTTTA	2	12	738464	738475	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006360	TTAAAA	2	12	743565	743576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006360	ATTTTA	2	12	755918	755929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006360	AAATAA	2	12	756044	756055	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006360	TTTAGG	2	12	784197	784208	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006360	GAAAAA	2	12	785381	785392	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006360	TACTTA	2	12	785472	785483	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_006360	CAAGAT	2	12	788792	788803	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_006360	ATTACA	2	12	817007	817018	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_006360	ATTTTT	2	12	830734	830745	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006360	TTATAA	2	12	832246	832257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006360	TTATAA	2	12	852834	852845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006360	AAAAAT	2	12	857281	857292	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006360	TATTAG	2	12	872867	872878	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006360	AGAATA	2	12	876136	876147	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.