MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 232 chromosome

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006360	ATATA	2	10	1509	1518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006360	AATAA	2	10	8886	8895	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006360	TATAA	2	10	17683	17692	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006360	AAAAT	2	10	19611	19620	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006360	AATTA	2	10	22410	22419	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006360	AATTA	2	10	24769	24778	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006360	TAAAT	2	10	46202	46211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006360	TAATT	2	10	67494	67503	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006360	TTGTT	2	10	83841	83850	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006360	GATTT	2	10	91297	91306	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006360	AATTA	2	10	97703	97712	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006360	TTTAT	2	10	102903	102912	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006360	TTTAA	2	10	104421	104430	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006360	ATTTT	2	10	109247	109256	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006360	TAATA	2	10	109375	109384	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006360	TTAAA	2	10	115599	115608	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006360	ATTTT	2	10	119595	119604	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006360	TTTTA	2	10	119958	119967	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006360	CTTTG	2	10	129858	129867	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_006360	ATTTT	2	10	150951	150960	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006360	TTTCT	2	10	151122	151131	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_006360	AAATA	2	10	164995	165004	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006360	CCGCT	2	10	169884	169893	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_006360	ATATG	2	10	184491	184500	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006360	TAAAA	2	10	206082	206091	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006360	ATATA	2	10	227462	227471	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006360	TATAA	2	10	228491	228500	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006360	AATTT	2	10	240026	240035	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006360	TTTTA	2	10	244249	244258	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006360	AACAA	2	10	248637	248646	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_006360	TTTTA	2	10	254204	254213	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006360	TTTAT	2	10	254267	254276	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006360	ATTTT	2	10	254550	254559	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006360	AATTA	2	10	254598	254607	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006360	AAATT	2	10	254620	254629	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006360	AATTT	2	10	260002	260011	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006360	TATAA	2	10	260168	260177	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006360	GTTTT	2	10	268570	268579	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006360	ATTTT	2	10	271644	271653	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006360	TAAAA	2	10	275902	275911	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006360	TATAA	2	10	282255	282264	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006360	AAATT	2	10	283720	283729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006360	TTTAA	2	10	288255	288264	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006360	TTTAA	2	10	288272	288281	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006360	TATTT	2	10	295001	295010	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006360	AAATA	2	10	298554	298563	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006360	ATTTA	2	10	298596	298605	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006360	TACCT	2	10	322103	322112	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_006360	ATAAA	2	10	324679	324688	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006360	TTTAT	2	10	337872	337881	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006360	TTAAA	2	10	338260	338269	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006360	TTTAA	2	10	338288	338297	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006360	ATTTT	2	10	345701	345710	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006360	ATTTT	2	10	345743	345752	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006360	TAAAA	2	10	345789	345798	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006360	TATAT	2	10	347582	347591	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006360	TTATA	2	10	349645	349654	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006360	TCAAA	2	10	350387	350396	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_006360	TTTTC	2	10	358485	358494	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_006360	TAACT	2	10	361214	361223	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_006360	GCTTT	2	10	363522	363531	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_006360	TATTT	2	10	385017	385026	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006360	TACTA	2	10	389568	389577	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_006360	AAATT	2	10	389660	389669	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006360	AATTT	2	10	389853	389862	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006360	TAATT	2	10	395514	395523	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006360	TTATT	2	10	398568	398577	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006360	ACAAA	2	10	399611	399620	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_006360	AATTA	2	10	399629	399638	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006360	TAATT	2	10	404320	404329	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006360	AATTA	2	10	405381	405390	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006360	TAATT	2	10	406366	406375	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006360	ATTCC	2	10	407527	407536	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_006360	TTTAA	2	10	410948	410957	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006360	TTCTT	2	10	410977	410986	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_006360	AAATT	2	10	410991	411000	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006360	AAACT	2	10	411090	411099	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_006360	TATAA	2	10	411121	411130	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006360	TTTTC	2	10	411453	411462	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_006360	TTTGG	2	10	411566	411575	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006360	ATTAT	2	10	416709	416718	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006360	TAAAT	2	10	416721	416730	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006360	TTTAA	2	10	417578	417587	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006360	TTTCT	2	10	419239	419248	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_006360	TAATT	2	10	419317	419326	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006360	TTAAT	2	10	420084	420093	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006360	TAAAA	2	10	420471	420480	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006360	ATTTT	2	10	422245	422254	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006360	AGAAA	2	10	422972	422981	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006360	TAAAG	2	10	425059	425068	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006360	TATTT	2	10	425939	425948	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006360	TATAA	2	10	428575	428584	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006360	ATTTT	2	10	428606	428615	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006360	TTAAA	2	10	434483	434492	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006360	TAAAA	2	10	436126	436135	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006360	AAATT	2	10	436196	436205	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006360	ATTTT	2	10	437860	437869	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006360	AATTT	2	10	438024	438033	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006360	TAGTT	2	10	444530	444539	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006360	ATGAA	2	10	464430	464439	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006360	AATTT	2	10	467493	467502	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006360	TTAAA	2	10	477724	477733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006360	TTAAT	2	10	477772	477781	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006360	ATTAT	2	10	477829	477838	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006360	CGGCT	2	10	480047	480056	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_006360	TATTT	2	10	482159	482168	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006360	AATTT	2	10	482169	482178	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006360	TTATT	2	10	491397	491406	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006360	AATAA	2	10	504786	504795	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006360	TATAA	2	10	506803	506812	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006360	ATTAA	2	10	506861	506870	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006360	AAATT	2	10	515184	515193	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006360	ATGGT	2	10	553397	553406	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006360	ATTAT	2	10	554730	554739	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006360	GTTTT	2	10	555648	555657	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006360	ATTAC	2	10	563897	563906	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_006360	AATAA	2	10	568608	568617	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006360	TAAAT	2	10	568624	568633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006360	TAATT	2	10	570254	570263	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006360	TATAA	2	10	572713	572722	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006360	TATAA	2	10	589187	589196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006360	TTAAT	2	10	602041	602050	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006360	TATAA	2	10	605153	605162	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006360	TATAA	2	10	606525	606534	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006360	TAAAA	2	10	610414	610423	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006360	TATAA	2	10	616175	616184	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006360	TTAAA	2	10	624834	624843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006360	CAAAA	2	10	633409	633418	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_006360	TATAA	2	10	637322	637331	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006360	ATTTA	2	10	648612	648621	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006360	AAAAT	2	10	651264	651273	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006360	ATTTA	2	10	651460	651469	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006360	ATAAA	2	10	651596	651605	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006360	TAAAA	2	10	653991	654000	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006360	TTAAA	2	10	657342	657351	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006360	ATAAA	2	10	673744	673753	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006360	ATTAT	3	15	682640	682654	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006360	ATTTT	2	10	682877	682886	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006360	TATAA	2	10	688013	688022	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006360	ATTTT	2	10	699989	699998	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006360	ATAAA	2	10	707594	707603	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006360	ATTAT	2	10	707833	707842	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006360	TCTAA	2	10	712967	712976	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_006360	TAAAA	2	10	717428	717437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006360	ATTAA	4	20	726547	726566	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006360	ATATT	2	10	726680	726689	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006360	ATATT	2	10	731053	731062	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006360	AAATT	2	10	732415	732424	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006360	ATATT	2	10	732539	732548	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_006360	ATTAA	2	10	736975	736984	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_006360	AAACA	2	10	892703	892712	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.