MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia succiniciproducens MBEL55E chromosome

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006300	TGAAAT	2	12	2268	2279	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006300	AATTAT	2	12	3604	3615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006300	TATTAA	2	12	38753	38764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006300	TAAATT	2	12	47956	47967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006300	TTGATA	2	12	90773	90784	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006300	AATAGC	2	12	92991	93002	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_006300	TACAAC	2	12	129154	129165	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_006300	CGAAGG	2	12	150253	150264	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_006300	TGAAAT	2	12	153617	153628	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006300	TAAGTT	2	12	171164	171175	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006300	TTTTTG	2	12	204788	204799	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006300	TTTATT	2	12	214939	214950	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006300	ACAATT	2	12	329738	329749	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_006300	TATTAG	2	12	355695	355706	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006300	CGAAGG	2	12	402370	402381	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_006300	TGAAAT	2	12	405875	405886	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006300	ATATTA	2	12	425052	425063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006300	CCATTA	2	12	469089	469100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_006300	ATTTGA	2	12	518888	518899	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006300	TTAAAA	2	12	523333	523344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006300	TTTTAT	2	12	523389	523400	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006300	TAAAAA	2	12	525609	525620	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006300	TAAAGG	2	12	525681	525692	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006300	GATAAA	2	12	619764	619775	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006300	AAAATT	2	12	633346	633357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006300	ATTAGC	2	12	672658	672669	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_006300	TTTTCT	2	12	688803	688814	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_006300	TTTTAT	2	12	695412	695423	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006300	TAGTTA	2	12	702420	702431	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006300	TAATTT	2	12	738257	738268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006300	CTTTTT	2	12	810862	810873	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_006300	CGAAGG	2	12	814164	814175	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_006300	TGAAAT	2	12	817526	817537	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006300	GAAAAA	2	12	876672	876683	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006300	CAAAAA	2	12	943645	943656	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_006300	GTTTTT	2	12	981789	981800	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006300	AGGAAA	2	12	1132553	1132564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006300	ATATCT	2	12	1148147	1148158	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_006300	ATAAAA	2	12	1148159	1148170	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006300	AAGTAC	2	12	1154523	1154534	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_006300	CTTTAT	2	12	1215896	1215907	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_006300	CGAAAA	2	12	1266071	1266082	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_006300	TAAAAA	2	12	1270120	1270131	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006300	TTTAAA	2	12	1294746	1294757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006300	AAAAAG	2	12	1295691	1295702	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006300	TATAAA	2	12	1360930	1360941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006300	GTCAAT	2	12	1373503	1373514	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_006300	CTGTTT	2	12	1394240	1394251	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_006300	TTTTCA	2	12	1433816	1433827	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_006300	CAATAA	2	12	1435373	1435384	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_006300	TTTATT	2	12	1454898	1454909	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006300	ATTTAT	2	12	1469784	1469795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006300	CTTTGA	2	12	1532265	1532276	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_006300	CGATAA	2	12	1542218	1542229	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_006300	AAAAAC	2	12	1547237	1547248	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_006300	TTTTAT	2	12	1558844	1558855	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006300	AAAAAT	2	12	1581776	1581787	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006300	GTTAGA	2	12	1685332	1685343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006300	GATATT	2	12	1693563	1693574	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006300	ATTTCA	2	12	1718489	1718500	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_006300	GCCTTC	2	12	1721994	1722005	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_006300	TAAAAA	2	12	1728236	1728247	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006300	TTTTAT	2	12	1733748	1733759	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006300	TATGTA	2	12	1776102	1776113	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006300	TAAAAA	2	12	1784636	1784647	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006300	TTCAAT	2	12	1846885	1846896	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_006300	TGAGCT	2	12	2113278	2113289	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_006300	TGCAAA	2	12	2116082	2116093	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_006300	ATTTTA	2	12	2148896	2148907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006300	CCTTAC	2	12	2191175	2191186	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_006300	TGATTT	2	12	2229503	2229514	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006300	AAAATT	2	12	2229596	2229607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006300	AGCACA	2	12	2230172	2230183	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006300	ATTTCA	2	12	2231382	2231393	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_006300	GCCTTC	2	12	2234746	2234757	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_006300	AGTTAA	2	12	2261323	2261334	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006300	TTGCCA	2	12	2278410	2278421	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_006300	TTTAAA	2	12	2298571	2298582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006300	CGAAGG	2	12	2312840	2312851	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.