MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia succiniciproducens MBEL55E chromosome

Total Repeats: 271

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006300	AGTCG	2	10	1230	1239	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_006300	TAGGT	2	10	1688	1697	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006300	AAGTT	2	10	3683	3692	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006300	AAAAT	2	10	10460	10469	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006300	CGTAT	2	10	14131	14140	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_006300	AAACG	2	10	19608	19617	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_006300	TTCCC	2	10	50305	50314	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_006300	TAAAA	2	10	53148	53157	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006300	AGGAG	2	10	66774	66783	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006300	TAAAA	2	10	92084	92093	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006300	GCAGT	2	10	92919	92928	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_006300	ATAAA	2	10	117203	117212	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006300	AAATT	2	10	129231	129240	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006300	TAAAA	2	10	149291	149300	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006300	TTAAT	2	10	149482	149491	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006300	AGTCG	2	10	152580	152589	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_006300	TAGGT	2	10	153037	153046	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006300	TTAGG	2	10	166088	166097	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006300	GAAAA	2	10	176466	176475	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006300	GTAAA	2	10	177518	177527	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006300	AATTA	2	10	177818	177827	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006300	TAATT	2	10	181340	181349	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006300	TTAAC	2	10	182660	182669	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_006300	TTTTA	2	10	182764	182773	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006300	AAAAT	2	10	209566	209575	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006300	GAAAT	2	10	229948	229957	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006300	GACAA	2	10	237098	237107	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_006300	AAAAG	2	10	238171	238180	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006300	ATTTT	2	10	280010	280019	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006300	AATAA	2	10	282089	282098	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006300	ATAAA	2	10	291582	291591	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006300	TAAAA	2	10	310978	310987	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006300	AAGAA	2	10	322011	322020	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006300	GTTTT	2	10	328255	328264	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006300	AAATT	2	10	329725	329734	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006300	AAATC	2	10	358367	358376	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_006300	GGATA	2	10	360681	360690	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006300	CTTTT	2	10	360879	360888	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_006300	TTATC	2	10	376675	376684	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_006300	AATGA	2	10	377031	377040	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006300	GAAAA	2	10	377092	377101	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006300	TAAAA	2	10	386613	386622	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006300	CAACA	2	10	387271	387280	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_006300	GTTAA	2	10	397008	397017	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006300	TTAAT	2	10	401599	401608	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006300	AAAGG	2	10	403377	403386	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006300	AGTCG	2	10	404838	404847	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_006300	TAGGT	2	10	405295	405304	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006300	TAGAT	2	10	407511	407520	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006300	ATTTA	2	10	425645	425654	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006300	TGAAA	2	10	425663	425672	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006300	CTTTT	2	10	445184	445193	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_006300	ATTTT	2	10	447902	447911	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006300	GTTTT	2	10	456400	456409	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006300	TAATG	2	10	464162	464171	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006300	GAAAG	2	10	476671	476680	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006300	ATATG	2	10	490024	490033	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006300	GCATT	2	10	515185	515194	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_006300	AATTA	2	10	520054	520063	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006300	ATTAA	2	10	524692	524701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006300	AAAAT	2	10	532122	532131	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006300	ATTTT	2	10	541030	541039	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006300	AAGGG	2	10	546032	546041	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006300	TAATT	2	10	546120	546129	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006300	TTTTA	2	10	546687	546696	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006300	TGATT	2	10	553520	553529	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006300	ACTTA	2	10	563306	563315	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_006300	ATAAA	2	10	577752	577761	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006300	TTATT	2	10	579931	579940	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006300	CTTTT	2	10	587593	587602	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_006300	TCGCT	2	10	593833	593842	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_006300	CTTGC	2	10	605122	605131	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_006300	TATTT	2	10	621818	621827	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006300	GTAGC	2	10	624097	624106	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_006300	CTACC	2	10	624176	624185	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
76	NC_006300	TAAAA	2	10	633424	633433	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006300	CATTT	2	10	635535	635544	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_006300	GTAGA	2	10	635625	635634	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006300	CGAAA	2	10	639248	639257	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_006300	CTAAT	2	10	652523	652532	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_006300	AATTT	2	10	652576	652585	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006300	TACAA	2	10	652707	652716	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_006300	AGCGA	2	10	660845	660854	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_006300	TAACT	2	10	664889	664898	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_006300	TTTAT	2	10	668237	668246	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006300	AATAA	2	10	679983	679992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006300	GATTT	2	10	725047	725056	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006300	AACAA	2	10	729181	729190	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_006300	GAAAA	2	10	732192	732201	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006300	TCTTT	2	10	742029	742038	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_006300	TTAAA	2	10	742042	742051	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006300	TAAAA	2	10	742122	742131	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006300	CTTTT	2	10	756167	756176	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_006300	CTTAC	2	10	769634	769643	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_006300	TTAAT	2	10	813393	813402	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006300	AGTCG	2	10	816488	816497	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_006300	TAGGT	2	10	816946	816955	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006300	TAATT	2	10	819784	819793	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006300	TATAT	2	10	823617	823626	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006300	TCAAA	2	10	856869	856878	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_006300	TATAA	2	10	858899	858908	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006300	ATTGC	2	10	870378	870387	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_006300	TTATC	2	10	873735	873744	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_006300	GTATA	2	10	879985	879994	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006300	ATAAG	2	10	934816	934825	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006300	GTTTT	2	10	937499	937508	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006300	GAGCG	2	10	953209	953218	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_006300	GAGGC	2	10	956081	956090	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_006300	ATGAA	2	10	977105	977114	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006300	AATAA	2	10	980990	980999	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006300	TAAAA	2	10	1002119	1002128	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006300	ATTTT	2	10	1003299	1003308	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006300	GCCAT	6	30	1005905	1005934	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_006300	TAAAG	2	10	1015722	1015731	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006300	AAAAT	2	10	1015934	1015943	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006300	CATTT	2	10	1024033	1024042	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_006300	CATTG	2	10	1038153	1038162	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_006300	GTATC	2	10	1038312	1038321	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_006300	CACAT	2	10	1059472	1059481	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_006300	TTTTA	2	10	1076435	1076444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006300	AATTA	2	10	1089673	1089682	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006300	TACAT	2	10	1089715	1089724	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_006300	ATTTA	2	10	1092993	1093002	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006300	GTAAT	2	10	1123193	1123202	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006300	AGACT	2	10	1128398	1128407	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_006300	TTTAT	2	10	1135765	1135774	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006300	TTTAA	2	10	1145250	1145259	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006300	CTTTA	2	10	1148661	1148670	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_006300	ATTGA	2	10	1178561	1178570	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006300	TTTTA	2	10	1192231	1192240	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006300	TTAAA	2	10	1209309	1209318	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006300	TTTAT	2	10	1209363	1209372	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006300	AAAAT	2	10	1210344	1210353	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006300	AATTA	2	10	1217218	1217227	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006300	TAAAA	2	10	1230474	1230483	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006300	AGTAC	2	10	1233958	1233967	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_006300	TAAAT	2	10	1255135	1255144	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006300	TAAAT	2	10	1287643	1287652	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006300	AAAAC	2	10	1289684	1289693	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_006300	CTTTT	2	10	1292931	1292940	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_006300	AGCGA	2	10	1293017	1293026	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_006300	AGTTC	2	10	1293061	1293070	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_006300	ATTTT	2	10	1295776	1295785	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006300	TAAAA	2	10	1295914	1295923	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006300	TAATT	2	10	1323481	1323490	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006300	TAAAA	2	10	1328418	1328427	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006300	CAAAC	2	10	1330175	1330184	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_006300	TCCTA	2	10	1333587	1333596	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
149	NC_006300	ATTTG	2	10	1343012	1343021	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_006300	TTTAT	2	10	1344547	1344556	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_006300	AAATT	2	10	1373468	1373477	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_006300	AGTGT	2	10	1379808	1379817	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_006300	TTTAC	2	10	1465958	1465967	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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162	NC_006300	ATAAA	2	10	1495708	1495717	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_006300	ATTTT	2	10	1503431	1503440	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_006300	TATGA	2	10	1551686	1551695	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_006300	TAAAA	2	10	1582891	1582900	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_006300	TAAAA	2	10	1583989	1583998	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_006300	GGATT	2	10	1584078	1584087	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_006300	TTATT	2	10	1676603	1676612	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_006300	TGTTT	2	10	1736232	1736241	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
194	NC_006300	TTAAT	2	10	1736316	1736325	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_006300	TTAAA	2	10	2310136	2310145	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_006300	AAAGG	2	10	2313847	2313856	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.