MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. PG1 chromosome

Total Repeats: 346

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005364	GTATT	2	10	5308	5317	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005364	ATTAT	2	10	5550	5559	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005364	TATAT	2	10	28324	28333	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005364	ATTAT	3	15	37899	37913	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005364	TTTTA	2	10	43547	43556	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005364	ACATT	2	10	49454	49463	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_005364	ATTAT	2	10	59923	59932	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005364	ACATT	2	10	71268	71277	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_005364	CTATT	2	10	72166	72175	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_005364	ATAAA	2	10	73246	73255	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005364	TATAA	2	10	75705	75714	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005364	TAATG	2	10	80014	80023	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005364	TTCAA	2	10	84773	84782	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_005364	ACATT	2	10	90432	90441	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_005364	TAATT	2	10	103132	103141	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005364	TTAAA	2	10	104969	104978	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005364	TATTT	2	10	105002	105011	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005364	AAAAC	2	10	112312	112321	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_005364	CTTAT	2	10	113777	113786	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_005364	ACATT	2	10	116950	116959	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_005364	TGTTT	2	10	117262	117271	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005364	TAATG	2	10	117651	117660	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005364	ATAAA	2	10	124682	124691	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005364	TAATT	2	10	124838	124847	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005364	ACTAT	2	10	134005	134014	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_005364	ATAGT	2	10	136172	136181	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005364	TCAAA	2	10	142202	142211	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_005364	ATAAA	2	10	142475	142484	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005364	TAATG	2	10	143137	143146	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005364	AATGA	2	10	143380	143389	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005364	AATTT	2	10	147353	147362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005364	TTTCT	2	10	147801	147810	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_005364	TAAAT	2	10	149587	149596	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005364	ATTCA	2	10	150599	150608	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_005364	ATAAC	2	10	150749	150758	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_005364	TTACC	2	10	162421	162430	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_005364	TAATG	2	10	163513	163522	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005364	AATGA	2	10	163756	163765	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005364	ATTCA	2	10	166413	166422	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_005364	ATAAC	2	10	166563	166572	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_005364	AAATT	2	10	168507	168516	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005364	AAAAT	2	10	168569	168578	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005364	ATAAA	2	10	178817	178826	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005364	ATTTT	2	10	181086	181095	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005364	AAAAC	2	10	191444	191453	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_005364	TTTAA	2	10	191606	191615	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005364	TAAAA	2	10	191842	191851	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005364	AAATA	2	10	192340	192349	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005364	TAAAA	2	10	192493	192502	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005364	TTAGT	2	10	196289	196298	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005364	ACATT	2	10	198367	198376	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_005364	TAAAT	2	10	200777	200786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005364	ACATT	2	10	202651	202660	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_005364	AACAA	2	10	210512	210521	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_005364	TAAAA	2	10	228485	228494	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005364	TATAT	2	10	230422	230431	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005364	AATTA	2	10	233355	233364	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005364	ATTTA	2	10	245529	245538	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005364	AAAAT	2	10	245706	245715	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005364	ATTTA	2	10	246135	246144	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005364	TAATT	2	10	246232	246241	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005364	TTAAA	2	10	246594	246603	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005364	AAAAT	2	10	246692	246701	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005364	TTTAA	2	10	246726	246735	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005364	TAATG	2	10	255347	255356	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005364	TAGAT	2	10	260778	260787	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005364	TGTTA	2	10	265356	265365	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005364	TGAAT	2	10	265507	265516	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005364	TTTAT	2	10	266633	266642	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005364	ATATT	2	10	267884	267893	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005364	CATGA	2	10	268006	268015	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_005364	TAAAT	2	10	278139	278148	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005364	ACATT	2	10	280106	280115	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_005364	AAATT	2	10	282282	282291	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005364	ACATT	2	10	285848	285857	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_005364	TAATA	2	10	288344	288353	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005364	TATTT	2	10	292492	292501	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005364	GTAAA	2	10	298208	298217	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005364	TTAAA	2	10	300273	300282	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005364	TAAAA	2	10	300452	300461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005364	TTAAA	2	10	315651	315660	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005364	GAAAA	2	10	326024	326033	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005364	AAAAT	2	10	326169	326178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005364	TTATT	2	10	327077	327086	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005364	ATTTT	2	10	334663	334672	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005364	AATTA	2	10	339604	339613	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005364	TAATT	2	10	341340	341349	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005364	TTTAT	2	10	351676	351685	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005364	ACATT	2	10	365344	365353	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_005364	TAATT	2	10	366254	366263	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005364	ATAAA	2	10	366519	366528	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005364	TTTAT	2	10	372060	372069	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005364	ATTTT	2	10	372220	372229	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005364	TATGA	2	10	372809	372818	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005364	TCCAA	2	10	372870	372879	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_005364	TAATT	2	10	373632	373641	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005364	TAATG	2	10	380066	380075	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005364	TTAAT	2	10	384859	384868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005364	ATAAA	2	10	384942	384951	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005364	AAATT	2	10	385417	385426	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005364	TAAAT	2	10	387202	387211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005364	TAATG	2	10	387547	387556	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005364	AATGA	2	10	387790	387799	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005364	ATTCA	2	10	390104	390113	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_005364	ATAAC	2	10	390254	390263	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_005364	TAAAA	2	10	390859	390868	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005364	ACATT	2	10	392802	392811	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_005364	TAAAA	2	10	396705	396714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005364	TTTAG	2	10	408381	408390	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005364	TAGTT	2	10	413753	413762	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005364	TAATG	2	10	414731	414740	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005364	TAGTT	2	10	416799	416808	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005364	TTTAA	2	10	416995	417004	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005364	TAGAT	2	10	417108	417117	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005364	AAAAT	2	10	417256	417265	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005364	TTTAA	2	10	417290	417299	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005364	TGTTA	2	10	418639	418648	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005364	TGAAT	2	10	418790	418799	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005364	ATTTA	2	10	419803	419812	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005364	AAATT	2	10	420138	420147	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005364	TTTAT	2	10	425818	425827	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005364	AATTA	2	10	428035	428044	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005364	ATTTA	2	10	428077	428086	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005364	TAAAT	2	10	428200	428209	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005364	TAATG	2	10	431055	431064	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005364	AATGA	2	10	431298	431307	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005364	TTTCA	2	10	433167	433176	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_005364	ACATT	2	10	433410	433419	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_005364	ATTAC	2	10	435294	435303	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_005364	TATAA	2	10	435839	435848	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005364	AAAAC	2	10	440410	440419	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_005364	TAAAT	2	10	441618	441627	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_005364	TAAGT	2	10	441862	441871	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005364	TTAAT	2	10	449749	449758	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005364	TTCTT	2	10	450702	450711	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_005364	ATTTA	2	10	452854	452863	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005364	CTAAA	2	10	452909	452918	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_005364	AATTT	2	10	457221	457230	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005364	AATCA	2	10	457847	457856	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_005364	TAATA	2	10	457976	457985	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005364	TTTCA	2	10	459557	459566	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_005364	ACATT	2	10	459801	459810	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_005364	ATATA	3	15	460649	460663	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005364	TAAAT	2	10	466336	466345	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_005364	TAATG	2	10	466513	466522	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005364	AATGA	2	10	466756	466765	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005364	TTTCA	2	10	470353	470362	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_005364	ACATT	2	10	470597	470606	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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344	NC_005364	TGAAT	2	10	1202433	1202442	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.