MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum str. R(low) chromosome

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004829	ATCAT	2	10	1093	1102	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_004829	AAAGT	2	10	1582	1591	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004829	ATATT	2	10	1858	1867	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004829	CTGAT	2	10	6272	6281	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_004829	TTAAA	2	10	20567	20576	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004829	TTCCA	2	10	30252	30261	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_004829	ATTTT	2	10	36650	36659	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004829	TTAAT	2	10	49841	49850	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004829	TTAGC	2	10	63830	63839	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_004829	TTTAT	2	10	64381	64390	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004829	GCAAA	2	10	68452	68461	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_004829	CTAAA	2	10	78928	78937	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_004829	ATTTA	2	10	80142	80151	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004829	CAAAC	2	10	80244	80253	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_004829	ATCAA	2	10	80458	80467	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_004829	ATATA	2	10	80473	80482	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004829	CTCAT	2	10	83034	83043	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_004829	CTTCC	2	10	83308	83317	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_004829	TAATA	2	10	87047	87056	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004829	TAAAA	2	10	94966	94975	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004829	ATATA	2	10	105290	105299	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004829	GAGAT	2	10	118530	118539	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004829	ATCTC	2	10	118556	118565	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_004829	GTTTT	2	10	118721	118730	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004829	ACATA	2	10	122804	122813	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_004829	TTTGC	2	10	122970	122979	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_004829	ATTTT	2	10	134715	134724	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004829	TATTT	2	10	136209	136218	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004829	TTATA	2	10	136983	136992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004829	CATCT	2	10	148125	148134	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_004829	GTTAG	2	10	150778	150787	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004829	CATTT	2	10	151229	151238	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_004829	TCTTA	2	10	170600	170609	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_004829	TTTTA	2	10	175920	175929	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004829	TAAAG	2	10	181222	181231	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004829	TTTTA	2	10	182742	182751	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004829	TGATC	2	10	184188	184197	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_004829	TAAAA	2	10	197781	197790	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004829	TAGCT	2	10	198589	198598	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_004829	TATAT	2	10	208014	208023	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004829	TCTTT	2	10	248228	248237	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_004829	TTTTA	2	10	303849	303858	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004829	AGAGA	2	10	320965	320974	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004829	ATATT	2	10	326736	326745	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004829	AGTTA	2	10	326848	326857	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004829	TAATT	2	10	329021	329030	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004829	TCTAG	2	10	334845	334854	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_004829	TCGTG	2	10	335264	335273	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_004829	TAGGG	2	10	335645	335654	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004829	ATCAA	2	10	336324	336333	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_004829	ATATA	2	10	336339	336348	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004829	CTCAT	2	10	338900	338909	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_004829	CTTCC	2	10	339174	339183	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
54	NC_004829	AATTA	2	10	364275	364284	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004829	ATTAT	2	10	364304	364313	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004829	TAAAT	2	10	369077	369086	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004829	ATTAA	2	10	369088	369097	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004829	TATTT	2	10	376912	376921	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004829	AGATG	2	10	378400	378409	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004829	TAAAA	2	10	378513	378522	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004829	AGTTA	2	10	395804	395813	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004829	ATTAA	2	10	396764	396773	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004829	ATTTT	2	10	398253	398262	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004829	ATTAA	2	10	406276	406285	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004829	AAATT	2	10	406392	406401	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004829	TAGTT	2	10	408669	408678	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004829	TAAAA	2	10	413203	413212	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004829	AAGTT	2	10	413488	413497	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004829	AAAAT	2	10	414312	414321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004829	AAATT	2	10	423975	423984	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004829	AAGAA	2	10	442708	442717	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004829	ATATA	2	10	466526	466535	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004829	GTCAG	2	10	468318	468327	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_004829	ATATA	2	10	478442	478451	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004829	ATTTT	2	10	505193	505202	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004829	TTAAC	2	10	509274	509283	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_004829	ATTGT	2	10	520938	520947	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004829	TAAAA	2	10	526917	526926	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004829	AAGAC	2	10	536852	536861	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_004829	TAAAA	2	10	574364	574373	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004829	ATCTT	2	10	575178	575187	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_004829	TTAGT	2	10	590153	590162	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004829	TAACC	2	10	590392	590401	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_004829	TAATT	2	10	602760	602769	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004829	TTTAT	2	10	604322	604331	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004829	TAAAT	2	10	618502	618511	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004829	TTTAT	2	10	626636	626645	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004829	TAGTC	2	10	627189	627198	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_004829	TAATT	2	10	627916	627925	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004829	TGAAA	2	10	632391	632400	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004829	AAATT	2	10	634106	634115	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004829	ATTTA	2	10	634130	634139	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004829	AAATC	2	10	635422	635431	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_004829	ATAAA	2	10	635474	635483	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004829	TAATT	2	10	639399	639408	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004829	CATTT	2	10	646588	646597	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_004829	AAATG	2	10	646604	646613	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004829	TTAAT	2	10	672937	672946	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004829	TAATT	2	10	672949	672958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004829	AAATA	2	10	674546	674555	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004829	CTTAT	2	10	675820	675829	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_004829	ATTAT	2	10	678977	678986	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004829	TTAAC	2	10	693248	693257	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_004829	TAATA	2	10	706331	706340	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004829	TTTAA	2	10	706756	706765	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004829	AGATC	2	10	730893	730902	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_004829	TGTAT	2	10	732137	732146	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004829	TTAAG	2	10	732827	732836	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004829	TTTTG	2	10	732868	732877	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004829	AAAAT	2	10	732993	733002	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004829	AGTTT	2	10	733425	733434	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004829	ATAAC	2	10	738474	738483	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_004829	ATTTA	2	10	738520	738529	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004829	ATTTA	2	10	738733	738742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004829	CAAAA	2	10	748974	748983	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_004829	TATAA	2	10	753860	753869	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004829	TTTTG	2	10	755331	755340	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004829	AATCT	2	10	755360	755369	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_004829	AAATT	2	10	756891	756900	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004829	TATTT	2	10	763300	763309	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004829	TAATA	2	10	818733	818742	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004829	TTTTG	2	10	845338	845347	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004829	TTTTA	2	10	858992	859001	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004829	ATTAA	2	10	868362	868371	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004829	CCCTA	2	10	872839	872848	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
126	NC_004829	CACGA	2	10	873220	873229	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_004829	CTAGA	2	10	873639	873648	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_004829	TATCT	2	10	883246	883255	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_004829	ACTTC	2	10	891477	891486	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_004829	AGATC	2	10	904621	904630	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_004829	TTAAT	2	10	910605	910614	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004829	CAATT	2	10	919130	919139	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_004829	TAAAC	2	10	927519	927528	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_004829	TAAAC	2	10	929235	929244	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_004829	ATTTA	2	10	931410	931419	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004829	ATATA	2	10	931544	931553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004829	TAACT	2	10	931789	931798	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_004829	TTGTT	2	10	934594	934603	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004829	ATCAG	2	10	934848	934857	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_004829	AAAAT	2	10	941345	941354	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004829	TAAAT	2	10	941400	941409	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004829	ATTAA	2	10	941425	941434	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004829	AGATG	2	10	946470	946479	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004829	TAAAA	2	10	947344	947353	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004829	AATTA	2	10	962578	962587	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004829	ATGAC	2	10	963257	963266	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_004829	AAAAG	2	10	963324	963333	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004829	ATGTT	2	10	966660	966669	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_004829	AATTT	2	10	970894	970903	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_004829	TAACC	2	10	999980	999989	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.