MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium bovis AF2122/97 chromosome

Total Repeats: 8920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002945	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_002945	A	7	7	1553	1559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002945	TC	4	8	1562	1569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_002945	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_002945	AC	4	8	1686	1693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_002945	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_002945	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_002945	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_002945	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_002945	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002945	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002945	CTG	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_002945	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_002945	TCG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_002945	GAA	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002945	CGA	3	9	9830	9838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_002945	GAG	2	6	9859	9864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002945	TCG	2	6	10862	10867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_002945	TCC	2	6	10947	10952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_002945	ACG	2	6	10977	10982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_002945	GGC	2	6	11022	11027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_002945	TCG	2	6	11030	11035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_002945	CCT	2	6	11083	11088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_002945	ACCCG	2	10	11279	11288	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_002945	CGG	2	6	11320	11325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_002945	ACG	2	6	11382	11387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_002945	ACC	2	6	11425	11430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_002945	ACC	3	9	11495	11503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_002945	GCC	2	6	11532	11537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_002945	GCAC	2	8	11608	11615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_002945	CCG	2	6	11637	11642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_002945	CGA	2	6	11694	11699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_002945	ACT	2	6	11741	11746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_002945	CAT	2	6	11802	11807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_002945	GAC	2	6	11863	11868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_002945	GCC	2	6	12315	12320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_002945	CGG	2	6	12395	12400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_002945	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_002945	TCG	2	6	13034	13039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_002945	CAC	2	6	13576	13581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_002945	CGACC	2	10	13671	13680	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
42	NC_002945	ATTC	2	8	13690	13697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_002945	CGG	2	6	13701	13706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_002945	GAC	2	6	14031	14036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_002945	C	6	6	23206	23211	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_002945	GC	3	6	23222	23227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_002945	TCG	2	6	23253	23258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_002945	GGT	2	6	23815	23820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002945	TCG	2	6	25457	25462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_002945	TCAA	2	8	25495	25502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_002945	GAGC	2	8	25523	25530	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_002945	GGCC	2	8	25537	25544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_002945	CCG	2	6	25558	25563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_002945	CTA	2	6	25593	25598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_002945	TCC	2	6	25610	25615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_002945	GTT	2	6	25617	25622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002945	TCG	3	9	25737	25745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_002945	GCC	2	6	25751	25756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_002945	AAC	2	6	26863	26868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_002945	CGT	2	6	26881	26886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_002945	CTT	2	6	26932	26937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_002945	CGAGC	2	10	26949	26958	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_002945	CCT	2	6	27431	27436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_002945	TA	3	6	27507	27512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002945	GTA	2	6	27546	27551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002945	AC	3	6	29640	29645	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_002945	CAA	2	6	31154	31159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_002945	GAG	2	6	31160	31165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002945	GGC	2	6	31857	31862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_002945	TCG	2	6	31917	31922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_002945	TGC	3	9	31926	31934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_002945	AC	3	6	31979	31984	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_002945	CAC	2	6	31989	31994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_002945	GAT	2	6	32018	32023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002945	TGG	2	6	33183	33188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002945	G	6	6	33187	33192	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002945	CCGCC	2	10	33792	33801	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
78	NC_002945	GCTA	2	8	33839	33846	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_002945	CGG	2	6	33898	33903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_002945	GCG	2	6	33919	33924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_002945	TGG	2	6	33980	33985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002945	CGG	2	6	34051	34056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_002945	GGT	2	6	34113	34118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002945	CCA	2	6	34135	34140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_002945	G	6	6	34175	34180	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002945	TCA	2	6	38947	38952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_002945	CG	3	6	38968	38973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_002945	GC	3	6	38978	38983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_002945	CT	3	6	39017	39022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_002945	CG	3	6	39024	39029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_002945	GC	3	6	39034	39039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_002945	CAC	2	6	39814	39819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_002945	TCG	2	6	39836	39841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_002945	GCC	2	6	41210	41215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_002945	GGT	2	6	41271	41276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002945	GAT	2	6	41279	41284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002945	CCG	3	9	41903	41911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_002945	AGC	2	6	41922	41927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_002945	GCGTC	2	10	41928	41937	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_002945	GCC	2	6	42352	42357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_002945	CGT	2	6	43387	43392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_002945	GTG	2	6	43464	43469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002945	CGG	2	6	46463	46468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_002945	CGC	2	6	46518	46523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_002945	CGG	2	6	46530	46535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_002945	CTAC	2	8	47203	47210	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_002945	GCT	2	6	47320	47325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_002945	ATCGG	2	10	47335	47344	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_002945	CCT	2	6	51719	51724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_002945	ACG	2	6	51750	51755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_002945	AT	3	6	51787	51792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002945	ACA	2	6	51798	51803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_002945	TAG	2	6	52690	52695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002945	CTGG	2	8	52700	52707	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_002945	CCG	2	6	52724	52729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_002945	CAA	2	6	52738	52743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_002945	GGT	2	6	52762	52767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002945	CGT	2	6	52776	52781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_002945	GTC	2	6	53247	53252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_002945	GCG	2	6	53255	53260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_002945	CG	3	6	53264	53269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_002945	CGA	2	6	53307	53312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_002945	TCC	2	6	53327	53332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_002945	GC	3	6	53402	53407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_002945	CGC	2	6	53420	53425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_002945	GAG	2	6	53437	53442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002945	GCC	2	6	53458	53463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_002945	CCG	2	6	53476	53481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_002945	G	6	6	53483	53488	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002945	TGG	2	6	53496	53501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002945	GCC	2	6	53520	53525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_002945	C	6	6	53530	53535	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
133	NC_002945	GCCG	2	8	53554	53561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_002945	TGC	2	6	57389	57394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_002945	CGC	2	6	58016	58021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_002945	TCG	2	6	58025	58030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_002945	GGT	2	6	58053	58058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002945	CCT	2	6	58125	58130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_002945	AGG	2	6	58163	58168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002945	TGA	2	6	58169	58174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002945	GAA	3	9	58526	58534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002945	GCC	2	6	58543	58548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_002945	AGG	2	6	58565	58570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002945	TG	3	6	63019	63024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002945	ATG	2	6	63056	63061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002945	CGG	2	6	63094	63099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_002945	CGT	2	6	63123	63128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_002945	AGG	3	9	63886	63894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002945	TCG	2	6	64969	64974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_002945	TGCCG	2	10	65471	65480	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_002945	GCC	2	6	65523	65528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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153	NC_002945	GGT	2	6	66811	66816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_002945	TGC	2	6	66849	66854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_002945	GCC	3	9	68499	68507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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159	NC_002945	TCG	2	6	68575	68580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_002945	AGG	2	6	68599	68604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_002945	CGG	2	6	71832	71837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_002945	CGT	2	6	72277	72282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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167	NC_002945	GAG	2	6	75317	75322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_002945	CGG	2	6	79233	79238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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176	NC_002945	GAG	2	6	79269	79274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_002945	CGG	2	6	79475	79480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_002945	GGC	2	6	79493	79498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_002945	GGC	2	6	80294	80299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_002945	CGG	2	6	80406	80411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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189	NC_002945	CGTG	2	8	82586	82593	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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192	NC_002945	CTT	2	6	85646	85651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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271	NC_002945	CGA	2	6	140045	140050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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273	NC_002945	GCT	2	6	140067	140072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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275	NC_002945	AC	3	6	141093	141098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
276	NC_002945	AGCA	2	8	141133	141140	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
277	NC_002945	CGC	2	6	141156	141161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
278	NC_002945	CG	3	6	141185	141190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
279	NC_002945	GAG	2	6	141228	141233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
280	NC_002945	TGT	2	6	143926	143931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_002945	GCCG	2	8	143939	143946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
282	NC_002945	TCC	2	6	147816	147821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
283	NC_002945	GTG	2	6	147843	147848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
284	NC_002945	CAG	2	6	147853	147858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_002945	GTA	2	6	147862	147867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
286	NC_002945	GCC	2	6	147887	147892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_002945	GGGTC	2	10	147901	147910	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
288	NC_002945	AGT	2	6	147916	147921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_002945	GGT	2	6	148501	148506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_002945	GCC	2	6	149273	149278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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312	NC_002945	GAG	3	9	154406	154414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_002945	AC	3	6	157952	157957	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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325	NC_002945	GA	3	6	158029	158034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_002945	CA	3	6	196963	196968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
402	NC_002945	AGG	3	9	196984	196992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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410	NC_002945	GGCC	2	8	218539	218546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
411	NC_002945	TCG	2	6	218601	218606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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414	NC_002945	AT	3	6	218809	218814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_002945	CTG	2	6	218861	218866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
416	NC_002945	GC	3	6	218867	218872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
417	NC_002945	CGGT	2	8	218875	218882	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
418	NC_002945	GATG	2	8	219622	219629	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
419	NC_002945	TGC	2	6	219653	219658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
420	NC_002945	CGC	2	6	221945	221950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
421	NC_002945	ATG	2	6	221999	222004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
422	NC_002945	CGC	2	6	222355	222360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
423	NC_002945	CAC	2	6	222382	222387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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445	NC_002945	GGC	2	6	241595	241600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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457	NC_002945	CTG	2	6	249172	249177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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