MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 1300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002944	AGCC	2	8	1897703	1897710	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
502	NC_002944	CCGC	2	8	1897769	1897776	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
503	NC_002944	CATA	2	8	1903043	1903050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
504	NC_002944	CCTG	2	8	1907670	1907677	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
505	NC_002944	GCTA	2	8	1907681	1907688	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
506	NC_002944	GCCG	2	8	1908384	1908391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
507	NC_002944	GGGA	2	8	1910098	1910105	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
508	NC_002944	CCGG	2	8	1912365	1912372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
509	NC_002944	CGGC	2	8	1917319	1917326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_002944	GTCG	2	8	1918272	1918279	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
511	NC_002944	CCGG	2	8	1926158	1926165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
512	NC_002944	CCGC	2	8	1938837	1938844	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
513	NC_002944	GCCG	2	8	1951058	1951065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_002944	CAGT	2	8	1951151	1951158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
515	NC_002944	CTAT	2	8	1951972	1951979	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
516	NC_002944	GCCG	2	8	1953613	1953620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_002944	GCGG	2	8	1972702	1972709	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
518	NC_002944	GGCA	2	8	1972713	1972720	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
519	NC_002944	ATGG	2	8	1973122	1973129	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_002944	CCGG	2	8	1978463	1978470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
521	NC_002944	CGGC	2	8	1979230	1979237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
522	NC_002944	GGTC	2	8	1991652	1991659	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
523	NC_002944	AATT	2	8	1997258	1997265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_002944	GGCC	2	8	1997742	1997749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
525	NC_002944	TCGG	2	8	2009704	2009711	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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530	NC_002944	GCCG	2	8	2026214	2026221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_002944	TCGC	2	8	2042852	2042859	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
532	NC_002944	CGGA	2	8	2043792	2043799	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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534	NC_002944	CGGA	2	8	2044348	2044355	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
535	NC_002944	GACG	2	8	2044377	2044384	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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542	NC_002944	ACGG	2	8	2066563	2066570	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
543	NC_002944	GCAT	2	8	2066700	2066707	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
544	NC_002944	GCCG	2	8	2073131	2073138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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549	NC_002944	ACCG	2	8	2074628	2074635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
550	NC_002944	CCGG	2	8	2075666	2075673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
551	NC_002944	GCAG	2	8	2078352	2078359	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
552	NC_002944	GCGA	2	8	2084576	2084583	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
553	NC_002944	GCCG	2	8	2084681	2084688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
554	NC_002944	GCCG	2	8	2084886	2084893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
555	NC_002944	AATA	2	8	2087100	2087107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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559	NC_002944	ACCG	2	8	2108555	2108562	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
560	NC_002944	CAGC	2	8	2111198	2111205	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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564	NC_002944	CCCT	2	8	2122156	2122163	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
565	NC_002944	CGGC	2	8	2122232	2122239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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572	NC_002944	CGGT	2	8	2145144	2145151	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
573	NC_002944	CGGC	3	12	2150757	2150768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
574	NC_002944	AACT	2	8	2150837	2150844	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
575	NC_002944	CGGG	2	8	2150890	2150897	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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599	NC_002944	GGCC	2	8	2239360	2239367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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610	NC_002944	ACGT	2	8	2263654	2263661	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
611	NC_002944	CCCG	2	8	2264983	2264990	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
612	NC_002944	CCGT	2	8	2279442	2279449	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
613	NC_002944	GGCG	2	8	2283614	2283621	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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615	NC_002944	GCCC	2	8	2285436	2285443	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
616	NC_002944	CGGC	2	8	2285517	2285524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
617	NC_002944	CGGG	2	8	2285707	2285714	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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622	NC_002944	TGGG	2	8	2304924	2304931	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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627	NC_002944	CCGA	2	8	2321893	2321900	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
628	NC_002944	CCCG	2	8	2322240	2322247	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
629	NC_002944	CGGT	2	8	2324091	2324098	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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947	NC_002944	CGGG	2	8	3414565	3414572	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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