MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 9626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_002944	TGG	2	6	2763584	2763589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_002944	C	6	6	2763598	2763603	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5503	NC_002944	CCG	2	6	2763622	2763627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5504	NC_002944	AGC	2	6	2763700	2763705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_002944	CCT	2	6	2767676	2767681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5506	NC_002944	GC	3	6	2767736	2767741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5507	NC_002944	TCG	2	6	2768024	2768029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_002944	CG	3	6	2768028	2768033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5509	NC_002944	CCG	2	6	2768092	2768097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5510	NC_002944	CG	3	6	2768103	2768108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5511	NC_002944	GC	3	6	2771204	2771209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_002944	CAA	3	9	2776790	2776798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_002944	CAC	2	6	2776879	2776884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5514	NC_002944	CGAT	2	8	2776918	2776925	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5515	NC_002944	GCC	2	6	2776932	2776937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5516	NC_002944	GTC	2	6	2778373	2778378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_002944	GTC	2	6	2778451	2778456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_002944	CTC	2	6	2778562	2778567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5519	NC_002944	CTT	2	6	2778622	2778627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_002944	GGC	2	6	2778631	2778636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_002944	CGT	2	6	2778678	2778683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_002944	ACTTC	2	10	2778771	2778780	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5523	NC_002944	CGC	2	6	2778791	2778796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_002944	TCG	2	6	2778814	2778819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_002944	TTG	2	6	2779404	2779409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_002944	CGG	3	9	2779444	2779452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_002944	TCG	2	6	2779966	2779971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_002944	GGC	2	6	2780076	2780081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_002944	GCT	2	6	2780087	2780092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_002944	GCC	2	6	2782273	2782278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5531	NC_002944	TCA	2	6	2782347	2782352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_002944	CGGCA	2	10	2784117	2784126	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5533	NC_002944	CGA	2	6	2784758	2784763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_002944	CTC	2	6	2784787	2784792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5535	NC_002944	CGCC	2	8	2784810	2784817	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5536	NC_002944	CG	3	6	2784917	2784922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5537	NC_002944	GCGGG	2	10	2784981	2784990	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5538	NC_002944	CTG	2	6	2784997	2785002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_002944	CCA	2	6	2785010	2785015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_002944	CGC	3	9	2785023	2785031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5541	NC_002944	CCGGC	2	10	2785033	2785042	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5542	NC_002944	TGACCG	2	12	2786052	2786063	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_002944	CGG	2	6	2786078	2786083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_002944	TGC	2	6	2786112	2786117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_002944	CGG	2	6	2786173	2786178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_002944	CGG	2	6	2786194	2786199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_002944	GCT	2	6	2786203	2786208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_002944	ACCG	2	8	2786228	2786235	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5549	NC_002944	CGA	2	6	2786239	2786244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_002944	CAG	2	6	2786284	2786289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_002944	GCG	2	6	2786303	2786308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_002944	GGA	2	6	2786320	2786325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_002944	CGGCC	2	10	2786359	2786368	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5554	NC_002944	ACA	2	6	2786394	2786399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_002944	GCC	2	6	2786428	2786433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5556	NC_002944	CGC	2	6	2786445	2786450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5557	NC_002944	CG	3	6	2786454	2786459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5558	NC_002944	GCG	2	6	2787380	2787385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_002944	CGG	2	6	2787409	2787414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_002944	GCCGGC	2	12	2790272	2790283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5561	NC_002944	GCGG	2	8	2790299	2790306	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5562	NC_002944	CGTCAC	2	12	2790307	2790318	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5563	NC_002944	GCCG	2	8	2790820	2790827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5564	NC_002944	CGGC	2	8	2790843	2790850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5565	NC_002944	T	6	6	2790897	2790902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_002944	GCC	2	6	2791444	2791449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5567	NC_002944	TGG	2	6	2791551	2791556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_002944	GCTTG	2	10	2795293	2795302	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5569	NC_002944	CGGC	2	8	2795318	2795325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5570	NC_002944	CGC	2	6	2795335	2795340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_002944	ATG	2	6	2797966	2797971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_002944	GCG	2	6	2797990	2797995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_002944	ACGCC	2	10	2798027	2798036	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5574	NC_002944	GAT	2	6	2798049	2798054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5577	NC_002944	GTA	2	6	2798091	2798096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_002944	TCG	2	6	2798107	2798112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_002944	CGGC	2	8	2798130	2798137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5580	NC_002944	GC	3	6	2798143	2798148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5581	NC_002944	GCT	2	6	2798171	2798176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_002944	GCC	2	6	2798183	2798188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5583	NC_002944	GCCG	2	8	2798245	2798252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5584	NC_002944	CG	3	6	2798263	2798268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5585	NC_002944	CCG	2	6	2802155	2802160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5586	NC_002944	GGGC	2	8	2802171	2802178	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5587	NC_002944	GCC	2	6	2803736	2803741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5588	NC_002944	CTG	2	6	2803777	2803782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_002944	GCT	2	6	2805437	2805442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_002944	GCC	2	6	2805466	2805471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5591	NC_002944	ACC	2	6	2805482	2805487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5592	NC_002944	GCC	2	6	2805513	2805518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5593	NC_002944	CGA	2	6	2805521	2805526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5595	NC_002944	CGGC	2	8	2805558	2805565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5596	NC_002944	CGA	2	6	2809269	2809274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_002944	AAG	2	6	2809320	2809325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_002944	CTG	2	6	2809739	2809744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_002944	AATT	2	8	2809745	2809752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_002944	ACA	2	6	2811446	2811451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_002944	CGC	2	6	2811452	2811457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5602	NC_002944	CGCCC	2	10	2811472	2811481	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5603	NC_002944	A	6	6	2811483	2811488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_002944	CAG	2	6	2811499	2811504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_002944	CG	4	8	2811518	2811525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5606	NC_002944	GCC	2	6	2811552	2811557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5607	NC_002944	C	6	6	2811589	2811594	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5608	NC_002944	C	6	6	2811597	2811602	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5609	NC_002944	GCG	2	6	2812779	2812784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_002944	TTG	2	6	2812789	2812794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_002944	GCG	2	6	2812805	2812810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_002944	CGGG	2	8	2812814	2812821	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5613	NC_002944	GGCCG	2	10	2818649	2818658	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5614	NC_002944	CGG	2	6	2818663	2818668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_002944	GCC	2	6	2819153	2819158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5616	NC_002944	CGC	2	6	2819163	2819168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5617	NC_002944	GTG	2	6	2819230	2819235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_002944	CG	3	6	2820349	2820354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5619	NC_002944	ACG	2	6	2820420	2820425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5621	NC_002944	GCT	2	6	2820451	2820456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_002944	CGG	2	6	2820517	2820522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_002944	CGA	2	6	2820523	2820528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_002944	CGA	2	6	2820556	2820561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_002944	CTGCCG	2	12	2820773	2820784	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5626	NC_002944	CGC	3	9	2820795	2820803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5627	NC_002944	ACCG	2	8	2820817	2820824	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5628	NC_002944	GCC	2	6	2820830	2820835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5630	NC_002944	GCC	2	6	2820857	2820862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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