MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CDC1551 chromosome

Total Repeats: 1099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002755	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_002755	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_002755	ATTC	2	8	13691	13698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_002755	TCAA	2	8	25496	25503	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_002755	GAGC	2	8	25524	25531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_002755	GGCC	2	8	25538	25545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_002755	ACCA	2	8	31105	31112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_002755	GCTA	2	8	33799	33806	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_002755	CTAC	2	8	47163	47170	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_002755	CTGG	2	8	52660	52667	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_002755	CGGT	2	8	79149	79156	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_002755	CGGT	2	8	79334	79341	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_002755	CTGG	2	8	87188	87195	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_002755	CGCA	2	8	89489	89496	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_002755	GCTG	2	8	95415	95422	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_002755	TGCG	2	8	96291	96298	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_002755	CGCT	2	8	97619	97626	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_002755	CCTG	2	8	97666	97673	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_002755	GCGA	2	8	97710	97717	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_002755	CGGC	2	8	104818	104825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_002755	GTTG	2	8	104909	104916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002755	ATCC	2	8	125568	125575	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_002755	CGGG	2	8	130699	130706	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_002755	GCTC	2	8	131211	131218	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_002755	CGGG	2	8	133923	133930	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_002755	TTCT	2	8	139838	139845	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_002755	ACGC	2	8	139910	139917	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_002755	CTGA	2	8	140941	140948	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_002755	GATA	2	8	140986	140993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002755	AGCA	2	8	141082	141089	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_002755	GCCG	2	8	143888	143895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_002755	GCGT	2	8	148432	148439	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_002755	GCCG	2	8	152404	152411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_002755	GCGT	3	12	155798	155809	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_002755	GGCT	2	8	157944	157951	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_002755	CGCA	2	8	157970	157977	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_002755	TCGT	2	8	161661	161668	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_002755	CCGG	2	8	161669	161676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_002755	CCCG	2	8	161881	161888	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_002755	ACTT	2	8	171358	171365	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_002755	CGGA	2	8	173437	173444	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_002755	GGCC	2	8	184325	184332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_002755	ACCG	2	8	185139	185146	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_002755	GCCA	2	8	185183	185190	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_002755	TTGA	2	8	186886	186893	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002755	GGCC	2	8	190833	190840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_002755	GCCG	2	8	191461	191468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_002755	ATTG	2	8	191505	191512	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002755	GACC	2	8	191614	191621	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_002755	CGGT	2	8	191667	191674	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_002755	TCGA	2	8	194553	194560	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_002755	CTGG	2	8	196872	196879	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_002755	CTGT	2	8	212367	212374	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_002755	CGGT	2	8	218791	218798	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_002755	GATG	2	8	219538	219545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002755	ACGT	2	8	231660	231667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_002755	ACAT	2	8	231727	231734	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_002755	AGCC	2	8	236677	236684	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_002755	GTGC	2	8	241439	241446	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_002755	GAAC	2	8	249125	249132	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_002755	CCGG	2	8	250253	250260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_002755	CGCA	2	8	253734	253741	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_002755	GACG	2	8	256143	256150	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_002755	GACC	2	8	260871	260878	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_002755	GCGG	2	8	273024	273031	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_002755	TAGA	2	8	288499	288506	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002755	ACTT	2	8	292204	292211	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_002755	TCGT	2	8	293832	293839	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_002755	AACT	2	8	295882	295889	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_002755	AACC	2	8	295890	295897	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_002755	GACG	2	8	302198	302205	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_002755	CGGT	2	8	305702	305709	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_002755	GCGG	2	8	318409	318416	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_002755	CCGT	2	8	318711	318718	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_002755	GGTG	2	8	318899	318906	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002755	GCGG	2	8	319707	319714	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_002755	GTGG	2	8	320151	320158	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002755	GTCG	2	8	320403	320410	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_002755	CAGA	2	8	320498	320505	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_002755	TCCG	2	8	320802	320809	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_002755	CCGT	2	8	321183	321190	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_002755	CCGG	2	8	321191	321198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_002755	CGCT	2	8	332811	332818	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_002755	GCCG	2	8	336602	336609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_002755	TGGC	2	8	336614	336621	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_002755	GGCG	2	8	342189	342196	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_002755	CATT	2	8	363647	363654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_002755	CTGT	2	8	364573	364580	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_002755	AATC	2	8	375813	375820	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_002755	GGCC	2	8	386172	386179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_002755	AAGG	2	8	387188	387195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002755	TGAC	2	8	396157	396164	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_002755	GTCA	2	8	396168	396175	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_002755	ATCG	2	8	417138	417145	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_002755	GCCA	2	8	417229	417236	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_002755	GTCC	2	8	417255	417262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_002755	ACGG	2	8	417341	417348	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_002755	GATC	2	8	421830	421837	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_002755	GAGC	2	8	424122	424129	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_002755	GAGC	2	8	424173	424180	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_002755	GAGC	2	8	424224	424231	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_002755	GAGC	2	8	424275	424282	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_002755	CTGG	2	8	437688	437695	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_002755	TCCG	2	8	453367	453374	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_002755	AGCC	2	8	453473	453480	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_002755	ATCC	2	8	453539	453546	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_002755	GAAC	2	8	453806	453813	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_002755	ACCC	2	8	454064	454071	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_002755	CACG	2	8	454471	454478	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_002755	TGCG	2	8	455583	455590	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_002755	GGAT	2	8	468255	468262	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002755	CGAG	2	8	468398	468405	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_002755	GCAC	2	8	476472	476479	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_002755	CAAC	2	8	480341	480348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_002755	AGAA	2	8	492206	492213	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002755	GCGG	2	8	504582	504589	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_002755	ACCG	2	8	506462	506469	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_002755	CGGG	2	8	506499	506506	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_002755	GAGG	2	8	508455	508462	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002755	GCGT	2	8	508541	508548	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_002755	ACGG	2	8	511791	511798	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_002755	CCGT	2	8	529943	529950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_002755	CGGC	2	8	535255	535262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_002755	CGGC	2	8	539998	540005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_002755	GACG	2	8	540008	540015	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_002755	TGTC	2	8	558961	558968	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_002755	CGGC	2	8	561313	561320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_002755	CCGG	2	8	562247	562254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_002755	AGCA	2	8	566391	566398	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_002755	TGGT	2	8	568051	568058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002755	CGAA	2	8	584929	584936	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_002755	GTTT	2	8	587687	587694	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002755	GAGT	2	8	593003	593010	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002755	TGGC	2	8	597822	597829	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_002755	GCTA	2	8	598002	598009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_002755	GCGT	2	8	605888	605895	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_002755	CCGA	2	8	605913	605920	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_002755	CCGA	2	8	609916	609923	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_002755	GTCC	2	8	612471	612478	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_002755	GCCC	2	8	626969	626976	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
141	NC_002755	AGCC	2	8	631450	631457	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_002755	TGCC	2	8	641412	641419	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_002755	TGGC	2	8	656244	656251	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_002755	CCAG	2	8	658954	658961	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_002755	CGGT	2	8	659698	659705	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_002755	CGGC	2	8	664904	664911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_002755	GTCG	2	8	667069	667076	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_002755	CGGC	2	8	669898	669905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_002755	GTGG	2	8	669915	669922	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002755	GCCG	2	8	673404	673411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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472	NC_002755	AGCG	2	8	1809472	1809479	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
473	NC_002755	GGTG	2	8	1814247	1814254	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
474	NC_002755	TGGG	2	8	1827747	1827754	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_002755	CCGG	2	8	1843079	1843086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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481	NC_002755	GCGG	2	8	1849519	1849526	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
482	NC_002755	GCGG	2	8	1863529	1863536	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
483	NC_002755	CCAG	2	8	1886577	1886584	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
484	NC_002755	GACT	2	8	1886595	1886602	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
485	NC_002755	GCCG	2	8	1886698	1886705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
486	NC_002755	GCCA	2	8	1890046	1890053	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
487	NC_002755	TGCG	2	8	1891795	1891802	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
488	NC_002755	TCGA	2	8	1891831	1891838	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
489	NC_002755	GCCG	2	8	1902914	1902921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
490	NC_002755	CCGG	2	8	1912335	1912342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
491	NC_002755	GGGT	2	8	1914494	1914501	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
492	NC_002755	GACC	2	8	1927213	1927220	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
493	NC_002755	GTTC	2	8	1937653	1937660	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
494	NC_002755	CCCG	2	8	1938562	1938569	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
495	NC_002755	GCCC	2	8	1938627	1938634	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
496	NC_002755	CTGG	2	8	1948306	1948313	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
497	NC_002755	GATG	2	8	1959817	1959824	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
498	NC_002755	GGGT	2	8	1961751	1961758	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
499	NC_002755	TCAC	2	8	1967090	1967097	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
500	NC_002755	ACGC	2	8	1967172	1967179	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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