MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLb

Total Repeats: 190

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002682	TCGC	2	8	308	315	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_002682	CGAG	2	8	2490	2497	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_002682	TGCG	2	8	2600	2607	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_002682	CTTC	2	8	3061	3068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_002682	CGGG	2	8	3094	3101	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_002682	CACG	2	8	4505	4512	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_002682	GGCT	2	8	14133	14140	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_002682	CTGG	2	8	14313	14320	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_002682	AATC	2	8	15067	15074	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_002682	GCCA	2	8	15741	15748	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_002682	GGTT	2	8	15883	15890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002682	TCTG	2	8	15967	15974	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_002682	CGCC	2	8	16601	16608	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_002682	AGGC	2	8	16806	16813	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_002682	GCCA	2	8	18221	18228	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_002682	CGAA	2	8	20649	20656	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_002682	GGCC	2	8	21010	21017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_002682	GCGA	2	8	21133	21140	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_002682	CCGA	2	8	21178	21185	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_002682	CCTC	2	8	21206	21213	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_002682	GTAG	2	8	22057	22064	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002682	CTTC	2	8	22810	22817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_002682	CGGC	2	8	30593	30600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_002682	TACG	2	8	31917	31924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_002682	TTGA	2	8	33660	33667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002682	GAGC	2	8	33891	33898	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_002682	TTGG	2	8	35224	35231	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002682	TCTT	2	8	35725	35732	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_002682	GGCG	2	8	36080	36087	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_002682	CGAA	2	8	36290	36297	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_002682	TTTG	2	8	36490	36497	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002682	ACAT	2	8	37960	37967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_002682	ATCG	2	8	40215	40222	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_002682	GCAG	2	8	42822	42829	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_002682	CGCT	2	8	43237	43244	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_002682	CATC	2	8	43421	43428	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_002682	GTTC	2	8	43444	43451	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_002682	TCCC	2	8	45104	45111	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_002682	TTGT	2	8	45154	45161	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002682	GTTT	2	8	45458	45465	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002682	CCAG	2	8	45566	45573	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_002682	ATCG	2	8	45777	45784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_002682	GAAG	2	8	46091	46098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002682	GAGC	2	8	46902	46909	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_002682	CGTC	2	8	47927	47934	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_002682	TTGA	2	8	48220	48227	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002682	TGCT	2	8	48652	48659	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_002682	GCCG	2	8	49650	49657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_002682	TCGC	2	8	49934	49941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_002682	GCAG	2	8	50400	50407	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_002682	AGCA	2	8	51305	51312	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_002682	GCCT	2	8	51645	51652	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_002682	GGAG	2	8	52694	52701	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002682	GCTC	2	8	52710	52717	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_002682	GCGA	2	8	54389	54396	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_002682	GCGA	2	8	55901	55908	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_002682	GAGC	2	8	56884	56891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_002682	CGAT	2	8	57235	57242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_002682	TGAC	2	8	57285	57292	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_002682	GTTC	2	8	61112	61119	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_002682	GCTC	2	8	61134	61141	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_002682	CGAC	2	8	61617	61624	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_002682	TCGG	2	8	61696	61703	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_002682	CGCA	2	8	61761	61768	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_002682	TGGC	2	8	63942	63949	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_002682	CGAC	2	8	63952	63959	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_002682	TCGG	2	8	64242	64249	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_002682	AGCG	2	8	64292	64299	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_002682	CCTC	2	8	64678	64685	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_002682	CGGG	2	8	64841	64848	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_002682	AGCG	2	8	64913	64920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_002682	ATTG	2	8	66090	66097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002682	TTGC	2	8	66959	66966	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_002682	TTGC	2	8	67125	67132	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_002682	CGCC	2	8	67140	67147	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_002682	GTTA	2	8	69317	69324	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002682	CAGT	2	8	69333	69340	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_002682	CTGC	2	8	69498	69505	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_002682	CGAT	2	8	69713	69720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_002682	GGAC	2	8	69913	69920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_002682	AGGA	2	8	70933	70940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002682	TGCT	2	8	71955	71962	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_002682	GCCC	2	8	71982	71989	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
84	NC_002682	CCGC	2	8	72111	72118	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_002682	CTCG	2	8	76968	76975	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_002682	GCGA	2	8	77052	77059	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_002682	CATA	2	8	82054	82061	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_002682	CGTT	2	8	86198	86205	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_002682	AAGT	2	8	86570	86577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002682	GCTG	2	8	86630	86637	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_002682	TTCG	2	8	87522	87529	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_002682	CGAC	2	8	87618	87625	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_002682	CGAC	2	8	88769	88776	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_002682	CTGG	2	8	90592	90599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_002682	CAGG	2	8	93384	93391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_002682	GCTG	2	8	93631	93638	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_002682	GGCC	2	8	93729	93736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_002682	GATC	2	8	93843	93850	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_002682	CAAA	2	8	94676	94683	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_002682	GAAA	2	8	94851	94858	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002682	CCCT	2	8	96050	96057	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
102	NC_002682	TCGC	2	8	96081	96088	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_002682	TAGC	2	8	96326	96333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_002682	CTCG	2	8	102274	102281	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_002682	CAGT	2	8	102365	102372	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_002682	CCTC	2	8	103286	103293	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
107	NC_002682	GCCC	2	8	103927	103934	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
108	NC_002682	CCCT	2	8	104041	104048	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_002682	GGCC	2	8	104215	104222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_002682	TTCG	2	8	109562	109569	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_002682	CGAG	2	8	109910	109917	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_002682	GGGA	2	8	110276	110283	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002682	TTCA	2	8	110418	110425	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_002682	GCGG	2	8	110737	110744	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_002682	GGAA	2	8	111136	111143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002682	TAAA	2	8	113729	113736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002682	GATC	2	8	113782	113789	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_002682	GGAA	2	8	116730	116737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002682	GCGG	2	8	118730	118737	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_002682	CGGA	2	8	118791	118798	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_002682	ACCA	2	8	118885	118892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_002682	CGGG	2	8	128782	128789	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_002682	GGAC	2	8	129891	129898	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_002682	TCGA	2	8	130995	131002	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_002682	CCTT	2	8	131861	131868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_002682	GCTG	2	8	131954	131961	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_002682	ACGA	2	8	132106	132113	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_002682	AAGC	2	8	132379	132386	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_002682	GCCG	2	8	132613	132620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_002682	AATG	2	8	132680	132687	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002682	CAGC	2	8	132816	132823	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_002682	TGGA	2	8	135843	135850	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002682	TCCA	2	8	135890	135897	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_002682	TCCC	2	8	137177	137184	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
135	NC_002682	GCCA	2	8	137422	137429	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_002682	CGAT	2	8	137488	137495	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_002682	TTCA	2	8	138251	138258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_002682	TCGC	2	8	139241	139248	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_002682	GCGA	2	8	139259	139266	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_002682	GCCA	2	8	144150	144157	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_002682	TCAC	2	8	148064	148071	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_002682	TCCA	2	8	150283	150290	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_002682	CGGC	2	8	151345	151352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_002682	GAGC	2	8	151493	151500	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_002682	GACC	2	8	151913	151920	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_002682	TGCC	2	8	152565	152572	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_002682	ACGC	2	8	152813	152820	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_002682	GAAG	2	8	155418	155425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002682	GCCG	2	8	155738	155745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_002682	GGCA	2	8	155824	155831	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_002682	CGAT	2	8	155864	155871	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_002682	CAGC	2	8	158460	158467	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_002682	CGGC	2	8	158590	158597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_002682	CTGC	2	8	158613	158620	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
155	NC_002682	CGGT	2	8	158925	158932	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_002682	CCGA	2	8	159104	159111	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
157	NC_002682	CCGA	2	8	160162	160169	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
158	NC_002682	TCTG	2	8	162475	162482	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
159	NC_002682	CTGG	2	8	166982	166989	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
160	NC_002682	CGTT	2	8	168180	168187	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
161	NC_002682	GATC	2	8	169364	169371	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_002682	GGTT	2	8	169742	169749	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
163	NC_002682	TGCT	2	8	174536	174543	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
164	NC_002682	CGAC	2	8	174544	174551	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
165	NC_002682	CTAG	2	8	177280	177287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
166	NC_002682	CGCT	2	8	178581	178588	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
167	NC_002682	GTCA	2	8	183382	183389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
168	NC_002682	GAAT	2	8	183559	183566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
169	NC_002682	GCAC	2	8	186027	186034	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
170	NC_002682	GATC	2	8	186185	186192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
171	NC_002682	ATCA	2	8	187448	187455	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
172	NC_002682	GGAA	2	8	188973	188980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
173	NC_002682	CTCG	2	8	189497	189504	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
174	NC_002682	TCCG	2	8	191106	191113	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
175	NC_002682	GCCA	2	8	191387	191394	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
176	NC_002682	GCGG	2	8	191464	191471	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
177	NC_002682	ATTG	2	8	193242	193249	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
178	NC_002682	CTCC	2	8	193957	193964	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
179	NC_002682	TTGG	2	8	194135	194142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
180	NC_002682	GGGT	2	8	194160	194167	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
181	NC_002682	AATA	2	8	194520	194527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_002682	ATCG	2	8	195594	195601	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
183	NC_002682	AGAA	2	8	198027	198034	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
184	NC_002682	GGTT	2	8	199258	199265	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
185	NC_002682	GATC	2	8	205711	205718	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
186	NC_002682	CAAC	2	8	206702	206709	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
187	NC_002682	CGGC	2	8	207247	207254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
188	NC_002682	ACAA	2	8	207338	207345	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
189	NC_002682	GGAC	2	8	207825	207832	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
190	NC_002682	TCCA	2	8	208074	208081	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.