MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002679	AG	3	6	3362	3367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002679	GC	3	6	6310	6315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_002679	CG	3	6	8388	8393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_002679	CG	3	6	8565	8570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_002679	TC	4	8	8659	8666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_002679	TG	3	6	9214	9219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002679	TC	3	6	9582	9587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_002679	CT	3	6	18927	18932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_002679	CG	3	6	22259	22264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_002679	GC	3	6	28238	28243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_002679	CA	3	6	29078	29083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_002679	AG	3	6	29116	29121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002679	TC	3	6	39887	39892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_002679	GC	4	8	40155	40162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_002679	GC	3	6	40386	40391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_002679	GC	3	6	40421	40426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_002679	GC	3	6	41529	41534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_002679	AC	3	6	43454	43459	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_002679	CG	3	6	44961	44966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_002679	GC	3	6	44996	45001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_002679	GC	3	6	48418	48423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_002679	GA	3	6	53923	53928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002679	GT	3	6	59284	59289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002679	GC	3	6	61410	61415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_002679	GA	3	6	61616	61621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002679	CG	3	6	62916	62921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_002679	TG	3	6	65277	65282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002679	GT	3	6	69112	69117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002679	GC	3	6	69157	69162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_002679	GC	3	6	69706	69711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_002679	GC	4	8	71011	71018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_002679	GA	3	6	71032	71037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002679	GC	3	6	71785	71790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_002679	CA	3	6	74667	74672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_002679	CT	3	6	86703	86708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_002679	GC	4	8	87809	87816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_002679	GC	3	6	89975	89980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_002679	GC	3	6	91615	91620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_002679	AG	4	8	95453	95460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002679	GA	3	6	95915	95920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002679	AG	3	6	96062	96067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002679	AG	3	6	97422	97427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002679	CG	3	6	98522	98527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_002679	GT	3	6	100885	100890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002679	CG	3	6	101661	101666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_002679	GA	3	6	108202	108207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002679	GC	3	6	109998	110003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_002679	AT	3	6	110079	110084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002679	GA	3	6	121510	121515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002679	GA	3	6	121808	121813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002679	TG	3	6	122357	122362	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002679	AG	3	6	137981	137986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002679	TG	3	6	158445	158450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002679	GC	3	6	160138	160143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_002679	GC	4	8	166265	166272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_002679	GC	3	6	166393	166398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_002679	AT	3	6	168979	168984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002679	CA	3	6	169686	169691	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_002679	GC	3	6	171263	171268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_002679	CG	3	6	172303	172308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_002679	TC	3	6	172315	172320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_002679	TC	3	6	175511	175516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_002679	AC	3	6	177957	177962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_002679	GA	3	6	178325	178330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002679	GC	3	6	179220	179225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_002679	GA	3	6	179385	179390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002679	GA	4	8	179469	179476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002679	TC	3	6	188415	188420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_002679	TC	3	6	189332	189337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_002679	TA	3	6	189533	189538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002679	GC	3	6	195154	195159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_002679	TG	3	6	195414	195419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002679	CT	3	6	195495	195500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_002679	GA	4	8	196100	196107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002679	AT	3	6	199785	199790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002679	CG	3	6	202947	202952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_002679	GA	3	6	205481	205486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002679	GC	3	6	205801	205806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_002679	CA	3	6	205869	205874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_002679	CA	3	6	207632	207637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_002679	CG	3	6	212828	212833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_002679	GT	3	6	212957	212962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002679	GC	3	6	213095	213100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_002679	GC	4	8	217277	217284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_002679	GA	3	6	217814	217819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002679	TC	4	8	219494	219501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_002679	AT	3	6	219676	219681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002679	CT	3	6	224156	224161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_002679	CG	3	6	227711	227716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_002679	CG	3	6	227980	227985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_002679	GC	3	6	227998	228003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_002679	CA	3	6	228015	228020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_002679	GC	3	6	242048	242053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_002679	GC	3	6	242822	242827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_002679	GA	3	6	242828	242833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002679	AG	3	6	242834	242839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002679	AG	3	6	243803	243808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002679	CA	3	6	245637	245642	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_002679	CG	3	6	262525	262530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_002679	CG	3	6	262734	262739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_002679	GC	3	6	265536	265541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_002679	TC	3	6	267044	267049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_002679	CG	4	8	267151	267158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_002679	CG	3	6	267793	267798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_002679	TC	3	6	270207	270212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_002679	GC	4	8	277207	277214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_002679	CG	3	6	279500	279505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_002679	GC	3	6	281357	281362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_002679	AC	3	6	283269	283274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_002679	CG	3	6	283282	283287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_002679	CG	3	6	286981	286986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_002679	GA	3	6	293436	293441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002679	CG	3	6	296574	296579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_002679	CG	3	6	297883	297888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_002679	TC	3	6	298879	298884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_002679	CA	3	6	298928	298933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_002679	GA	3	6	299620	299625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002679	CG	3	6	300599	300604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_002679	CG	3	6	302961	302966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_002679	GC	3	6	303106	303111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_002679	CT	3	6	305422	305427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_002679	GA	3	6	308986	308991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002679	CG	3	6	311942	311947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_002679	GC	3	6	311959	311964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_002679	GC	3	6	312207	312212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_002679	GC	3	6	313396	313401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_002679	GC	3	6	313447	313452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_002679	AT	3	6	315335	315340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002679	GC	3	6	315455	315460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_002679	CG	3	6	323428	323433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_002679	AT	3	6	324795	324800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002679	GA	3	6	326464	326469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002679	TG	3	6	326609	326614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002679	AG	3	6	331919	331924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002679	GA	3	6	334604	334609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002679	GC	3	6	341465	341470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_002679	AT	3	6	348056	348061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002679	GC	3	6	348601	348606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_002679	GC	3	6	348622	348627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_002679	CT	3	6	349159	349164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_002679	AC	3	6	351173	351178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_002679	GC	3	6	351225	351230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_002679	CG	3	6	351403	351408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_002679	GA	3	6	351578	351583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.