MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002679	GAA	2	6	17	22	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002679	CTT	2	6	50	55	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002679	GTT	2	6	255	260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002679	GCA	2	6	387	392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_002679	TAT	2	6	447	452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002679	TAC	3	9	529	537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_002679	CGC	2	6	552	557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_002679	TCA	2	6	562	567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_002679	TCA	2	6	569	574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_002679	CGG	2	6	576	581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_002679	TGG	2	6	688	693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002679	ATT	2	6	799	804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002679	CAT	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_002679	GGC	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_002679	GCT	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_002679	ATC	2	6	1225	1230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_002679	GCA	2	6	1294	1299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_002679	CAT	2	6	1412	1417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_002679	CAA	2	6	1674	1679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_002679	TCG	2	6	1832	1837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_002679	AAC	2	6	1951	1956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_002679	AAG	2	6	1985	1990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002679	ATA	2	6	2010	2015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002679	GGT	2	6	2062	2067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002679	AGG	2	6	2125	2130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002679	CGA	2	6	3267	3272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_002679	ATC	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_002679	CGG	2	6	3290	3295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_002679	GCA	2	6	3545	3550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_002679	GCG	2	6	3601	3606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_002679	GTC	2	6	3609	3614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_002679	ACC	2	6	3654	3659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_002679	TGC	2	6	3712	3717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_002679	CAA	2	6	3783	3788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_002679	CCG	3	9	4161	4169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_002679	CGT	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_002679	CAT	2	6	4179	4184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_002679	TGG	2	6	4198	4203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002679	CGC	2	6	4307	4312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_002679	CGG	2	6	4414	4419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_002679	GCC	2	6	6192	6197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_002679	AGC	2	6	6222	6227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_002679	ACG	2	6	6249	6254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_002679	AGA	2	6	6282	6287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002679	AAG	2	6	6348	6353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002679	TAC	2	6	6452	6457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_002679	TCT	2	6	6468	6473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_002679	AGT	2	6	6480	6485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002679	CTG	2	6	7972	7977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_002679	TGC	2	6	8059	8064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_002679	CAG	2	6	8251	8256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_002679	GCG	2	6	8360	8365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_002679	TTC	2	6	8493	8498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_002679	GCC	2	6	8518	8523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_002679	GAC	2	6	8547	8552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_002679	CGT	2	6	8634	8639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_002679	CGG	2	6	8683	8688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_002679	CGG	2	6	8777	8782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_002679	GCG	2	6	8923	8928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_002679	GAA	2	6	8956	8961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002679	TAC	2	6	9033	9038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_002679	CGC	2	6	9197	9202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_002679	CAG	2	6	9388	9393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_002679	GCC	2	6	9495	9500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_002679	TGC	2	6	12062	12067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_002679	TGA	2	6	12092	12097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002679	GAC	2	6	12112	12117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_002679	TCG	2	6	12159	12164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_002679	GCG	2	6	12165	12170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_002679	GCG	2	6	12172	12177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_002679	GGC	2	6	12183	12188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_002679	CCG	2	6	12222	12227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_002679	GCC	2	6	12249	12254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_002679	TCT	2	6	14655	14660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_002679	CCG	2	6	19006	19011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_002679	TCG	2	6	20108	20113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_002679	TGC	2	6	20142	20147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_002679	CGA	2	6	20205	20210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_002679	CAA	2	6	20512	20517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_002679	CGA	2	6	20604	20609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_002679	AGT	2	6	20670	20675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002679	CAA	2	6	20685	20690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_002679	GAC	2	6	22065	22070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_002679	CAC	2	6	22076	22081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_002679	CTG	2	6	22088	22093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_002679	ATC	2	6	22188	22193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_002679	GCA	2	6	22216	22221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_002679	GCC	2	6	22234	22239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_002679	TAA	2	6	22276	22281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002679	GAA	2	6	22757	22762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002679	GGT	2	6	22780	22785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002679	TGC	2	6	25814	25819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_002679	GAA	2	6	25863	25868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002679	CAC	2	6	27982	27987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_002679	GCC	2	6	28034	28039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_002679	TTG	2	6	28041	28046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002679	GAC	2	6	28087	28092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_002679	AGC	2	6	28109	28114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_002679	CGC	2	6	28184	28189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_002679	CGC	2	6	28212	28217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_002679	TCT	2	6	28259	28264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_002679	GTC	2	6	28324	28329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_002679	GTC	2	6	39264	39269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_002679	CAC	2	6	39300	39305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_002679	CCG	2	6	39334	39339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_002679	AGC	2	6	39761	39766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_002679	GAA	2	6	39773	39778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002679	GAA	2	6	39787	39792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002679	CCG	2	6	39910	39915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_002679	GCT	2	6	39956	39961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_002679	CGT	2	6	40290	40295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_002679	GAT	2	6	40306	40311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002679	GCA	2	6	40402	40407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_002679	GTC	2	6	40440	40445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_002679	TCA	2	6	41566	41571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_002679	AGG	2	6	41659	41664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002679	TTG	2	6	41745	41750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002679	GAT	2	6	41759	41764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002679	AGC	2	6	42278	42283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_002679	CGA	2	6	42342	42347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_002679	CTG	2	6	42349	42354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_002679	CGT	2	6	42417	42422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_002679	GTT	2	6	42464	42469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002679	AGC	2	6	42477	42482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_002679	GTT	2	6	42500	42505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002679	CAT	2	6	42565	42570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_002679	TAA	2	6	42627	42632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002679	GCT	2	6	42725	42730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_002679	GCT	2	6	42989	42994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_002679	ACC	2	6	43169	43174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_002679	GCT	2	6	43421	43426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_002679	GGC	2	6	43533	43538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_002679	CCG	3	9	43545	43553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_002679	GGT	2	6	43595	43600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002679	CTG	2	6	44904	44909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_002679	CTG	2	6	45070	45075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_002679	CCG	2	6	45147	45152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_002679	TCG	2	6	46019	46024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_002679	GCC	2	6	46095	46100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_002679	CGC	2	6	46127	46132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_002679	ACC	2	6	46133	46138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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