MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 plasmid large ECE

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001732	TATAA	2	10	1766	1775	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001732	TAATT	2	10	3752	3761	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001732	AATAA	2	10	7736	7745	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001732	TGATA	2	10	10235	10244	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001732	TTTTG	2	10	10589	10598	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001732	TCAAA	2	10	12583	12592	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_001732	CTCCC	2	10	14026	14035	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
8	NC_001732	AAAAT	2	10	16973	16982	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001732	TATAA	2	10	17286	17295	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001732	ATATT	2	10	17410	17419	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001732	TTTGT	3	15	17749	17763	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001732	AAATA	2	10	18215	18224	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001732	AAAAC	2	10	18237	18246	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_001732	AAAAG	2	10	18717	18726	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001732	GTTTA	2	10	19354	19363	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001732	ATTGA	2	10	19835	19844	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001732	TACAA	2	10	20218	20227	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_001732	CAATA	2	10	20244	20253	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_001732	ATTAT	2	10	22268	22277	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001732	AAATC	2	10	24713	24722	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_001732	TAATG	2	10	28013	28022	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001732	AAAAG	2	10	31173	31182	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001732	CAATA	2	10	35466	35475	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_001732	AAAAG	2	10	35874	35883	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001732	CATCA	2	10	36727	36736	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_001732	TTTGG	2	10	37113	37122	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001732	CTCCC	2	10	38167	38176	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
28	NC_001732	TTGTT	2	10	38317	38326	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001732	TATTG	2	10	38403	38412	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001732	AAATT	2	10	42148	42157	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001732	AAAAC	2	10	45197	45206	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_001732	ATAAA	2	10	45256	45265	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001732	GGGGA	2	10	45325	45334	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001732	GGAAT	2	10	55996	56005	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.