MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 8228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_000962	CCG	2	6	3458134	3458139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6502	NC_000962	GCG	2	6	3458148	3458153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_000962	TTC	2	6	3458159	3458164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6504	NC_000962	GGC	2	6	3463893	3463898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_000962	TGA	2	6	3463902	3463907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_000962	ACC	2	6	3463929	3463934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6507	NC_000962	TGG	2	6	3463964	3463969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_000962	TTG	2	6	3464467	3464472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_000962	AGT	2	6	3467175	3467180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_000962	GAG	2	6	3468108	3468113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_000962	ACG	2	6	3468256	3468261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_000962	GGT	2	6	3468267	3468272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_000962	CGC	2	6	3468374	3468379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6514	NC_000962	CAA	2	6	3468383	3468388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_000962	GCCCA	2	10	3473950	3473959	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6516	NC_000962	CCG	2	6	3476997	3477002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6517	NC_000962	ACC	2	6	3477006	3477011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6518	NC_000962	CGA	2	6	3477025	3477030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6519	NC_000962	CCA	2	6	3477053	3477058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6520	NC_000962	TGCGC	2	10	3477525	3477534	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6521	NC_000962	GTTA	2	8	3477566	3477573	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_000962	CT	3	6	3477588	3477593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6523	NC_000962	GGA	2	6	3477624	3477629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_000962	GAT	2	6	3477637	3477642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_000962	CGAA	2	8	3478731	3478738	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6526	NC_000962	AGGA	2	8	3478768	3478775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_000962	TCG	2	6	3479985	3479990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6528	NC_000962	CGC	2	6	3480045	3480050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6529	NC_000962	AGG	2	6	3481318	3481323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_000962	GTG	2	6	3481342	3481347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_000962	AGT	2	6	3481384	3481389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_000962	AGG	2	6	3482761	3482766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_000962	AGGA	2	8	3485117	3485124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_000962	TTG	2	6	3486203	3486208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_000962	ACCG	2	8	3486250	3486257	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6536	NC_000962	CGC	2	6	3486258	3486263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6537	NC_000962	CAG	2	6	3486311	3486316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_000962	CG	3	6	3486380	3486385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6539	NC_000962	CGAG	2	8	3486389	3486396	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6540	NC_000962	GAG	2	6	3486499	3486504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_000962	GCC	2	6	3487757	3487762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6542	NC_000962	GCTCCT	2	12	3487778	3487789	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6543	NC_000962	CTC	2	6	3487877	3487882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6544	NC_000962	GGC	2	6	3487936	3487941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_000962	TCA	2	6	3487942	3487947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_000962	CGGCG	2	10	3487977	3487986	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6547	NC_000962	TGA	2	6	3488015	3488020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_000962	GGGT	2	8	3488039	3488046	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_000962	GTAG	2	8	3488060	3488067	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_000962	CCG	2	6	3489099	3489104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6551	NC_000962	GAGAT	2	10	3489141	3489150	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_000962	CAC	2	6	3489172	3489177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6553	NC_000962	CCGT	2	8	3489212	3489219	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6554	NC_000962	CGG	2	6	3489260	3489265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_000962	GTC	2	6	3489289	3489294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6556	NC_000962	AGG	2	6	3489308	3489313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_000962	GGC	3	9	3489357	3489365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_000962	TTG	2	6	3489371	3489376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_000962	CGG	2	6	3489428	3489433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6560	NC_000962	GGAGT	2	10	3489471	3489480	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_000962	ACG	2	6	3489491	3489496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_000962	TGT	2	6	3490408	3490413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_000962	CA	3	6	3490441	3490446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6564	NC_000962	GCC	2	6	3491671	3491676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6565	NC_000962	GAAT	2	8	3491718	3491725	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6567	NC_000962	ATG	2	6	3491790	3491795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_000962	GGCA	2	8	3491797	3491804	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6569	NC_000962	GCT	2	6	3493236	3493241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_000962	GAG	2	6	3493264	3493269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_000962	CTG	2	6	3493345	3493350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6572	NC_000962	GCG	2	6	3493389	3493394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6573	NC_000962	CGG	3	9	3493418	3493426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6575	NC_000962	CGG	2	6	3493530	3493535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6578	NC_000962	TGG	2	6	3493593	3493598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_000962	TGA	2	6	3493662	3493667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6581	NC_000962	GTT	2	6	3493774	3493779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6584	NC_000962	GTG	2	6	3493953	3493958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_000962	TCG	3	9	3493965	3493973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6586	NC_000962	AC	3	6	3493974	3493979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6589	NC_000962	AC	3	6	3494094	3494099	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6593	NC_000962	CG	3	6	3494300	3494305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6595	NC_000962	CTT	2	6	3494362	3494367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_000962	CTG	2	6	3494396	3494401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6597	NC_000962	CG	3	6	3494410	3494415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6598	NC_000962	ACG	2	6	3494448	3494453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6599	NC_000962	CGA	2	6	3494543	3494548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6601	NC_000962	TCGG	2	8	3494605	3494612	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6602	NC_000962	ACC	2	6	3494619	3494624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6603	NC_000962	TGA	2	6	3494630	3494635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_000962	GAG	2	6	3496427	3496432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_000962	TCC	2	6	3496454	3496459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6606	NC_000962	CG	3	6	3496498	3496503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6607	NC_000962	CAC	2	6	3499921	3499926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6609	NC_000962	CGGC	2	8	3501084	3501091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6610	NC_000962	CCG	2	6	3501114	3501119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6611	NC_000962	GCCC	2	8	3501142	3501149	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6612	NC_000962	CAA	2	6	3501188	3501193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6613	NC_000962	G	6	6	3501247	3501252	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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6622	NC_000962	GCT	2	6	3511338	3511343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6624	NC_000962	TGC	2	6	3511407	3511412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6625	NC_000962	CGAC	2	8	3511483	3511490	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6626	NC_000962	GCC	2	6	3511640	3511645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6627	NC_000962	GGC	2	6	3511651	3511656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6628	NC_000962	ACG	2	6	3511662	3511667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6755	NC_000962	CGC	2	6	3572567	3572572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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