MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 8228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_000962	GCCG	2	8	3193273	3193280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6002	NC_000962	AGGCC	2	10	3193281	3193290	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6003	NC_000962	CAA	2	6	3193325	3193330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_000962	GTTCT	2	10	3193341	3193350	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6005	NC_000962	GTT	2	6	3200006	3200011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_000962	GGA	2	6	3200065	3200070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_000962	CCG	2	6	3200086	3200091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_000962	CCG	2	6	3200161	3200166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6009	NC_000962	AGT	2	6	3200182	3200187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_000962	CGA	2	6	3200233	3200238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_000962	GCG	3	9	3200256	3200264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_000962	TCCC	2	8	3202027	3202034	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6013	NC_000962	GCCG	2	8	3202037	3202044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6014	NC_000962	GTC	2	6	3202156	3202161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_000962	GGC	2	6	3202209	3202214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_000962	GAAG	2	8	3202319	3202326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_000962	CGC	2	6	3204334	3204339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6018	NC_000962	TCC	2	6	3205236	3205241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_000962	GACCC	2	10	3205248	3205257	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6020	NC_000962	CGA	2	6	3208390	3208395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_000962	TCA	2	6	3208465	3208470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_000962	GGC	2	6	3208525	3208530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_000962	CAT	2	6	3208548	3208553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_000962	CGAC	3	12	3211749	3211760	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6025	NC_000962	CA	3	6	3211766	3211771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6026	NC_000962	GGC	2	6	3213879	3213884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_000962	C	6	6	3214289	3214294	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6028	NC_000962	GGT	2	6	3214308	3214313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_000962	GCA	2	6	3214351	3214356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_000962	GGC	2	6	3214357	3214362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_000962	ACC	2	6	3214377	3214382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6032	NC_000962	GACA	2	8	3214385	3214392	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6033	NC_000962	GGT	2	6	3214446	3214451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_000962	CG	3	6	3214514	3214519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_000962	GCC	2	6	3214578	3214583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_000962	CGGG	2	8	3217686	3217693	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6037	NC_000962	ACC	2	6	3217726	3217731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6038	NC_000962	GGC	2	6	3217733	3217738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_000962	GTC	2	6	3217756	3217761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_000962	GCC	2	6	3217774	3217779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6041	NC_000962	CAT	2	6	3219246	3219251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_000962	CTG	2	6	3219264	3219269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_000962	CGC	2	6	3221731	3221736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_000962	CG	3	6	3223555	3223560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_000962	CCG	2	6	3224687	3224692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6046	NC_000962	CCA	2	6	3226350	3226355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_000962	GGTT	2	8	3230711	3230718	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_000962	GAC	2	6	3232555	3232560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_000962	GTT	2	6	3232584	3232589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_000962	GCG	2	6	3232590	3232595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_000962	GCC	2	6	3232601	3232606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6052	NC_000962	TCA	2	6	3232612	3232617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_000962	GCG	2	6	3232668	3232673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_000962	CG	3	6	3232678	3232683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_000962	CCA	2	6	3232694	3232699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6056	NC_000962	GCG	2	6	3232724	3232729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_000962	CG	3	6	3232734	3232739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_000962	CCA	2	6	3232750	3232755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_000962	GCG	2	6	3232780	3232785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_000962	CG	3	6	3232790	3232795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6061	NC_000962	CCA	2	6	3232806	3232811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_000962	GCG	2	6	3232836	3232841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_000962	CG	3	6	3232846	3232851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6064	NC_000962	CTT	2	6	3238502	3238507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_000962	GA	4	8	3238553	3238560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_000962	TGA	2	6	3239475	3239480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_000962	GCG	2	6	3239489	3239494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_000962	TCA	2	6	3239512	3239517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_000962	TGA	2	6	3239530	3239535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_000962	GCG	2	6	3239544	3239549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_000962	TCA	2	6	3239567	3239572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_000962	TGA	2	6	3239585	3239590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_000962	GCG	2	6	3239599	3239604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_000962	TCA	2	6	3239646	3239651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_000962	TGA	2	6	3239664	3239669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_000962	GCG	2	6	3239678	3239683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_000962	TCA	2	6	3239725	3239730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_000962	TGA	2	6	3239743	3239748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_000962	GCG	2	6	3239757	3239762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_000962	TCA	2	6	3239811	3239816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_000962	CCT	2	6	3241968	3241973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6082	NC_000962	TGT	2	6	3241992	3241997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_000962	TGG	2	6	3242033	3242038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_000962	GT	3	6	3242044	3242049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_000962	CGA	2	6	3242069	3242074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_000962	CTG	2	6	3242103	3242108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_000962	CGG	2	6	3242129	3242134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_000962	CGT	2	6	3242151	3242156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_000962	ACCA	2	8	3243315	3243322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6090	NC_000962	CGGCA	2	10	3243332	3243341	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6091	NC_000962	CAC	3	9	3243369	3243377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6092	NC_000962	ACG	2	6	3243390	3243395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_000962	CGCC	2	8	3243440	3243447	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6094	NC_000962	TGC	2	6	3243537	3243542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_000962	A	6	6	3243652	3243657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_000962	CCG	2	6	3276232	3276237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6097	NC_000962	ATC	2	6	3276278	3276283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_000962	CAC	2	6	3276345	3276350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_000962	CGA	2	6	3282753	3282758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_000962	ACG	2	6	3282864	3282869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_000962	C	6	6	3282876	3282881	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6102	NC_000962	GTT	2	6	3282977	3282982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_000962	TGC	2	6	3283071	3283076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_000962	ATT	2	6	3283107	3283112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_000962	CGC	2	6	3283164	3283169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6106	NC_000962	GCG	2	6	3283174	3283179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_000962	CACAT	2	10	3283181	3283190	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6108	NC_000962	TGG	2	6	3283205	3283210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_000962	CTG	2	6	3283234	3283239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_000962	CGA	3	9	3287869	3287877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_000962	GTT	2	6	3287916	3287921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_000962	GC	3	6	3287939	3287944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_000962	GAT	2	6	3287975	3287980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_000962	ACG	2	6	3288130	3288135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_000962	CAA	2	6	3288226	3288231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_000962	CGC	2	6	3288234	3288239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6117	NC_000962	CTG	2	6	3288351	3288356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_000962	AGG	2	6	3288448	3288453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_000962	CCT	2	6	3291406	3291411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_000962	TCGCCG	2	12	3291432	3291443	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6121	NC_000962	CCT	2	6	3291463	3291468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6122	NC_000962	TCGCCG	2	12	3291489	3291500	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_000962	TTC	2	6	3300572	3300577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_000962	CTTC	2	8	3302459	3302466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6125	NC_000962	AG	3	6	3302480	3302485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_000962	GCTGC	2	10	3302492	3302501	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6127	NC_000962	CGCGA	2	10	3302554	3302563	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6128	NC_000962	GCTG	2	8	3302650	3302657	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6129	NC_000962	AC	3	6	3302674	3302679	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6130	NC_000962	GGCT	2	8	3302685	3302692	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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