MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 3924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_000916	AGC	2	6	1154553	1154558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_000916	TAG	2	6	1155084	1155089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_000916	TA	3	6	1155110	1155115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_000916	ATG	2	6	1155118	1155123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_000916	TATG	2	8	1155132	1155139	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_000916	ATG	2	6	1155146	1155151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_000916	ATT	2	6	1155160	1155165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_000916	AATT	2	8	1155195	1155202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_000916	TG	3	6	1155213	1155218	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_000916	TGA	2	6	1155235	1155240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_000916	ATTT	2	8	1155507	1155514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_000916	T	6	6	1155512	1155517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_000916	GGTTCA	2	12	1155518	1155529	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2514	NC_000916	ATA	2	6	1155569	1155574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_000916	GCT	2	6	1155581	1155586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_000916	CAG	2	6	1155619	1155624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_000916	ACAG	2	8	1155628	1155635	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2518	NC_000916	ACT	2	6	1155724	1155729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_000916	A	6	6	1157238	1157243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_000916	TTA	2	6	1157266	1157271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_000916	TTA	2	6	1157286	1157291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_000916	ATG	2	6	1157292	1157297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_000916	G	6	6	1158920	1158925	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_000916	TCA	2	6	1158992	1158997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_000916	GC	3	6	1159011	1159016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2526	NC_000916	TTC	2	6	1159020	1159025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_000916	GAT	2	6	1159045	1159050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2529	NC_000916	ATC	2	6	1159929	1159934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_000916	ATA	2	6	1159967	1159972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_000916	CTG	2	6	1159999	1160004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_000916	TGA	2	6	1160023	1160028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_000916	GGGGCC	2	12	1160033	1160044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_000916	ACCCC	2	10	1160095	1160104	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
2535	NC_000916	GAT	3	9	1160213	1160221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_000916	GAA	2	6	1160228	1160233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_000916	CCGG	2	8	1160258	1160265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2538	NC_000916	ACTAC	2	10	1160313	1160322	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2539	NC_000916	GCC	2	6	1160373	1160378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2540	NC_000916	CGC	2	6	1160424	1160429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2541	NC_000916	CTAC	2	8	1160475	1160482	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2542	NC_000916	CGG	2	6	1160490	1160495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_000916	CTTG	2	8	1160516	1160523	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2544	NC_000916	CAA	2	6	1160524	1160529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_000916	GGT	2	6	1160533	1160538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_000916	TA	3	6	1160584	1160589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_000916	ACT	2	6	1161094	1161099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_000916	ATG	2	6	1162232	1162237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_000916	ATA	3	9	1162238	1162246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_000916	GGA	2	6	1162276	1162281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_000916	TGG	2	6	1165028	1165033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_000916	TCTATC	2	12	1165757	1165768	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_000916	GCA	2	6	1165786	1165791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_000916	CTT	2	6	1165839	1165844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_000916	AGTAA	2	10	1165851	1165860	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_000916	ATG	2	6	1165875	1165880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_000916	TAGA	2	8	1167118	1167125	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_000916	ATAA	2	8	1169439	1169446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_000916	TA	3	6	1169984	1169989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_000916	A	6	6	1170051	1170056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_000916	GCG	2	6	1172427	1172432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_000916	T	7	7	1172484	1172490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_000916	TGA	2	6	1172496	1172501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_000916	AATT	2	8	1172504	1172511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_000916	TAG	2	6	1172514	1172519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_000916	T	6	6	1173690	1173695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_000916	AGTT	2	8	1173721	1173728	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_000916	AG	3	6	1173733	1173738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_000916	AAC	2	6	1173739	1173744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_000916	GAA	2	6	1173762	1173767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2573	NC_000916	GCA	2	6	1173945	1173950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2577	NC_000916	ATG	2	6	1174108	1174113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2583	NC_000916	TA	4	8	1175237	1175244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_000916	TAAA	2	8	1175255	1175262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2586	NC_000916	A	7	7	1179707	1179713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_000916	TTA	3	9	1179746	1179754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_000916	T	6	6	1179781	1179786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_000916	TA	3	6	1179806	1179811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2592	NC_000916	TAGCC	2	10	1181063	1181072	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2593	NC_000916	CGG	2	6	1181120	1181125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2595	NC_000916	TAGCC	2	10	1181161	1181170	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2596	NC_000916	CGG	2	6	1181218	1181223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_000916	ATTCTA	2	12	1181235	1181246	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2598	NC_000916	T	6	6	1181269	1181274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_000916	GAA	2	6	1181315	1181320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_000916	ATG	2	6	1181324	1181329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_000916	GAT	2	6	1181330	1181335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_000916	ATC	2	6	1182526	1182531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_000916	A	6	6	1182535	1182540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_000916	GGT	2	6	1182543	1182548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2607	NC_000916	ATG	2	6	1183167	1183172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_000916	TAT	2	6	1183213	1183218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_000916	T	6	6	1184813	1184818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_000916	ACC	2	6	1184868	1184873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2611	NC_000916	TGG	2	6	1184874	1184879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_000916	CTG	2	6	1184980	1184985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_000916	TCC	2	6	1186437	1186442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2614	NC_000916	TA	3	6	1186449	1186454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_000916	TA	3	6	1186477	1186482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2618	NC_000916	TCA	2	6	1187360	1187365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2620	NC_000916	CTTAC	2	10	1189292	1189301	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2621	NC_000916	TA	4	8	1189325	1189332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_000916	TAC	2	6	1189383	1189388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2624	NC_000916	AGCC	2	8	1189446	1189453	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2625	NC_000916	TTG	2	6	1191087	1191092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2628	NC_000916	CCA	2	6	1191193	1191198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2629	NC_000916	TA	3	6	1191207	1191212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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