MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 3924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_000916	ATT	2	6	700180	700185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_000916	GGA	2	6	700225	700230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_000916	AAAT	2	8	701886	701893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_000916	TAA	2	6	702354	702359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_000916	A	6	6	703614	703619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_000916	AT	3	6	708211	708216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_000916	ATTA	2	8	708736	708743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_000916	TAA	2	6	708757	708762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_000916	TTG	2	6	708799	708804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_000916	T	6	6	708889	708894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_000916	ATTT	2	8	708916	708923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_000916	TTA	2	6	708955	708960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_000916	A	7	7	708965	708971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_000916	TCC	2	6	710746	710751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_000916	TA	3	6	711177	711182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_000916	T	6	6	712090	712095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_000916	TTA	2	6	712109	712114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_000916	T	7	7	712117	712123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_000916	ATC	2	6	712128	712133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_000916	A	6	6	712167	712172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_000916	AAAAAG	2	12	712249	712260	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_000916	AAGTG	2	10	714230	714239	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_000916	TTAAAA	2	12	714241	714252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_000916	TTAC	2	8	714289	714296	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1525	NC_000916	AT	3	6	714311	714316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_000916	CCA	2	6	714342	714347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1527	NC_000916	TCAG	2	8	715696	715703	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_000916	AG	3	6	717451	717456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_000916	A	7	7	717471	717477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_000916	AT	3	6	717485	717490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_000916	TAA	2	6	718890	718895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_000916	T	6	6	718975	718980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_000916	TAA	2	6	718987	718992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_000916	TCTT	2	8	719080	719087	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1535	NC_000916	AT	3	6	719839	719844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1541	NC_000916	AT	3	6	720318	720323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_000916	TA	4	8	720328	720335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_000916	TAG	2	6	720349	720354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1545	NC_000916	AAT	2	6	720382	720387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1548	NC_000916	T	8	8	722714	722721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1550	NC_000916	TC	3	6	722877	722882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_000916	GCT	2	6	724640	724645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_000916	AGA	2	6	724651	724656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_000916	CAGAA	2	10	727288	727297	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1554	NC_000916	AGA	2	6	727307	727312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1556	NC_000916	CAT	2	6	729822	729827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1558	NC_000916	A	7	7	731939	731945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1562	NC_000916	TCA	2	6	733441	733446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_000916	TA	3	6	733473	733478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_000916	TAA	2	6	733496	733501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_000916	GAA	2	6	734491	734496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_000916	CTT	2	6	734787	734792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_000916	AATT	2	8	734797	734804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_000916	TGA	2	6	735939	735944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_000916	TGA	2	6	735997	736002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1572	NC_000916	TA	3	6	740254	740259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_000916	TAA	2	6	740272	740277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_000916	CAGA	2	8	740289	740296	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1590	NC_000916	T	7	7	746507	746513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_000916	TGC	2	6	749420	749425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1601	NC_000916	ATC	2	6	749486	749491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_000916	C	8	8	749498	749505	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1603	NC_000916	TA	3	6	749521	749526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_000916	GGT	2	6	749561	749566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1607	NC_000916	A	6	6	749748	749753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_000916	ACT	2	6	749767	749772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1611	NC_000916	CAT	2	6	749903	749908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_000916	TCAG	2	8	749917	749924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1613	NC_000916	A	6	6	751262	751267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1615	NC_000916	CAT	2	6	753139	753144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_000916	GAAT	2	8	756304	756311	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_000916	T	6	6	756330	756335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_000916	GA	3	6	756336	756341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_000916	A	7	7	756380	756386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_000916	ATTT	2	8	756402	756409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_000916	C	6	6	756461	756466	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1627	NC_000916	TGA	2	6	763414	763419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_000916	AC	3	6	763454	763459	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1631	NC_000916	TAA	2	6	765484	765489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_000916	A	6	6	765506	765511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1636	NC_000916	TGG	2	6	768435	768440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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