MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma pneumoniae M129 chromosome

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000912	TGGTAA	2	12	14305	14316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000912	TATTTT	2	12	15819	15830	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000912	TACTTT	2	12	46421	46432	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_000912	AAAAAT	2	12	47076	47087	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000912	TAACTG	2	12	52461	52472	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_000912	TTTTAA	2	12	61951	61962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000912	TCTTAA	2	12	69099	69110	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_000912	AAATTT	2	12	107207	107218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000912	TAAATA	2	12	110450	110461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000912	AAGCAG	2	12	115056	115067	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_000912	TTAACT	2	12	115570	115581	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_000912	GGCGAA	2	12	119033	119044	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_000912	TTATGC	2	12	126265	126276	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_000912	AAAACA	2	12	126461	126472	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_000912	ACGGGC	2	12	127821	127832	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_000912	CCCAGC	2	12	128938	128949	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_000912	CAAGCT	2	12	129393	129404	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_000912	GGAAGG	2	12	132479	132490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000912	TTCCAC	2	12	132888	132899	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_000912	AAAATA	2	12	134907	134918	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000912	AGAAAA	2	12	144679	144690	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000912	GTTTTC	2	12	164290	164301	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_000912	CACCGC	2	12	165830	165841	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_000912	GGCAGT	2	12	166083	166094	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_000912	ATCTGG	2	12	166575	166586	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_000912	CACCCC	2	12	166825	166836	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
27	NC_000912	TTAAAC	2	12	179846	179857	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_000912	CAACTA	2	12	195004	195015	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_000912	TTTTTA	2	12	196366	196377	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000912	CCCAAC	3	18	247129	247146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_000912	CAAGCT	2	12	247590	247601	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_000912	TTTTTC	2	12	253452	253463	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_000912	ATTTTG	2	12	253529	253540	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000912	CTTTTT	2	12	265838	265849	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_000912	GTTTGG	2	12	265887	265898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000912	TAGTTT	2	12	284485	284496	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000912	AACAGT	2	12	324071	324082	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_000912	ATTTAC	2	12	334777	334788	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_000912	ATGCTA	2	12	335216	335227	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_000912	AAAATG	2	12	335414	335425	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000912	CCCAAC	2	12	343117	343128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_000912	GCTCAG	2	12	343216	343227	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_000912	GTATTA	2	12	359682	359693	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000912	TACCCG	2	12	360598	360609	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_000912	TCATTT	2	12	364128	364139	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_000912	AAATTA	2	12	364173	364184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000912	ATTTAA	2	12	372715	372726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000912	TAAAAT	2	12	407788	407799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000912	AGAAAA	2	12	415423	415434	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000912	GGAAGG	2	12	437489	437500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000912	AAGCAG	2	12	438256	438267	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_000912	GCAAAT	2	12	440924	440935	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_000912	ATCTGG	2	12	443868	443879	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_000912	CACCCC	2	12	444107	444118	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
55	NC_000912	TAAAAG	2	12	483404	483415	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000912	GCAACT	2	12	490194	490205	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_000912	CAAGCT	2	12	494629	494640	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_000912	AAAATA	2	12	495151	495162	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000912	CAAATA	2	12	495251	495262	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_000912	TTTTTA	2	12	521686	521697	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000912	TTTCGT	2	12	529654	529665	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_000912	ACCATT	2	12	559230	559241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_000912	TTAACC	2	12	560027	560038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_000912	GTTCTT	2	12	560056	560067	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_000912	GAAGGG	2	12	560945	560956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000912	CGGATG	2	12	561715	561726	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_000912	AATATA	2	12	564365	564376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000912	ATTGTT	2	12	583385	583396	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000912	ATCTTA	2	12	586720	586731	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_000912	AGGTGA	2	12	596388	596399	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000912	CAAGCT	2	12	608102	608113	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_000912	CAAGGC	2	12	611418	611429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_000912	AAGCAG	2	12	611793	611804	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_000912	ATTTAA	2	12	624754	624765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000912	AATTTT	2	12	690504	690515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000912	TAATAT	2	12	690516	690527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000912	AAATAA	2	12	697730	697741	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000912	ATTTAA	2	12	716550	716561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000912	CTGTTT	2	12	774285	774296	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_000912	AAAAGT	2	12	776029	776040	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000912	GAAAAA	2	12	780985	780996	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_000912	CCTTTT	2	12	797681	797692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.