MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium kansasii ATCC 12478 plasmid pMK12478

Total Repeats: 3145

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022654	GCG	3	9	48009	48017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559760
1002	NC_022654	TTC	2	6	48075	48080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556559761
1003	NC_022654	CAC	2	6	48113	48118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556559761
1004	NC_022654	CTCC	2	8	48144	48151	0 %	25 %	0 %	75 %	556559761
1005	NC_022654	GCC	2	6	48152	48157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559761
1006	NC_022654	GCG	2	6	48190	48195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559761
1007	NC_022654	CGG	2	6	48197	48202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559761
1008	NC_022654	GCGA	2	8	48220	48227	25 %	0 %	50 %	25 %	556559761
1009	NC_022654	GAC	2	6	48240	48245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559761
1010	NC_022654	CGGCCC	2	12	48263	48274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559761
1011	NC_022654	CGA	2	6	48278	48283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559761
1012	NC_022654	TGA	2	6	48287	48292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556559761
1013	NC_022654	GAC	3	9	48309	48317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559761
1014	NC_022654	AC	3	6	48316	48321	50 %	0 %	0 %	50 %	556559761
1015	NC_022654	CCA	2	6	48380	48385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556559761
1016	NC_022654	C	6	6	48436	48441	0 %	0 %	0 %	100 %	556559761
1017	NC_022654	ACA	2	6	48445	48450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556559761
1018	NC_022654	AGA	2	6	48451	48456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556559761
1019	NC_022654	TCA	2	6	48475	48480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556559761
1020	NC_022654	GGC	2	6	48485	48490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559761
1021	NC_022654	CTG	2	6	48513	48518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559761
1022	NC_022654	AGC	2	6	48547	48552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559761
1023	NC_022654	GCC	2	6	48591	48596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559761
1024	NC_022654	ACC	2	6	48606	48611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556559761
1025	NC_022654	CTGC	2	8	48665	48672	0 %	25 %	25 %	50 %	556559761
1026	NC_022654	ACC	2	6	48711	48716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556559761
1027	NC_022654	CGG	2	6	48737	48742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559761
1028	NC_022654	TCA	2	6	48763	48768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556559761
1029	NC_022654	TGG	2	6	48784	48789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556559761
1030	NC_022654	ACG	2	6	48892	48897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559761
1031	NC_022654	CAG	2	6	48962	48967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559761
1032	NC_022654	ATC	2	6	48987	48992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556559761
1033	NC_022654	GC	3	6	49013	49018	0 %	0 %	50 %	50 %	556559761
1034	NC_022654	CCG	2	6	49021	49026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559761
1035	NC_022654	CAC	3	9	49037	49045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556559761
1036	NC_022654	CGG	3	9	49055	49063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559761
1037	NC_022654	ACC	2	6	49088	49093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556559761
1038	NC_022654	GCC	2	6	49095	49100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559761
1039	NC_022654	CAG	2	6	49121	49126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559761
1040	NC_022654	TGC	2	6	49135	49140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559761
1041	NC_022654	GCCT	2	8	49144	49151	0 %	25 %	25 %	50 %	556559761
1042	NC_022654	ACA	2	6	49180	49185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556559761
1043	NC_022654	CGT	3	9	49192	49200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559761
1044	NC_022654	AGG	2	6	49237	49242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556559761
1045	NC_022654	CGC	2	6	49306	49311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559762
1046	NC_022654	TCA	2	6	49319	49324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556559762
1047	NC_022654	GGCCT	2	10	49327	49336	0 %	20 %	40 %	40 %	556559762
1048	NC_022654	GTG	2	6	49345	49350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556559762
1049	NC_022654	CCA	2	6	49358	49363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556559762
1050	NC_022654	GGCCC	2	10	49402	49411	0 %	0 %	40 %	60 %	556559762
1051	NC_022654	ACCGC	2	10	49424	49433	20 %	0 %	20 %	60 %	556559762
1052	NC_022654	TG	3	6	49459	49464	0 %	50 %	50 %	0 %	556559762
1053	NC_022654	CACCGC	2	12	49476	49487	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	556559762
1054	NC_022654	CTG	2	6	49512	49517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559762
1055	NC_022654	CAC	2	6	49545	49550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556559762
1056	NC_022654	CAC	2	6	49611	49616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556559762
1057	NC_022654	CAG	2	6	49618	49623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559762
1058	NC_022654	GTG	2	6	49630	49635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556559762
1059	NC_022654	GCC	2	6	49663	49668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559762
1060	NC_022654	C	6	6	49670	49675	0 %	0 %	0 %	100 %	556559762
1061	NC_022654	CTA	2	6	49683	49688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556559762
1062	NC_022654	CGT	2	6	49698	49703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559762
1063	NC_022654	CGGCGC	2	12	49758	49769	0 %	0 %	50 %	50 %	556559762
1064	NC_022654	CGC	2	6	49775	49780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559762
1065	NC_022654	CAC	2	6	49821	49826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556559762
1066	NC_022654	TCA	2	6	49838	49843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556559762
1067	NC_022654	CCGGCG	2	12	49856	49867	0 %	0 %	50 %	50 %	556559762
1068	NC_022654	CAC	2	6	49884	49889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556559762
1069	NC_022654	GCT	2	6	49899	49904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559762
1070	NC_022654	CGC	2	6	49908	49913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559762
1071	NC_022654	TCA	2	6	49934	49939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556559762
1072	NC_022654	CTG	2	6	49979	49984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559762
1073	NC_022654	CAC	2	6	49989	49994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556559762
1074	NC_022654	CCAG	2	8	50027	50034	25 %	0 %	25 %	50 %	556559762
1075	NC_022654	C	6	6	50114	50119	0 %	0 %	0 %	100 %	556559762
1076	NC_022654	GCC	2	6	50164	50169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559762
1077	NC_022654	CCA	2	6	50190	50195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556559763
1078	NC_022654	TGC	2	6	50259	50264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559763
1079	NC_022654	CGTGTA	2	12	50272	50283	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	556559763
1080	NC_022654	CCG	2	6	50284	50289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559763
1081	NC_022654	GCC	2	6	50347	50352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559763
1082	NC_022654	CGC	2	6	50480	50485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559764
1083	NC_022654	CCTCC	2	10	50502	50511	0 %	20 %	0 %	80 %	556559764
1084	NC_022654	TGGG	2	8	50527	50534	0 %	25 %	75 %	0 %	556559764
1085	NC_022654	TG	3	6	50540	50545	0 %	50 %	50 %	0 %	556559764
1086	NC_022654	CCG	2	6	50638	50643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559764
1087	NC_022654	CT	3	6	50674	50679	0 %	50 %	0 %	50 %	556559764
1088	NC_022654	CA	3	6	50732	50737	50 %	0 %	0 %	50 %	556559765
1089	NC_022654	CGG	3	9	50824	50832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559765
1090	NC_022654	CG	3	6	50837	50842	0 %	0 %	50 %	50 %	556559765
1091	NC_022654	CTT	2	6	50851	50856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556559765
1092	NC_022654	CGG	2	6	50857	50862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559765
1093	NC_022654	TGGGC	2	10	50880	50889	0 %	20 %	60 %	20 %	556559765
1094	NC_022654	CGT	3	9	50899	50907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559765
1095	NC_022654	TCG	2	6	50916	50921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559765
1096	NC_022654	AC	3	6	50953	50958	50 %	0 %	0 %	50 %	556559765
1097	NC_022654	CAC	2	6	50977	50982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556559765
1098	NC_022654	CGG	2	6	51179	51184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559766
1099	NC_022654	CTG	2	6	51258	51263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559766
1100	NC_022654	CCG	2	6	51268	51273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559766
1101	NC_022654	CCG	2	6	51277	51282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559766
1102	NC_022654	GC	3	6	51344	51349	0 %	0 %	50 %	50 %	556559766
1103	NC_022654	GCT	2	6	51386	51391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559766
1104	NC_022654	CCG	2	6	51396	51401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559766
1105	NC_022654	CTA	2	6	51473	51478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556559766
1106	NC_022654	CCA	2	6	51487	51492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556559766
1107	NC_022654	CGC	2	6	51495	51500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559766
1108	NC_022654	CCG	2	6	51544	51549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559766
1109	NC_022654	GCT	2	6	51593	51598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559766
1110	NC_022654	ACC	3	9	51676	51684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556559766
1111	NC_022654	CCCGCA	2	12	51685	51696	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	556559766
1112	NC_022654	CTGG	2	8	51701	51708	0 %	25 %	50 %	25 %	556559766
1113	NC_022654	GCCG	2	8	51723	51730	0 %	0 %	50 %	50 %	556559766
1114	NC_022654	GCC	2	6	51756	51761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559766
1115	NC_022654	CGA	2	6	51800	51805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559766
1116	NC_022654	GCC	2	6	51813	51818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559766
1117	NC_022654	CAT	2	6	51839	51844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556559766
1118	NC_022654	GGC	2	6	51907	51912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559766
1119	NC_022654	CAA	2	6	51935	51940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556559766
1120	NC_022654	CCG	2	6	51950	51955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559766
1121	NC_022654	CCG	2	6	51979	51984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559766
1122	NC_022654	CGC	2	6	51992	51997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559766
1123	NC_022654	CGA	2	6	52004	52009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559766
1124	NC_022654	CGG	2	6	52028	52033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559766
1125	NC_022654	CCT	2	6	52037	52042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556559766
1126	NC_022654	CGC	3	9	52070	52078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559766
1127	NC_022654	CGGC	2	8	52087	52094	0 %	0 %	50 %	50 %	556559766
1128	NC_022654	AGC	2	6	52115	52120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559766
1129	NC_022654	C	6	6	52120	52125	0 %	0 %	0 %	100 %	556559766
1130	NC_022654	CCG	2	6	52138	52143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559766
1131	NC_022654	GCT	2	6	52148	52153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559766
1132	NC_022654	CCG	2	6	52162	52167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559766
1133	NC_022654	GCG	2	6	52172	52177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559766
1134	NC_022654	GTC	2	6	52257	52262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559766
1135	NC_022654	CGA	2	6	52316	52321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559766
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1142	NC_022654	ACC	2	6	52710	52715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556559766
1143	NC_022654	ACCCA	2	10	52728	52737	40 %	0 %	0 %	60 %	556559766
1144	NC_022654	CCA	4	12	52735	52746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556559766
1145	NC_022654	AAC	2	6	52824	52829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556559766
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1150	NC_022654	GCG	2	6	52903	52908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559766
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1157	NC_022654	ATG	2	6	53136	53141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556559766
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1159	NC_022654	GCC	2	6	53170	53175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559766
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1164	NC_022654	CGA	2	6	53381	53386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559766
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1232	NC_022654	CG	3	6	55539	55544	0 %	0 %	50 %	50 %	556559767
1233	NC_022654	A	6	6	55556	55561	100 %	0 %	0 %	0 %	556559767
1234	NC_022654	CGA	3	9	55564	55572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559767
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1239	NC_022654	C	7	7	55633	55639	0 %	0 %	0 %	100 %	556559767
1240	NC_022654	GC	3	6	55663	55668	0 %	0 %	50 %	50 %	556559767
1241	NC_022654	CAA	2	6	55673	55678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556559767
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1245	NC_022654	CTC	2	6	55717	55722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556559767
1246	NC_022654	CCG	2	6	55725	55730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559767
1247	NC_022654	GCC	3	9	55742	55750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559767
1248	NC_022654	ATG	2	6	55760	55765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556559767
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1250	NC_022654	CCG	2	6	55782	55787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559767
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1373	NC_022654	CGA	2	6	60441	60446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559772
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1375	NC_022654	AGC	2	6	60500	60505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559772
1376	NC_022654	CG	3	6	60544	60549	0 %	0 %	50 %	50 %	556559772
1377	NC_022654	GGC	2	6	60556	60561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559772
1378	NC_022654	CGC	2	6	60577	60582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559772
1379	NC_022654	TGC	2	6	60621	60626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559772
1380	NC_022654	TCA	2	6	60639	60644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556559772
1381	NC_022654	CG	3	6	60654	60659	0 %	0 %	50 %	50 %	556559772
1382	NC_022654	GCCG	2	8	60904	60911	0 %	0 %	50 %	50 %	556559772
1383	NC_022654	CGC	2	6	60955	60960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559772
1384	NC_022654	ATCA	2	8	60976	60983	50 %	25 %	0 %	25 %	556559772
1385	NC_022654	GTCG	2	8	60985	60992	0 %	25 %	50 %	25 %	556559772
1386	NC_022654	CGCC	2	8	61080	61087	0 %	0 %	25 %	75 %	556559772
1387	NC_022654	GA	3	6	61134	61139	50 %	0 %	50 %	0 %	556559772
1388	NC_022654	GCCGGC	2	12	61208	61219	0 %	0 %	50 %	50 %	556559772
1389	NC_022654	GGC	3	9	61217	61225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559772
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1391	NC_022654	GGC	2	6	61244	61249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559772
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1403	NC_022654	GCG	2	6	61485	61490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559772
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1409	NC_022654	CGA	2	6	62035	62040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556559773
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1465	NC_022654	TCAGC	2	10	63885	63894	20 %	20 %	20 %	40 %	556559774
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1477	NC_022654	GCCC	2	8	64608	64615	0 %	0 %	25 %	75 %	556559774
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1481	NC_022654	C	6	6	64697	64702	0 %	0 %	0 %	100 %	556559774
1482	NC_022654	CCAC	2	8	64763	64770	25 %	0 %	0 %	75 %	556559774
1483	NC_022654	CGG	2	6	64771	64776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559774
1484	NC_022654	GGC	3	9	64787	64795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559774
1485	NC_022654	CCT	2	6	64833	64838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556559774
1486	NC_022654	CGG	2	6	64891	64896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556559774
1487	NC_022654	GTCA	2	8	64924	64931	25 %	25 %	25 %	25 %	556559774
1488	NC_022654	GC	3	6	65081	65086	0 %	0 %	50 %	50 %	556559775
1489	NC_022654	CGT	2	6	65107	65112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559775
1490	NC_022654	CCG	2	6	65139	65144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559775
1491	NC_022654	GCCA	2	8	65153	65160	25 %	0 %	25 %	50 %	556559775
1492	NC_022654	CTG	2	6	65164	65169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559775
1493	NC_022654	CGGG	2	8	65178	65185	0 %	0 %	75 %	25 %	556559775
1494	NC_022654	GC	4	8	65273	65280	0 %	0 %	50 %	50 %	556559775
1495	NC_022654	TCT	2	6	65306	65311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556559775
1496	NC_022654	CGC	2	6	65314	65319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556559775
1497	NC_022654	CAGC	2	8	65328	65335	25 %	0 %	25 %	50 %	556559775
1498	NC_022654	GC	3	6	65357	65362	0 %	0 %	50 %	50 %	556559775
1499	NC_022654	GCT	2	6	65378	65383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559775
1500	NC_022654	GTC	2	6	65536	65541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556559775

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