MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem

Total Repeats: 101379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022350	GTG	2	6	244643	244648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197738184
5502	NC_022350	GTC	2	6	244682	244687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738184
5503	NC_022350	CAA	2	6	244723	244728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197738184
5504	NC_022350	TGC	2	6	244740	244745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738184
5505	NC_022350	TTC	2	6	244780	244785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197738184
5506	NC_022350	TCACC	2	10	244789	244798	20 %	20 %	0 %	60 %	197738184
5507	NC_022350	GCC	3	9	244849	244857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161355
5508	NC_022350	GCG	3	9	244858	244866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161355
5509	NC_022350	GCT	2	6	244902	244907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161355
5510	NC_022350	GTC	2	6	244924	244929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161355
5511	NC_022350	CGC	2	6	245002	245007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161355
5512	NC_022350	CGGGGT	2	12	245050	245061	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	544161355
5513	NC_022350	TGG	2	6	245062	245067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161355
5514	NC_022350	GACC	2	8	245093	245100	25 %	0 %	25 %	50 %	544161355
5515	NC_022350	CGG	2	6	245122	245127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161355
5516	NC_022350	CGA	2	6	245134	245139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161355
5517	NC_022350	GTG	2	6	245156	245161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161355
5518	NC_022350	GCC	2	6	245177	245182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161355
5519	NC_022350	GCG	2	6	245303	245308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161355
5520	NC_022350	CG	3	6	245307	245312	0 %	0 %	50 %	50 %	544161355
5521	NC_022350	CCAGC	2	10	245319	245328	20 %	0 %	20 %	60 %	544161355
5522	NC_022350	GGA	2	6	245336	245341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	544161355
5523	NC_022350	TCG	2	6	245378	245383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161355
5524	NC_022350	CAG	2	6	245447	245452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161355
5525	NC_022350	AGC	2	6	245462	245467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161355
5526	NC_022350	TCA	2	6	245469	245474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544161355
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5528	NC_022350	CAG	3	9	245512	245520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161355
5529	NC_022350	CGC	2	6	245521	245526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161355
5530	NC_022350	TCA	3	9	245550	245558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544161355
5531	NC_022350	CGA	2	6	245586	245591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161355
5532	NC_022350	CAA	2	6	245595	245600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	544161355
5533	NC_022350	CGG	2	6	245610	245615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161355
5534	NC_022350	ATG	2	6	245618	245623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544161355
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5536	NC_022350	GAT	2	6	245746	245751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544161355
5537	NC_022350	CGA	2	6	245817	245822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161355
5538	NC_022350	TGG	2	6	245844	245849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161355
5539	NC_022350	TCA	2	6	245868	245873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544161355
5540	NC_022350	GCA	2	6	245889	245894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161355
5541	NC_022350	GTG	2	6	245930	245935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161355
5542	NC_022350	CAG	2	6	245938	245943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161355
5543	NC_022350	ACC	2	6	245948	245953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	544161355
5544	NC_022350	CG	3	6	246049	246054	0 %	0 %	50 %	50 %	544161355
5545	NC_022350	CTT	2	6	246067	246072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	544161355
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5547	NC_022350	ATCGCC	2	12	246203	246214	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	544161355
5548	NC_022350	TGC	2	6	246216	246221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161355
5549	NC_022350	CTC	2	6	246322	246327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	544161355
5550	NC_022350	CGG	2	6	246352	246357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161355
5551	NC_022350	ATG	3	9	246419	246427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544161355
5552	NC_022350	GCG	2	6	246437	246442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161355
5553	NC_022350	TCA	2	6	246459	246464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544161355
5554	NC_022350	GGC	2	6	246553	246558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161355
5555	NC_022350	AGC	2	6	246737	246742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161355
5556	NC_022350	CGACG	2	10	246754	246763	20 %	0 %	40 %	40 %	544161355
5557	NC_022350	CCG	2	6	246771	246776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161355
5558	NC_022350	CGG	2	6	246795	246800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161355
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5560	NC_022350	ATG	2	6	246968	246973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544161355
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5587	NC_022350	CAG	2	6	248202	248207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161356
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5589	NC_022350	TCA	3	9	248429	248437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544161356
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5606	NC_022350	TCGCCA	2	12	248941	248952	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	197738186
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5612	NC_022350	GCAT	2	8	249201	249208	25 %	25 %	25 %	25 %	197738186
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5617	NC_022350	GCC	2	6	249451	249456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161357
5618	NC_022350	GGGT	2	8	249491	249498	0 %	25 %	75 %	0 %	544161357
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5620	NC_022350	TCG	2	6	249538	249543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161357
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5981	NC_022350	ATC	2	6	265896	265901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197738199
5982	NC_022350	CGC	2	6	265937	265942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738199
5983	NC_022350	CGATG	2	10	265961	265970	20 %	20 %	40 %	20 %	197738199
5984	NC_022350	GTTC	2	8	266026	266033	0 %	50 %	25 %	25 %	197738199
5985	NC_022350	GTC	3	9	266076	266084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738199
5986	NC_022350	CCG	2	6	266115	266120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738199
5987	NC_022350	TGC	2	6	266135	266140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738199
5988	NC_022350	TGC	2	6	266183	266188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738199
5989	NC_022350	GGC	2	6	266201	266206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738199
5990	NC_022350	CGG	3	9	266255	266263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197738199
5991	NC_022350	TGC	2	6	266269	266274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738199
5992	NC_022350	CG	3	6	266346	266351	0 %	0 %	50 %	50 %	197738199
5993	NC_022350	TGC	2	6	266402	266407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197738199
5994	NC_022350	GGT	2	6	266450	266455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197738199
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5997	NC_022350	ACG	2	6	266551	266556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738199
5998	NC_022350	GAAG	2	8	266558	266565	50 %	0 %	50 %	0 %	197738199
5999	NC_022350	GCA	2	6	266644	266649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738200
6000	NC_022350	GCC	2	6	266723	266728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197738200

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