MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USMARC_2286

Total Repeats: 44842

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021883	TTC	2	6	236069	236074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467629
4002	NC_021883	AAT	2	6	236161	236166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467629
4003	NC_021883	T	6	6	236249	236254	0 %	100 %	0 %	0 %	526467629
4004	NC_021883	CAA	2	6	236515	236520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467630
4005	NC_021883	AC	3	6	236530	236535	50 %	0 %	0 %	50 %	526467630
4006	NC_021883	TAA	4	12	236587	236598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467630
4007	NC_021883	T	7	7	236696	236702	0 %	100 %	0 %	0 %	526467630
4008	NC_021883	T	7	7	236797	236803	0 %	100 %	0 %	0 %	526467630
4009	NC_021883	ATG	2	6	236919	236924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467631
4010	NC_021883	TCA	2	6	236989	236994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467631
4011	NC_021883	GAA	2	6	237044	237049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467631
4012	NC_021883	AAT	2	6	237050	237055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467631
4013	NC_021883	TGG	2	6	237217	237222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467631
4014	NC_021883	ATT	2	6	237319	237324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467632
4015	NC_021883	TAA	2	6	237338	237343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467632
4016	NC_021883	T	6	6	237383	237388	0 %	100 %	0 %	0 %	526467632
4017	NC_021883	TG	3	6	237412	237417	0 %	50 %	50 %	0 %	526467632
4018	NC_021883	GAT	2	6	237614	237619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467632
4019	NC_021883	AC	3	6	237646	237651	50 %	0 %	0 %	50 %	526467632
4020	NC_021883	CCA	2	6	237666	237671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467632
4021	NC_021883	CCA	2	6	237727	237732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467632
4022	NC_021883	CAC	2	6	237815	237820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467632
4023	NC_021883	CGGCA	2	10	237827	237836	20 %	0 %	40 %	40 %	526467632
4024	NC_021883	TTGG	2	8	237882	237889	0 %	50 %	50 %	0 %	526467632
4025	NC_021883	GAT	2	6	237923	237928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467632
4026	NC_021883	T	6	6	237965	237970	0 %	100 %	0 %	0 %	526467632
4027	NC_021883	TAC	2	6	237983	237988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467632
4028	NC_021883	T	6	6	238001	238006	0 %	100 %	0 %	0 %	526467632
4029	NC_021883	CTG	2	6	238057	238062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467632
4030	NC_021883	AAT	2	6	238124	238129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467632
4031	NC_021883	TTG	2	6	238144	238149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467632
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4033	NC_021883	T	6	6	238399	238404	0 %	100 %	0 %	0 %	526467633
4034	NC_021883	GCA	2	6	238411	238416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467633
4035	NC_021883	TGC	2	6	238417	238422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467633
4036	NC_021883	GAT	2	6	238526	238531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467633
4037	NC_021883	GGC	2	6	238552	238557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467633
4038	NC_021883	CAT	2	6	238622	238627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467633
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4040	NC_021883	GAA	2	6	238937	238942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467633
4041	NC_021883	AATT	2	8	238958	238965	50 %	50 %	0 %	0 %	526467634
4042	NC_021883	CAA	2	6	238975	238980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467634
4043	NC_021883	GGA	2	6	239058	239063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526467634
4044	NC_021883	GGT	2	6	239155	239160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467634
4045	NC_021883	ATT	2	6	239204	239209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467634
4046	NC_021883	TGAT	2	8	239219	239226	25 %	50 %	25 %	0 %	526467634
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4049	NC_021883	TTG	2	6	239317	239322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467634
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4051	NC_021883	CAAA	2	8	239472	239479	75 %	0 %	0 %	25 %	526467634
4052	NC_021883	A	6	6	239477	239482	100 %	0 %	0 %	0 %	526467634
4053	NC_021883	A	6	6	239494	239499	100 %	0 %	0 %	0 %	526467634
4054	NC_021883	A	7	7	239577	239583	100 %	0 %	0 %	0 %	526467634
4055	NC_021883	CA	3	6	239645	239650	50 %	0 %	0 %	50 %	526467634
4056	NC_021883	CCA	2	6	239651	239656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467634
4057	NC_021883	A	7	7	239830	239836	100 %	0 %	0 %	0 %	526467635
4058	NC_021883	A	8	8	239839	239846	100 %	0 %	0 %	0 %	526467635
4059	NC_021883	AAAG	2	8	239851	239858	75 %	0 %	25 %	0 %	526467635
4060	NC_021883	TTC	2	6	239902	239907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467635
4061	NC_021883	ATA	2	6	240065	240070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467635
4062	NC_021883	CGG	2	6	240104	240109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467635
4063	NC_021883	AGC	2	6	240116	240121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467635
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4065	NC_021883	AAG	3	9	240143	240151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467635
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4067	NC_021883	GAA	3	9	240247	240255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467635
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4070	NC_021883	AAGC	2	8	240295	240302	50 %	0 %	25 %	25 %	526467635
4071	NC_021883	A	6	6	240331	240336	100 %	0 %	0 %	0 %	526467635
4072	NC_021883	CAG	2	6	240337	240342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467635
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4074	NC_021883	AGC	2	6	240356	240361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467635
4075	NC_021883	TGC	2	6	240381	240386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467635
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4079	NC_021883	GCTT	2	8	240697	240704	0 %	50 %	25 %	25 %	526467636
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4082	NC_021883	CAAG	2	8	240911	240918	50 %	0 %	25 %	25 %	526467636
4083	NC_021883	ACC	2	6	240997	241002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467636
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4091	NC_021883	CAG	2	6	241377	241382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467636
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4095	NC_021883	CAA	2	6	241637	241642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467636
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4099	NC_021883	CAA	2	6	242073	242078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467637
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4101	NC_021883	GCC	2	6	242143	242148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526467637
4102	NC_021883	TGC	2	6	242152	242157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467637
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4104	NC_021883	TGA	2	6	242428	242433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467638
4105	NC_021883	TATC	2	8	242603	242610	25 %	50 %	0 %	25 %	526467638
4106	NC_021883	AAG	2	6	242656	242661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467638
4107	NC_021883	CGATTG	2	12	242680	242691	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	526467638
4108	NC_021883	TTA	2	6	242727	242732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467638
4109	NC_021883	GAG	2	6	242779	242784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526467638
4110	NC_021883	GCACG	2	10	242786	242795	20 %	0 %	40 %	40 %	526467638
4111	NC_021883	GAT	2	6	242834	242839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467638
4112	NC_021883	CCA	2	6	242884	242889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467638
4113	NC_021883	GTT	2	6	242906	242911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467638
4114	NC_021883	GGT	2	6	242915	242920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467638
4115	NC_021883	CAA	2	6	242930	242935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467638
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4117	NC_021883	ACC	2	6	243092	243097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467638
4118	NC_021883	GAG	2	6	243159	243164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526467638
4119	NC_021883	AAC	2	6	243226	243231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467638
4120	NC_021883	TTCG	2	8	243238	243245	0 %	50 %	25 %	25 %	526467638
4121	NC_021883	TGG	2	6	243265	243270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467638
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4248	NC_021883	CAA	2	6	249797	249802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467641
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4252	NC_021883	CAAT	2	8	249863	249870	50 %	25 %	0 %	25 %	526467641
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4343	NC_021883	GCAT	2	8	254221	254228	25 %	25 %	25 %	25 %	526467644
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4350	NC_021883	TGGATT	2	12	254869	254880	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	526467645
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4357	NC_021883	TGA	2	6	255388	255393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467645
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4359	NC_021883	CAG	2	6	255521	255526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467645
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4363	NC_021883	GAT	2	6	255590	255595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467645
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4367	NC_021883	TTC	2	6	255934	255939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467645
4368	NC_021883	GAA	2	6	256164	256169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467646
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4372	NC_021883	ATC	2	6	256562	256567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467646
4373	NC_021883	ATG	2	6	256626	256631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467646
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4375	NC_021883	ATG	2	6	256648	256653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467646
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4476	NC_021883	TAACC	2	10	262511	262520	40 %	20 %	0 %	40 %	526467652
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4479	NC_021883	TAC	2	6	262665	262670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467653
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4483	NC_021883	T	6	6	262761	262766	0 %	100 %	0 %	0 %	526467653
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4486	NC_021883	CT	3	6	262875	262880	0 %	50 %	0 %	50 %	526467653
4487	NC_021883	TAA	2	6	263062	263067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467653
4488	NC_021883	AGT	3	9	263131	263139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467653
4489	NC_021883	TCA	2	6	263146	263151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467653
4490	NC_021883	AATGT	2	10	263271	263280	40 %	40 %	20 %	0 %	526467653
4491	NC_021883	ACCA	2	8	263281	263288	50 %	0 %	0 %	50 %	526467653
4492	NC_021883	TGT	2	6	263364	263369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467653
4493	NC_021883	CTT	2	6	263387	263392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467653
4494	NC_021883	CATTC	2	10	263555	263564	20 %	40 %	0 %	40 %	526467653
4495	NC_021883	TAA	2	6	263668	263673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467653
4496	NC_021883	CAA	2	6	263675	263680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467653
4497	NC_021883	CTG	2	6	263686	263691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467653
4498	NC_021883	TA	3	6	263692	263697	50 %	50 %	0 %	0 %	526467653
4499	NC_021883	TACT	2	8	263740	263747	25 %	50 %	0 %	25 %	526467653
4500	NC_021883	AAT	2	6	263754	263759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467653

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