MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D153

Total Repeats: 44099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_021743	TGTAA	2	10	2675815	2675824	40 %	40 %	20 %	0 %	525703731
44002	NC_021743	TTG	2	6	2675849	2675854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525703731
44003	NC_021743	GT	3	6	2675861	2675866	0 %	50 %	50 %	0 %	525703731
44004	NC_021743	CTA	2	6	2675873	2675878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525703731
44005	NC_021743	CTGT	2	8	2675879	2675886	0 %	50 %	25 %	25 %	525703731
44006	NC_021743	A	6	6	2675902	2675907	100 %	0 %	0 %	0 %	525703731
44007	NC_021743	AAG	2	6	2675909	2675914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525703731
44008	NC_021743	TAA	2	6	2675964	2675969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525703731
44009	NC_021743	ATT	2	6	2676040	2676045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525703731
44010	NC_021743	AGG	2	6	2676101	2676106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525703732
44011	NC_021743	ATCA	2	8	2676107	2676114	50 %	25 %	0 %	25 %	525703732
44012	NC_021743	AAT	2	6	2676155	2676160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525703732
44013	NC_021743	TGC	2	6	2676185	2676190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525703732
44014	NC_021743	CAA	3	9	2676205	2676213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525703732
44015	NC_021743	CTT	2	6	2676268	2676273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525703732
44016	NC_021743	AT	3	6	2676312	2676317	50 %	50 %	0 %	0 %	525703732
44017	NC_021743	TCA	2	6	2676483	2676488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525703733
44018	NC_021743	T	7	7	2676513	2676519	0 %	100 %	0 %	0 %	525703733
44019	NC_021743	GTT	2	6	2676552	2676557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525703733
44020	NC_021743	CAT	2	6	2676645	2676650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525703733
44021	NC_021743	GTT	2	6	2676743	2676748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525703733
44022	NC_021743	CTG	2	6	2676840	2676845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525703733
44023	NC_021743	TAA	2	6	2676886	2676891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525703733
44024	NC_021743	CGG	2	6	2676958	2676963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525703734
44025	NC_021743	TTA	2	6	2676979	2676984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525703734
44026	NC_021743	CAG	2	6	2677004	2677009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525703734
44027	NC_021743	TCT	2	6	2677219	2677224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525703734
44028	NC_021743	ACC	2	6	2677431	2677436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525703734
44029	NC_021743	GCT	2	6	2677462	2677467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525703734
44030	NC_021743	GA	3	6	2677508	2677513	50 %	0 %	50 %	0 %	525703734
44031	NC_021743	T	6	6	2677679	2677684	0 %	100 %	0 %	0 %	525703734
44032	NC_021743	AAT	2	6	2677725	2677730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525703734
44033	NC_021743	T	6	6	2677826	2677831	0 %	100 %	0 %	0 %	525703734
44034	NC_021743	TTACT	2	10	2677835	2677844	20 %	60 %	0 %	20 %	525703734
44035	NC_021743	ATC	2	6	2677893	2677898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525703734
44036	NC_021743	TCAA	2	8	2677909	2677916	50 %	25 %	0 %	25 %	525703734
44037	NC_021743	ACT	2	6	2677935	2677940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525703734
44038	NC_021743	TTC	3	9	2678022	2678030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525703734
44039	NC_021743	TCC	2	6	2678083	2678088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525703734
44040	NC_021743	ATTG	2	8	2678101	2678108	25 %	50 %	25 %	0 %	525703734
44041	NC_021743	AAT	2	6	2678115	2678120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525703734
44042	NC_021743	AAG	2	6	2678128	2678133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525703734
44043	NC_021743	GCA	2	6	2678137	2678142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525703734
44044	NC_021743	GCT	2	6	2678196	2678201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525703734
44045	NC_021743	TAAAT	2	10	2678226	2678235	60 %	40 %	0 %	0 %	525703734
44046	NC_021743	CCA	2	6	2678299	2678304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525703734
44047	NC_021743	T	6	6	2678328	2678333	0 %	100 %	0 %	0 %	525703734
44048	NC_021743	TCT	2	6	2678335	2678340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525703734
44049	NC_021743	GCTT	2	8	2678353	2678360	0 %	50 %	25 %	25 %	525703734
44050	NC_021743	CT	3	6	2678395	2678400	0 %	50 %	0 %	50 %	525703734
44051	NC_021743	CTG	2	6	2678405	2678410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525703734
44052	NC_021743	TCC	2	6	2678424	2678429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525703734
44053	NC_021743	GT	3	6	2678432	2678437	0 %	50 %	50 %	0 %	525703734
44054	NC_021743	GTT	2	6	2678659	2678664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525703734
44055	NC_021743	CAAT	2	8	2678952	2678959	50 %	25 %	0 %	25 %	525703735
44056	NC_021743	ACA	2	6	2678990	2678995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525703735
44057	NC_021743	C	6	6	2679068	2679073	0 %	0 %	0 %	100 %	525703735
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44059	NC_021743	TGG	2	6	2679161	2679166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525703735
44060	NC_021743	ACC	2	6	2679179	2679184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525703735
44061	NC_021743	T	6	6	2679185	2679190	0 %	100 %	0 %	0 %	525703735
44062	NC_021743	AAAT	2	8	2679201	2679208	75 %	25 %	0 %	0 %	525703735
44063	NC_021743	CT	3	6	2679244	2679249	0 %	50 %	0 %	50 %	525703735
44064	NC_021743	TAG	2	6	2679465	2679470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525703735
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44068	NC_021743	CGA	2	6	2679736	2679741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525703735
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44086	NC_021743	TTTCG	2	10	2680799	2680808	0 %	60 %	20 %	20 %	525703737
44087	NC_021743	ATCA	2	8	2680854	2680861	50 %	25 %	0 %	25 %	525703737
44088	NC_021743	GAA	2	6	2680872	2680877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525703737
44089	NC_021743	AGCA	2	8	2680918	2680925	50 %	0 %	25 %	25 %	525703737
44090	NC_021743	ATT	2	6	2680992	2680997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525703737
44091	NC_021743	CT	3	6	2681037	2681042	0 %	50 %	0 %	50 %	525703737
44092	NC_021743	ATGT	2	8	2681119	2681126	25 %	50 %	25 %	0 %	525703738
44093	NC_021743	AATG	2	8	2681177	2681184	50 %	25 %	25 %	0 %	525703738
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44096	NC_021743	T	7	7	2681525	2681531	0 %	100 %	0 %	0 %	525703739
44097	NC_021743	CAT	2	6	2681572	2681577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525703739
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44099	NC_021743	CAA	2	6	2681662	2681667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525703740

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.