MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D153

Total Repeats: 44099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021743	TAA	2	6	305364	305369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701558
5002	NC_021743	C	6	6	305395	305400	0 %	0 %	0 %	100 %	525701558
5003	NC_021743	TCT	2	6	305483	305488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701558
5004	NC_021743	TC	3	6	305495	305500	0 %	50 %	0 %	50 %	525701558
5005	NC_021743	AAT	2	6	305501	305506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701558
5006	NC_021743	CAG	2	6	305542	305547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701558
5007	NC_021743	GCTG	2	8	305562	305569	0 %	25 %	50 %	25 %	525701558
5008	NC_021743	ATA	2	6	305578	305583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701558
5009	NC_021743	TGC	2	6	305596	305601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701558
5010	NC_021743	TG	3	6	305764	305769	0 %	50 %	50 %	0 %	525701558
5011	NC_021743	AAT	2	6	305784	305789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701558
5012	NC_021743	CTTG	2	8	305858	305865	0 %	50 %	25 %	25 %	525701558
5013	NC_021743	ATC	2	6	305930	305935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701558
5014	NC_021743	CAT	2	6	306022	306027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701558
5015	NC_021743	TTGC	2	8	306028	306035	0 %	50 %	25 %	25 %	525701558
5016	NC_021743	TTG	2	6	306071	306076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701558
5017	NC_021743	TAAA	2	8	306400	306407	75 %	25 %	0 %	0 %	525701558
5018	NC_021743	AAT	2	6	306443	306448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701558
5019	NC_021743	A	6	6	306485	306490	100 %	0 %	0 %	0 %	525701558
5020	NC_021743	T	7	7	306574	306580	0 %	100 %	0 %	0 %	525701558
5021	NC_021743	CGC	2	6	306750	306755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525701558
5022	NC_021743	CGGCA	2	10	306806	306815	20 %	0 %	40 %	40 %	525701558
5023	NC_021743	TGA	2	6	306847	306852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701558
5024	NC_021743	ACA	2	6	306958	306963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701558
5025	NC_021743	TTG	2	6	307016	307021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701558
5026	NC_021743	AAC	2	6	307302	307307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701558
5027	NC_021743	TCT	2	6	307336	307341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701558
5028	NC_021743	GTTT	2	8	307380	307387	0 %	75 %	25 %	0 %	525701558
5029	NC_021743	T	6	6	307435	307440	0 %	100 %	0 %	0 %	525701558
5030	NC_021743	T	6	6	307446	307451	0 %	100 %	0 %	0 %	525701558
5031	NC_021743	CTG	2	6	307819	307824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701559
5032	NC_021743	AAT	2	6	307830	307835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701559
5033	NC_021743	TGA	2	6	307844	307849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701559
5034	NC_021743	ACCC	2	8	307895	307902	25 %	0 %	0 %	75 %	525701559
5035	NC_021743	AGC	2	6	307913	307918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701559
5036	NC_021743	TAAA	2	8	307936	307943	75 %	25 %	0 %	0 %	525701559
5037	NC_021743	AAT	3	9	307962	307970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701559
5038	NC_021743	TAG	2	6	308027	308032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701559
5039	NC_021743	TCA	2	6	308157	308162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701559
5040	NC_021743	GCT	2	6	308208	308213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701559
5041	NC_021743	CT	3	6	308244	308249	0 %	50 %	0 %	50 %	525701559
5042	NC_021743	GCG	2	6	308282	308287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701559
5043	NC_021743	TAA	2	6	308303	308308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701559
5044	NC_021743	ACT	2	6	308352	308357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701559
5045	NC_021743	CTA	2	6	308413	308418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701559
5046	NC_021743	CAA	2	6	308461	308466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701559
5047	NC_021743	ACA	2	6	308712	308717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701559
5048	NC_021743	A	6	6	308732	308737	100 %	0 %	0 %	0 %	525701559
5049	NC_021743	CTT	2	6	308791	308796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701559
5050	NC_021743	A	6	6	308864	308869	100 %	0 %	0 %	0 %	525701559
5051	NC_021743	TAA	2	6	308908	308913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701559
5052	NC_021743	TGA	2	6	308981	308986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701559
5053	NC_021743	ACCA	2	8	309261	309268	50 %	0 %	0 %	50 %	525701560
5054	NC_021743	GCC	2	6	309346	309351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525701560
5055	NC_021743	CTA	2	6	309374	309379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701560
5056	NC_021743	ATT	2	6	309429	309434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701560
5057	NC_021743	ACT	2	6	309468	309473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701560
5058	NC_021743	TGT	2	6	309492	309497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701560
5059	NC_021743	TTTTG	2	10	309605	309614	0 %	80 %	20 %	0 %	525701560
5060	NC_021743	A	8	8	309663	309670	100 %	0 %	0 %	0 %	525701561
5061	NC_021743	ACT	2	6	309687	309692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701561
5062	NC_021743	GCT	2	6	309808	309813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701561
5063	NC_021743	A	6	6	309815	309820	100 %	0 %	0 %	0 %	525701561
5064	NC_021743	ATA	2	6	309830	309835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701561
5065	NC_021743	GGT	2	6	309859	309864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525701561
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5067	NC_021743	TC	3	6	310014	310019	0 %	50 %	0 %	50 %	525701561
5068	NC_021743	TAA	2	6	310068	310073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701561
5069	NC_021743	A	7	7	310072	310078	100 %	0 %	0 %	0 %	525701561
5070	NC_021743	AAC	2	6	310149	310154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701561
5071	NC_021743	A	6	6	310227	310232	100 %	0 %	0 %	0 %	525701561
5072	NC_021743	ACGT	2	8	310268	310275	25 %	25 %	25 %	25 %	525701561
5073	NC_021743	TGA	2	6	310416	310421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701561
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5076	NC_021743	A	8	8	310596	310603	100 %	0 %	0 %	0 %	525701561
5077	NC_021743	A	6	6	310609	310614	100 %	0 %	0 %	0 %	525701561
5078	NC_021743	A	6	6	310687	310692	100 %	0 %	0 %	0 %	525701561
5079	NC_021743	TTA	2	6	310747	310752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701561
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5088	NC_021743	A	6	6	311224	311229	100 %	0 %	0 %	0 %	525701561
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5093	NC_021743	TTA	2	6	311502	311507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701562
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5096	NC_021743	TAAAT	2	10	311596	311605	60 %	40 %	0 %	0 %	525701562
5097	NC_021743	ATTA	2	8	311673	311680	50 %	50 %	0 %	0 %	525701562
5098	NC_021743	TG	3	6	311720	311725	0 %	50 %	50 %	0 %	525701562
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5106	NC_021743	TAT	2	6	312119	312124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701562
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5108	NC_021743	TCT	2	6	312305	312310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701562
5109	NC_021743	TAG	2	6	312374	312379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701562
5110	NC_021743	CCT	2	6	312380	312385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525701563
5111	NC_021743	CAC	2	6	312408	312413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525701563
5112	NC_021743	T	6	6	312417	312422	0 %	100 %	0 %	0 %	525701563
5113	NC_021743	TTG	2	6	312430	312435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525701563
5114	NC_021743	GGA	2	6	312473	312478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525701563
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5117	NC_021743	TCA	2	6	312565	312570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701563
5118	NC_021743	CTGG	2	8	312584	312591	0 %	25 %	50 %	25 %	525701563
5119	NC_021743	TTC	2	6	312612	312617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701563
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5121	NC_021743	T	6	6	312666	312671	0 %	100 %	0 %	0 %	525701563
5122	NC_021743	ACATT	2	10	312698	312707	40 %	40 %	0 %	20 %	525701563
5123	NC_021743	T	6	6	312774	312779	0 %	100 %	0 %	0 %	525701563
5124	NC_021743	GCGA	2	8	312786	312793	25 %	0 %	50 %	25 %	525701563
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5154	NC_021743	ACC	2	6	314347	314352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525701564
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5237	NC_021743	CAA	2	6	318607	318612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701568
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5241	NC_021743	TCA	2	6	318780	318785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701568
5242	NC_021743	GCG	2	6	318801	318806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701568
5243	NC_021743	TGA	2	6	318814	318819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525701568
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5245	NC_021743	TCA	2	6	318915	318920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701568
5246	NC_021743	AAT	2	6	318927	318932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525701568
5247	NC_021743	GCG	2	6	318934	318939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701568
5248	NC_021743	TTA	2	6	318987	318992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525701568
5249	NC_021743	TGC	2	6	319083	319088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701568
5250	NC_021743	ACT	2	6	319089	319094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701568
5251	NC_021743	AGTCA	2	10	319349	319358	40 %	20 %	20 %	20 %	525701568
5252	NC_021743	GCG	2	6	319403	319408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701568
5253	NC_021743	TCTT	2	8	319443	319450	0 %	75 %	0 %	25 %	525701568
5254	NC_021743	TCA	2	6	319497	319502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701568
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5260	NC_021743	TCATAT	2	12	319840	319851	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525701568
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5269	NC_021743	CGCA	2	8	320105	320112	25 %	0 %	25 %	50 %	525701568
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5273	NC_021743	CAA	2	6	320336	320341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525701568
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5277	NC_021743	T	6	6	320648	320653	0 %	100 %	0 %	0 %	525701568
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5279	NC_021743	TACA	2	8	320759	320766	50 %	25 %	0 %	25 %	525701568
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5302	NC_021743	CTTTG	2	10	322228	322237	0 %	60 %	20 %	20 %	525701569
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5352	NC_021743	TTAA	2	8	325002	325009	50 %	50 %	0 %	0 %	525701572
5353	NC_021743	A	7	7	325016	325022	100 %	0 %	0 %	0 %	525701572
5354	NC_021743	A	6	6	325036	325041	100 %	0 %	0 %	0 %	525701572
5355	NC_021743	GAA	2	6	325074	325079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701572
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5359	NC_021743	GGC	2	6	325171	325176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525701572
5360	NC_021743	TCA	2	6	325201	325206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701572
5361	NC_021743	GATT	2	8	325216	325223	25 %	50 %	25 %	0 %	525701572
5362	NC_021743	TCG	2	6	325331	325336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701572
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5364	NC_021743	GCA	2	6	325556	325561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525701573
5365	NC_021743	T	6	6	325600	325605	0 %	100 %	0 %	0 %	525701573
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5490	NC_021743	GTC	2	6	332201	332206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701576
5491	NC_021743	CTT	2	6	332318	332323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701577
5492	NC_021743	AACCA	2	10	332464	332473	60 %	0 %	0 %	40 %	525701577
5493	NC_021743	TG	3	6	332594	332599	0 %	50 %	50 %	0 %	525701577
5494	NC_021743	ATC	2	6	332681	332686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525701577
5495	NC_021743	T	7	7	332769	332775	0 %	100 %	0 %	0 %	525701577
5496	NC_021743	CGT	2	6	332782	332787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525701577
5497	NC_021743	AGA	2	6	332792	332797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525701577
5498	NC_021743	ATAAA	2	10	332812	332821	80 %	20 %	0 %	0 %	525701577
5499	NC_021743	GTTAA	2	10	333948	333957	40 %	40 %	20 %	0 %	525701578
5500	NC_021743	TCT	2	6	334020	334025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525701578

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