MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D174

Total Repeats: 1625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021739	ATTCA	2	10	9733	9742	40 %	40 %	0 %	20 %	525662566
2	NC_021739	CTGTA	2	10	9924	9933	20 %	40 %	20 %	20 %	525662566
3	NC_021739	AATAC	2	10	11477	11486	60 %	20 %	0 %	20 %	525662380
4	NC_021739	TGAAT	2	10	14771	14780	40 %	40 %	20 %	0 %	525662569
5	NC_021739	ATACC	2	10	15694	15703	40 %	20 %	0 %	40 %	525662569
6	NC_021739	TTGGC	2	10	17387	17396	0 %	40 %	40 %	20 %	525662570
7	NC_021739	AGCTG	2	10	19595	19604	20 %	20 %	40 %	20 %	525662574
8	NC_021739	AAGTG	2	10	19898	19907	40 %	20 %	40 %	0 %	525662574
9	NC_021739	TTCAC	2	10	20568	20577	20 %	40 %	0 %	40 %	525662574
10	NC_021739	CTTAT	2	10	21040	21049	20 %	60 %	0 %	20 %	525662575
11	NC_021739	TTTTA	2	10	22287	22296	20 %	80 %	0 %	0 %	525662577
12	NC_021739	GTTTC	2	10	22616	22625	0 %	60 %	20 %	20 %	525662577
13	NC_021739	AATCC	2	10	24149	24158	40 %	20 %	0 %	40 %	525662578
14	NC_021739	GTTTC	2	10	24302	24311	0 %	60 %	20 %	20 %	525662578
15	NC_021739	GCAAC	2	10	25434	25443	40 %	0 %	20 %	40 %	525662580
16	NC_021739	GTGGC	2	10	27950	27959	0 %	20 %	60 %	20 %	525662582
17	NC_021739	TTAAA	2	10	33290	33299	60 %	40 %	0 %	0 %	525662584
18	NC_021739	CATTT	2	10	34630	34639	20 %	60 %	0 %	20 %	525662585
19	NC_021739	GTTTT	2	10	35064	35073	0 %	80 %	20 %	0 %	525662585
20	NC_021739	TTGCA	2	10	37987	37996	20 %	40 %	20 %	20 %	525662588
21	NC_021739	TAAAT	2	10	38084	38093	60 %	40 %	0 %	0 %	525662588
22	NC_021739	CCAAG	2	10	40783	40792	40 %	0 %	20 %	40 %	525662591
23	NC_021739	CGTTT	2	10	42368	42377	0 %	60 %	20 %	20 %	525662592
24	NC_021739	AATGA	2	10	42565	42574	60 %	20 %	20 %	0 %	525662592
25	NC_021739	ACCCA	2	10	42853	42862	40 %	0 %	0 %	60 %	525662592
26	NC_021739	AATCA	2	10	44020	44029	60 %	20 %	0 %	20 %	525662593
27	NC_021739	AGCAC	2	10	46966	46975	40 %	0 %	20 %	40 %	525662596
28	NC_021739	TAAGT	2	10	47025	47034	40 %	40 %	20 %	0 %	525662596
29	NC_021739	TAAAA	2	10	47604	47613	80 %	20 %	0 %	0 %	525662596
30	NC_021739	ACATC	2	10	48295	48304	40 %	20 %	0 %	40 %	525662597
31	NC_021739	GTAAT	2	10	48346	48355	40 %	40 %	20 %	0 %	525662597
32	NC_021739	CCGGC	2	10	49240	49249	0 %	0 %	40 %	60 %	525662598
33	NC_021739	ACCCA	2	10	52469	52478	40 %	0 %	0 %	60 %	525662600
34	NC_021739	AAATC	2	10	54572	54581	60 %	20 %	0 %	20 %	525662601
35	NC_021739	ATACC	2	10	56664	56673	40 %	20 %	0 %	40 %	525662603
36	NC_021739	TTTGG	2	10	57358	57367	0 %	60 %	40 %	0 %	525662604
37	NC_021739	TACCG	2	10	57601	57610	20 %	20 %	20 %	40 %	525662604
38	NC_021739	TAAGA	2	10	57639	57648	60 %	20 %	20 %	0 %	525662604
39	NC_021739	TTTAA	2	10	59638	59647	40 %	60 %	0 %	0 %	525662605
40	NC_021739	TCAAA	2	10	60396	60405	60 %	20 %	0 %	20 %	525662607
41	NC_021739	AAATG	2	10	61510	61519	60 %	20 %	20 %	0 %	525662609
42	NC_021739	GTTTT	2	10	61962	61971	0 %	80 %	20 %	0 %	525662609
43	NC_021739	CATAA	2	10	62752	62761	60 %	20 %	0 %	20 %	525662609
44	NC_021739	ATCTC	2	10	63020	63029	20 %	40 %	0 %	40 %	525662609
45	NC_021739	AAATC	2	10	63275	63284	60 %	20 %	0 %	20 %	525662609
46	NC_021739	ATTTA	2	10	63961	63970	40 %	60 %	0 %	0 %	525662609
47	NC_021739	ATTGC	2	10	64728	64737	20 %	40 %	20 %	20 %	525662609
48	NC_021739	ATTGT	2	10	64801	64810	20 %	60 %	20 %	0 %	525662609
49	NC_021739	TGTAA	2	10	70388	70397	40 %	40 %	20 %	0 %	525662616
50	NC_021739	GGATA	2	10	73030	73039	40 %	20 %	40 %	0 %	525662618
51	NC_021739	ATTTA	2	10	74012	74021	40 %	60 %	0 %	0 %	525662619
52	NC_021739	GCTTT	2	10	76420	76429	0 %	60 %	20 %	20 %	525662621
53	NC_021739	ACACC	2	10	78975	78984	40 %	0 %	0 %	60 %	525662624
54	NC_021739	TAGAA	2	10	82699	82708	60 %	20 %	20 %	0 %	525662630
55	NC_021739	CGGTA	2	10	83165	83174	20 %	20 %	40 %	20 %	525662631
56	NC_021739	CTTCA	2	10	83831	83840	20 %	40 %	0 %	40 %	525662631
57	NC_021739	ACCGA	2	10	84069	84078	40 %	0 %	20 %	40 %	525662631
58	NC_021739	GATTG	2	10	86477	86486	20 %	40 %	40 %	0 %	525662633
59	NC_021739	TAAGC	2	10	88171	88180	40 %	20 %	20 %	20 %	525662636
60	NC_021739	AATTA	2	10	88313	88322	60 %	40 %	0 %	0 %	525662637
61	NC_021739	ACCAT	2	10	92821	92830	40 %	20 %	0 %	40 %	525662640
62	NC_021739	TATAA	2	10	93099	93108	60 %	40 %	0 %	0 %	525662640
63	NC_021739	ATTTT	2	10	93979	93988	20 %	80 %	0 %	0 %	525662641
64	NC_021739	AATAA	2	10	94351	94360	80 %	20 %	0 %	0 %	525662642
65	NC_021739	AATAG	2	10	95099	95108	60 %	20 %	20 %	0 %	525662643
66	NC_021739	CGCTA	2	10	98340	98349	20 %	20 %	20 %	40 %	525662648
67	NC_021739	AAATA	2	10	105599	105608	80 %	20 %	0 %	0 %	525662659
68	NC_021739	TTGTT	2	10	107368	107377	0 %	80 %	20 %	0 %	525662662
69	NC_021739	TTGGT	2	10	109053	109062	0 %	60 %	40 %	0 %	525662663
70	NC_021739	AACTG	2	10	110306	110315	40 %	20 %	20 %	20 %	525662665
71	NC_021739	TTAGC	2	10	113028	113037	20 %	40 %	20 %	20 %	525662668
72	NC_021739	TAGAT	2	10	113770	113779	40 %	40 %	20 %	0 %	525662668
73	NC_021739	TTAGA	2	10	114170	114179	40 %	40 %	20 %	0 %	525662669
74	NC_021739	ACGCT	2	10	114180	114189	20 %	20 %	20 %	40 %	525662669
75	NC_021739	AGTTA	2	10	114205	114214	40 %	40 %	20 %	0 %	525662669
76	NC_021739	GCACG	2	10	117709	117718	20 %	0 %	40 %	40 %	525662672
77	NC_021739	TCAAA	2	10	119506	119515	60 %	20 %	0 %	20 %	525662675
78	NC_021739	AAAAG	2	10	123269	123278	80 %	0 %	20 %	0 %	525662383
79	NC_021739	CACGA	2	10	123303	123312	40 %	0 %	20 %	40 %	525662383
80	NC_021739	AAATT	2	10	124457	124466	60 %	40 %	0 %	0 %	525662679
81	NC_021739	ATTCC	2	10	127780	127789	20 %	40 %	0 %	40 %	525662685
82	NC_021739	TGAAG	2	10	129244	129253	40 %	20 %	40 %	0 %	525662687
83	NC_021739	TTTCA	2	10	129889	129898	20 %	60 %	0 %	20 %	525662688
84	NC_021739	GTCCG	2	10	135555	135564	0 %	20 %	40 %	40 %	525662698
85	NC_021739	ATTTT	2	10	137622	137631	20 %	80 %	0 %	0 %	525662702
86	NC_021739	GCAAT	2	10	139068	139077	40 %	20 %	20 %	20 %	525662703
87	NC_021739	ATTCT	2	10	139236	139245	20 %	60 %	0 %	20 %	525662386
88	NC_021739	AGTTG	2	10	139525	139534	20 %	40 %	40 %	0 %	525662386
89	NC_021739	GGATT	2	10	141693	141702	20 %	40 %	40 %	0 %	525662707
90	NC_021739	AGAAA	2	10	141933	141942	80 %	0 %	20 %	0 %	525662707
91	NC_021739	CAAAC	2	10	144199	144208	60 %	0 %	0 %	40 %	525662391
92	NC_021739	GAGAA	2	10	144768	144777	60 %	0 %	40 %	0 %	525662392
93	NC_021739	AGGCG	2	10	146318	146327	20 %	0 %	60 %	20 %	525662393
94	NC_021739	ACAAA	2	10	149209	149218	80 %	0 %	0 %	20 %	525662712
95	NC_021739	AAATC	2	10	149871	149880	60 %	20 %	0 %	20 %	525662396
96	NC_021739	AGCCT	2	10	150005	150014	20 %	20 %	20 %	40 %	525662396
97	NC_021739	GGAAA	2	10	150201	150210	60 %	0 %	40 %	0 %	525662397
98	NC_021739	AATGG	2	10	153416	153425	40 %	20 %	40 %	0 %	525662716
99	NC_021739	CAAGA	2	10	154645	154654	60 %	0 %	20 %	20 %	525662718
100	NC_021739	GATTG	2	10	155343	155352	20 %	40 %	40 %	0 %	525662719
101	NC_021739	AATGC	2	10	160002	160011	40 %	20 %	20 %	20 %	525662400
102	NC_021739	TAAAT	2	10	161490	161499	60 %	40 %	0 %	0 %	525662723
103	NC_021739	ACTCA	2	10	169484	169493	40 %	20 %	0 %	40 %	525662724
104	NC_021739	TGTAG	2	10	169716	169725	20 %	40 %	40 %	0 %	525662724
105	NC_021739	TTTAA	2	10	173957	173966	40 %	60 %	0 %	0 %	525662729
106	NC_021739	AAATG	2	10	174184	174193	60 %	20 %	20 %	0 %	525662729
107	NC_021739	TTTAG	2	10	176171	176180	20 %	60 %	20 %	0 %	525662731
108	NC_021739	GGTTT	2	10	176702	176711	0 %	60 %	40 %	0 %	525662731
109	NC_021739	GAGCG	2	10	177861	177870	20 %	0 %	60 %	20 %	525662732
110	NC_021739	CAGTC	2	10	181018	181027	20 %	20 %	20 %	40 %	525662734
111	NC_021739	TCTTG	2	10	181629	181638	0 %	60 %	20 %	20 %	525662734
112	NC_021739	CCTTT	2	10	183393	183402	0 %	60 %	0 %	40 %	525662735
113	NC_021739	GAAAA	2	10	184489	184498	80 %	0 %	20 %	0 %	525662736
114	NC_021739	TTTTC	2	10	184506	184515	0 %	80 %	0 %	20 %	525662736
115	NC_021739	GAATT	2	10	185592	185601	40 %	40 %	20 %	0 %	525662737
116	NC_021739	AATGA	2	10	185610	185619	60 %	20 %	20 %	0 %	525662737
117	NC_021739	TTCAC	2	10	189236	189245	20 %	40 %	0 %	40 %	525662740
118	NC_021739	GCATC	2	10	193819	193828	20 %	20 %	20 %	40 %	525662746
119	NC_021739	CAATG	2	10	198441	198450	40 %	20 %	20 %	20 %	525662749
120	NC_021739	TACCG	2	10	201346	201355	20 %	20 %	20 %	40 %	525662752
121	NC_021739	AGGTA	2	10	202783	202792	40 %	20 %	40 %	0 %	525662754
122	NC_021739	GATTC	2	10	204574	204583	20 %	40 %	20 %	20 %	525662403
123	NC_021739	ACCCA	2	10	205498	205507	40 %	0 %	0 %	60 %	525662404
124	NC_021739	AGGCG	2	10	207261	207270	20 %	0 %	60 %	20 %	525662405
125	NC_021739	AATGC	2	10	209741	209750	40 %	20 %	20 %	20 %	525662408
126	NC_021739	GAACC	2	10	212295	212304	40 %	0 %	20 %	40 %	525662412
127	NC_021739	AAAAT	2	10	213453	213462	80 %	20 %	0 %	0 %	525662414
128	NC_021739	CCCCG	2	10	217743	217752	0 %	0 %	20 %	80 %	525662418
129	NC_021739	AGTGC	2	10	218873	218882	20 %	20 %	40 %	20 %	525662419
130	NC_021739	GCAAA	2	10	219096	219105	60 %	0 %	20 %	20 %	525662419
131	NC_021739	CAAAT	2	10	221376	221385	60 %	20 %	0 %	20 %	525662759
132	NC_021739	ATTTT	2	10	224794	224803	20 %	80 %	0 %	0 %	525662762
133	NC_021739	GCGAG	2	10	226035	226044	20 %	0 %	60 %	20 %	525662425
134	NC_021739	ATTAT	2	10	227050	227059	40 %	60 %	0 %	0 %	525662763
135	NC_021739	CTTTC	2	10	227611	227620	0 %	60 %	0 %	40 %	525662764
136	NC_021739	GCATT	2	10	227675	227684	20 %	40 %	20 %	20 %	525662764
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283	NC_021739	TTGAT	2	10	463217	463226	20 %	60 %	20 %	0 %	525662947
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374	NC_021739	ACCGC	2	10	625556	625565	20 %	0 %	20 %	60 %	525663104
375	NC_021739	CATTG	2	10	627539	627548	20 %	40 %	20 %	20 %	525662471
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378	NC_021739	AACCG	2	10	634879	634888	40 %	0 %	20 %	40 %	525662475
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380	NC_021739	TCAAA	2	10	637486	637495	60 %	20 %	0 %	20 %	525662478
381	NC_021739	CACAA	2	10	638108	638117	60 %	0 %	0 %	40 %	525663118
382	NC_021739	TAAAC	2	10	638239	638248	60 %	20 %	0 %	20 %	525663118
383	NC_021739	TTTAG	2	10	640925	640934	20 %	60 %	20 %	0 %	525663121
384	NC_021739	GCAAA	2	10	641740	641749	60 %	0 %	20 %	20 %	525663124
385	NC_021739	AAAAG	2	10	643220	643229	80 %	0 %	20 %	0 %	525663125
386	NC_021739	AGCAC	2	10	643658	643667	40 %	0 %	20 %	40 %	525662482
387	NC_021739	CATTT	2	10	644975	644984	20 %	60 %	0 %	20 %	525663126
388	NC_021739	TCATT	2	10	650257	650266	20 %	60 %	0 %	20 %	525663128
389	NC_021739	ATCAC	2	10	651118	651127	40 %	20 %	0 %	40 %	525663129
390	NC_021739	AAATC	2	10	651605	651614	60 %	20 %	0 %	20 %	525663129
391	NC_021739	AGTGC	2	10	652630	652639	20 %	20 %	40 %	20 %	525663130
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