MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D174

Total Repeats: 44153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_021739	A	8	8	187949	187956	100 %	0 %	0 %	0 %	525662739
3003	NC_021739	TAT	2	6	187976	187981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662739
3004	NC_021739	GCT	2	6	188002	188007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662739
3005	NC_021739	AGTG	2	8	188025	188032	25 %	25 %	50 %	0 %	525662739
3006	NC_021739	AAC	2	6	188040	188045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662739
3007	NC_021739	TA	3	6	188168	188173	50 %	50 %	0 %	0 %	525662739
3008	NC_021739	GTC	2	6	188183	188188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662739
3009	NC_021739	GAA	2	6	188197	188202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662739
3010	NC_021739	TCT	2	6	188315	188320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525662739
3011	NC_021739	TCA	2	6	188347	188352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662739
3012	NC_021739	TTCGAT	2	12	188377	188388	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525662739
3013	NC_021739	GTT	2	6	188419	188424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525662739
3014	NC_021739	CAA	2	6	188437	188442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662739
3015	NC_021739	CAA	2	6	188461	188466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662739
3016	NC_021739	CTG	2	6	188501	188506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662739
3017	NC_021739	CGT	2	6	188530	188535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662739
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3019	NC_021739	CGT	2	6	188674	188679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662739
3020	NC_021739	ATG	2	6	188777	188782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662739
3021	NC_021739	AAT	2	6	188789	188794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662739
3022	NC_021739	ACT	2	6	188919	188924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662740
3023	NC_021739	CAA	2	6	188936	188941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662740
3024	NC_021739	TTA	2	6	189036	189041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662740
3025	NC_021739	TG	3	6	189069	189074	0 %	50 %	50 %	0 %	525662740
3026	NC_021739	CAG	2	6	189137	189142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662740
3027	NC_021739	ATG	2	6	189164	189169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662740
3028	NC_021739	TTCAC	2	10	189236	189245	20 %	40 %	0 %	40 %	525662740
3029	NC_021739	CAA	2	6	189316	189321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662740
3030	NC_021739	TTA	2	6	189356	189361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662740
3031	NC_021739	TTG	2	6	189392	189397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525662740
3032	NC_021739	ATG	2	6	189554	189559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662740
3033	NC_021739	GAA	2	6	189630	189635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662740
3034	NC_021739	AAT	2	6	189649	189654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662740
3035	NC_021739	TAT	2	6	189797	189802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662741
3036	NC_021739	A	7	7	189890	189896	100 %	0 %	0 %	0 %	525662741
3037	NC_021739	GCT	2	6	189899	189904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662741
3038	NC_021739	TTG	2	6	189915	189920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525662741
3039	NC_021739	ATC	2	6	189925	189930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662741
3040	NC_021739	CAA	2	6	190005	190010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662741
3041	NC_021739	AG	3	6	190096	190101	50 %	0 %	50 %	0 %	525662741
3042	NC_021739	TGA	2	6	190103	190108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662741
3043	NC_021739	GATTGC	2	12	190166	190177	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525662741
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3045	NC_021739	A	6	6	190226	190231	100 %	0 %	0 %	0 %	525662741
3046	NC_021739	ATT	2	6	190233	190238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662741
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3048	NC_021739	TA	3	6	190381	190386	50 %	50 %	0 %	0 %	525662741
3049	NC_021739	AGA	2	6	190394	190399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662741
3050	NC_021739	CGT	2	6	190419	190424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662741
3051	NC_021739	TAT	2	6	190453	190458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662741
3052	NC_021739	ATT	2	6	190472	190477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662741
3053	NC_021739	TAA	2	6	190493	190498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662741
3054	NC_021739	GATT	2	8	190553	190560	25 %	50 %	25 %	0 %	525662741
3055	NC_021739	CTG	2	6	190627	190632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662741
3056	NC_021739	AGCAAC	2	12	190762	190773	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525662741
3057	NC_021739	GGA	2	6	190787	190792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525662741
3058	NC_021739	ATT	2	6	190800	190805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662741
3059	NC_021739	ATG	2	6	190933	190938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662741
3060	NC_021739	GAC	2	6	190964	190969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662741
3061	NC_021739	AAG	2	6	190987	190992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662741
3062	NC_021739	ACA	2	6	191000	191005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662741
3063	NC_021739	A	6	6	191014	191019	100 %	0 %	0 %	0 %	525662741
3064	NC_021739	CAG	2	6	191097	191102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662741
3065	NC_021739	ATG	3	9	191194	191202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662741
3066	NC_021739	TGC	2	6	191243	191248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662741
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3068	NC_021739	TAA	2	6	191391	191396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662741
3069	NC_021739	CCG	2	6	191526	191531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525662742
3070	NC_021739	CGG	2	6	191558	191563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525662742
3071	NC_021739	GGT	2	6	191608	191613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525662742
3072	NC_021739	GCTG	2	8	191633	191640	0 %	25 %	50 %	25 %	525662742
3073	NC_021739	ATT	2	6	191744	191749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662742
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3079	NC_021739	TGC	2	6	192178	192183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662743
3080	NC_021739	GAT	2	6	192212	192217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662743
3081	NC_021739	TGG	2	6	192241	192246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525662743
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3084	NC_021739	GA	3	6	192591	192596	50 %	0 %	50 %	0 %	525662743
3085	NC_021739	ATT	2	6	192604	192609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662743
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3087	NC_021739	ATT	2	6	192724	192729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662744
3088	NC_021739	AGG	2	6	192800	192805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525662744
3089	NC_021739	GGT	2	6	192828	192833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525662744
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3091	NC_021739	GCG	2	6	192863	192868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525662744
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3093	NC_021739	ATGA	2	8	192982	192989	50 %	25 %	25 %	0 %	525662745
3094	NC_021739	TGC	2	6	193027	193032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662745
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3096	NC_021739	GCG	2	6	193059	193064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525662745
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3099	NC_021739	TGAT	2	8	193340	193347	25 %	50 %	25 %	0 %	525662745
3100	NC_021739	TGA	2	6	193365	193370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662745
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3102	NC_021739	GA	3	6	193693	193698	50 %	0 %	50 %	0 %	525662746
3103	NC_021739	TTAC	2	8	193722	193729	25 %	50 %	0 %	25 %	525662746
3104	NC_021739	TTC	2	6	193805	193810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525662746
3105	NC_021739	GCATC	2	10	193819	193828	20 %	20 %	20 %	40 %	525662746
3106	NC_021739	ACC	2	6	193865	193870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525662746
3107	NC_021739	GGC	2	6	193898	193903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525662746
3108	NC_021739	AATT	2	8	193910	193917	50 %	50 %	0 %	0 %	525662746
3109	NC_021739	T	7	7	193923	193929	0 %	100 %	0 %	0 %	525662746
3110	NC_021739	CTT	2	6	193963	193968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525662746
3111	NC_021739	CAT	2	6	193997	194002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662746
3112	NC_021739	GTT	2	6	194368	194373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525662747
3113	NC_021739	A	7	7	194382	194388	100 %	0 %	0 %	0 %	525662747
3114	NC_021739	ATT	2	6	194409	194414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662747
3115	NC_021739	ATTT	2	8	194444	194451	25 %	75 %	0 %	0 %	525662747
3116	NC_021739	TCG	2	6	194478	194483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662747
3117	NC_021739	GAA	2	6	194527	194532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662747
3118	NC_021739	GGT	2	6	194602	194607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525662747
3119	NC_021739	TAT	2	6	194612	194617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662747
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3121	NC_021739	ATG	2	6	194675	194680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662747
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3241	NC_021739	A	6	6	202686	202691	100 %	0 %	0 %	0 %	525662754
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3243	NC_021739	CAT	2	6	202747	202752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662754
3244	NC_021739	TCA	2	6	202757	202762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662754
3245	NC_021739	AGGTA	2	10	202783	202792	40 %	20 %	40 %	0 %	525662754
3246	NC_021739	TGT	2	6	202855	202860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525662754
3247	NC_021739	AGA	2	6	202963	202968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662754
3248	NC_021739	GTT	2	6	202973	202978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525662754
3249	NC_021739	GCA	3	9	203021	203029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662754
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3251	NC_021739	TA	3	6	203124	203129	50 %	50 %	0 %	0 %	525662754
3252	NC_021739	A	6	6	204024	204029	100 %	0 %	0 %	0 %	525662403
3253	NC_021739	GCA	2	6	204037	204042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662403
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3256	NC_021739	AGC	2	6	204111	204116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662403
3257	NC_021739	CAT	2	6	204122	204127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662403
3258	NC_021739	A	6	6	204150	204155	100 %	0 %	0 %	0 %	525662403
3259	NC_021739	AAT	2	6	204186	204191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662403
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3262	NC_021739	TCT	2	6	204292	204297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525662403
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3264	NC_021739	CAAG	2	8	204458	204465	50 %	0 %	25 %	25 %	525662403
3265	NC_021739	GATTC	2	10	204574	204583	20 %	40 %	20 %	20 %	525662403
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3269	NC_021739	TGA	2	6	204728	204733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662403
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3271	NC_021739	TGA	2	6	204753	204758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662403
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3274	NC_021739	T	6	6	204956	204961	0 %	100 %	0 %	0 %	525662403
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3344	NC_021739	AGCA	2	8	209850	209857	50 %	0 %	25 %	25 %	525662408
3345	NC_021739	TGA	3	9	209881	209889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662408
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3352	NC_021739	G	6	6	210400	210405	0 %	0 %	100 %	0 %	525662755
3353	NC_021739	TTA	2	6	210438	210443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662755
3354	NC_021739	TAT	2	6	210573	210578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662410
3355	NC_021739	CAG	2	6	210872	210877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662410
3356	NC_021739	ACA	2	6	210940	210945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662410
3357	NC_021739	CCG	2	6	211044	211049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525662410
3358	NC_021739	AGAAAA	2	12	211050	211061	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525662410
3359	NC_021739	AGG	2	6	211079	211084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525662410
3360	NC_021739	GCAC	2	8	211218	211225	25 %	0 %	25 %	50 %	525662756
3361	NC_021739	GAC	2	6	211320	211325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662756
3362	NC_021739	CCT	2	6	211428	211433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525662756
3363	NC_021739	GCT	2	6	211445	211450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662756
3364	NC_021739	CAAC	2	8	211451	211458	50 %	0 %	0 %	50 %	525662756
3365	NC_021739	AG	3	6	211738	211743	50 %	0 %	50 %	0 %	525662411
3366	NC_021739	GAT	2	6	211910	211915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662411
3367	NC_021739	CA	3	6	211943	211948	50 %	0 %	0 %	50 %	525662412
3368	NC_021739	AT	3	6	211957	211962	50 %	50 %	0 %	0 %	525662412
3369	NC_021739	GTG	2	6	212070	212075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525662412
3370	NC_021739	GTT	2	6	212099	212104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525662412
3371	NC_021739	CAA	2	6	212195	212200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662412
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3374	NC_021739	CAA	2	6	212473	212478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662413
3375	NC_021739	CAA	2	6	212524	212529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662413
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3379	NC_021739	TGA	2	6	212790	212795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662413
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3383	NC_021739	ATA	2	6	213025	213030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662757
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3389	NC_021739	AAT	2	6	213221	213226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662414
3390	NC_021739	AGT	2	6	213238	213243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662414
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3392	NC_021739	A	6	6	213351	213356	100 %	0 %	0 %	0 %	525662414
3393	NC_021739	A	7	7	213380	213386	100 %	0 %	0 %	0 %	525662414
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3395	NC_021739	A	7	7	213512	213518	100 %	0 %	0 %	0 %	525662414
3396	NC_021739	CAA	2	6	213527	213532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662414
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3399	NC_021739	AGA	2	6	213655	213660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662414
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3403	NC_021739	GTG	2	6	213951	213956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525662414
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3441	NC_021739	TG	3	6	216231	216236	0 %	50 %	50 %	0 %	525662758
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3452	NC_021739	CCG	2	6	217054	217059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525662416
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3469	NC_021739	GTAACG	2	12	218218	218229	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525662418
3470	NC_021739	ATC	2	6	218269	218274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662418
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3473	NC_021739	ACTC	2	8	218479	218486	25 %	25 %	0 %	50 %	525662418
3474	NC_021739	CGC	2	6	218496	218501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525662418
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3476	NC_021739	TCA	2	6	218651	218656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662419
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3478	NC_021739	CA	3	6	218733	218738	50 %	0 %	0 %	50 %	525662419
3479	NC_021739	ATT	2	6	218787	218792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662419
3480	NC_021739	GAA	2	6	218810	218815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662419
3481	NC_021739	ATT	2	6	218831	218836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662419
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3483	NC_021739	GAAA	2	8	218856	218863	75 %	0 %	25 %	0 %	525662419
3484	NC_021739	AGTGC	2	10	218873	218882	20 %	20 %	40 %	20 %	525662419
3485	NC_021739	GAA	2	6	218883	218888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662419
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3487	NC_021739	ACGGCA	2	12	218941	218952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662419
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3489	NC_021739	A	6	6	219003	219008	100 %	0 %	0 %	0 %	525662419
3490	NC_021739	TTGA	2	8	219029	219036	25 %	50 %	25 %	0 %	525662419
3491	NC_021739	GCAAA	2	10	219096	219105	60 %	0 %	20 %	20 %	525662419
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3493	NC_021739	ATT	2	6	219134	219139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662419
3494	NC_021739	ATTT	2	8	219192	219199	25 %	75 %	0 %	0 %	525662419
3495	NC_021739	CAA	2	6	219204	219209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662419
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3498	NC_021739	TCA	2	6	219370	219375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662759
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