MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5079

Total Repeats: 101623

< Previous12...192193194195196197198199200201202203204Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
101501	NC_021251	GTC	2	6	4407598	4407603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928534
101502	NC_021251	AGC	2	6	4407638	4407643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928534
101503	NC_021251	CCG	2	6	4407651	4407656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928534
101504	NC_021251	GGT	2	6	4407731	4407736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928534
101505	NC_021251	GGT	2	6	4407846	4407851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928534
101506	NC_021251	GCT	2	6	4407915	4407920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928534
101507	NC_021251	TCA	2	6	4408294	4408299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928535
101508	NC_021251	GC	3	6	4408310	4408315	0 %	0 %	50 %	50 %	506928535
101509	NC_021251	ATC	2	6	4408319	4408324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928535
101510	NC_021251	CCA	2	6	4408339	4408344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928535
101511	NC_021251	GGT	2	6	4408394	4408399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928535
101512	NC_021251	CGC	2	6	4408449	4408454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928535
101513	NC_021251	GGC	2	6	4408455	4408460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928535
101514	NC_021251	GTCGC	2	10	4408470	4408479	0 %	20 %	40 %	40 %	506928535
101515	NC_021251	CGA	2	6	4408558	4408563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928535
101516	NC_021251	CTC	2	6	4408577	4408582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928535
101517	NC_021251	TCCGG	2	10	4408590	4408599	0 %	20 %	40 %	40 %	506928535
101518	NC_021251	CAG	2	6	4408610	4408615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928535
101519	NC_021251	CGG	2	6	4408645	4408650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928535
101520	NC_021251	CGC	2	6	4408656	4408661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928535
101521	NC_021251	GC	3	6	4408727	4408732	0 %	0 %	50 %	50 %	506928535
101522	NC_021251	TCG	2	6	4408761	4408766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928535
101523	NC_021251	GCC	2	6	4408782	4408787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928535
101524	NC_021251	CTT	2	6	4408789	4408794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928535
101525	NC_021251	AGG	2	6	4408830	4408835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506928535
101526	NC_021251	GCA	2	6	4408843	4408848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928535
101527	NC_021251	TCG	2	6	4408854	4408859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928535
101528	NC_021251	CACG	2	8	4408867	4408874	25 %	0 %	25 %	50 %	506928535
101529	NC_021251	TGG	2	6	4408885	4408890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928535
101530	NC_021251	CAC	2	6	4408979	4408984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928535
101531	NC_021251	TCG	2	6	4409043	4409048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928535
101532	NC_021251	CCG	2	6	4409142	4409147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928535
101533	NC_021251	GTC	2	6	4409286	4409291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928536
101534	NC_021251	TGG	2	6	4409302	4409307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928536
101535	NC_021251	CGCGC	2	10	4409353	4409362	0 %	0 %	40 %	60 %	506928536
101536	NC_021251	GAT	2	6	4409380	4409385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928536
101537	NC_021251	TCG	2	6	4409474	4409479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928536
101538	NC_021251	GGT	2	6	4409530	4409535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928536
101539	NC_021251	AC	3	6	4409595	4409600	50 %	0 %	0 %	50 %	506928536
101540	NC_021251	GTA	2	6	4409611	4409616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928536
101541	NC_021251	ATC	2	6	4409633	4409638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928536
101542	NC_021251	CGA	2	6	4409652	4409657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928536
101543	NC_021251	CAG	2	6	4409671	4409676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928536
101544	NC_021251	GGGC	2	8	4409686	4409693	0 %	0 %	75 %	25 %	506928536
101545	NC_021251	CGA	2	6	4409697	4409702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928536
101546	NC_021251	AGTCGA	2	12	4409709	4409720	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	506928536
101547	NC_021251	CG	3	6	4409760	4409765	0 %	0 %	50 %	50 %	506928536
101548	NC_021251	CCA	2	6	4409766	4409771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928536
101549	NC_021251	GATC	2	8	4409802	4409809	25 %	25 %	25 %	25 %	506928536
101550	NC_021251	CGCT	2	8	4409831	4409838	0 %	25 %	25 %	50 %	506928536
101551	NC_021251	CGGT	2	8	4409918	4409925	0 %	25 %	50 %	25 %	506928536
101552	NC_021251	GATCGA	2	12	4409958	4409969	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	506928536
101553	NC_021251	CGG	2	6	4410018	4410023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928536
101554	NC_021251	GTC	2	6	4410026	4410031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928536
101555	NC_021251	GTGG	2	8	4410100	4410107	0 %	25 %	75 %	0 %	506928536
101556	NC_021251	CTG	2	6	4410132	4410137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928536
101557	NC_021251	TCG	2	6	4410189	4410194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928536
101558	NC_021251	GTCGGT	2	12	4410215	4410226	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	506928536
101559	NC_021251	CG	3	6	4410379	4410384	0 %	0 %	50 %	50 %	506928537
101560	NC_021251	CAC	2	6	4410429	4410434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928537
101561	NC_021251	ATC	2	6	4410460	4410465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928537
101562	NC_021251	TCG	2	6	4410487	4410492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928537
101563	NC_021251	GCC	2	6	4410606	4410611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928537
101564	NC_021251	CTC	2	6	4410633	4410638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928537
101565	NC_021251	GC	3	6	4410640	4410645	0 %	0 %	50 %	50 %	506928537
101566	NC_021251	TC	3	6	4410686	4410691	0 %	50 %	0 %	50 %	506928537
101567	NC_021251	GAA	2	6	4410692	4410697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506928537
101568	NC_021251	GAG	2	6	4410819	4410824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506928537
101569	NC_021251	CCA	2	6	4410887	4410892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928537
101570	NC_021251	CCG	2	6	4410933	4410938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928537
101571	NC_021251	CGC	2	6	4410972	4410977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928537
101572	NC_021251	TTCGCT	2	12	4411169	4411180	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	506928538
101573	NC_021251	CGC	2	6	4411278	4411283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928538
101574	NC_021251	TCG	2	6	4411290	4411295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928538
101575	NC_021251	GCC	2	6	4411302	4411307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928538
101576	NC_021251	TCC	2	6	4411311	4411316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928538
101577	NC_021251	GCC	2	6	4411321	4411326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928538
101578	NC_021251	TCT	2	6	4411372	4411377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928538
101579	NC_021251	GTC	2	6	4411451	4411456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928538
101580	NC_021251	CAC	2	6	4411472	4411477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928538
101581	NC_021251	TC	3	6	4411580	4411585	0 %	50 %	0 %	50 %	506928538
101582	NC_021251	TCG	2	6	4411593	4411598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928538
101583	NC_021251	TCC	2	6	4411623	4411628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928538
101584	NC_021251	CGTCGA	2	12	4411654	4411665	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	506928538
101585	NC_021251	GGT	2	6	4411670	4411675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928538
101586	NC_021251	T	6	6	4411774	4411779	0 %	100 %	0 %	0 %	506928539
101587	NC_021251	GCC	2	6	4411982	4411987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928539
101588	NC_021251	CCT	2	6	4412001	4412006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928539
101589	NC_021251	CCT	4	12	4412016	4412027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928539
101590	NC_021251	TGC	3	9	4412051	4412059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928539
101591	NC_021251	GAT	2	6	4412095	4412100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928539
101592	NC_021251	CCG	2	6	4412120	4412125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928539
101593	NC_021251	TCA	2	6	4412166	4412171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928539
101594	NC_021251	GCC	2	6	4412192	4412197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928539
101595	NC_021251	CG	3	6	4412210	4412215	0 %	0 %	50 %	50 %	506928539
101596	NC_021251	CG	3	6	4412221	4412226	0 %	0 %	50 %	50 %	506928539
101597	NC_021251	ATC	2	6	4412258	4412263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928539
101598	NC_021251	CACC	2	8	4412271	4412278	25 %	0 %	0 %	75 %	506928539
101599	NC_021251	CGA	2	6	4412304	4412309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928539
101600	NC_021251	CAGT	2	8	4412415	4412422	25 %	25 %	25 %	25 %	506928539
101601	NC_021251	TGG	2	6	4412664	4412669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928539
101602	NC_021251	CAG	2	6	4412698	4412703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928539
101603	NC_021251	CGCA	2	8	4412704	4412711	25 %	0 %	25 %	50 %	506928539
101604	NC_021251	GAA	2	6	4412749	4412754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506928539
101605	NC_021251	GTA	2	6	4412818	4412823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928539
101606	NC_021251	GAA	2	6	4412839	4412844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506928539
101607	NC_021251	CAAA	2	8	4412847	4412854	75 %	0 %	0 %	25 %	506928539
101608	NC_021251	GTC	2	6	4412891	4412896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928540
101609	NC_021251	GTCT	2	8	4412912	4412919	0 %	50 %	25 %	25 %	506928540
101610	NC_021251	TCC	2	6	4412963	4412968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928540
101611	NC_021251	ACG	2	6	4413085	4413090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928540
101612	NC_021251	GCG	2	6	4413100	4413105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928540
101613	NC_021251	AGAC	2	8	4413197	4413204	50 %	0 %	25 %	25 %	506928540
101614	NC_021251	TGC	2	6	4413257	4413262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928541
101615	NC_021251	CCGAG	2	10	4413268	4413277	20 %	0 %	40 %	40 %	506928541
101616	NC_021251	GCT	2	6	4413289	4413294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928541
101617	NC_021251	GC	3	6	4413300	4413305	0 %	0 %	50 %	50 %	506928541
101618	NC_021251	CAC	2	6	4413310	4413315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928541
101619	NC_021251	CG	3	6	4413429	4413434	0 %	0 %	50 %	50 %	506928541
101620	NC_021251	CCA	2	6	4413454	4413459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928541
101621	NC_021251	GTT	2	6	4413506	4413511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	506928541
101622	NC_021251	CGC	2	6	4413679	4413684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928542
101623	NC_021251	GTT	2	6	4413687	4413692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	506928542

< Previous12...192193194195196197198199200201202203204Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.