MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_021200	GAG	2	6	167730	167735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074538
4003	NC_021200	GAA	2	6	167770	167775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074538
4004	NC_021200	TGA	2	6	167779	167784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074538
4005	NC_021200	ATC	2	6	167820	167825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074538
4006	NC_021200	CTG	2	6	167841	167846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4007	NC_021200	CACT	2	8	167868	167875	25 %	25 %	0 %	50 %	499074538
4008	NC_021200	CGC	2	6	167891	167896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074538
4009	NC_021200	GCT	2	6	167912	167917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4010	NC_021200	GCCT	2	8	167937	167944	0 %	25 %	25 %	50 %	499074538
4011	NC_021200	GCC	2	6	167956	167961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074538
4012	NC_021200	CTGG	2	8	168041	168048	0 %	25 %	50 %	25 %	499074538
4013	NC_021200	AGA	2	6	168061	168066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074538
4014	NC_021200	CTG	2	6	168171	168176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4015	NC_021200	CGG	2	6	168203	168208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074538
4016	NC_021200	C	6	6	168228	168233	0 %	0 %	0 %	100 %	499074538
4017	NC_021200	AGC	2	6	168295	168300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4018	NC_021200	GTG	2	6	168306	168311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074538
4019	NC_021200	CAG	2	6	168345	168350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4020	NC_021200	CGG	2	6	168383	168388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074538
4021	NC_021200	CAC	2	6	168464	168469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074538
4022	NC_021200	ATG	2	6	168523	168528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074538
4023	NC_021200	AAG	2	6	168534	168539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074538
4024	NC_021200	GCGG	2	8	168551	168558	0 %	0 %	75 %	25 %	499074538
4025	NC_021200	CCG	2	6	168564	168569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074538
4026	NC_021200	CGG	2	6	168590	168595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074538
4027	NC_021200	TGC	3	9	168658	168666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4028	NC_021200	GCT	3	9	168677	168685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4029	NC_021200	GGT	2	6	168707	168712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074538
4030	NC_021200	TGA	2	6	168733	168738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074538
4031	NC_021200	GC	3	6	168739	168744	0 %	0 %	50 %	50 %	499074538
4032	NC_021200	TCG	2	6	168784	168789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4033	NC_021200	CGC	2	6	168826	168831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074538
4034	NC_021200	TGG	3	9	168835	168843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074538
4035	NC_021200	GTC	2	6	168855	168860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4036	NC_021200	GC	3	6	168921	168926	0 %	0 %	50 %	50 %	499074538
4037	NC_021200	ACC	2	6	168972	168977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074538
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4039	NC_021200	GCC	3	9	168993	169001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074538
4040	NC_021200	GTTC	2	8	169024	169031	0 %	50 %	25 %	25 %	499074538
4041	NC_021200	TGA	2	6	169051	169056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074538
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4043	NC_021200	GCT	3	9	169085	169093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4044	NC_021200	GGT	2	6	169103	169108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074538
4045	NC_021200	TGA	2	6	169132	169137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074538
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4050	NC_021200	CGA	2	6	169223	169228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074538
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4052	NC_021200	CCG	2	6	169266	169271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074538
4053	NC_021200	GGC	2	6	169274	169279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074538
4054	NC_021200	CGC	2	6	169289	169294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074538
4055	NC_021200	GCGCC	2	10	169296	169305	0 %	0 %	40 %	60 %	499074538
4056	NC_021200	CGC	2	6	169306	169311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074538
4057	NC_021200	CACC	2	8	169319	169326	25 %	0 %	0 %	75 %	499074538
4058	NC_021200	CGGC	2	8	169347	169354	0 %	0 %	50 %	50 %	499074538
4059	NC_021200	GC	3	6	169353	169358	0 %	0 %	50 %	50 %	499074538
4060	NC_021200	CAC	2	6	169403	169408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074538
4061	NC_021200	CCCGG	2	10	169415	169424	0 %	0 %	40 %	60 %	499074538
4062	NC_021200	CCGA	2	8	169434	169441	25 %	0 %	25 %	50 %	499074538
4063	NC_021200	GAC	2	6	169448	169453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074538
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4070	NC_021200	CGA	2	6	169592	169597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074538
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4104	NC_021200	GGC	2	6	170553	170558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074539
4105	NC_021200	CAGC	2	8	170610	170617	25 %	0 %	25 %	50 %	499074539
4106	NC_021200	GCA	2	6	170681	170686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074539
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4121	NC_021200	GGC	2	6	170913	170918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074539
4122	NC_021200	CGT	2	6	170948	170953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074539
4123	NC_021200	ACG	2	6	171145	171150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074540
4124	NC_021200	CG	3	6	171175	171180	0 %	0 %	50 %	50 %	499074540
4125	NC_021200	CG	3	6	171190	171195	0 %	0 %	50 %	50 %	499074540
4126	NC_021200	TGG	2	6	171204	171209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074540
4127	NC_021200	GTG	2	6	171231	171236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074540
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4129	NC_021200	TGG	3	9	171315	171323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074540
4130	NC_021200	GGT	2	6	171335	171340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074540
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4151	NC_021200	CGC	2	6	171911	171916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074540
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4155	NC_021200	CGGG	2	8	172003	172010	0 %	0 %	75 %	25 %	499074540
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4201	NC_021200	GGT	3	9	173932	173940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074542
4202	NC_021200	CTG	2	6	173960	173965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074542
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4230	NC_021200	TGA	2	6	174972	174977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074542
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4237	NC_021200	TTCGCG	2	12	175268	175279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074542
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4241	NC_021200	GCC	2	6	175405	175410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074542
4242	NC_021200	CGT	2	6	175477	175482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074542
4243	NC_021200	CGA	2	6	175492	175497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074542
4244	NC_021200	CAC	2	6	175624	175629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074542
4245	NC_021200	GGC	2	6	175630	175635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074542
4246	NC_021200	CCCGG	2	10	175645	175654	0 %	0 %	40 %	60 %	499074542
4247	NC_021200	GAG	2	6	175697	175702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074542
4248	NC_021200	CGG	2	6	175716	175721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074542
4249	NC_021200	GCA	2	6	175740	175745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074542
4250	NC_021200	CGG	2	6	175764	175769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074542
4251	NC_021200	AAG	2	6	175775	175780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074542
4252	NC_021200	CG	3	6	175786	175791	0 %	0 %	50 %	50 %	499074542
4253	NC_021200	GACC	2	8	175915	175922	25 %	0 %	25 %	50 %	499074542
4254	NC_021200	CGG	2	6	175934	175939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074542
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4261	NC_021200	ATC	2	6	176152	176157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074542
4262	NC_021200	GGC	2	6	176160	176165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074542
4263	NC_021200	CCG	2	6	176188	176193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074542
4264	NC_021200	CCGATC	2	12	176199	176210	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	499074542
4265	NC_021200	TGGCCG	2	12	176286	176297	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	499074542
4266	NC_021200	GGA	2	6	176308	176313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074542
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4270	NC_021200	CGG	3	9	176391	176399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074543
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4272	NC_021200	GC	3	6	176510	176515	0 %	0 %	50 %	50 %	499074543
4273	NC_021200	CG	3	6	176541	176546	0 %	0 %	50 %	50 %	499074543
4274	NC_021200	GC	3	6	176646	176651	0 %	0 %	50 %	50 %	499074543
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4277	NC_021200	CGC	2	6	176809	176814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074543
4278	NC_021200	GC	3	6	176883	176888	0 %	0 %	50 %	50 %	499074543
4279	NC_021200	GC	3	6	176945	176950	0 %	0 %	50 %	50 %	499074543
4280	NC_021200	GGT	2	6	176986	176991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074543
4281	NC_021200	CGG	2	6	176998	177003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074543
4282	NC_021200	GCA	2	6	177030	177035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074543
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4289	NC_021200	CGC	2	6	177365	177370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074543
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4312	NC_021200	TCG	2	6	178106	178111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074543
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4319	NC_021200	CGC	2	6	178353	178358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074543
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4321	NC_021200	GGT	2	6	178482	178487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074543
4322	NC_021200	TGCCC	2	10	178488	178497	0 %	20 %	20 %	60 %	499074543
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4332	NC_021200	GAC	2	6	178756	178761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074543
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4334	NC_021200	GCG	2	6	178836	178841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074544
4335	NC_021200	CAG	2	6	178865	178870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074544
4336	NC_021200	ACG	2	6	178890	178895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074544
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4338	NC_021200	GC	3	6	178948	178953	0 %	0 %	50 %	50 %	499074544
4339	NC_021200	TGG	2	6	178954	178959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074544
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4342	NC_021200	CGA	2	6	179005	179010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074544
4343	NC_021200	GGTC	2	8	179026	179033	0 %	25 %	50 %	25 %	499074544
4344	NC_021200	CGG	2	6	179050	179055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074544
4345	NC_021200	CCA	2	6	179113	179118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074544
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4347	NC_021200	CAG	2	6	179183	179188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074544
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4349	NC_021200	AGT	2	6	179284	179289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074544
4350	NC_021200	CG	3	6	179302	179307	0 %	0 %	50 %	50 %	499074544
4351	NC_021200	GC	3	6	179308	179313	0 %	0 %	50 %	50 %	499074544
4352	NC_021200	CAG	2	6	179369	179374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074544
4353	NC_021200	ACC	2	6	179385	179390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074544
4354	NC_021200	CG	3	6	179398	179403	0 %	0 %	50 %	50 %	499074544
4355	NC_021200	TCG	2	6	179413	179418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074544
4356	NC_021200	CGG	2	6	179537	179542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074545
4357	NC_021200	CGT	2	6	179546	179551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074545
4358	NC_021200	TCT	2	6	179552	179557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074545
4359	NC_021200	CGC	3	9	179564	179572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074545
4360	NC_021200	TTC	2	6	179578	179583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074545
4361	NC_021200	GAT	2	6	179586	179591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074545
4362	NC_021200	GAA	2	6	179616	179621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074545
4363	NC_021200	TTGGCG	2	12	179626	179637	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	499074545
4364	NC_021200	GTC	2	6	179682	179687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074545
4365	NC_021200	GC	3	6	179699	179704	0 %	0 %	50 %	50 %	499074545
4366	NC_021200	TCC	2	6	179743	179748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074545
4367	NC_021200	CGA	2	6	179796	179801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074545
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4370	NC_021200	GTA	2	6	179835	179840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074545
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4372	NC_021200	GCCG	2	8	179865	179872	0 %	0 %	50 %	50 %	499074545
4373	NC_021200	TCT	2	6	179897	179902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074545
4374	NC_021200	CGT	2	6	179942	179947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074545
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4379	NC_021200	CGG	2	6	180093	180098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074545
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4383	NC_021200	TGA	3	9	180161	180169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074545
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4385	NC_021200	CGG	2	6	180228	180233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074545
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4387	NC_021200	CGG	2	6	180263	180268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074545
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4391	NC_021200	CGG	2	6	180312	180317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074545
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4395	NC_021200	GGC	3	9	180355	180363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074545
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4399	NC_021200	CGG	2	6	180419	180424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074545
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4401	NC_021200	CGA	2	6	180479	180484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074545
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4442	NC_021200	CGG	2	6	181794	181799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074546
4443	NC_021200	CGG	2	6	181818	181823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074546
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4452	NC_021200	TGAG	2	8	182179	182186	25 %	25 %	50 %	0 %	499074547
4453	NC_021200	TCC	2	6	182206	182211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074547
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4464	NC_021200	AAGG	2	8	182657	182664	50 %	0 %	50 %	0 %	499074548
4465	NC_021200	CGC	2	6	182671	182676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074548
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4469	NC_021200	ATC	2	6	182969	182974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074548
4470	NC_021200	GC	4	8	183000	183007	0 %	0 %	50 %	50 %	499074548
4471	NC_021200	CG	3	6	183018	183023	0 %	0 %	50 %	50 %	499074548
4472	NC_021200	GCG	2	6	183072	183077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074548
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4474	NC_021200	CCG	2	6	183149	183154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074548
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4476	NC_021200	CCG	3	9	183163	183171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074548
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4478	NC_021200	GCT	2	6	183211	183216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074548
4479	NC_021200	CCGC	2	8	183231	183238	0 %	0 %	25 %	75 %	499074548
4480	NC_021200	AGG	2	6	183252	183257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074548
4481	NC_021200	GGT	2	6	183277	183282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074548
4482	NC_021200	CGG	2	6	183292	183297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074548
4483	NC_021200	CCA	2	6	183300	183305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074548
4484	NC_021200	TGC	2	6	183312	183317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074548
4485	NC_021200	CTG	2	6	183320	183325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074548
4486	NC_021200	CGA	2	6	183361	183366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074548
4487	NC_021200	CGGC	2	8	183418	183425	0 %	0 %	50 %	50 %	499074548
4488	NC_021200	TGA	2	6	183429	183434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074548
4489	NC_021200	CGG	2	6	183451	183456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074548
4490	NC_021200	TGA	3	9	183465	183473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074548
4491	NC_021200	GCT	2	6	183478	183483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074548
4492	NC_021200	GCT	2	6	183493	183498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074548
4493	NC_021200	CGCCC	2	10	183556	183565	0 %	0 %	20 %	80 %	499074548
4494	NC_021200	TGC	2	6	183582	183587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074548
4495	NC_021200	CGG	2	6	183616	183621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074548
4496	NC_021200	GGT	2	6	183661	183666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074548
4497	NC_021200	CCG	2	6	183672	183677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074548
4498	NC_021200	GGA	2	6	183748	183753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074548
4499	NC_021200	GGT	2	6	183778	183783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074548
4500	NC_021200	GGGC	2	8	183805	183812	0 %	0 %	75 %	25 %	499074548

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