MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021200	GGC	2	6	69832	69837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074459
1502	NC_021200	CGA	2	6	69988	69993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074459
1503	NC_021200	CGC	2	6	70006	70011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074459
1504	NC_021200	GC	3	6	70024	70029	0 %	0 %	50 %	50 %	499074459
1505	NC_021200	CGG	2	6	70065	70070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074459
1506	NC_021200	GGT	2	6	70155	70160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074459
1507	NC_021200	AGC	2	6	70215	70220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074459
1508	NC_021200	GTG	2	6	70241	70246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074459
1509	NC_021200	TCG	2	6	70322	70327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074459
1510	NC_021200	GGC	2	6	70386	70391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074459
1511	NC_021200	TCG	2	6	70407	70412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074459
1512	NC_021200	CGC	2	6	70420	70425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074459
1513	NC_021200	CGA	2	6	70455	70460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074459
1514	NC_021200	TCA	2	6	70461	70466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074459
1515	NC_021200	GCCTT	2	10	70490	70499	0 %	40 %	20 %	40 %	499074459
1516	NC_021200	AGG	2	6	70503	70508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074459
1517	NC_021200	GCG	2	6	70559	70564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074459
1518	NC_021200	GCG	2	6	70617	70622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074459
1519	NC_021200	GCA	2	6	71101	71106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074460
1520	NC_021200	CAT	2	6	71117	71122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074460
1521	NC_021200	CAG	2	6	71183	71188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074460
1522	NC_021200	CAG	2	6	71258	71263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074460
1523	NC_021200	GGT	2	6	71270	71275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074460
1524	NC_021200	CAG	2	6	71291	71296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074460
1525	NC_021200	GGC	2	6	71299	71304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074460
1526	NC_021200	CGT	2	6	71324	71329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074460
1527	NC_021200	CAG	2	6	71345	71350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074460
1528	NC_021200	CCAG	2	8	71425	71432	25 %	0 %	25 %	50 %	499074460
1529	NC_021200	CCG	2	6	71451	71456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074460
1530	NC_021200	ATC	2	6	71457	71462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074460
1531	NC_021200	GCG	2	6	71571	71576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074460
1532	NC_021200	TCG	2	6	71583	71588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074460
1533	NC_021200	CGG	2	6	71670	71675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074461
1534	NC_021200	CGG	2	6	71680	71685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074461
1535	NC_021200	CGC	2	6	71707	71712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074461
1536	NC_021200	CGGC	2	8	71902	71909	0 %	0 %	50 %	50 %	499074461
1537	NC_021200	GGT	2	6	71923	71928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074461
1538	NC_021200	CGA	2	6	71981	71986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074461
1539	NC_021200	AGA	2	6	72022	72027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074461
1540	NC_021200	GAA	3	9	72056	72064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074461
1541	NC_021200	GCCC	2	8	72071	72078	0 %	0 %	25 %	75 %	499074461
1542	NC_021200	TGAT	2	8	72174	72181	25 %	50 %	25 %	0 %	499074461
1543	NC_021200	CCG	2	6	72183	72188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074461
1544	NC_021200	ATC	2	6	72222	72227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074461
1545	NC_021200	CTG	2	6	72342	72347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074462
1546	NC_021200	CGAT	2	8	72405	72412	25 %	25 %	25 %	25 %	499074462
1547	NC_021200	GCC	2	6	72416	72421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074462
1548	NC_021200	CG	3	6	72433	72438	0 %	0 %	50 %	50 %	499074462
1549	NC_021200	CGC	2	6	72472	72477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074462
1550	NC_021200	GGCC	2	8	72481	72488	0 %	0 %	50 %	50 %	499074462
1551	NC_021200	CGG	2	6	72492	72497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074462
1552	NC_021200	ACT	2	6	72510	72515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074462
1553	NC_021200	GCGCT	2	10	72548	72557	0 %	20 %	40 %	40 %	499074462
1554	NC_021200	CGA	2	6	72562	72567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074462
1555	NC_021200	GC	4	8	72577	72584	0 %	0 %	50 %	50 %	499074462
1556	NC_021200	GC	3	6	72619	72624	0 %	0 %	50 %	50 %	499074462
1557	NC_021200	GCC	2	6	72635	72640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074462
1558	NC_021200	GAT	2	6	72700	72705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074462
1559	NC_021200	ACG	2	6	72708	72713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074462
1560	NC_021200	CCG	2	6	72775	72780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074462
1561	NC_021200	CGA	3	9	72805	72813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074462
1562	NC_021200	CGA	3	9	72898	72906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074462
1563	NC_021200	TCG	2	6	72980	72985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074463
1564	NC_021200	TCG	2	6	73012	73017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074463
1565	NC_021200	CGCCGG	2	12	73043	73054	0 %	0 %	50 %	50 %	499074463
1566	NC_021200	GAT	2	6	73112	73117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074463
1567	NC_021200	CGC	2	6	73118	73123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074463
1568	NC_021200	AGC	2	6	73224	73229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074463
1569	NC_021200	TGG	2	6	73249	73254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074463
1570	NC_021200	GCTG	2	8	73273	73280	0 %	25 %	50 %	25 %	499074463
1571	NC_021200	TGC	2	6	73309	73314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074463
1572	NC_021200	GCC	2	6	73344	73349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074463
1573	NC_021200	CCG	2	6	73450	73455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074463
1574	NC_021200	TGGA	2	8	73488	73495	25 %	25 %	50 %	0 %	499074463
1575	NC_021200	CGC	2	6	73496	73501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074463
1576	NC_021200	CGT	2	6	73502	73507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074463
1577	NC_021200	CGA	2	6	73508	73513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074463
1578	NC_021200	CGACCT	2	12	73538	73549	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	499074463
1579	NC_021200	C	6	6	73569	73574	0 %	0 %	0 %	100 %	499074463
1580	NC_021200	GC	3	6	73606	73611	0 %	0 %	50 %	50 %	499074463
1581	NC_021200	CG	3	6	73616	73621	0 %	0 %	50 %	50 %	499074463
1582	NC_021200	AG	3	6	73650	73655	50 %	0 %	50 %	0 %	499074463
1583	NC_021200	CG	3	6	73668	73673	0 %	0 %	50 %	50 %	499074463
1584	NC_021200	CGG	2	6	73822	73827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074463
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1586	NC_021200	ACGCCG	2	12	73930	73941	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499074463
1587	NC_021200	ACT	2	6	74029	74034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074463
1588	NC_021200	CAC	2	6	74036	74041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074463
1589	NC_021200	TCG	2	6	74071	74076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074463
1590	NC_021200	GGAT	2	8	74079	74086	25 %	25 %	50 %	0 %	499074463
1591	NC_021200	TGG	2	6	74244	74249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074464
1592	NC_021200	CGC	2	6	74307	74312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074464
1593	NC_021200	CGG	2	6	74371	74376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074464
1594	NC_021200	CGC	2	6	74536	74541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074464
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1596	NC_021200	GC	3	6	74559	74564	0 %	0 %	50 %	50 %	499074464
1597	NC_021200	GGCAG	2	10	74577	74586	20 %	0 %	60 %	20 %	499074464
1598	NC_021200	CG	3	6	74612	74617	0 %	0 %	50 %	50 %	499074464
1599	NC_021200	CGC	3	9	74623	74631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074464
1600	NC_021200	GCT	2	6	74641	74646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074464
1601	NC_021200	TGC	2	6	74649	74654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074464
1602	NC_021200	GCG	2	6	74670	74675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074464
1603	NC_021200	GTGG	2	8	74680	74687	0 %	25 %	75 %	0 %	499074464
1604	NC_021200	TGC	2	6	74688	74693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074464
1605	NC_021200	GC	3	6	74692	74697	0 %	0 %	50 %	50 %	499074464
1606	NC_021200	CGA	2	6	74782	74787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074464
1607	NC_021200	CGT	2	6	74788	74793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074464
1608	NC_021200	TGA	2	6	74829	74834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074464
1609	NC_021200	CTG	2	6	74840	74845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074464
1610	NC_021200	CCG	2	6	74847	74852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074464
1611	NC_021200	GC	3	6	74867	74872	0 %	0 %	50 %	50 %	499074464
1612	NC_021200	CGAC	2	8	74877	74884	25 %	0 %	25 %	50 %	499074464
1613	NC_021200	GAT	2	6	74968	74973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074464
1614	NC_021200	CGC	2	6	75010	75015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074464
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1616	NC_021200	CGA	2	6	75025	75030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074464
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1620	NC_021200	GC	3	6	75123	75128	0 %	0 %	50 %	50 %	499074464
1621	NC_021200	CGG	2	6	75148	75153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074464
1622	NC_021200	CACGA	2	10	75173	75182	40 %	0 %	20 %	40 %	499074464
1623	NC_021200	TAC	2	6	75188	75193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074464
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1625	NC_021200	GGT	2	6	75250	75255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074464
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1752	NC_021200	CG	3	6	80146	80151	0 %	0 %	50 %	50 %	499074467
1753	NC_021200	GGC	2	6	80157	80162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074467
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1997	NC_021200	CCG	2	6	89547	89552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074475
1998	NC_021200	GC	3	6	89568	89573	0 %	0 %	50 %	50 %	499074475
1999	NC_021200	CGCC	2	8	89579	89586	0 %	0 %	25 %	75 %	499074475
2000	NC_021200	CGC	2	6	89642	89647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074476

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