MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_021200	GCC	3	9	515867	515875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074856
13502	NC_021200	AAG	2	6	515876	515881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074856
13503	NC_021200	TGA	2	6	515943	515948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074856
13504	NC_021200	TCG	2	6	515964	515969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074856
13505	NC_021200	GCC	2	6	516110	516115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074856
13506	NC_021200	GTC	3	9	516122	516130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074856
13507	NC_021200	CTG	2	6	516136	516141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074856
13508	NC_021200	CGG	2	6	516182	516187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074857
13509	NC_021200	CCA	2	6	516271	516276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074857
13510	NC_021200	CAG	2	6	516290	516295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074857
13511	NC_021200	TTG	2	6	516324	516329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074857
13512	NC_021200	GGC	2	6	516341	516346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074857
13513	NC_021200	GGCCC	2	10	516371	516380	0 %	0 %	40 %	60 %	499074857
13514	NC_021200	CCG	2	6	516393	516398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074857
13515	NC_021200	CCA	2	6	516424	516429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074857
13516	NC_021200	CAT	2	6	516521	516526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074857
13517	NC_021200	AGC	2	6	516558	516563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074857
13518	NC_021200	CGG	2	6	516566	516571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074857
13519	NC_021200	TCA	2	6	516664	516669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074857
13520	NC_021200	GTT	2	6	516725	516730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074857
13521	NC_021200	CCG	2	6	516747	516752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074857
13522	NC_021200	CGG	2	6	516775	516780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074857
13523	NC_021200	CCGC	2	8	516831	516838	0 %	0 %	25 %	75 %	499074857
13524	NC_021200	GCC	2	6	516855	516860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074857
13525	NC_021200	GCG	2	6	516936	516941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074857
13526	NC_021200	GTG	2	6	517231	517236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074858
13527	NC_021200	CGA	2	6	517244	517249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074858
13528	NC_021200	GAG	2	6	517261	517266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074858
13529	NC_021200	TGGC	2	8	517271	517278	0 %	25 %	50 %	25 %	499074858
13530	NC_021200	GCA	2	6	517324	517329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074858
13531	NC_021200	CGG	2	6	517418	517423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074858
13532	NC_021200	CTG	2	6	517492	517497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074858
13533	NC_021200	CGG	2	6	517509	517514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074858
13534	NC_021200	TGC	2	6	517556	517561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074858
13535	NC_021200	AAG	2	6	517672	517677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074858
13536	NC_021200	CCGA	2	8	517699	517706	25 %	0 %	25 %	50 %	499074858
13537	NC_021200	GAA	2	6	517834	517839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074858
13538	NC_021200	CTG	2	6	517966	517971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074858
13539	NC_021200	GCA	2	6	518007	518012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074858
13540	NC_021200	GAG	2	6	518020	518025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074858
13541	NC_021200	GTC	2	6	518028	518033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074858
13542	NC_021200	TGAG	2	8	518035	518042	25 %	25 %	50 %	0 %	499074858
13543	NC_021200	ACG	2	6	518083	518088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074859
13544	NC_021200	GCT	3	9	518135	518143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074859
13545	NC_021200	GCT	2	6	518206	518211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074859
13546	NC_021200	GAG	2	6	518229	518234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074859
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13548	NC_021200	CAT	2	6	518327	518332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074859
13549	NC_021200	GC	3	6	518720	518725	0 %	0 %	50 %	50 %	499074860
13550	NC_021200	TGC	2	6	518797	518802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074860
13551	NC_021200	GGTG	2	8	518873	518880	0 %	25 %	75 %	0 %	499074860
13552	NC_021200	GGCG	2	8	518891	518898	0 %	0 %	75 %	25 %	499074860
13553	NC_021200	TGC	2	6	518987	518992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074861
13554	NC_021200	ACC	2	6	519008	519013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074861
13555	NC_021200	GGT	2	6	519021	519026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074861
13556	NC_021200	GCT	2	6	519039	519044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074861
13557	NC_021200	CGA	2	6	519087	519092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074861
13558	NC_021200	GCCG	2	8	519119	519126	0 %	0 %	50 %	50 %	499074861
13559	NC_021200	TGC	2	6	519143	519148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074861
13560	NC_021200	CGT	2	6	519168	519173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074861
13561	NC_021200	GCC	2	6	519220	519225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074861
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13564	NC_021200	GTG	2	6	519310	519315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074861
13565	NC_021200	GCC	2	6	519346	519351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074861
13566	NC_021200	CG	3	6	519355	519360	0 %	0 %	50 %	50 %	499074861
13567	NC_021200	CG	3	6	519470	519475	0 %	0 %	50 %	50 %	499074861
13568	NC_021200	CGT	2	6	519510	519515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074861
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13570	NC_021200	CAC	2	6	519564	519569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074861
13571	NC_021200	TTCG	2	8	519621	519628	0 %	50 %	25 %	25 %	499074861
13572	NC_021200	CTG	2	6	519661	519666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074861
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13591	NC_021200	GC	3	6	520565	520570	0 %	0 %	50 %	50 %	499074862
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13620	NC_021200	CAG	2	6	521955	521960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074863
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13974	NC_021200	GGC	2	6	534636	534641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074877
13975	NC_021200	CGT	2	6	534645	534650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074877
13976	NC_021200	GGC	2	6	534652	534657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074877
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13979	NC_021200	CGA	2	6	534697	534702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074877
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