MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021200	CGA	4	12	496332	496343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074837
13002	NC_021200	GGC	2	6	496368	496373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074837
13003	NC_021200	GCT	2	6	496389	496394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074837
13004	NC_021200	GCC	2	6	496431	496436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074837
13005	NC_021200	CG	3	6	496441	496446	0 %	0 %	50 %	50 %	499074837
13006	NC_021200	GGC	2	6	496452	496457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074837
13007	NC_021200	CGA	2	6	496464	496469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074837
13008	NC_021200	GAC	2	6	496492	496497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074837
13009	NC_021200	GGCCG	2	10	496512	496521	0 %	0 %	60 %	40 %	499074837
13010	NC_021200	CGC	2	6	496542	496547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074837
13011	NC_021200	CGC	3	9	496560	496568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074837
13012	NC_021200	CGG	2	6	496574	496579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074837
13013	NC_021200	CGC	2	6	496605	496610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074837
13014	NC_021200	TCG	2	6	496640	496645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074837
13015	NC_021200	CCTGG	2	10	496665	496674	0 %	20 %	40 %	40 %	499074837
13016	NC_021200	GCCA	2	8	496678	496685	25 %	0 %	25 %	50 %	499074837
13017	NC_021200	CTG	2	6	496699	496704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074837
13018	NC_021200	TGT	2	6	496709	496714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074837
13019	NC_021200	GAC	2	6	496846	496851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074838
13020	NC_021200	CGC	2	6	496942	496947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074838
13021	NC_021200	GC	3	6	496946	496951	0 %	0 %	50 %	50 %	499074838
13022	NC_021200	CAC	2	6	496954	496959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074838
13023	NC_021200	GCT	2	6	496963	496968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074838
13024	NC_021200	CGA	2	6	496972	496977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074838
13025	NC_021200	CATCGG	2	12	497122	497133	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	499074838
13026	NC_021200	TGGCGG	2	12	497153	497164	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	499074838
13027	NC_021200	CGTCGG	2	12	497193	497204	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	499074838
13028	NC_021200	TGG	2	6	497262	497267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074838
13029	NC_021200	GGC	2	6	497299	497304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074838
13030	NC_021200	TGC	2	6	497322	497327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074838
13031	NC_021200	CCG	2	6	497361	497366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074838
13032	NC_021200	TGC	2	6	497394	497399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074838
13033	NC_021200	GCC	2	6	497489	497494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074838
13034	NC_021200	ACCCGC	2	12	497537	497548	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	499074838
13035	NC_021200	CTG	2	6	497567	497572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074838
13036	NC_021200	CGC	2	6	497638	497643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074838
13037	NC_021200	CGCCGG	2	12	497719	497730	0 %	0 %	50 %	50 %	499074838
13038	NC_021200	CGACGC	2	12	497767	497778	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499074838
13039	NC_021200	CGT	2	6	497784	497789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074838
13040	NC_021200	GATG	2	8	497791	497798	25 %	25 %	50 %	0 %	499074838
13041	NC_021200	GCC	2	6	497807	497812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074838
13042	NC_021200	GT	3	6	497857	497862	0 %	50 %	50 %	0 %	499074838
13043	NC_021200	GACG	2	8	498115	498122	25 %	0 %	50 %	25 %	499074839
13044	NC_021200	GGA	2	6	498172	498177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074839
13045	NC_021200	CG	3	6	498180	498185	0 %	0 %	50 %	50 %	499074839
13046	NC_021200	CCG	2	6	498208	498213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074839
13047	NC_021200	GC	4	8	498229	498236	0 %	0 %	50 %	50 %	499074839
13048	NC_021200	CCGG	2	8	498246	498253	0 %	0 %	50 %	50 %	499074839
13049	NC_021200	CTG	3	9	498254	498262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074839
13050	NC_021200	GCC	2	6	498263	498268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074839
13051	NC_021200	GTG	2	6	498286	498291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074839
13052	NC_021200	ATC	2	6	498323	498328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074839
13053	NC_021200	CTC	2	6	498397	498402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074839
13054	NC_021200	GTGGGA	2	12	498406	498417	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	499074839
13055	NC_021200	GTC	2	6	498427	498432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074839
13056	NC_021200	CAC	2	6	498464	498469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074839
13057	NC_021200	GAC	3	9	498494	498502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074839
13058	NC_021200	TGC	2	6	498516	498521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074839
13059	NC_021200	GCA	2	6	498616	498621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074839
13060	NC_021200	CGA	2	6	498682	498687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074839
13061	NC_021200	GGT	2	6	498712	498717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074839
13062	NC_021200	TCT	2	6	498837	498842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074839
13063	NC_021200	GGCC	2	8	498949	498956	0 %	0 %	50 %	50 %	499074839
13064	NC_021200	CAC	2	6	499001	499006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074839
13065	NC_021200	GGTGCG	2	12	499048	499059	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	499074839
13066	NC_021200	CGA	2	6	499171	499176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074839
13067	NC_021200	AGCG	2	8	499202	499209	25 %	0 %	50 %	25 %	499074839
13068	NC_021200	CGC	2	6	499265	499270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074839
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13070	NC_021200	CGG	2	6	499342	499347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074839
13071	NC_021200	GGC	2	6	499354	499359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074839
13072	NC_021200	CGA	2	6	499528	499533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074840
13073	NC_021200	GTCG	2	8	499582	499589	0 %	25 %	50 %	25 %	499074840
13074	NC_021200	GC	3	6	499596	499601	0 %	0 %	50 %	50 %	499074840
13075	NC_021200	CGA	2	6	499615	499620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074840
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13078	NC_021200	CCGA	2	8	499655	499662	25 %	0 %	25 %	50 %	499074840
13079	NC_021200	GGC	2	6	499675	499680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074840
13080	NC_021200	TGC	2	6	499702	499707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074840
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13082	NC_021200	TCG	2	6	499794	499799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074840
13083	NC_021200	TCG	2	6	499830	499835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074840
13084	NC_021200	CGG	2	6	499858	499863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074840
13085	NC_021200	CGA	2	6	499867	499872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074840
13086	NC_021200	AGCCG	2	10	499879	499888	20 %	0 %	40 %	40 %	499074840
13087	NC_021200	GAA	2	6	499894	499899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074840
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13089	NC_021200	ACC	2	6	499944	499949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074840
13090	NC_021200	AGGTC	2	10	499954	499963	20 %	20 %	40 %	20 %	499074840
13091	NC_021200	CAG	2	6	499985	499990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074840
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13094	NC_021200	TCG	2	6	500046	500051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074840
13095	NC_021200	CAG	2	6	500120	500125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074840
13096	NC_021200	GTC	2	6	500138	500143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074840
13097	NC_021200	CGGGTT	2	12	500149	500160	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	499074840
13098	NC_021200	CGG	2	6	500163	500168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074840
13099	NC_021200	TCGG	2	8	500192	500199	0 %	25 %	50 %	25 %	499074840
13100	NC_021200	GAA	2	6	500240	500245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074840
13101	NC_021200	CGTCG	2	10	500290	500299	0 %	20 %	40 %	40 %	499074840
13102	NC_021200	CA	3	6	500993	500998	50 %	0 %	0 %	50 %	499074841
13103	NC_021200	CGC	3	9	501007	501015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074841
13104	NC_021200	GCCA	2	8	501044	501051	25 %	0 %	25 %	50 %	499074841
13105	NC_021200	CG	3	6	501084	501089	0 %	0 %	50 %	50 %	499074841
13106	NC_021200	GC	3	6	501125	501130	0 %	0 %	50 %	50 %	499074841
13107	NC_021200	TCG	2	6	501149	501154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074841
13108	NC_021200	GC	3	6	501229	501234	0 %	0 %	50 %	50 %	499074841
13109	NC_021200	TGC	2	6	501249	501254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074841
13110	NC_021200	GCA	2	6	501255	501260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074841
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13112	NC_021200	CAG	2	6	501280	501285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074841
13113	NC_021200	TCG	2	6	501302	501307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074841
13114	NC_021200	GAC	2	6	501328	501333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074841
13115	NC_021200	CGA	2	6	501339	501344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074841
13116	NC_021200	GTC	2	6	501358	501363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074841
13117	NC_021200	CCGC	2	8	501423	501430	0 %	0 %	25 %	75 %	499074841
13118	NC_021200	AGC	2	6	501431	501436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074841
13119	NC_021200	GGT	2	6	501439	501444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074841
13120	NC_021200	CGG	2	6	501489	501494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074841
13121	NC_021200	TGG	2	6	501507	501512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074841
13122	NC_021200	CGC	2	6	501519	501524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074841
13123	NC_021200	CGCA	2	8	501530	501537	25 %	0 %	25 %	50 %	499074841
13124	NC_021200	GCC	3	9	501545	501553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074841
13125	NC_021200	CG	3	6	501560	501565	0 %	0 %	50 %	50 %	499074841
13126	NC_021200	TCG	2	6	501575	501580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074841
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13133	NC_021200	GCG	2	6	501922	501927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074842
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13152	NC_021200	TCG	2	6	502641	502646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074842
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13222	NC_021200	CGG	2	6	505480	505485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074846
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13224	NC_021200	ACG	2	6	505554	505559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074846
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13228	NC_021200	TCG	2	6	505824	505829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074846
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13230	NC_021200	CAGGTC	2	12	505850	505861	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	499074846
13231	NC_021200	CTG	2	6	505868	505873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074846
13232	NC_021200	CGG	2	6	505886	505891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074846
13233	NC_021200	GGTC	2	8	505897	505904	0 %	25 %	50 %	25 %	499074846
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13459	NC_021200	TTCC	2	8	514505	514512	0 %	50 %	0 %	50 %	499074855
13460	NC_021200	CG	3	6	514529	514534	0 %	0 %	50 %	50 %	499074855
13461	NC_021200	CGA	2	6	514544	514549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074855
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13470	NC_021200	GAT	2	6	514904	514909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074855
13471	NC_021200	GCG	2	6	514931	514936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074855
13472	NC_021200	CGA	2	6	514952	514957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074855
13473	NC_021200	CCG	2	6	514966	514971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074855
13474	NC_021200	GC	3	6	514980	514985	0 %	0 %	50 %	50 %	499074855
13475	NC_021200	GCTC	2	8	514997	515004	0 %	25 %	25 %	50 %	499074855
13476	NC_021200	ACC	2	6	515005	515010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074855
13477	NC_021200	CGA	2	6	515045	515050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074855
13478	NC_021200	GTC	2	6	515171	515176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074856
13479	NC_021200	CG	3	6	515202	515207	0 %	0 %	50 %	50 %	499074856
13480	NC_021200	CGG	2	6	515269	515274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074856
13481	NC_021200	CGC	2	6	515280	515285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074856
13482	NC_021200	AC	3	6	515293	515298	50 %	0 %	0 %	50 %	499074856
13483	NC_021200	CCGG	2	8	515315	515322	0 %	0 %	50 %	50 %	499074856
13484	NC_021200	GTC	2	6	515327	515332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074856
13485	NC_021200	CGT	2	6	515374	515379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074856
13486	NC_021200	CAT	2	6	515407	515412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074856
13487	NC_021200	CGG	2	6	515419	515424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074856
13488	NC_021200	CTG	2	6	515450	515455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074856
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13490	NC_021200	CG	3	6	515545	515550	0 %	0 %	50 %	50 %	499074856
13491	NC_021200	GTC	3	9	515591	515599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074856
13492	NC_021200	GCA	2	6	515656	515661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074856
13493	NC_021200	GTC	2	6	515726	515731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074856
13494	NC_021200	CCG	2	6	515736	515741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074856
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13496	NC_021200	GGC	2	6	515752	515757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074856
13497	NC_021200	GC	3	6	515756	515761	0 %	0 %	50 %	50 %	499074856
13498	NC_021200	CGC	2	6	515830	515835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074856
13499	NC_021200	GC	3	6	515838	515843	0 %	0 %	50 %	50 %	499074856
13500	NC_021200	CGT	2	6	515848	515853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074856

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