MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_021200	CCG	2	6	424103	424108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074768
11003	NC_021200	CGG	2	6	424114	424119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074768
11004	NC_021200	ATC	2	6	424136	424141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074768
11005	NC_021200	CCG	2	6	424162	424167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074768
11006	NC_021200	CG	3	6	424191	424196	0 %	0 %	50 %	50 %	499074768
11007	NC_021200	GGT	2	6	424203	424208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074768
11008	NC_021200	GGTG	2	8	424212	424219	0 %	25 %	75 %	0 %	499074768
11009	NC_021200	CGG	2	6	424239	424244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074768
11010	NC_021200	CCG	2	6	424248	424253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074768
11011	NC_021200	TCG	2	6	424268	424273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074768
11012	NC_021200	CGA	2	6	424329	424334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074768
11013	NC_021200	TCG	2	6	424349	424354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074768
11014	NC_021200	GCC	2	6	424360	424365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074768
11015	NC_021200	CGG	2	6	424368	424373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074768
11016	NC_021200	CCGGGC	2	12	424381	424392	0 %	0 %	50 %	50 %	499074768
11017	NC_021200	GC	3	6	424445	424450	0 %	0 %	50 %	50 %	499074768
11018	NC_021200	CAC	2	6	424558	424563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074768
11019	NC_021200	GCG	2	6	424582	424587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074768
11020	NC_021200	GTA	2	6	424594	424599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074768
11021	NC_021200	CG	3	6	424642	424647	0 %	0 %	50 %	50 %	499074768
11022	NC_021200	CGG	2	6	424689	424694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074768
11023	NC_021200	CGG	2	6	424800	424805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074768
11024	NC_021200	CGGC	2	8	424867	424874	0 %	0 %	50 %	50 %	499074768
11025	NC_021200	TGAG	2	8	424910	424917	25 %	25 %	50 %	0 %	499074769
11026	NC_021200	CGA	2	6	424923	424928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074769
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11028	NC_021200	CGG	2	6	425015	425020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074769
11029	NC_021200	CG	3	6	425073	425078	0 %	0 %	50 %	50 %	499074769
11030	NC_021200	CTC	2	6	425129	425134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074769
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11032	NC_021200	GCA	2	6	425172	425177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074769
11033	NC_021200	GAG	2	6	425182	425187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074769
11034	NC_021200	TGC	2	6	425228	425233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074769
11035	NC_021200	CTG	2	6	425269	425274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074769
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11039	NC_021200	CCG	2	6	425417	425422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074770
11040	NC_021200	GCCCGC	2	12	425437	425448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074770
11041	NC_021200	GCA	2	6	425489	425494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074770
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11050	NC_021200	TCG	2	6	425729	425734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074770
11051	NC_021200	TTC	2	6	425779	425784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074770
11052	NC_021200	CGG	2	6	425790	425795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074770
11053	NC_021200	AACG	2	8	425851	425858	50 %	0 %	25 %	25 %	499074770
11054	NC_021200	TGC	2	6	425891	425896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074770
11055	NC_021200	GCG	2	6	425903	425908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074770
11056	NC_021200	TGCGG	2	10	426014	426023	0 %	20 %	60 %	20 %	499074770
11057	NC_021200	CG	3	6	426067	426072	0 %	0 %	50 %	50 %	499074770
11058	NC_021200	AGGGCG	2	12	426125	426136	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	499074770
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11060	NC_021200	TTC	2	6	426160	426165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074770
11061	NC_021200	GCG	2	6	426174	426179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074770
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11069	NC_021200	CGA	2	6	426342	426347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074770
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11079	NC_021200	CGA	2	6	426654	426659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074770
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11119	NC_021200	ACG	2	6	428426	428431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074774
11120	NC_021200	TGG	2	6	428432	428437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074774
11121	NC_021200	CGA	2	6	428478	428483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074774
11122	NC_021200	GGC	2	6	428559	428564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074774
11123	NC_021200	CAG	2	6	428568	428573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074774
11124	NC_021200	CGG	2	6	428591	428596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074775
11125	NC_021200	CGAA	2	8	428611	428618	50 %	0 %	25 %	25 %	499074775
11126	NC_021200	TCG	2	6	428701	428706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074775
11127	NC_021200	TGCC	2	8	428712	428719	0 %	25 %	25 %	50 %	499074775
11128	NC_021200	GC	3	6	428736	428741	0 %	0 %	50 %	50 %	499074775
11129	NC_021200	CGA	2	6	428768	428773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074775
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11132	NC_021200	CAT	2	6	428867	428872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074775
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11134	NC_021200	CGG	2	6	428925	428930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074775
11135	NC_021200	CCG	2	6	428965	428970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074775
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11476	NC_021200	GGAC	2	8	440849	440856	25 %	0 %	50 %	25 %	499074787
11477	NC_021200	CTC	2	6	440905	440910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074788
11478	NC_021200	CAGCGA	2	12	440930	440941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074788
11479	NC_021200	CGC	2	6	440960	440965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074788
11480	NC_021200	CCG	2	6	440992	440997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074788
11481	NC_021200	GGT	2	6	441005	441010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074788
11482	NC_021200	CG	4	8	441047	441054	0 %	0 %	50 %	50 %	499074788
11483	NC_021200	CGC	2	6	441056	441061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074788
11484	NC_021200	CGGG	2	8	441062	441069	0 %	0 %	75 %	25 %	499074788
11485	NC_021200	ATC	2	6	441081	441086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074788
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11490	NC_021200	CTG	2	6	441270	441275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074788
11491	NC_021200	TCG	2	6	441322	441327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074788
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