MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_021200	GCC	2	6	389367	389372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074736
10003	NC_021200	GCCA	2	8	389383	389390	25 %	0 %	25 %	50 %	499074736
10004	NC_021200	CAG	2	6	389391	389396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074736
10005	NC_021200	CGT	2	6	389471	389476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074736
10006	NC_021200	ATG	2	6	389488	389493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074736
10007	NC_021200	CGGCG	2	10	389579	389588	0 %	0 %	60 %	40 %	499074736
10008	NC_021200	CAC	2	6	389720	389725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074737
10009	NC_021200	GCCG	2	8	389726	389733	0 %	0 %	50 %	50 %	499074737
10010	NC_021200	CAG	3	9	389741	389749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074737
10011	NC_021200	CGA	2	6	389761	389766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074737
10012	NC_021200	TGG	2	6	389784	389789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074737
10013	NC_021200	CGA	2	6	389884	389889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074737
10014	NC_021200	GCA	2	6	389941	389946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074737
10015	NC_021200	AGA	2	6	389980	389985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074737
10016	NC_021200	TCG	2	6	389986	389991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074737
10017	NC_021200	CGC	2	6	389992	389997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074737
10018	NC_021200	GCA	2	6	390007	390012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074737
10019	NC_021200	GTG	2	6	390052	390057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074737
10020	NC_021200	GC	3	6	390068	390073	0 %	0 %	50 %	50 %	499074737
10021	NC_021200	GTTGT	2	10	390112	390121	0 %	60 %	40 %	0 %	499074737
10022	NC_021200	CGA	2	6	390401	390406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074738
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10051	NC_021200	CGC	2	6	391162	391167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074739
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10053	NC_021200	AAG	2	6	391265	391270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074739
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10055	NC_021200	GAG	2	6	391337	391342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074739
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10057	NC_021200	CCGC	2	8	391426	391433	0 %	0 %	25 %	75 %	499074739
10058	NC_021200	GCCG	2	8	391498	391505	0 %	0 %	50 %	50 %	499074739
10059	NC_021200	GTC	2	6	391508	391513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074739
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10087	NC_021200	TCCA	2	8	392626	392633	25 %	25 %	0 %	50 %	499074740
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10119	NC_021200	TCG	2	6	394619	394624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074742
10120	NC_021200	TGT	2	6	394656	394661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074742
10121	NC_021200	AC	3	6	394671	394676	50 %	0 %	0 %	50 %	499074742
10122	NC_021200	CAT	2	6	394725	394730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074742
10123	NC_021200	GCA	2	6	394764	394769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074742
10124	NC_021200	GCC	2	6	394786	394791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074742
10125	NC_021200	TGC	2	6	394828	394833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074742
10126	NC_021200	TCA	2	6	394841	394846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074742
10127	NC_021200	GTGCG	2	10	394876	394885	0 %	20 %	60 %	20 %	499074742
10128	NC_021200	GCC	2	6	394906	394911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074742
10129	NC_021200	TTC	2	6	395247	395252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074743
10130	NC_021200	GCT	2	6	395258	395263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074743
10131	NC_021200	TGC	2	6	395269	395274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074743
10132	NC_021200	GTG	2	6	395292	395297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074743
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10135	NC_021200	TGC	2	6	395323	395328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074743
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10139	NC_021200	CTG	2	6	395424	395429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074743
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10143	NC_021200	GTG	2	6	395484	395489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074743
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10148	NC_021200	GCC	2	6	395648	395653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074743
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10182	NC_021200	CTGG	2	8	396840	396847	0 %	25 %	50 %	25 %	499074744
10183	NC_021200	CGG	2	6	396857	396862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074744
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10185	NC_021200	GTGG	2	8	396960	396967	0 %	25 %	75 %	0 %	499074744
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10475	NC_021200	CGG	2	6	406439	406444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074754
10476	NC_021200	CCGG	2	8	406449	406456	0 %	0 %	50 %	50 %	499074754
10477	NC_021200	GCC	2	6	406464	406469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074754
10478	NC_021200	TGG	2	6	406471	406476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074754
10479	NC_021200	CCT	2	6	406480	406485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074754
10480	NC_021200	CGG	2	6	406532	406537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074754
10481	NC_021200	GAC	2	6	406551	406556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074754
10482	NC_021200	CG	3	6	406611	406616	0 %	0 %	50 %	50 %	499074754
10483	NC_021200	ATCGAC	2	12	406635	406646	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	499074754
10484	NC_021200	CCG	2	6	406708	406713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074754
10485	NC_021200	GCT	2	6	406727	406732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074754
10486	NC_021200	GGCGTG	2	12	406734	406745	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	499074754
10487	NC_021200	GCCG	2	8	406755	406762	0 %	0 %	50 %	50 %	499074754
10488	NC_021200	ACCCC	2	10	406777	406786	20 %	0 %	0 %	80 %	499074754
10489	NC_021200	GCA	3	9	406828	406836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074754
10490	NC_021200	CGT	2	6	406853	406858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074754
10491	NC_021200	ACC	2	6	406963	406968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074754
10492	NC_021200	GTG	2	6	407043	407048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074754
10493	NC_021200	TGC	2	6	407065	407070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074754
10494	NC_021200	GACGCC	2	12	407079	407090	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499074754
10495	NC_021200	GCG	2	6	407122	407127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074754
10496	NC_021200	GAA	2	6	407138	407143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074754
10497	NC_021200	CG	5	10	407144	407153	0 %	0 %	50 %	50 %	499074754
10498	NC_021200	TGA	2	6	407230	407235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074754
10499	NC_021200	CCG	2	6	407257	407262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074754
10500	NC_021200	GCCTGG	2	12	407263	407274	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	499074754

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