MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 2165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021192	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	494690660
2	NC_021192	CGTTT	2	10	2087	2096	0 %	60 %	20 %	20 %	494690661
3	NC_021192	CGGTT	2	10	3224	3233	0 %	40 %	40 %	20 %	494690661
4	NC_021192	GCAGC	2	10	7342	7351	20 %	0 %	40 %	40 %	494690665
5	NC_021192	CGGTG	2	10	9238	9247	0 %	20 %	60 %	20 %	494690666
6	NC_021192	CAGAC	2	10	9756	9765	40 %	0 %	20 %	40 %	494690666
7	NC_021192	CGCAA	2	10	10280	10289	40 %	0 %	20 %	40 %	494690667
8	NC_021192	CGGCG	2	10	10405	10414	0 %	0 %	60 %	40 %	494690667
9	NC_021192	GGCGT	2	10	14101	14110	0 %	20 %	60 %	20 %	494690674
10	NC_021192	GCGTT	2	10	15117	15126	0 %	40 %	40 %	20 %	494690676
11	NC_021192	CCAGC	2	10	15655	15664	20 %	0 %	20 %	60 %	494690677
12	NC_021192	ACCGA	2	10	16415	16424	40 %	0 %	20 %	40 %	494690677
13	NC_021192	ATCGG	2	10	16808	16817	20 %	20 %	40 %	20 %	494690677
14	NC_021192	GTCGT	2	10	21534	21543	0 %	40 %	40 %	20 %	494690680
15	NC_021192	GGCAA	2	10	29149	29158	40 %	0 %	40 %	20 %	494690689
16	NC_021192	CGATC	2	10	29964	29973	20 %	20 %	20 %	40 %	494690690
17	NC_021192	TCCTG	2	10	37262	37271	0 %	40 %	20 %	40 %	494690697
18	NC_021192	GTCCA	2	10	39188	39197	20 %	20 %	20 %	40 %	494690698
19	NC_021192	GCGTC	2	10	41716	41725	0 %	20 %	40 %	40 %	494690700
20	NC_021192	GCACA	2	10	42100	42109	40 %	0 %	20 %	40 %	494690701
21	NC_021192	GGTAC	2	10	44626	44635	20 %	20 %	40 %	20 %	494690703
22	NC_021192	TCGAA	2	10	44858	44867	40 %	20 %	20 %	20 %	494690703
23	NC_021192	GCACC	2	10	45787	45796	20 %	0 %	20 %	60 %	494690703
24	NC_021192	CGGTG	2	10	46820	46829	0 %	20 %	60 %	20 %	494690704
25	NC_021192	TCATG	2	10	46966	46975	20 %	40 %	20 %	20 %	494690704
26	NC_021192	ATCGG	2	10	47108	47117	20 %	20 %	40 %	20 %	494690704
27	NC_021192	CAGCG	2	10	49546	49555	20 %	0 %	40 %	40 %	494690706
28	NC_021192	ATGGG	2	10	57485	57494	20 %	20 %	60 %	0 %	494690713
29	NC_021192	CGACC	2	10	57884	57893	20 %	0 %	20 %	60 %	494690713
30	NC_021192	GGCGA	2	10	66041	66050	20 %	0 %	60 %	20 %	494690724
31	NC_021192	GGTGT	2	10	68595	68604	0 %	40 %	60 %	0 %	494690725
32	NC_021192	GTCCA	2	10	72492	72501	20 %	20 %	20 %	40 %	494690728
33	NC_021192	TGACC	2	10	75107	75116	20 %	20 %	20 %	40 %	494690729
34	NC_021192	GTCGC	2	10	75498	75507	0 %	20 %	40 %	40 %	494690730
35	NC_021192	GCGCG	2	10	76581	76590	0 %	0 %	60 %	40 %	494690731
36	NC_021192	GAGCA	2	10	81957	81966	40 %	0 %	40 %	20 %	494690736
37	NC_021192	GCCGG	2	10	82056	82065	0 %	0 %	60 %	40 %	494690736
38	NC_021192	GCGAC	2	10	82130	82139	20 %	0 %	40 %	40 %	494690736
39	NC_021192	ATCCG	2	10	82898	82907	20 %	20 %	20 %	40 %	494690737
40	NC_021192	CACCG	2	10	83674	83683	20 %	0 %	20 %	60 %	494690738
41	NC_021192	TGGTC	2	10	85789	85798	0 %	40 %	40 %	20 %	494690741
42	NC_021192	GCTGG	2	10	86420	86429	0 %	20 %	60 %	20 %	494690741
43	NC_021192	TGGGT	2	10	89442	89451	0 %	40 %	60 %	0 %	494690746
44	NC_021192	TCGCC	2	10	89649	89658	0 %	20 %	20 %	60 %	494690746
45	NC_021192	GGCCG	2	10	91938	91947	0 %	0 %	60 %	40 %	494690749
46	NC_021192	GCGCC	2	10	92585	92594	0 %	0 %	40 %	60 %	494690750
47	NC_021192	GCTTG	2	10	94619	94628	0 %	40 %	40 %	20 %	494690752
48	NC_021192	CGTGT	2	10	95051	95060	0 %	40 %	40 %	20 %	494690753
49	NC_021192	AGATC	2	10	95130	95139	40 %	20 %	20 %	20 %	494690753
50	NC_021192	CGGCG	2	10	98701	98710	0 %	0 %	60 %	40 %	494690755
51	NC_021192	CGGCG	2	10	98827	98836	0 %	0 %	60 %	40 %	494690755
52	NC_021192	GGTGA	2	10	99986	99995	20 %	20 %	60 %	0 %	494690756
53	NC_021192	GGCTT	2	10	104286	104295	0 %	40 %	40 %	20 %	494690759
54	NC_021192	GCACA	2	10	106105	106114	40 %	0 %	20 %	40 %	494690762
55	NC_021192	CTGAA	2	10	108429	108438	40 %	20 %	20 %	20 %	494690764
56	NC_021192	ATCGC	2	10	108924	108933	20 %	20 %	20 %	40 %	494690764
57	NC_021192	TCTGA	2	10	110242	110251	20 %	40 %	20 %	20 %	494690765
58	NC_021192	GGCTG	2	10	114184	114193	0 %	20 %	60 %	20 %	494690766
59	NC_021192	TCGTG	2	10	122003	122012	0 %	40 %	40 %	20 %	494690768
60	NC_021192	GCACG	2	10	123649	123658	20 %	0 %	40 %	40 %	494690769
61	NC_021192	CCGGA	2	10	123775	123784	20 %	0 %	40 %	40 %	494690769
62	NC_021192	CGGGC	2	10	131827	131836	0 %	0 %	60 %	40 %	494690773
63	NC_021192	GCGAT	2	10	133614	133623	20 %	20 %	40 %	20 %	494690774
64	NC_021192	GTTCG	2	10	133831	133840	0 %	40 %	40 %	20 %	494690774
65	NC_021192	GGCCC	2	10	134319	134328	0 %	0 %	40 %	60 %	494690775
66	NC_021192	GAGAT	2	10	137899	137908	40 %	20 %	40 %	0 %	494690777
67	NC_021192	TGCGG	2	10	140662	140671	0 %	20 %	60 %	20 %	494690781
68	NC_021192	GTTGC	2	10	141916	141925	0 %	40 %	40 %	20 %	494690782
69	NC_021192	CCGCC	2	10	144670	144679	0 %	0 %	20 %	80 %	494690783
70	NC_021192	CCGCC	2	10	145312	145321	0 %	0 %	20 %	80 %	494690783
71	NC_021192	AGCGA	2	10	153313	153322	40 %	0 %	40 %	20 %	494690790
72	NC_021192	AGCGA	2	10	153366	153375	40 %	0 %	40 %	20 %	494690790
73	NC_021192	TCGTC	2	10	153712	153721	0 %	40 %	20 %	40 %	494690790
74	NC_021192	CACGC	2	10	154170	154179	20 %	0 %	20 %	60 %	494690790
75	NC_021192	CGGCG	2	10	158771	158780	0 %	0 %	60 %	40 %	494690794
76	NC_021192	GCACC	2	10	158941	158950	20 %	0 %	20 %	60 %	494690794
77	NC_021192	CTGGG	2	10	163280	163289	0 %	20 %	60 %	20 %	494690797
78	NC_021192	GCCGC	2	10	167658	167667	0 %	0 %	40 %	60 %	494690801
79	NC_021192	CCGCC	2	10	168899	168908	0 %	0 %	20 %	80 %	494690803
80	NC_021192	GCATG	2	10	170245	170254	20 %	20 %	40 %	20 %	494690804
81	NC_021192	GCGCC	2	10	172997	173006	0 %	0 %	40 %	60 %	494690807
82	NC_021192	TCGCT	2	10	175242	175251	0 %	40 %	20 %	40 %	494690808
83	NC_021192	GGGCT	2	10	175282	175291	0 %	20 %	60 %	20 %	494690808
84	NC_021192	GCCGA	2	10	178113	178122	20 %	0 %	40 %	40 %	494690810
85	NC_021192	TTCAT	2	10	179280	179289	20 %	60 %	0 %	20 %	494690810
86	NC_021192	CGGCC	2	10	181405	181414	0 %	0 %	40 %	60 %	494690812
87	NC_021192	ACGGC	2	10	186825	186834	20 %	0 %	40 %	40 %	494690818
88	NC_021192	CGGCT	2	10	189659	189668	0 %	20 %	40 %	40 %	494690822
89	NC_021192	GGCTG	2	10	189890	189899	0 %	20 %	60 %	20 %	494690822
90	NC_021192	ACGGT	2	10	190033	190042	20 %	20 %	40 %	20 %	494690822
91	NC_021192	CACCC	2	10	190155	190164	20 %	0 %	0 %	80 %	494690822
92	NC_021192	GCCGA	2	10	192922	192931	20 %	0 %	40 %	40 %	494690824
93	NC_021192	GGAAG	2	10	193886	193895	40 %	0 %	60 %	0 %	494690825
94	NC_021192	CGGCG	2	10	196041	196050	0 %	0 %	60 %	40 %	494690828
95	NC_021192	GCCGC	2	10	203302	203311	0 %	0 %	40 %	60 %	494690835
96	NC_021192	GACCT	2	10	203917	203926	20 %	20 %	20 %	40 %	494690835
97	NC_021192	TTGCG	2	10	205889	205898	0 %	40 %	40 %	20 %	494690836
98	NC_021192	TTGCG	2	10	205962	205971	0 %	40 %	40 %	20 %	494690836
99	NC_021192	CCACG	2	10	207549	207558	20 %	0 %	20 %	60 %	494690837
100	NC_021192	ACCGC	2	10	211188	211197	20 %	0 %	20 %	60 %	494690840
101	NC_021192	GCAGG	2	10	211273	211282	20 %	0 %	60 %	20 %	494690840
102	NC_021192	GCCGA	2	10	213734	213743	20 %	0 %	40 %	40 %	494690843
103	NC_021192	CCTCG	2	10	214165	214174	0 %	20 %	20 %	60 %	494690843
104	NC_021192	GTGCG	2	10	215818	215827	0 %	20 %	60 %	20 %	494690844
105	NC_021192	CAACC	2	10	217511	217520	40 %	0 %	0 %	60 %	494690846
106	NC_021192	CGGCG	2	10	217964	217973	0 %	0 %	60 %	40 %	494690846
107	NC_021192	CCCGA	2	10	219542	219551	20 %	0 %	20 %	60 %	494690847
108	NC_021192	ACCCG	2	10	222556	222565	20 %	0 %	20 %	60 %	494690849
109	NC_021192	CGCAG	2	10	223610	223619	20 %	0 %	40 %	40 %	494690850
110	NC_021192	CCGGG	2	10	226665	226674	0 %	0 %	60 %	40 %	494690853
111	NC_021192	CTGCG	2	10	233227	233236	0 %	20 %	40 %	40 %	494690857
112	NC_021192	ATCCA	2	10	234064	234073	40 %	20 %	0 %	40 %	494690857
113	NC_021192	TGCGC	2	10	234955	234964	0 %	20 %	40 %	40 %	494690857
114	NC_021192	CACGC	2	10	237939	237948	20 %	0 %	20 %	60 %	494690859
115	NC_021192	CGACG	2	10	245070	245079	20 %	0 %	40 %	40 %	494690863
116	NC_021192	TGGCC	2	10	250972	250981	0 %	20 %	40 %	40 %	494690868
117	NC_021192	CGGCT	2	10	251039	251048	0 %	20 %	40 %	40 %	494690868
118	NC_021192	GTCCA	2	10	255596	255605	20 %	20 %	20 %	40 %	494690873
119	NC_021192	CCCGG	2	10	256846	256855	0 %	0 %	40 %	60 %	494690874
120	NC_021192	CGGTG	2	10	258099	258108	0 %	20 %	60 %	20 %	494690874
121	NC_021192	GGCTC	2	10	258150	258159	0 %	20 %	40 %	40 %	494690874
122	NC_021192	TGGCA	2	10	258606	258615	20 %	20 %	40 %	20 %	494690875
123	NC_021192	GGCGA	2	10	260621	260630	20 %	0 %	60 %	20 %	494690877
124	NC_021192	CGATG	2	10	264163	264172	20 %	20 %	40 %	20 %	494690881
125	NC_021192	GCCGC	2	10	273870	273879	0 %	0 %	40 %	60 %	494690883
126	NC_021192	GCCCG	2	10	274089	274098	0 %	0 %	40 %	60 %	494690883
127	NC_021192	GCAGT	2	10	274461	274470	20 %	20 %	40 %	20 %	494690883
128	NC_021192	AACCG	2	10	278992	279001	40 %	0 %	20 %	40 %	494690886
129	NC_021192	GGCGA	2	10	279617	279626	20 %	0 %	60 %	20 %	494690887
130	NC_021192	CAGCG	2	10	281211	281220	20 %	0 %	40 %	40 %	494690888
131	NC_021192	CGCGG	2	10	281796	281805	0 %	0 %	60 %	40 %	494690889
132	NC_021192	GCCGA	2	10	282382	282391	20 %	0 %	40 %	40 %	494690890
133	NC_021192	TGGCC	2	10	289050	289059	0 %	20 %	40 %	40 %	494690895
134	NC_021192	GCGGT	2	10	290725	290734	0 %	20 %	60 %	20 %	494690898
135	NC_021192	CGGCC	2	10	300460	300469	0 %	0 %	40 %	60 %	494690905
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141	NC_021192	CGGCC	2	10	311417	311426	0 %	0 %	40 %	60 %	494690913
142	NC_021192	GCCCG	2	10	313673	313682	0 %	0 %	40 %	60 %	494690915
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262	NC_021192	CGCGG	2	10	581742	581751	0 %	0 %	60 %	40 %	494691133
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389	NC_021192	TGCGG	2	10	793568	793577	0 %	20 %	60 %	20 %	494691325
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