MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 49520

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021192	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690660
2	NC_021192	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690660
3	NC_021192	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690660
4	NC_021192	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690660
5	NC_021192	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690660
6	NC_021192	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690660
7	NC_021192	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690660
8	NC_021192	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690660
9	NC_021192	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690660
10	NC_021192	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690660
11	NC_021192	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690660
12	NC_021192	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690660
13	NC_021192	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690660
14	NC_021192	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690660
15	NC_021192	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690660
16	NC_021192	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494690660
17	NC_021192	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494690660
18	NC_021192	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690660
19	NC_021192	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690660
20	NC_021192	CGA	2	6	1061	1066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690660
21	NC_021192	CAG	2	6	1085	1090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690660
22	NC_021192	GCG	2	6	1236	1241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690660
23	NC_021192	CCG	2	6	1258	1263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690660
24	NC_021192	CAC	2	6	1490	1495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690660
25	NC_021192	GTT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690661
26	NC_021192	CCG	2	6	2235	2240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690661
27	NC_021192	TTG	2	6	2297	2302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690661
28	NC_021192	CGA	2	6	2400	2405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690661
29	NC_021192	TTG	2	6	2456	2461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690661
30	NC_021192	ATT	2	6	2470	2475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	494690661
31	NC_021192	CGC	2	6	2503	2508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690661
32	NC_021192	GAC	2	6	2516	2521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690661
33	NC_021192	GGT	2	6	2569	2574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690661
34	NC_021192	CGT	2	6	2628	2633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690661
35	NC_021192	GCC	2	6	2681	2686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690661
36	NC_021192	CGG	2	6	2698	2703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690661
37	NC_021192	GCA	2	6	2784	2789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690661
38	NC_021192	CTT	2	6	2798	2803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494690661
39	NC_021192	CCA	2	6	2859	2864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690661
40	NC_021192	GAT	2	6	2978	2983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690661
41	NC_021192	TTG	3	9	3005	3013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690661
42	NC_021192	CGG	2	6	3189	3194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690661
43	NC_021192	TTG	2	6	3345	3350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690662
44	NC_021192	CGA	2	6	3399	3404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690662
45	NC_021192	GTG	2	6	3482	3487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690662
46	NC_021192	ACG	2	6	3489	3494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690662
47	NC_021192	CAA	2	6	3538	3543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494690662
48	NC_021192	ATC	2	6	3559	3564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690662
49	NC_021192	TGT	2	6	3606	3611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690662
50	NC_021192	CGG	2	6	3656	3661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690662
51	NC_021192	GAT	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690662
52	NC_021192	TGG	2	6	3852	3857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690662
53	NC_021192	GAA	2	6	3898	3903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494690662
54	NC_021192	AGC	2	6	4012	4017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690662
55	NC_021192	GGC	2	6	4027	4032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690662
56	NC_021192	GGC	2	6	4036	4041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690662
57	NC_021192	GAC	2	6	4094	4099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690662
58	NC_021192	GGC	2	6	4183	4188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690662
59	NC_021192	TGG	2	6	4210	4215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690662
60	NC_021192	GTT	2	6	4225	4230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690662
61	NC_021192	CGA	2	6	4234	4239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690662
62	NC_021192	CGG	2	6	4284	4289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690662
63	NC_021192	CCG	2	6	4296	4301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690662
64	NC_021192	CCG	2	6	4341	4346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690662
65	NC_021192	GGT	2	6	4405	4410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690662
66	NC_021192	GGT	2	6	4718	4723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690663
67	NC_021192	CCA	2	6	4727	4732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690663
68	NC_021192	ACG	2	6	4765	4770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690663
69	NC_021192	CGC	2	6	4850	4855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690663
70	NC_021192	CGG	2	6	4900	4905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690663
71	NC_021192	GGT	2	6	5354	5359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690664
72	NC_021192	CGA	2	6	5372	5377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690664
73	NC_021192	TGC	2	6	5413	5418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690664
74	NC_021192	CGA	2	6	5444	5449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690664
75	NC_021192	GTG	2	6	5502	5507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690664
76	NC_021192	CGG	2	6	5525	5530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690664
77	NC_021192	TGG	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690664
78	NC_021192	GGT	2	6	5588	5593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690664
79	NC_021192	AAG	2	6	5703	5708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494690664
80	NC_021192	CAA	2	6	5810	5815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494690664
81	NC_021192	CGA	2	6	5837	5842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690664
82	NC_021192	GTC	2	6	5862	5867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690664
83	NC_021192	TGG	2	6	5980	5985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690664
84	NC_021192	AGC	2	6	6027	6032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690664
85	NC_021192	GGC	2	6	6147	6152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690664
86	NC_021192	GGT	2	6	6188	6193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690664
87	NC_021192	GCG	2	6	6491	6496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690664
88	NC_021192	ATC	2	6	6663	6668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690664
89	NC_021192	ATC	2	6	6723	6728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690664
90	NC_021192	ACG	2	6	6751	6756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690664
91	NC_021192	TGT	2	6	6838	6843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690664
92	NC_021192	GTT	3	9	6848	6856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690664
93	NC_021192	CCG	2	6	6904	6909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690664
94	NC_021192	CTG	2	6	6976	6981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690664
95	NC_021192	GAA	2	6	7002	7007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494690664
96	NC_021192	CAA	2	6	7011	7016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494690664
97	NC_021192	ACC	2	6	7078	7083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690664
98	NC_021192	GAC	2	6	7123	7128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690664
99	NC_021192	GCC	4	12	7129	7140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690664
100	NC_021192	GTT	2	6	7146	7151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690664
101	NC_021192	CAG	2	6	7331	7336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690665
102	NC_021192	TCG	2	6	7377	7382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690665
103	NC_021192	ACC	2	6	7521	7526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690665
104	NC_021192	TGG	2	6	7596	7601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690665
105	NC_021192	CGG	2	6	7640	7645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690665
106	NC_021192	GGC	2	6	7795	7800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690666
107	NC_021192	CGC	2	6	7829	7834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690666
108	NC_021192	ACG	2	6	7883	7888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690666
109	NC_021192	CGA	2	6	7890	7895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690666
110	NC_021192	CCG	2	6	7949	7954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690666
111	NC_021192	TCG	2	6	7961	7966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690666
112	NC_021192	GTT	2	6	8026	8031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690666
113	NC_021192	AGA	2	6	8037	8042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494690666
114	NC_021192	TCA	2	6	8108	8113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690666
115	NC_021192	GGT	2	6	8235	8240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690666
116	NC_021192	TCG	2	6	8303	8308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690666
117	NC_021192	ACC	2	6	8359	8364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690666
118	NC_021192	GCG	2	6	8381	8386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690666
119	NC_021192	CAC	2	6	8387	8392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690666
120	NC_021192	GCT	2	6	8528	8533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690666
121	NC_021192	CGA	2	6	8540	8545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690666
122	NC_021192	GCG	2	6	8579	8584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690666
123	NC_021192	CAT	2	6	8609	8614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690666
124	NC_021192	CGA	2	6	8615	8620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690666
125	NC_021192	CGA	2	6	8699	8704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690666
126	NC_021192	CGA	2	6	8732	8737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690666
127	NC_021192	ATC	2	6	8751	8756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690666
128	NC_021192	CGA	2	6	8777	8782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690666
129	NC_021192	CGT	2	6	8804	8809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690666
130	NC_021192	CGG	2	6	8876	8881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690666
131	NC_021192	GAC	2	6	8913	8918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690666
132	NC_021192	TCG	2	6	8920	8925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690666
133	NC_021192	CTT	2	6	8930	8935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494690666
134	NC_021192	TTC	2	6	8964	8969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494690666
135	NC_021192	ACC	2	6	8970	8975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690666
136	NC_021192	GCA	2	6	9038	9043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690666
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139	NC_021192	CTG	3	9	9269	9277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690666
140	NC_021192	CGA	2	6	9379	9384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690666
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142	NC_021192	CGT	2	6	9403	9408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690666
143	NC_021192	CTG	2	6	9425	9430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690666
144	NC_021192	CGG	2	6	9493	9498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690666
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146	NC_021192	CGA	3	9	9562	9570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690666
147	NC_021192	CGG	2	6	9595	9600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690666
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150	NC_021192	CGA	2	6	9727	9732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690666
151	NC_021192	CGA	3	9	9787	9795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690666
152	NC_021192	GAG	2	6	9816	9821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494690666
153	NC_021192	CGC	2	6	9998	10003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690667
154	NC_021192	TGC	2	6	10014	10019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690667
155	NC_021192	GCC	3	9	10050	10058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690667
156	NC_021192	CCG	4	12	10094	10105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690667
157	NC_021192	GCC	2	6	10159	10164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690667
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159	NC_021192	GCC	2	6	10342	10347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690667
160	NC_021192	GCG	3	9	10355	10363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690667
161	NC_021192	TGT	3	9	10485	10493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690667
162	NC_021192	TTC	2	6	10505	10510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494690667
163	NC_021192	GAT	2	6	10516	10521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690667
164	NC_021192	CGG	2	6	10549	10554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690667
165	NC_021192	AAC	2	6	10601	10606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494690667
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187	NC_021192	GAG	2	6	12157	12162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494690670
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240	NC_021192	ACG	2	6	16650	16655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690677
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250	NC_021192	CGG	2	6	17446	17451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690677
251	NC_021192	GGT	3	9	17554	17562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690678
252	NC_021192	CTG	2	6	17581	17586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690678
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254	NC_021192	TGA	2	6	17610	17615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690678
255	NC_021192	AGC	2	6	17618	17623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690678
256	NC_021192	GAT	3	9	17629	17637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690678
257	NC_021192	AGC	2	6	17669	17674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690678
258	NC_021192	CGG	2	6	17704	17709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690678
259	NC_021192	ACC	2	6	17716	17721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690678
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267	NC_021192	ACG	2	6	20340	20345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690680
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375	NC_021192	CAC	2	6	28852	28857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690689
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