MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 65792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021192	CG	3	6	61755	61760	0 %	0 %	50 %	50 %	494690718
1002	NC_021192	GCG	2	6	61778	61783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690718
1003	NC_021192	TGGC	2	8	61784	61791	0 %	25 %	50 %	25 %	494690718
1004	NC_021192	GTT	2	6	61870	61875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690718
1005	NC_021192	TGG	2	6	61897	61902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690718
1006	NC_021192	CTA	2	6	61942	61947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690718
1007	NC_021192	CGT	2	6	62373	62378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690719
1008	NC_021192	CA	4	8	62430	62437	50 %	0 %	0 %	50 %	494690719
1009	NC_021192	TCG	2	6	62441	62446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690719
1010	NC_021192	CTG	2	6	62500	62505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690719
1011	NC_021192	CGA	2	6	62529	62534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690719
1012	NC_021192	CGA	2	6	62585	62590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690719
1013	NC_021192	TG	3	6	62658	62663	0 %	50 %	50 %	0 %	494690719
1014	NC_021192	ATG	2	6	62695	62700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690719
1015	NC_021192	CGG	2	6	62733	62738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690719
1016	NC_021192	CGT	2	6	62762	62767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690719
1017	NC_021192	GGT	2	6	62874	62879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690719
1018	NC_021192	ATC	2	6	62946	62951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690719
1019	NC_021192	CTG	2	6	62964	62969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690719
1020	NC_021192	CAG	2	6	62977	62982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690719
1021	NC_021192	CGA	2	6	62989	62994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690719
1022	NC_021192	GTC	2	6	63038	63043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690719
1023	NC_021192	CAG	2	6	63052	63057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690719
1024	NC_021192	GCG	2	6	63101	63106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690719
1025	NC_021192	CGT	2	6	63124	63129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690719
1026	NC_021192	GAC	2	6	63341	63346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690720
1027	NC_021192	GCC	2	6	63360	63365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690720
1028	NC_021192	GCC	2	6	63368	63373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690720
1029	NC_021192	GT	3	6	63419	63424	0 %	50 %	50 %	0 %	494690720
1030	NC_021192	TCA	2	6	63495	63500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690720
1031	NC_021192	TAC	2	6	63512	63517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690720
1032	NC_021192	AAGG	2	8	63519	63526	50 %	0 %	50 %	0 %	494690720
1033	NC_021192	AGG	3	9	63524	63532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494690720
1034	NC_021192	CCT	2	6	63560	63565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494690720
1035	NC_021192	CGC	2	6	63645	63650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690720
1036	NC_021192	TCG	3	9	63718	63726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690720
1037	NC_021192	CAT	2	6	63755	63760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690720
1038	NC_021192	CCA	2	6	63769	63774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690720
1039	NC_021192	CAG	2	6	63945	63950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690720
1040	NC_021192	C	6	6	63977	63982	0 %	0 %	0 %	100 %	494690720
1041	NC_021192	GC	3	6	64037	64042	0 %	0 %	50 %	50 %	494690721
1042	NC_021192	GCG	2	6	64061	64066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690721
1043	NC_021192	CAG	2	6	64074	64079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690721
1044	NC_021192	CGC	2	6	64080	64085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690721
1045	NC_021192	CCGATC	2	12	64162	64173	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	494690721
1046	NC_021192	AACC	2	8	64296	64303	50 %	0 %	0 %	50 %	494690721
1047	NC_021192	ACT	2	6	64314	64319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690721
1048	NC_021192	GCT	2	6	64439	64444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690721
1049	NC_021192	CGA	2	6	64546	64551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690721
1050	NC_021192	TCG	2	6	64606	64611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690721
1051	NC_021192	GCT	2	6	64653	64658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690721
1052	NC_021192	CGGA	2	8	64659	64666	25 %	0 %	50 %	25 %	494690721
1053	NC_021192	ACC	2	6	64681	64686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690721
1054	NC_021192	GGC	2	6	64691	64696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690721
1055	NC_021192	CCG	2	6	64715	64720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690721
1056	NC_021192	ACTTCA	2	12	64965	64976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690721
1057	NC_021192	CGG	2	6	65007	65012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690721
1058	NC_021192	GCC	2	6	65160	65165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690722
1059	NC_021192	GTC	2	6	65258	65263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690722
1060	NC_021192	ATT	2	6	65291	65296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	494690722
1061	NC_021192	TCA	2	6	65311	65316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690722
1062	NC_021192	CG	3	6	65331	65336	0 %	0 %	50 %	50 %	494690722
1063	NC_021192	CCT	2	6	65349	65354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494690722
1064	NC_021192	CGG	2	6	65485	65490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690722
1065	NC_021192	CGC	2	6	65498	65503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690722
1066	NC_021192	GC	3	6	65502	65507	0 %	0 %	50 %	50 %	494690722
1067	NC_021192	CCG	2	6	65517	65522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690723
1068	NC_021192	CCG	2	6	65583	65588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690723
1069	NC_021192	CGG	2	6	65597	65602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690723
1070	NC_021192	GCG	2	6	65625	65630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690723
1071	NC_021192	GGC	2	6	65633	65638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690723
1072	NC_021192	CGA	2	6	65775	65780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690723
1073	NC_021192	TCG	2	6	65784	65789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690723
1074	NC_021192	GCTG	2	8	65925	65932	0 %	25 %	50 %	25 %	494690724
1075	NC_021192	GCC	2	6	65948	65953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690724
1076	NC_021192	CG	5	10	65978	65987	0 %	0 %	50 %	50 %	494690724
1077	NC_021192	ACC	2	6	66017	66022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690724
1078	NC_021192	GGCGA	2	10	66041	66050	20 %	0 %	60 %	20 %	494690724
1079	NC_021192	CAC	2	6	66172	66177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690724
1080	NC_021192	GC	3	6	66189	66194	0 %	0 %	50 %	50 %	494690724
1081	NC_021192	CGGA	2	8	66234	66241	25 %	0 %	50 %	25 %	494690724
1082	NC_021192	AG	3	6	66318	66323	50 %	0 %	50 %	0 %	494690724
1083	NC_021192	CGTCGG	2	12	66363	66374	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	494690724
1084	NC_021192	GGT	2	6	66448	66453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690724
1085	NC_021192	TGC	2	6	66486	66491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690724
1086	NC_021192	GCC	2	6	66589	66594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690724
1087	NC_021192	GCC	2	6	66604	66609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690724
1088	NC_021192	CTGG	2	8	66656	66663	0 %	25 %	50 %	25 %	494690724
1089	NC_021192	TCTT	2	8	66667	66674	0 %	75 %	0 %	25 %	494690724
1090	NC_021192	GAC	2	6	66701	66706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690724
1091	NC_021192	CGG	2	6	66762	66767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690724
1092	NC_021192	AAC	2	6	66827	66832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494690724
1093	NC_021192	GCCG	2	8	68554	68561	0 %	0 %	50 %	50 %	494690725
1094	NC_021192	GGTGT	2	10	68595	68604	0 %	40 %	60 %	0 %	494690725
1095	NC_021192	TTCG	2	8	68618	68625	0 %	50 %	25 %	25 %	494690725
1096	NC_021192	GTT	2	6	68642	68647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690725
1097	NC_021192	GCT	2	6	71754	71759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690726
1098	NC_021192	GC	3	6	71781	71786	0 %	0 %	50 %	50 %	494690726
1099	NC_021192	CGT	2	6	71850	71855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690726
1100	NC_021192	CGT	2	6	71869	71874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690726
1101	NC_021192	CCG	2	6	71927	71932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690726
1102	NC_021192	GTA	2	6	71955	71960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690726
1103	NC_021192	GCC	2	6	71961	71966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690726
1104	NC_021192	GCT	2	6	72065	72070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690727
1105	NC_021192	GTC	2	6	72072	72077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690727
1106	NC_021192	CAG	2	6	72180	72185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690727
1107	NC_021192	GGC	2	6	72195	72200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690727
1108	NC_021192	TCC	2	6	72316	72321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494690727
1109	NC_021192	CCGC	2	8	72352	72359	0 %	0 %	25 %	75 %	494690727
1110	NC_021192	CCG	3	9	72376	72384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690727
1111	NC_021192	GTCCA	2	10	72492	72501	20 %	20 %	20 %	40 %	494690728
1112	NC_021192	CTT	2	6	72600	72605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494690728
1113	NC_021192	GCGG	2	8	72623	72630	0 %	0 %	75 %	25 %	494690728
1114	NC_021192	CCAG	2	8	72638	72645	25 %	0 %	25 %	50 %	494690728
1115	NC_021192	GC	4	8	72669	72676	0 %	0 %	50 %	50 %	494690728
1116	NC_021192	CAGC	2	8	72683	72690	25 %	0 %	25 %	50 %	494690728
1117	NC_021192	CAG	2	6	72765	72770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690728
1118	NC_021192	CGA	2	6	72791	72796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690728
1119	NC_021192	CTC	2	6	72847	72852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494690728
1120	NC_021192	CTG	2	6	72856	72861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690728
1121	NC_021192	TCG	3	9	72894	72902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690728
1122	NC_021192	TGA	2	6	72933	72938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690728
1123	NC_021192	GCC	2	6	73021	73026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690728
1124	NC_021192	CG	3	6	73027	73032	0 %	0 %	50 %	50 %	494690728
1125	NC_021192	ATC	2	6	73034	73039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690728
1126	NC_021192	GAT	2	6	73156	73161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690728
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1128	NC_021192	TTG	2	6	73217	73222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690728
1129	NC_021192	GTC	2	6	73237	73242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690728
1130	NC_021192	AGA	2	6	73278	73283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494690728
1131	NC_021192	TCA	2	6	73323	73328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690728
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1134	NC_021192	GC	3	6	73633	73638	0 %	0 %	50 %	50 %	494690728
1135	NC_021192	CCG	2	6	73764	73769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690728
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1154	NC_021192	GC	3	6	74821	74826	0 %	0 %	50 %	50 %	494690729
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1158	NC_021192	CCG	2	6	74938	74943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690729
1159	NC_021192	TCA	2	6	74944	74949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690729
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1166	NC_021192	CGC	3	9	75134	75142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690729
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1245	NC_021192	GTGGTC	2	12	81825	81836	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	494690736
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1250	NC_021192	CGG	2	6	82031	82036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690736
1251	NC_021192	GCCGG	2	10	82056	82065	0 %	0 %	60 %	40 %	494690736
1252	NC_021192	GCT	2	6	82087	82092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690736
1253	NC_021192	CGTG	2	8	82116	82123	0 %	25 %	50 %	25 %	494690736
1254	NC_021192	GCGAC	2	10	82130	82139	20 %	0 %	40 %	40 %	494690736
1255	NC_021192	TGGTCG	2	12	82412	82423	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	494690736
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1258	NC_021192	ATGCGC	2	12	82523	82534	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	494690736
1259	NC_021192	CTG	2	6	82596	82601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690736
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1270	NC_021192	GGGA	2	8	82856	82863	25 %	0 %	75 %	0 %	494690737
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1283	NC_021192	CACCG	2	10	83674	83683	20 %	0 %	20 %	60 %	494690738
1284	NC_021192	GCGT	2	8	83704	83711	0 %	25 %	50 %	25 %	494690738
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1325	NC_021192	CGG	3	9	85615	85623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690740
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1367	NC_021192	ACC	2	6	87242	87247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690742
1368	NC_021192	CTC	2	6	87358	87363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494690743
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1500	NC_021192	TGC	2	6	92537	92542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690750

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