MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 1708

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021082	TTTAG	2	10	1775	1784	20 %	60 %	20 %	0 %	482884696
2	NC_021082	TCTGC	2	10	3477	3486	0 %	40 %	20 %	40 %	482884698
3	NC_021082	TCGGA	2	10	5244	5253	20 %	20 %	40 %	20 %	482884699
4	NC_021082	CCACC	2	10	9454	9463	20 %	0 %	0 %	80 %	482884702
5	NC_021082	TGCTT	2	10	11426	11435	0 %	60 %	20 %	20 %	482884706
6	NC_021082	ACGAA	2	10	13588	13597	60 %	0 %	20 %	20 %	482884709
7	NC_021082	AAAAT	2	10	13773	13782	80 %	20 %	0 %	0 %	482884709
8	NC_021082	GTTTT	2	10	18027	18036	0 %	80 %	20 %	0 %	482884714
9	NC_021082	CCACG	2	10	20163	20172	20 %	0 %	20 %	60 %	482884716
10	NC_021082	AACCG	2	10	22241	22250	40 %	0 %	20 %	40 %	482884717
11	NC_021082	ATATT	2	10	23117	23126	40 %	60 %	0 %	0 %	482884718
12	NC_021082	TTTAC	2	10	24598	24607	20 %	60 %	0 %	20 %	482884720
13	NC_021082	GCCGA	2	10	27600	27609	20 %	0 %	40 %	40 %	482884723
14	NC_021082	GCACA	2	10	27861	27870	40 %	0 %	20 %	40 %	482884723
15	NC_021082	AGCTC	2	10	29021	29030	20 %	20 %	20 %	40 %	482884726
16	NC_021082	TACGC	2	10	30569	30578	20 %	20 %	20 %	40 %	482884728
17	NC_021082	GCCAA	2	10	35133	35142	40 %	0 %	20 %	40 %	482884732
18	NC_021082	TGGTT	2	10	37035	37044	0 %	60 %	40 %	0 %	482884734
19	NC_021082	TATTT	2	10	38768	38777	20 %	80 %	0 %	0 %	482884736
20	NC_021082	GAAAT	2	10	40456	40465	60 %	20 %	20 %	0 %	482884737
21	NC_021082	TTTTG	2	10	45183	45192	0 %	80 %	20 %	0 %	482884744
22	NC_021082	GCCGA	2	10	47466	47475	20 %	0 %	40 %	40 %	482884746
23	NC_021082	AACCA	2	10	47577	47586	60 %	0 %	0 %	40 %	482884746
24	NC_021082	CAGCT	2	10	48815	48824	20 %	20 %	20 %	40 %	482884747
25	NC_021082	AAGCA	2	10	51967	51976	60 %	0 %	20 %	20 %	482884751
26	NC_021082	GTTGC	2	10	52343	52352	0 %	40 %	40 %	20 %	482884751
27	NC_021082	CGATT	2	10	56607	56616	20 %	40 %	20 %	20 %	482884755
28	NC_021082	TTTTA	2	10	58994	59003	20 %	80 %	0 %	0 %	482884758
29	NC_021082	AGTGA	2	10	59235	59244	40 %	20 %	40 %	0 %	482884758
30	NC_021082	TTAAA	2	10	67474	67483	60 %	40 %	0 %	0 %	482884767
31	NC_021082	GAAAA	2	10	67893	67902	80 %	0 %	20 %	0 %	482884767
32	NC_021082	ATGTT	2	10	68458	68467	20 %	60 %	20 %	0 %	482884767
33	NC_021082	AAATT	2	10	69493	69502	60 %	40 %	0 %	0 %	482884767
34	NC_021082	GAATG	2	10	70572	70581	40 %	20 %	40 %	0 %	482884768
35	NC_021082	AAGCT	2	10	71394	71403	40 %	20 %	20 %	20 %	482884769
36	NC_021082	TTTAT	2	10	73041	73050	20 %	80 %	0 %	0 %	482884770
37	NC_021082	AAAAC	2	10	73685	73694	80 %	0 %	0 %	20 %	482884771
38	NC_021082	CGATT	2	10	74235	74244	20 %	40 %	20 %	20 %	482884771
39	NC_021082	ATTTT	2	10	75137	75146	20 %	80 %	0 %	0 %	482884772
40	NC_021082	GTCCG	2	10	76575	76584	0 %	20 %	40 %	40 %	482884773
41	NC_021082	ACCGC	2	10	78519	78528	20 %	0 %	20 %	60 %	482884774
42	NC_021082	TGGCT	2	10	78798	78807	0 %	40 %	40 %	20 %	482884774
43	NC_021082	TGATG	2	10	79673	79682	20 %	40 %	40 %	0 %	482884775
44	NC_021082	AATTA	2	10	80993	81002	60 %	40 %	0 %	0 %	482884777
45	NC_021082	AATTC	2	10	83156	83165	40 %	40 %	0 %	20 %	482884778
46	NC_021082	AACAA	2	10	85458	85467	80 %	0 %	0 %	20 %	482884780
47	NC_021082	AACGG	2	10	86319	86328	40 %	0 %	40 %	20 %	482884781
48	NC_021082	CACCG	2	10	86872	86881	20 %	0 %	20 %	60 %	482884781
49	NC_021082	TGCCG	2	10	87319	87328	0 %	20 %	40 %	40 %	482884781
50	NC_021082	TTTGC	2	10	89784	89793	0 %	60 %	20 %	20 %	482884783
51	NC_021082	CATCG	2	10	90724	90733	20 %	20 %	20 %	40 %	482884784
52	NC_021082	ACTTA	2	10	91327	91336	40 %	40 %	0 %	20 %	482884785
53	NC_021082	ATTTT	2	10	92172	92181	20 %	80 %	0 %	0 %	482884786
54	NC_021082	AAGCC	2	10	92840	92849	40 %	0 %	20 %	40 %	482884787
55	NC_021082	ATCAA	2	10	97323	97332	60 %	20 %	0 %	20 %	482884794
56	NC_021082	CCGCA	2	10	98314	98323	20 %	0 %	20 %	60 %	482884794
57	NC_021082	AAATT	2	10	101299	101308	60 %	40 %	0 %	0 %	482884796
58	NC_021082	TTTAG	2	10	108742	108751	20 %	60 %	20 %	0 %	482884806
59	NC_021082	ATCAG	2	10	108808	108817	40 %	20 %	20 %	20 %	482884806
60	NC_021082	TATTT	2	10	109317	109326	20 %	80 %	0 %	0 %	482884806
61	NC_021082	CGGCT	2	10	111959	111968	0 %	20 %	40 %	40 %	482884810
62	NC_021082	CAGTT	2	10	114728	114737	20 %	40 %	20 %	20 %	482884814
63	NC_021082	GCAGG	2	10	115068	115077	20 %	0 %	60 %	20 %	482884814
64	NC_021082	TCAGC	2	10	115753	115762	20 %	20 %	20 %	40 %	482884815
65	NC_021082	CAAAA	2	10	119294	119303	80 %	0 %	0 %	20 %	482884820
66	NC_021082	AGTAA	2	10	120079	120088	60 %	20 %	20 %	0 %	482884821
67	NC_021082	AACAG	2	10	121188	121197	60 %	0 %	20 %	20 %	482884821
68	NC_021082	CTGCC	2	10	122211	122220	0 %	20 %	20 %	60 %	482884822
69	NC_021082	TCGGC	2	10	125045	125054	0 %	20 %	40 %	40 %	482884827
70	NC_021082	GCTAT	2	10	128670	128679	20 %	40 %	20 %	20 %	482884833
71	NC_021082	TGCTT	2	10	129920	129929	0 %	60 %	20 %	20 %	482884837
72	NC_021082	CCAAA	2	10	132822	132831	60 %	0 %	0 %	40 %	482884840
73	NC_021082	TGAAG	2	10	134362	134371	40 %	20 %	40 %	0 %	482884842
74	NC_021082	TACGA	2	10	138672	138681	40 %	20 %	20 %	20 %	482884845
75	NC_021082	ACCAG	2	10	139536	139545	40 %	0 %	20 %	40 %	482884845
76	NC_021082	GCAAT	2	10	141418	141427	40 %	20 %	20 %	20 %	482884848
77	NC_021082	TTGGC	2	10	141592	141601	0 %	40 %	40 %	20 %	482884848
78	NC_021082	CATAT	2	10	142773	142782	40 %	40 %	0 %	20 %	482884849
79	NC_021082	GCAAT	2	10	145721	145730	40 %	20 %	20 %	20 %	482884853
80	NC_021082	TTTAT	2	10	150717	150726	20 %	80 %	0 %	0 %	482884856
81	NC_021082	TTTCA	2	10	151025	151034	20 %	60 %	0 %	20 %	482884856
82	NC_021082	TTATT	2	10	153778	153787	20 %	80 %	0 %	0 %	482884858
83	NC_021082	CGATT	2	10	158364	158373	20 %	40 %	20 %	20 %	482884861
84	NC_021082	AAAGT	2	10	159509	159518	60 %	20 %	20 %	0 %	482884862
85	NC_021082	AAATC	2	10	161867	161876	60 %	20 %	0 %	20 %	482884865
86	NC_021082	CCGCT	2	10	163856	163865	0 %	20 %	20 %	60 %	482884867
87	NC_021082	CACTG	2	10	164070	164079	20 %	20 %	20 %	40 %	482884867
88	NC_021082	ATTTG	2	10	164555	164564	20 %	60 %	20 %	0 %	482884868
89	NC_021082	CGGTA	2	10	164618	164627	20 %	20 %	40 %	20 %	482884868
90	NC_021082	ATTGG	2	10	164923	164932	20 %	40 %	40 %	0 %	482884868
91	NC_021082	GATGT	2	10	165184	165193	20 %	40 %	40 %	0 %	482884869
92	NC_021082	TTATT	2	10	165282	165291	20 %	80 %	0 %	0 %	482884869
93	NC_021082	GTGAA	2	10	170197	170206	40 %	20 %	40 %	0 %	482884877
94	NC_021082	TCAAA	2	10	170265	170274	60 %	20 %	0 %	20 %	482884877
95	NC_021082	AGCAA	2	10	171280	171289	60 %	0 %	20 %	20 %	482884879
96	NC_021082	AAATC	2	10	172903	172912	60 %	20 %	0 %	20 %	482884881
97	NC_021082	TCGGT	2	10	173538	173547	0 %	40 %	40 %	20 %	482884882
98	NC_021082	GCACG	2	10	176691	176700	20 %	0 %	40 %	40 %	482884886
99	NC_021082	AAATC	2	10	176910	176919	60 %	20 %	0 %	20 %	482884886
100	NC_021082	TTAAT	2	10	177632	177641	40 %	60 %	0 %	0 %	482884887
101	NC_021082	TCTGC	2	10	178518	178527	0 %	40 %	20 %	40 %	482884889
102	NC_021082	CAATT	2	10	181241	181250	40 %	40 %	0 %	20 %	482884891
103	NC_021082	TTTAC	2	10	181857	181866	20 %	60 %	0 %	20 %	482884892
104	NC_021082	GCCAA	2	10	182114	182123	40 %	0 %	20 %	40 %	482884892
105	NC_021082	TCACC	2	10	182993	183002	20 %	20 %	0 %	60 %	482884893
106	NC_021082	GCGGG	2	10	187013	187022	0 %	0 %	80 %	20 %	482884896
107	NC_021082	AATAA	2	10	189517	189526	80 %	20 %	0 %	0 %	482884896
108	NC_021082	CAAAC	2	10	190952	190961	60 %	0 %	0 %	40 %	482884898
109	NC_021082	GTGAT	2	10	194140	194149	20 %	40 %	40 %	0 %	482884900
110	NC_021082	ATTGT	2	10	194381	194390	20 %	60 %	20 %	0 %	482884900
111	NC_021082	TGGGT	2	10	195267	195276	0 %	40 %	60 %	0 %	482884901
112	NC_021082	TCCGC	2	10	196925	196934	0 %	20 %	20 %	60 %	482884903
113	NC_021082	TAATT	2	10	198123	198132	40 %	60 %	0 %	0 %	482884903
114	NC_021082	GAAAA	2	10	200112	200121	80 %	0 %	20 %	0 %	482884906
115	NC_021082	GGAAT	2	10	203753	203762	40 %	20 %	40 %	0 %	482884913
116	NC_021082	TGCAA	2	10	204909	204918	40 %	20 %	20 %	20 %	482884914
117	NC_021082	TAACT	2	10	206304	206313	40 %	40 %	0 %	20 %	482884916
118	NC_021082	AAGCC	2	10	207472	207481	40 %	0 %	20 %	40 %	482884917
119	NC_021082	TAAAG	2	10	209692	209701	60 %	20 %	20 %	0 %	482884920
120	NC_021082	GCGTT	2	10	210824	210833	0 %	40 %	40 %	20 %	482884921
121	NC_021082	CATCA	2	10	214180	214189	40 %	20 %	0 %	40 %	482884924
122	NC_021082	TGCGT	2	10	214966	214975	0 %	40 %	40 %	20 %	482884925
123	NC_021082	GCTTT	2	10	216081	216090	0 %	60 %	20 %	20 %	482884927
124	NC_021082	GGCAA	2	10	216297	216306	40 %	0 %	40 %	20 %	482884927
125	NC_021082	TGCAT	2	10	218246	218255	20 %	40 %	20 %	20 %	482884928
126	NC_021082	TTCTA	2	10	223486	223495	20 %	60 %	0 %	20 %	482884928
127	NC_021082	GTTTG	2	10	228112	228121	0 %	60 %	40 %	0 %	482884932
128	NC_021082	TTACG	2	10	228868	228877	20 %	40 %	20 %	20 %	482884933
129	NC_021082	TACCA	2	10	230752	230761	40 %	20 %	0 %	40 %	482884934
130	NC_021082	AAATC	2	10	232520	232529	60 %	20 %	0 %	20 %	482884937
131	NC_021082	AGAGT	2	10	233691	233700	40 %	20 %	40 %	0 %	482884937
132	NC_021082	TACCG	2	10	234524	234533	20 %	20 %	20 %	40 %	482884938
133	NC_021082	TCCTT	2	10	240026	240035	0 %	60 %	0 %	40 %	482884945
134	NC_021082	GCAAA	2	10	240869	240878	60 %	0 %	20 %	20 %	482884946
135	NC_021082	ACCTT	2	10	240990	240999	20 %	40 %	0 %	40 %	482884946
136	NC_021082	GGCAA	2	10	241765	241774	40 %	0 %	40 %	20 %	482884947
137	NC_021082	TTGAT	2	10	248562	248571	20 %	60 %	20 %	0 %	482884957
138	NC_021082	GCAAG	2	10	248693	248702	40 %	0 %	40 %	20 %	482884957
139	NC_021082	ACCAC	2	10	249269	249278	40 %	0 %	0 %	60 %	482884958
140	NC_021082	TGAAA	2	10	250445	250454	60 %	20 %	20 %	0 %	482884959
141	NC_021082	CCCAA	2	10	250886	250895	40 %	0 %	0 %	60 %	482884959
142	NC_021082	CAATT	2	10	251100	251109	40 %	40 %	0 %	20 %	482884959
143	NC_021082	CTGAG	2	10	252000	252009	20 %	20 %	40 %	20 %	482884961
144	NC_021082	TCAAA	2	10	257750	257759	60 %	20 %	0 %	20 %	482884969
145	NC_021082	TGGCT	2	10	262958	262967	0 %	40 %	40 %	20 %	482884975
146	NC_021082	AAATG	2	10	263608	263617	60 %	20 %	20 %	0 %	482884976
147	NC_021082	TATTT	2	10	265695	265704	20 %	80 %	0 %	0 %	482884980
148	NC_021082	ATACA	2	10	266030	266039	60 %	20 %	0 %	20 %	482884980
149	NC_021082	GTGCA	2	10	266223	266232	20 %	20 %	40 %	20 %	482884981
150	NC_021082	AAAAG	2	10	275858	275867	80 %	0 %	20 %	0 %	482884985
151	NC_021082	TTTAA	2	10	277951	277960	40 %	60 %	0 %	0 %	482884989
152	NC_021082	CCAAA	2	10	280903	280912	60 %	0 %	0 %	40 %	482884991
153	NC_021082	AATGC	2	10	282704	282713	40 %	20 %	20 %	20 %	482884993
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155	NC_021082	GGCAA	2	10	286515	286524	40 %	0 %	40 %	20 %	482884997
156	NC_021082	AAAGC	2	10	286603	286612	60 %	0 %	20 %	20 %	482884997
157	NC_021082	CACCT	2	10	287227	287236	20 %	20 %	0 %	60 %	482884998
158	NC_021082	TGGTG	2	10	287842	287851	0 %	40 %	60 %	0 %	482884999
159	NC_021082	GCTTG	2	10	291722	291731	0 %	40 %	40 %	20 %	482885003
160	NC_021082	TTCGG	2	10	294120	294129	0 %	40 %	40 %	20 %	482885005
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163	NC_021082	ATTGA	2	10	298845	298854	40 %	40 %	20 %	0 %	482885010
164	NC_021082	GCCTT	2	10	299174	299183	0 %	40 %	20 %	40 %	482885010
165	NC_021082	TTAAA	2	10	299643	299652	60 %	40 %	0 %	0 %	482885010
166	NC_021082	CTTTG	2	10	313294	313303	0 %	60 %	20 %	20 %	482885016
167	NC_021082	CTGCC	2	10	313778	313787	0 %	20 %	20 %	60 %	482885017
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169	NC_021082	GCATT	2	10	315056	315065	20 %	40 %	20 %	20 %	482885019
170	NC_021082	CGTGC	2	10	315799	315808	0 %	20 %	40 %	40 %	482885020
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172	NC_021082	ACGGC	2	10	317839	317848	20 %	0 %	40 %	40 %	482885022
173	NC_021082	ACCAA	2	10	318498	318507	60 %	0 %	0 %	40 %	482885022
174	NC_021082	TCTTT	2	10	320775	320784	0 %	80 %	0 %	20 %	482885024
175	NC_021082	ATTCT	2	10	320951	320960	20 %	60 %	0 %	20 %	482885024
176	NC_021082	TAAGA	2	10	321437	321446	60 %	20 %	20 %	0 %	482885024
177	NC_021082	TAATT	2	10	321490	321499	40 %	60 %	0 %	0 %	482885024
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181	NC_021082	CGGTA	2	10	324625	324634	20 %	20 %	40 %	20 %	482885025
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185	NC_021082	TACCG	2	10	330192	330201	20 %	20 %	20 %	40 %	482885026
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188	NC_021082	TAATT	2	10	336278	336287	40 %	60 %	0 %	0 %	482885036
189	NC_021082	ATTGA	2	10	337104	337113	40 %	40 %	20 %	0 %	482885037
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193	NC_021082	AATCA	2	10	341280	341289	60 %	20 %	0 %	20 %	482885041
194	NC_021082	TTTGC	2	10	341649	341658	0 %	60 %	20 %	20 %	482885041
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196	NC_021082	GCGTG	2	10	347936	347945	0 %	20 %	60 %	20 %	482885050
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198	NC_021082	TCATT	2	10	349468	349477	20 %	60 %	0 %	20 %	482885052
199	NC_021082	CACCG	2	10	351471	351480	20 %	0 %	20 %	60 %	482885054
200	NC_021082	GTGAG	2	10	351686	351695	20 %	20 %	60 %	0 %	482885054
201	NC_021082	AGAGA	2	10	352049	352058	60 %	0 %	40 %	0 %	482885054
202	NC_021082	GTTCG	2	10	355111	355120	0 %	40 %	40 %	20 %	482885060
203	NC_021082	CAATC	2	10	355944	355953	40 %	20 %	0 %	40 %	482885061
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205	NC_021082	AGTTC	2	10	363797	363806	20 %	40 %	20 %	20 %	482885070
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211	NC_021082	AAATT	2	10	368714	368723	60 %	40 %	0 %	0 %	482885073
212	NC_021082	GATTG	2	10	369272	369281	20 %	40 %	40 %	0 %	482885074
213	NC_021082	TTGGT	2	10	372221	372230	0 %	60 %	40 %	0 %	482885077
214	NC_021082	GGTTT	2	10	372408	372417	0 %	60 %	40 %	0 %	482885077
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236	NC_021082	GTAGC	2	10	417524	417533	20 %	20 %	40 %	20 %	482885120
237	NC_021082	TTCAC	2	10	419046	419055	20 %	40 %	0 %	40 %	482885121
238	NC_021082	TGGGG	2	10	421620	421629	0 %	20 %	80 %	0 %	482885123
239	NC_021082	TGGCT	2	10	424448	424457	0 %	40 %	40 %	20 %	482885127
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241	NC_021082	TTCCA	2	10	429049	429058	20 %	40 %	0 %	40 %	482885133
242	NC_021082	ATGCA	2	10	429577	429586	40 %	20 %	20 %	20 %	482885133
243	NC_021082	ATGAG	2	10	430499	430508	40 %	20 %	40 %	0 %	482885134
244	NC_021082	CTGAA	2	10	431297	431306	40 %	20 %	20 %	20 %	482885135
245	NC_021082	ATTGG	2	10	431712	431721	20 %	40 %	40 %	0 %	482885135
246	NC_021082	AATGG	2	10	433176	433185	40 %	20 %	40 %	0 %	482885136
247	NC_021082	GGTGT	2	10	433657	433666	0 %	40 %	60 %	0 %	482885137
248	NC_021082	TTAAC	2	10	434937	434946	40 %	40 %	0 %	20 %	482885138
249	NC_021082	TACTT	2	10	436545	436554	20 %	60 %	0 %	20 %	482885140
250	NC_021082	TTATT	2	10	436736	436745	20 %	80 %	0 %	0 %	482885140
251	NC_021082	CGCAA	2	10	439700	439709	40 %	0 %	20 %	40 %	482885143
252	NC_021082	CAATC	2	10	440834	440843	40 %	20 %	0 %	40 %	482885145
253	NC_021082	TTCAT	2	10	441532	441541	20 %	60 %	0 %	20 %	482885145
254	NC_021082	AAAAT	2	10	443085	443094	80 %	20 %	0 %	0 %	482885147
255	NC_021082	ACACC	2	10	443311	443320	40 %	0 %	0 %	60 %	482885147
256	NC_021082	GTATG	2	10	451399	451408	20 %	40 %	40 %	0 %	482885155
257	NC_021082	AAAGG	2	10	452212	452221	60 %	0 %	40 %	0 %	482885156
258	NC_021082	ATTTA	2	10	454184	454193	40 %	60 %	0 %	0 %	482885158
259	NC_021082	AATTA	2	10	455853	455862	60 %	40 %	0 %	0 %	482885160
260	NC_021082	AAACA	2	10	456863	456872	80 %	0 %	0 %	20 %	482885161
261	NC_021082	CAAAA	2	10	456912	456921	80 %	0 %	0 %	20 %	482885161
262	NC_021082	CAAAA	2	10	457401	457410	80 %	0 %	0 %	20 %	482885161
263	NC_021082	GTTTG	2	10	458238	458247	0 %	60 %	40 %	0 %	482885162
264	NC_021082	TGCGT	2	10	459906	459915	0 %	40 %	40 %	20 %	482885162
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