MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 46290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021082	CAC	2	6	84719	84724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884780
1502	NC_021082	A	6	6	84735	84740	100 %	0 %	0 %	0 %	482884780
1503	NC_021082	TGA	2	6	84791	84796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884780
1504	NC_021082	A	6	6	84843	84848	100 %	0 %	0 %	0 %	482884780
1505	NC_021082	GAA	2	6	84946	84951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884780
1506	NC_021082	TCT	2	6	84976	84981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884780
1507	NC_021082	GAG	2	6	84985	84990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482884780
1508	NC_021082	TTA	2	6	85021	85026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884780
1509	NC_021082	TGA	3	9	85029	85037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884780
1510	NC_021082	GATTCA	2	12	85143	85154	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	482884780
1511	NC_021082	AAGC	2	8	85157	85164	50 %	0 %	25 %	25 %	482884780
1512	NC_021082	TAC	2	6	85211	85216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884780
1513	NC_021082	ATA	2	6	85226	85231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884780
1514	NC_021082	GAAT	2	8	85278	85285	50 %	25 %	25 %	0 %	482884780
1515	NC_021082	GAA	2	6	85348	85353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884780
1516	NC_021082	AGA	2	6	85404	85409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884780
1517	NC_021082	CA	3	6	85434	85439	50 %	0 %	0 %	50 %	482884780
1518	NC_021082	CT	3	6	85444	85449	0 %	50 %	0 %	50 %	482884780
1519	NC_021082	AACAA	2	10	85458	85467	80 %	0 %	0 %	20 %	482884780
1520	NC_021082	A	6	6	85526	85531	100 %	0 %	0 %	0 %	482884780
1521	NC_021082	GCA	2	6	85571	85576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884780
1522	NC_021082	ACA	2	6	85584	85589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884780
1523	NC_021082	TGG	2	6	85617	85622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884780
1524	NC_021082	TAT	2	6	85686	85691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884780
1525	NC_021082	TGA	2	6	85695	85700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884780
1526	NC_021082	CTG	2	6	85724	85729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884780
1527	NC_021082	TAT	2	6	85778	85783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884780
1528	NC_021082	CAG	2	6	85822	85827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884780
1529	NC_021082	AAT	2	6	85852	85857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884780
1530	NC_021082	TTCT	2	8	86250	86257	0 %	75 %	0 %	25 %	482884781
1531	NC_021082	AACGG	2	10	86319	86328	40 %	0 %	40 %	20 %	482884781
1532	NC_021082	AAT	2	6	86432	86437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884781
1533	NC_021082	CGGCTT	2	12	86454	86465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884781
1534	NC_021082	AGC	3	9	86476	86484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884781
1535	NC_021082	TCG	2	6	86489	86494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884781
1536	NC_021082	GCT	2	6	86524	86529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884781
1537	NC_021082	TTC	2	6	86581	86586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884781
1538	NC_021082	ACTG	2	8	86731	86738	25 %	25 %	25 %	25 %	482884781
1539	NC_021082	AATG	2	8	86739	86746	50 %	25 %	25 %	0 %	482884781
1540	NC_021082	GA	3	6	86772	86777	50 %	0 %	50 %	0 %	482884781
1541	NC_021082	TTAA	2	8	86822	86829	50 %	50 %	0 %	0 %	482884781
1542	NC_021082	TCA	2	6	86849	86854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884781
1543	NC_021082	CACCG	2	10	86872	86881	20 %	0 %	20 %	60 %	482884781
1544	NC_021082	GTG	2	6	86982	86987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884781
1545	NC_021082	TTG	2	6	86990	86995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884781
1546	NC_021082	GTC	2	6	87040	87045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884781
1547	NC_021082	CAC	3	9	87046	87054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884781
1548	NC_021082	AAT	2	6	87091	87096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884781
1549	NC_021082	TAC	2	6	87154	87159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884781
1550	NC_021082	TCGG	2	8	87167	87174	0 %	25 %	50 %	25 %	482884781
1551	NC_021082	CTT	2	6	87264	87269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884781
1552	NC_021082	TGCCG	2	10	87319	87328	0 %	20 %	40 %	40 %	482884781
1553	NC_021082	GCG	2	6	87437	87442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884781
1554	NC_021082	CAT	2	6	87501	87506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884781
1555	NC_021082	TGA	2	6	87655	87660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884782
1556	NC_021082	TAC	2	6	87685	87690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884782
1557	NC_021082	A	6	6	87711	87716	100 %	0 %	0 %	0 %	482884782
1558	NC_021082	A	6	6	87732	87737	100 %	0 %	0 %	0 %	482884782
1559	NC_021082	TTTCTT	2	12	88457	88468	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	482884783
1560	NC_021082	AAG	2	6	88481	88486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884783
1561	NC_021082	TTCTTG	2	12	88521	88532	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	482884783
1562	NC_021082	TAAT	2	8	88558	88565	50 %	50 %	0 %	0 %	482884783
1563	NC_021082	TAC	2	6	88568	88573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884783
1564	NC_021082	ATA	2	6	88575	88580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884783
1565	NC_021082	ATA	2	6	88647	88652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884783
1566	NC_021082	GCAA	2	8	88663	88670	50 %	0 %	25 %	25 %	482884783
1567	NC_021082	CAC	2	6	88709	88714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884783
1568	NC_021082	GTT	2	6	88718	88723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884783
1569	NC_021082	CGA	2	6	88732	88737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884783
1570	NC_021082	CAA	2	6	88743	88748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884783
1571	NC_021082	GCT	2	6	88771	88776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884783
1572	NC_021082	CAT	2	6	88923	88928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884783
1573	NC_021082	GCC	2	6	88993	88998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884783
1574	NC_021082	TCT	2	6	89131	89136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884783
1575	NC_021082	CAG	2	6	89181	89186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884783
1576	NC_021082	TCA	2	6	89242	89247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884783
1577	NC_021082	GCA	2	6	89290	89295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884783
1578	NC_021082	CTT	2	6	89360	89365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884783
1579	NC_021082	AAT	2	6	89454	89459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884783
1580	NC_021082	AAG	2	6	89525	89530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884783
1581	NC_021082	AAT	2	6	89534	89539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884783
1582	NC_021082	AGGA	2	8	89540	89547	50 %	0 %	50 %	0 %	482884783
1583	NC_021082	AGC	2	6	89584	89589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884783
1584	NC_021082	GCA	2	6	89596	89601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884783
1585	NC_021082	CAT	2	6	89609	89614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884783
1586	NC_021082	CTA	2	6	89644	89649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884783
1587	NC_021082	CAA	2	6	89738	89743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884783
1588	NC_021082	TTTGC	2	10	89784	89793	0 %	60 %	20 %	20 %	482884783
1589	NC_021082	TGAA	2	8	89820	89827	50 %	25 %	25 %	0 %	482884783
1590	NC_021082	T	6	6	89831	89836	0 %	100 %	0 %	0 %	482884783
1591	NC_021082	TTAT	2	8	90583	90590	25 %	75 %	0 %	0 %	482884784
1592	NC_021082	TTC	2	6	90707	90712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884784
1593	NC_021082	CATCG	2	10	90724	90733	20 %	20 %	20 %	40 %	482884784
1594	NC_021082	CAA	2	6	90773	90778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884784
1595	NC_021082	CAC	2	6	90828	90833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884784
1596	NC_021082	TAA	2	6	90836	90841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884784
1597	NC_021082	CAT	2	6	91032	91037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884784
1598	NC_021082	GCT	2	6	91079	91084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884784
1599	NC_021082	A	7	7	91085	91091	100 %	0 %	0 %	0 %	482884784
1600	NC_021082	A	6	6	91101	91106	100 %	0 %	0 %	0 %	482884784
1601	NC_021082	AAT	2	6	91223	91228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884785
1602	NC_021082	ACTTA	2	10	91327	91336	40 %	40 %	0 %	20 %	482884785
1603	NC_021082	TGC	2	6	91436	91441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884785
1604	NC_021082	GAT	2	6	91530	91535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884785
1605	NC_021082	A	6	6	91626	91631	100 %	0 %	0 %	0 %	482884785
1606	NC_021082	GTG	2	6	91645	91650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884785
1607	NC_021082	ACC	2	6	91666	91671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884785
1608	NC_021082	GCT	2	6	91690	91695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884785
1609	NC_021082	CAT	2	6	91716	91721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884785
1610	NC_021082	AGA	2	6	91988	91993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884785
1611	NC_021082	GAT	2	6	92016	92021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884785
1612	NC_021082	ACC	2	6	92044	92049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884785
1613	NC_021082	T	6	6	92155	92160	0 %	100 %	0 %	0 %	482884786
1614	NC_021082	ATTTT	2	10	92172	92181	20 %	80 %	0 %	0 %	482884786
1615	NC_021082	TAA	2	6	92188	92193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884786
1616	NC_021082	CTT	2	6	92194	92199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884786
1617	NC_021082	TCA	3	9	92295	92303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884786
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1619	NC_021082	TCA	2	6	92337	92342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884786
1620	NC_021082	GCT	2	6	92400	92405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884786
1621	NC_021082	TCT	3	9	92517	92525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884786
1622	NC_021082	TTA	2	6	92526	92531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884786
1623	NC_021082	AAT	2	6	92532	92537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884786
1624	NC_021082	CAA	2	6	92554	92559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884786
1625	NC_021082	AAGCC	2	10	92840	92849	40 %	0 %	20 %	40 %	482884787
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1744	NC_021082	ACT	2	6	100131	100136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884796
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1746	NC_021082	ATA	2	6	100276	100281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884796
1747	NC_021082	GAT	2	6	100361	100366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884796
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1749	NC_021082	CGTCTT	2	12	100618	100629	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	482884796
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1752	NC_021082	TAAACC	2	12	100724	100735	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	482884796
1753	NC_021082	CAA	2	6	100845	100850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884796
1754	NC_021082	TCA	2	6	100917	100922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884796
1755	NC_021082	CGC	2	6	100963	100968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884796
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1757	NC_021082	ATG	3	9	101061	101069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884796
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1762	NC_021082	CGC	2	6	101168	101173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884796
1763	NC_021082	TCT	2	6	101178	101183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884796
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1765	NC_021082	AGT	2	6	101249	101254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884796
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1768	NC_021082	AAATT	2	10	101299	101308	60 %	40 %	0 %	0 %	482884796
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1773	NC_021082	TTG	2	6	101670	101675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884797
1774	NC_021082	CA	3	6	101808	101813	50 %	0 %	0 %	50 %	482884797
1775	NC_021082	CTA	2	6	101848	101853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884797
1776	NC_021082	GTTG	2	8	101880	101887	0 %	50 %	50 %	0 %	482884797
1777	NC_021082	GCT	2	6	101953	101958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884797
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1780	NC_021082	TAAA	2	8	102410	102417	75 %	25 %	0 %	0 %	482884798
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1784	NC_021082	AATT	2	8	103008	103015	50 %	50 %	0 %	0 %	482884798
1785	NC_021082	TCTT	2	8	103028	103035	0 %	75 %	0 %	25 %	482884798
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1851	NC_021082	ACG	2	6	107094	107099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884803
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1857	NC_021082	A	6	6	107432	107437	100 %	0 %	0 %	0 %	482884803
1858	NC_021082	CGG	2	6	107441	107446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884803
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1865	NC_021082	ACCA	2	8	108133	108140	50 %	0 %	0 %	50 %	482884805
1866	NC_021082	AGA	2	6	108154	108159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884805
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1869	NC_021082	CAC	2	6	108399	108404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884805
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1872	NC_021082	ATT	2	6	108454	108459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884805
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1874	NC_021082	GAA	2	6	108482	108487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884805
1875	NC_021082	GGA	2	6	108493	108498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482884805
1876	NC_021082	TGC	2	6	108530	108535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884805
1877	NC_021082	GCG	2	6	108560	108565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884805
1878	NC_021082	GAA	2	6	108581	108586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884805
1879	NC_021082	TAAG	2	8	108597	108604	50 %	25 %	25 %	0 %	482884805
1880	NC_021082	TTTAG	2	10	108742	108751	20 %	60 %	20 %	0 %	482884806
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1882	NC_021082	ATCAG	2	10	108808	108817	40 %	20 %	20 %	20 %	482884806
1883	NC_021082	GTT	2	6	109010	109015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884806
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1887	NC_021082	CAGC	2	8	109205	109212	25 %	0 %	25 %	50 %	482884806
1888	NC_021082	T	6	6	109214	109219	0 %	100 %	0 %	0 %	482884806
1889	NC_021082	TTG	2	6	109227	109232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884806
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1891	NC_021082	TATTT	2	10	109317	109326	20 %	80 %	0 %	0 %	482884806
1892	NC_021082	T	6	6	109331	109336	0 %	100 %	0 %	0 %	482884806
1893	NC_021082	TCAA	2	8	109378	109385	50 %	25 %	0 %	25 %	482884807
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1897	NC_021082	CAAA	2	8	109613	109620	75 %	0 %	0 %	25 %	482884807
1898	NC_021082	T	6	6	109688	109693	0 %	100 %	0 %	0 %	482884807
1899	NC_021082	GAT	2	6	109718	109723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884807
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1903	NC_021082	T	6	6	109931	109936	0 %	100 %	0 %	0 %	482884808
1904	NC_021082	TCA	2	6	109978	109983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884808
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1957	NC_021082	A	6	6	113362	113367	100 %	0 %	0 %	0 %	482884812
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1965	NC_021082	TTTA	2	8	113574	113581	25 %	75 %	0 %	0 %	482884812
1966	NC_021082	TGA	2	6	113670	113675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884812
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1968	NC_021082	CAT	2	6	113700	113705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884812
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1979	NC_021082	TGA	2	6	114327	114332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884814
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1981	NC_021082	TGG	2	6	114504	114509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884814
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1983	NC_021082	GTT	2	6	114589	114594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884814
1984	NC_021082	TCGC	2	8	114673	114680	0 %	25 %	25 %	50 %	482884814
1985	NC_021082	AGT	2	6	114704	114709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884814
1986	NC_021082	CAGTT	2	10	114728	114737	20 %	40 %	20 %	20 %	482884814
1987	NC_021082	AT	3	6	114848	114853	50 %	50 %	0 %	0 %	482884814
1988	NC_021082	TG	3	6	114906	114911	0 %	50 %	50 %	0 %	482884814
1989	NC_021082	CAT	2	6	114924	114929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884814
1990	NC_021082	AAC	2	6	114953	114958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884814
1991	NC_021082	CAT	2	6	114961	114966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884814
1992	NC_021082	GAAC	2	8	115000	115007	50 %	0 %	25 %	25 %	482884814
1993	NC_021082	GCAGG	2	10	115068	115077	20 %	0 %	60 %	20 %	482884814
1994	NC_021082	TCA	2	6	115139	115144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884814
1995	NC_021082	GGGT	2	8	115173	115180	0 %	25 %	75 %	0 %	482884814
1996	NC_021082	CTGTAT	2	12	115195	115206	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	482884814
1997	NC_021082	ACC	2	6	115407	115412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884815
1998	NC_021082	CT	3	6	115424	115429	0 %	50 %	0 %	50 %	482884815
1999	NC_021082	AAT	2	6	115490	115495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884815
2000	NC_021082	AGG	2	6	115548	115553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482884815

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