MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 1708

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021082	GTAGT	2	10	874051	874060	20 %	40 %	40 %	0 %	482885572
502	NC_021082	ACCTG	2	10	874241	874250	20 %	20 %	20 %	40 %	482885572
503	NC_021082	CAGTT	2	10	874252	874261	20 %	40 %	20 %	20 %	482885572
504	NC_021082	TTTTA	2	10	874663	874672	20 %	80 %	0 %	0 %	482885572
505	NC_021082	TTAAC	2	10	875608	875617	40 %	40 %	0 %	20 %	482885573
506	NC_021082	ATGAA	2	10	876523	876532	60 %	20 %	20 %	0 %	482885573
507	NC_021082	CGGTT	2	10	878594	878603	0 %	40 %	40 %	20 %	482885575
508	NC_021082	GGTTT	2	10	881693	881702	0 %	60 %	40 %	0 %	482885579
509	NC_021082	GGTTT	2	10	882676	882685	0 %	60 %	40 %	0 %	482885580
510	NC_021082	CTTTA	2	10	882940	882949	20 %	60 %	0 %	20 %	482885580
511	NC_021082	GCTTG	2	10	883058	883067	0 %	40 %	40 %	20 %	482885580
512	NC_021082	GTAGT	2	10	883836	883845	20 %	40 %	40 %	0 %	482885581
513	NC_021082	GGAAT	2	10	884486	884495	40 %	20 %	40 %	0 %	482885581
514	NC_021082	TGATG	2	10	886099	886108	20 %	40 %	40 %	0 %	482885582
515	NC_021082	GGTGG	2	10	887349	887358	0 %	20 %	80 %	0 %	482885584
516	NC_021082	CCAAC	2	10	891187	891196	40 %	0 %	0 %	60 %	482885590
517	NC_021082	AGGCT	2	10	892250	892259	20 %	20 %	40 %	20 %	482885591
518	NC_021082	CGTTT	2	10	895775	895784	0 %	60 %	20 %	20 %	482885591
519	NC_021082	GTATT	2	10	896234	896243	20 %	60 %	20 %	0 %	482885591
520	NC_021082	TCGTT	2	10	897516	897525	0 %	60 %	20 %	20 %	482885592
521	NC_021082	ATTGC	2	10	897961	897970	20 %	40 %	20 %	20 %	482885593
522	NC_021082	TTGGT	2	10	898092	898101	0 %	60 %	40 %	0 %	482885593
523	NC_021082	TGCAT	2	10	898284	898293	20 %	40 %	20 %	20 %	482885593
524	NC_021082	TTTGG	2	10	899038	899047	0 %	60 %	40 %	0 %	482885594
525	NC_021082	ACGGC	2	10	901547	901556	20 %	0 %	40 %	40 %	482885598
526	NC_021082	TCGGC	2	10	903139	903148	0 %	20 %	40 %	40 %	482885599
527	NC_021082	TAAAT	2	10	904832	904841	60 %	40 %	0 %	0 %	482885600
528	NC_021082	TTGAT	2	10	905705	905714	20 %	60 %	20 %	0 %	482885601
529	NC_021082	CAAAA	2	10	907686	907695	80 %	0 %	0 %	20 %	482885603
530	NC_021082	TAAAT	2	10	908101	908110	60 %	40 %	0 %	0 %	482885603
531	NC_021082	GCAAT	2	10	909488	909497	40 %	20 %	20 %	20 %	482885604
532	NC_021082	ATGAG	2	10	909914	909923	40 %	20 %	40 %	0 %	482885605
533	NC_021082	GCAAA	2	10	910745	910754	60 %	0 %	20 %	20 %	482885605
534	NC_021082	AAGAT	2	10	911287	911296	60 %	20 %	20 %	0 %	482885606
535	NC_021082	ACCTT	2	10	911456	911465	20 %	40 %	0 %	40 %	482885606
536	NC_021082	ATTTT	2	10	914345	914354	20 %	80 %	0 %	0 %	482885609
537	NC_021082	CAAAG	2	10	917551	917560	60 %	0 %	20 %	20 %	482885611
538	NC_021082	ATTAT	2	10	917789	917798	40 %	60 %	0 %	0 %	482885612
539	NC_021082	TGAAA	2	10	918177	918186	60 %	20 %	20 %	0 %	482885612
540	NC_021082	CAACG	2	10	919454	919463	40 %	0 %	20 %	40 %	482885614
541	NC_021082	GCTAT	2	10	919599	919608	20 %	40 %	20 %	20 %	482885615
542	NC_021082	GATAA	2	10	921640	921649	60 %	20 %	20 %	0 %	482885618
543	NC_021082	ATTTG	2	10	922471	922480	20 %	60 %	20 %	0 %	482885618
544	NC_021082	TATTT	2	10	923501	923510	20 %	80 %	0 %	0 %	482885619
545	NC_021082	TGCTT	2	10	924058	924067	0 %	60 %	20 %	20 %	482885620
546	NC_021082	AAAAG	2	10	925459	925468	80 %	0 %	20 %	0 %	482885623
547	NC_021082	GTTTT	2	10	925687	925696	0 %	80 %	20 %	0 %	482885623
548	NC_021082	AGTGA	2	10	927074	927083	40 %	20 %	40 %	0 %	482885624
549	NC_021082	TTTGT	2	10	928736	928745	0 %	80 %	20 %	0 %	482885626
550	NC_021082	GGAAA	2	10	929234	929243	60 %	0 %	40 %	0 %	482885626
551	NC_021082	AAGCG	2	10	933905	933914	40 %	0 %	40 %	20 %	482885630
552	NC_021082	GCAGT	2	10	938818	938827	20 %	20 %	40 %	20 %	482885635
553	NC_021082	CCATT	2	10	943062	943071	20 %	40 %	0 %	40 %	482885639
554	NC_021082	TCGAC	2	10	944988	944997	20 %	20 %	20 %	40 %	482885641
555	NC_021082	ATATT	2	10	947774	947783	40 %	60 %	0 %	0 %	482885645
556	NC_021082	CCTTC	2	10	948057	948066	0 %	40 %	0 %	60 %	482885645
557	NC_021082	ATTGC	2	10	948192	948201	20 %	40 %	20 %	20 %	482885645
558	NC_021082	GACCA	2	10	948555	948564	40 %	0 %	20 %	40 %	482885645
559	NC_021082	AAATC	2	10	951633	951642	60 %	20 %	0 %	20 %	482885647
560	NC_021082	AAGTG	2	10	952162	952171	40 %	20 %	40 %	0 %	482885647
561	NC_021082	CTTTT	2	10	953278	953287	0 %	80 %	0 %	20 %	482885648
562	NC_021082	AAGCG	2	10	955096	955105	40 %	0 %	40 %	20 %	482885649
563	NC_021082	ACGAT	2	10	955321	955330	40 %	20 %	20 %	20 %	482885649
564	NC_021082	CGGCA	2	10	956819	956828	20 %	0 %	40 %	40 %	482885650
565	NC_021082	AAAGG	2	10	957680	957689	60 %	0 %	40 %	0 %	482885651
566	NC_021082	GCCCA	2	10	958136	958145	20 %	0 %	20 %	60 %	482885651
567	NC_021082	GCTTT	2	10	958161	958170	0 %	60 %	20 %	20 %	482885651
568	NC_021082	TTGGA	2	10	959282	959291	20 %	40 %	40 %	0 %	482885652
569	NC_021082	CGGCA	2	10	959652	959661	20 %	0 %	40 %	40 %	482885653
570	NC_021082	CAGAC	2	10	960074	960083	40 %	0 %	20 %	40 %	482885653
571	NC_021082	TAAAT	2	10	960111	960120	60 %	40 %	0 %	0 %	482885653
572	NC_021082	TAAAT	2	10	961398	961407	60 %	40 %	0 %	0 %	482885654
573	NC_021082	ATTTT	2	10	962149	962158	20 %	80 %	0 %	0 %	482885654
574	NC_021082	GCACC	2	10	962723	962732	20 %	0 %	20 %	60 %	482885655
575	NC_021082	CAGTG	2	10	963219	963228	20 %	20 %	40 %	20 %	482885655
576	NC_021082	TTAAT	2	10	963620	963629	40 %	60 %	0 %	0 %	482885655
577	NC_021082	AAATT	2	10	965166	965175	60 %	40 %	0 %	0 %	482885657
578	NC_021082	ACTTA	2	10	966759	966768	40 %	40 %	0 %	20 %	482885658
579	NC_021082	TTGGT	2	10	967798	967807	0 %	60 %	40 %	0 %	482885659
580	NC_021082	TTGCA	2	10	968724	968733	20 %	40 %	20 %	20 %	482885659
581	NC_021082	GCATT	2	10	972010	972019	20 %	40 %	20 %	20 %	482885663
582	NC_021082	ATTTA	2	10	972590	972599	40 %	60 %	0 %	0 %	482885663
583	NC_021082	ATAGT	2	10	973476	973485	40 %	40 %	20 %	0 %	482885663
584	NC_021082	TCCAA	2	10	973565	973574	40 %	20 %	0 %	40 %	482885663
585	NC_021082	GTAAA	2	10	973868	973877	60 %	20 %	20 %	0 %	482885663
586	NC_021082	TTTTC	2	10	975226	975235	0 %	80 %	0 %	20 %	482885665
587	NC_021082	GCGGT	2	10	976210	976219	0 %	20 %	60 %	20 %	482885667
588	NC_021082	TATGG	2	10	976715	976724	20 %	40 %	40 %	0 %	482885668
589	NC_021082	TGAAG	2	10	978993	979002	40 %	20 %	40 %	0 %	482885671
590	NC_021082	ATTAA	2	10	979707	979716	60 %	40 %	0 %	0 %	482885671
591	NC_021082	AATGA	2	10	981980	981989	60 %	20 %	20 %	0 %	482885674
592	NC_021082	CACTA	2	10	984236	984245	40 %	20 %	0 %	40 %	482885676
593	NC_021082	AAAGC	2	10	985366	985375	60 %	0 %	20 %	20 %	482885677
594	NC_021082	CAAAC	2	10	989977	989986	60 %	0 %	0 %	40 %	482885681
595	NC_021082	CAATG	2	10	990027	990036	40 %	20 %	20 %	20 %	482885681
596	NC_021082	CCACG	2	10	992136	992145	20 %	0 %	20 %	60 %	482885683
597	NC_021082	CGGCA	2	10	992694	992703	20 %	0 %	40 %	40 %	482885684
598	NC_021082	GCCCC	2	10	995530	995539	0 %	0 %	20 %	80 %	482885685
599	NC_021082	AAGGC	2	10	999177	999186	40 %	0 %	40 %	20 %	482885689
600	NC_021082	TCGGT	2	10	999567	999576	0 %	40 %	40 %	20 %	482885690
601	NC_021082	AGCAG	2	10	999888	999897	40 %	0 %	40 %	20 %	482885690
602	NC_021082	CAATC	2	10	1001251	1001260	40 %	20 %	0 %	40 %	482885692
603	NC_021082	TTTTC	2	10	1001440	1001449	0 %	80 %	0 %	20 %	482885692
604	NC_021082	TGGAT	2	10	1008718	1008727	20 %	40 %	40 %	0 %	482885694
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607	NC_021082	GCTGA	2	10	1011296	1011305	20 %	20 %	40 %	20 %	482885698
608	NC_021082	TTTTA	2	10	1011596	1011605	20 %	80 %	0 %	0 %	482885698
609	NC_021082	GCTTT	2	10	1013023	1013032	0 %	60 %	20 %	20 %	482885700
610	NC_021082	AGTAG	2	10	1016032	1016041	40 %	20 %	40 %	0 %	482885704
611	NC_021082	AATTG	2	10	1016310	1016319	40 %	40 %	20 %	0 %	482885704
612	NC_021082	CATTT	2	10	1017483	1017492	20 %	60 %	0 %	20 %	482885705
613	NC_021082	ATTTA	2	10	1019688	1019697	40 %	60 %	0 %	0 %	482885707
614	NC_021082	TTAAT	2	10	1020486	1020495	40 %	60 %	0 %	0 %	482885709
615	NC_021082	AGGTA	2	10	1024660	1024669	40 %	20 %	40 %	0 %	482885712
616	NC_021082	GTACG	2	10	1026289	1026298	20 %	20 %	40 %	20 %	482885713
617	NC_021082	AGAAA	2	10	1028332	1028341	80 %	0 %	20 %	0 %	482885715
618	NC_021082	GTGGA	2	10	1028454	1028463	20 %	20 %	60 %	0 %	482885715
619	NC_021082	ATGAA	2	10	1028825	1028834	60 %	20 %	20 %	0 %	482885716
620	NC_021082	ATTAT	2	10	1029011	1029020	40 %	60 %	0 %	0 %	482885716
621	NC_021082	GATTG	2	10	1029505	1029514	20 %	40 %	40 %	0 %	482885716
622	NC_021082	TCCAA	2	10	1029757	1029766	40 %	20 %	0 %	40 %	482885716
623	NC_021082	ATTAC	2	10	1030396	1030405	40 %	40 %	0 %	20 %	482885716
624	NC_021082	CTACG	2	10	1030972	1030981	20 %	20 %	20 %	40 %	482885717
625	NC_021082	GGTAA	2	10	1031347	1031356	40 %	20 %	40 %	0 %	482885718
626	NC_021082	ATTTT	2	10	1032441	1032450	20 %	80 %	0 %	0 %	482885718
627	NC_021082	GCCAA	2	10	1034560	1034569	40 %	0 %	20 %	40 %	482885719
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997	NC_021082	TTATC	2	10	1615219	1615228	20 %	60 %	0 %	20 %	482886325
998	NC_021082	AACCG	2	10	1618260	1618269	40 %	0 %	20 %	40 %	482886330
999	NC_021082	CAACG	2	10	1618978	1618987	40 %	0 %	20 %	40 %	482886332
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