MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 6641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021081	GGTC	2	8	511	518	0 %	25 %	50 %	25 %	482881634
2	NC_021081	GCAA	2	8	576	583	50 %	0 %	25 %	25 %	482881634
3	NC_021081	TGGT	2	8	1052	1059	0 %	50 %	50 %	0 %	482881636
4	NC_021081	GTGG	2	8	1294	1301	0 %	25 %	75 %	0 %	482881636
5	NC_021081	CCCG	2	8	2115	2122	0 %	0 %	25 %	75 %	482881639
6	NC_021081	GCCC	2	8	2207	2214	0 %	0 %	25 %	75 %	482881639
7	NC_021081	CCCG	2	8	2387	2394	0 %	0 %	25 %	75 %	482881639
8	NC_021081	CTGC	2	8	3404	3411	0 %	25 %	25 %	50 %	482881640
9	NC_021081	GGGC	2	8	3456	3463	0 %	0 %	75 %	25 %	482881640
10	NC_021081	CGGG	2	8	4197	4204	0 %	0 %	75 %	25 %	482881642
11	NC_021081	GTCT	2	8	4744	4751	0 %	50 %	25 %	25 %	482881642
12	NC_021081	AAGA	2	8	4991	4998	75 %	0 %	25 %	0 %	482881643
13	NC_021081	GGGA	2	8	6332	6339	25 %	0 %	75 %	0 %	482881646
14	NC_021081	GATG	2	8	6467	6474	25 %	25 %	50 %	0 %	482881646
15	NC_021081	TGGC	2	8	7148	7155	0 %	25 %	50 %	25 %	482881648
16	NC_021081	GAAG	2	8	7163	7170	50 %	0 %	50 %	0 %	482881648
17	NC_021081	CTTT	2	8	7586	7593	0 %	75 %	0 %	25 %	482881649
18	NC_021081	GGTG	2	8	8104	8111	0 %	25 %	75 %	0 %	482881650
19	NC_021081	GGTT	2	8	8432	8439	0 %	50 %	50 %	0 %	482881651
20	NC_021081	CCTG	2	8	8539	8546	0 %	25 %	25 %	50 %	482881651
21	NC_021081	GGGT	2	8	8862	8869	0 %	25 %	75 %	0 %	482881652
22	NC_021081	TGCT	2	8	8900	8907	0 %	50 %	25 %	25 %	482881652
23	NC_021081	GCCC	2	8	9204	9211	0 %	0 %	25 %	75 %	482881652
24	NC_021081	CCAG	2	8	9264	9271	25 %	0 %	25 %	50 %	482881652
25	NC_021081	GCCA	2	8	9656	9663	25 %	0 %	25 %	50 %	482881652
26	NC_021081	GTGG	2	8	10072	10079	0 %	25 %	75 %	0 %	482881652
27	NC_021081	CCGG	2	8	10272	10279	0 %	0 %	50 %	50 %	482881652
28	NC_021081	CGCC	2	8	10677	10684	0 %	0 %	25 %	75 %	482881652
29	NC_021081	GCGG	2	8	11128	11135	0 %	0 %	75 %	25 %	482881652
30	NC_021081	CGGG	2	8	11229	11236	0 %	0 %	75 %	25 %	482881652
31	NC_021081	AGGC	2	8	11280	11287	25 %	0 %	50 %	25 %	482881652
32	NC_021081	TGAG	2	8	11846	11853	25 %	25 %	50 %	0 %	482881654
33	NC_021081	ACCT	2	8	12227	12234	25 %	25 %	0 %	50 %	482881655
34	NC_021081	TTTG	2	8	12376	12383	0 %	75 %	25 %	0 %	482881655
35	NC_021081	TACC	2	8	12697	12704	25 %	25 %	0 %	50 %	482881655
36	NC_021081	GCTG	2	8	13194	13201	0 %	25 %	50 %	25 %	482881655
37	NC_021081	CCCA	2	8	13428	13435	25 %	0 %	0 %	75 %	482881656
38	NC_021081	GCGG	2	8	13486	13493	0 %	0 %	75 %	25 %	482881656
39	NC_021081	AGCC	2	8	13946	13953	25 %	0 %	25 %	50 %	482881656
40	NC_021081	AAAG	2	8	14402	14409	75 %	0 %	25 %	0 %	482881657
41	NC_021081	CAGC	2	8	14413	14420	25 %	0 %	25 %	50 %	482881657
42	NC_021081	GGCC	2	8	15034	15041	0 %	0 %	50 %	50 %	482881658
43	NC_021081	GGGC	2	8	15394	15401	0 %	0 %	75 %	25 %	482881659
44	NC_021081	GTAC	2	8	15784	15791	25 %	25 %	25 %	25 %	482881659
45	NC_021081	GCCC	2	8	16019	16026	0 %	0 %	25 %	75 %	482881659
46	NC_021081	GCGG	2	8	16059	16066	0 %	0 %	75 %	25 %	482881659
47	NC_021081	GGCT	2	8	16068	16075	0 %	25 %	50 %	25 %	482881659
48	NC_021081	GGTA	2	8	16670	16677	25 %	25 %	50 %	0 %	482881660
49	NC_021081	GCTG	2	8	16982	16989	0 %	25 %	50 %	25 %	482881661
50	NC_021081	GGCC	2	8	17524	17531	0 %	0 %	50 %	50 %	482881662
51	NC_021081	GGGT	2	8	17983	17990	0 %	25 %	75 %	0 %	482881662
52	NC_021081	GGCT	2	8	18238	18245	0 %	25 %	50 %	25 %	482881662
53	NC_021081	CTTC	2	8	18538	18545	0 %	50 %	0 %	50 %	482881662
54	NC_021081	GTGG	2	8	18612	18619	0 %	25 %	75 %	0 %	482881662
55	NC_021081	CTGG	2	8	19100	19107	0 %	25 %	50 %	25 %	482881663
56	NC_021081	GAGC	2	8	19350	19357	25 %	0 %	50 %	25 %	482881663
57	NC_021081	CGAC	2	8	19367	19374	25 %	0 %	25 %	50 %	482881663
58	NC_021081	CGGG	2	8	19650	19657	0 %	0 %	75 %	25 %	482881663
59	NC_021081	TCAC	2	8	19771	19778	25 %	25 %	0 %	50 %	482881663
60	NC_021081	CCTT	2	8	20265	20272	0 %	50 %	0 %	50 %	482881664
61	NC_021081	GACC	2	8	20794	20801	25 %	0 %	25 %	50 %	482881664
62	NC_021081	CTGG	2	8	21248	21255	0 %	25 %	50 %	25 %	482881664
63	NC_021081	TTTG	2	8	22070	22077	0 %	75 %	25 %	0 %	482881665
64	NC_021081	CGGG	2	8	22928	22935	0 %	0 %	75 %	25 %	482881666
65	NC_021081	GGTG	2	8	23172	23179	0 %	25 %	75 %	0 %	482881666
66	NC_021081	GGGT	2	8	23471	23478	0 %	25 %	75 %	0 %	482881666
67	NC_021081	CTTT	2	8	24062	24069	0 %	75 %	0 %	25 %	482881667
68	NC_021081	GGCT	2	8	24767	24774	0 %	25 %	50 %	25 %	482881667
69	NC_021081	GATG	2	8	24906	24913	25 %	25 %	50 %	0 %	482881667
70	NC_021081	GTTT	2	8	25001	25008	0 %	75 %	25 %	0 %	482881667
71	NC_021081	GGGT	2	8	25157	25164	0 %	25 %	75 %	0 %	482881667
72	NC_021081	ATCA	2	8	25376	25383	50 %	25 %	0 %	25 %	482881668
73	NC_021081	TCCA	2	8	26736	26743	25 %	25 %	0 %	50 %	482881670
74	NC_021081	CGTT	2	8	27505	27512	0 %	50 %	25 %	25 %	482881670
75	NC_021081	CAGC	2	8	27965	27972	25 %	0 %	25 %	50 %	482881671
76	NC_021081	CCGG	2	8	28199	28206	0 %	0 %	50 %	50 %	482881671
77	NC_021081	CCCA	2	8	31727	31734	25 %	0 %	0 %	75 %	482881673
78	NC_021081	TGGC	2	8	31901	31908	0 %	25 %	50 %	25 %	482881673
79	NC_021081	CCGC	2	8	32141	32148	0 %	0 %	25 %	75 %	482881673
80	NC_021081	GGCT	2	8	34531	34538	0 %	25 %	50 %	25 %	482881677
81	NC_021081	AAAG	2	8	34884	34891	75 %	0 %	25 %	0 %	482881677
82	NC_021081	GACC	2	8	35439	35446	25 %	0 %	25 %	50 %	482881677
83	NC_021081	AACG	2	8	36258	36265	50 %	0 %	25 %	25 %	482881677
84	NC_021081	CGGG	2	8	36588	36595	0 %	0 %	75 %	25 %	482881678
85	NC_021081	GTGG	2	8	36753	36760	0 %	25 %	75 %	0 %	482881678
86	NC_021081	CGGC	2	8	37176	37183	0 %	0 %	50 %	50 %	482881679
87	NC_021081	CCCA	2	8	38092	38099	25 %	0 %	0 %	75 %	482881680
88	NC_021081	GACC	2	8	38706	38713	25 %	0 %	25 %	50 %	482881680
89	NC_021081	AGCC	2	8	39428	39435	25 %	0 %	25 %	50 %	482881681
90	NC_021081	CGGG	2	8	40404	40411	0 %	0 %	75 %	25 %	482881682
91	NC_021081	GTAG	2	8	40434	40441	25 %	25 %	50 %	0 %	482881682
92	NC_021081	ATGG	2	8	42001	42008	25 %	25 %	50 %	0 %	482881684
93	NC_021081	CTGC	2	8	42712	42719	0 %	25 %	25 %	50 %	482881684
94	NC_021081	CGGG	2	8	43112	43119	0 %	0 %	75 %	25 %	482881684
95	NC_021081	ACGC	2	8	43606	43613	25 %	0 %	25 %	50 %	482881685
96	NC_021081	AACC	2	8	43671	43678	50 %	0 %	0 %	50 %	482881685
97	NC_021081	ACCC	2	8	43884	43891	25 %	0 %	0 %	75 %	482881686
98	NC_021081	GGGC	2	8	44659	44666	0 %	0 %	75 %	25 %	482881688
99	NC_021081	GCCC	2	8	46219	46226	0 %	0 %	25 %	75 %	482881689
100	NC_021081	AGCG	2	8	46632	46639	25 %	0 %	50 %	25 %	482881689
101	NC_021081	GCGG	2	8	49011	49018	0 %	0 %	75 %	25 %	482881691
102	NC_021081	GGCT	2	8	49450	49457	0 %	25 %	50 %	25 %	482881692
103	NC_021081	ACCC	2	8	49789	49796	25 %	0 %	0 %	75 %	482881692
104	NC_021081	GGGC	2	8	49920	49927	0 %	0 %	75 %	25 %	482881692
105	NC_021081	GGGT	2	8	51027	51034	0 %	25 %	75 %	0 %	482881693
106	NC_021081	CTGG	2	8	51125	51132	0 %	25 %	50 %	25 %	482881693
107	NC_021081	GGGC	2	8	51170	51177	0 %	0 %	75 %	25 %	482881693
108	NC_021081	AACC	2	8	51403	51410	50 %	0 %	0 %	50 %	482881693
109	NC_021081	CGGG	2	8	51447	51454	0 %	0 %	75 %	25 %	482881693
110	NC_021081	AAGG	2	8	51709	51716	50 %	0 %	50 %	0 %	482881694
111	NC_021081	CTTA	2	8	52559	52566	25 %	50 %	0 %	25 %	482881696
112	NC_021081	GCTC	2	8	52771	52778	0 %	25 %	25 %	50 %	482881696
113	NC_021081	GACC	2	8	53468	53475	25 %	0 %	25 %	50 %	482881697
114	NC_021081	GGCT	2	8	54009	54016	0 %	25 %	50 %	25 %	482881697
115	NC_021081	CTGG	2	8	54068	54075	0 %	25 %	50 %	25 %	482881697
116	NC_021081	GGGT	2	8	54340	54347	0 %	25 %	75 %	0 %	482881697
117	NC_021081	CCCA	2	8	54450	54457	25 %	0 %	0 %	75 %	482881697
118	NC_021081	AAGG	2	8	54462	54469	50 %	0 %	50 %	0 %	482881697
119	NC_021081	CCAC	2	8	55417	55424	25 %	0 %	0 %	75 %	482881697
120	NC_021081	GCCC	2	8	55767	55774	0 %	0 %	25 %	75 %	482881698
121	NC_021081	GCCC	2	8	56073	56080	0 %	0 %	25 %	75 %	482881698
122	NC_021081	CGGC	2	8	56619	56626	0 %	0 %	50 %	50 %	482881698
123	NC_021081	CAGC	2	8	56649	56656	25 %	0 %	25 %	50 %	482881698
124	NC_021081	CCCA	2	8	57537	57544	25 %	0 %	0 %	75 %	482881699
125	NC_021081	CCCG	2	8	57845	57852	0 %	0 %	25 %	75 %	482881699
126	NC_021081	ACCA	2	8	58575	58582	50 %	0 %	0 %	50 %	482881700
127	NC_021081	GTGC	2	8	60265	60272	0 %	25 %	50 %	25 %	482881701
128	NC_021081	GGCG	2	8	61927	61934	0 %	0 %	75 %	25 %	482881703
129	NC_021081	CGCT	2	8	62120	62127	0 %	25 %	25 %	50 %	482881703
130	NC_021081	AAGC	2	8	63461	63468	50 %	0 %	25 %	25 %	482881705
131	NC_021081	GGCG	2	8	63703	63710	0 %	0 %	75 %	25 %	482881705
132	NC_021081	GGCC	2	8	63718	63725	0 %	0 %	50 %	50 %	482881705
133	NC_021081	CACC	2	8	64063	64070	25 %	0 %	0 %	75 %	482881705
134	NC_021081	GGTG	2	8	65799	65806	0 %	25 %	75 %	0 %	482881707
135	NC_021081	GGCC	2	8	65869	65876	0 %	0 %	50 %	50 %	482881707
136	NC_021081	CCAG	2	8	65975	65982	25 %	0 %	25 %	50 %	482881707
137	NC_021081	TGAA	2	8	66133	66140	50 %	25 %	25 %	0 %	482881707
138	NC_021081	AGCC	2	8	66286	66293	25 %	0 %	25 %	50 %	482881707
139	NC_021081	CGCC	2	8	66294	66301	0 %	0 %	25 %	75 %	482881707
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