MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. Gladysdale MU clone SC5

Total Repeats: 921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021025	AACAGC	2	12	841	852	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479184589
2	NC_021025	TTTAAA	2	12	2004	2015	50 %	50 %	0 %	0 %	479183818
3	NC_021025	AACTAA	2	12	2552	2563	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479183818
4	NC_021025	ATTTAA	2	12	3259	3270	50 %	50 %	0 %	0 %	479183934
5	NC_021025	AGAAAA	2	12	5147	5158	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479184798
6	NC_021025	CTTTAT	2	12	5897	5908	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479183841
7	NC_021025	GTTGAA	2	12	5911	5922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479183841
8	NC_021025	AAACTA	2	12	6530	6541	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479183841
9	NC_021025	TGATGG	2	12	7824	7835	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	479184653
10	NC_021025	TGAAGA	2	12	8970	8981	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479184653
11	NC_021025	TCCTAA	2	12	10641	10652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479184186
12	NC_021025	GTTCTT	2	12	11185	11196	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479184867
13	NC_021025	CTTGTT	2	12	11611	11622	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479184867
14	NC_021025	CATTAA	2	12	12124	12135	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479184867
15	NC_021025	CTTTTT	2	12	13763	13774	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479183852
16	NC_021025	ATACCA	2	12	14881	14892	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479183852
17	NC_021025	TTTTCT	2	12	17221	17232	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479184192
18	NC_021025	TCTAAT	2	12	18935	18946	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479184098
19	NC_021025	TTTACT	2	12	19403	19414	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479184098
20	NC_021025	AAAATA	2	12	19449	19460	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	479184098
21	NC_021025	TCTTTA	2	12	22803	22814	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479184583
22	NC_021025	TTTTAG	2	12	23266	23277	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479184139
23	NC_021025	CAATAT	2	12	24426	24437	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479184752
24	NC_021025	ACCAGG	2	12	27302	27313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479184414
25	NC_021025	TTTGAA	2	12	27367	27378	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479184414
26	NC_021025	ACTATT	2	12	28599	28610	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479183795
27	NC_021025	AGTTGT	2	12	29571	29582	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479184466
28	NC_021025	AAAACC	2	12	31575	31586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479184449
29	NC_021025	TTAACT	2	12	32598	32609	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479184319
30	NC_021025	AAAACA	2	12	32958	32969	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	479184319
31	NC_021025	TCCAGA	2	12	33023	33034	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479184319
32	NC_021025	GTTTTT	2	12	33247	33258	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	479184319
33	NC_021025	TAGTTT	2	12	33358	33369	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479184319
34	NC_021025	TTTCAT	2	12	34753	34764	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479184172
35	NC_021025	TAGTTT	2	12	35221	35232	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479184172
36	NC_021025	CAATTC	2	12	35293	35304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479184172
37	NC_021025	TTTCAT	2	12	36535	36546	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479184172
38	NC_021025	GATTTT	2	12	38371	38382	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479184379
39	NC_021025	TCAAAT	2	12	39061	39072	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479184379
40	NC_021025	CAGCAA	2	12	39650	39661	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479184379
41	NC_021025	GAAAAA	2	12	42356	42367	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479184379
42	NC_021025	GTTGAT	2	12	42829	42840	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479184379
43	NC_021025	ATATTT	2	12	42959	42970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479184379
44	NC_021025	AGCTGG	2	12	44486	44497	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479184048
45	NC_021025	GGATAT	2	12	47823	47834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479184460
46	NC_021025	TCTTGT	2	12	49576	49587	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479184042
47	NC_021025	TTTTTC	2	12	49593	49604	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479184042
48	NC_021025	TAAAAT	2	12	51060	51071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479184042
49	NC_021025	CAAAAC	2	12	51412	51423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479184042
50	NC_021025	TGTAAT	2	12	53335	53346	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479183896
51	NC_021025	TATTAA	2	12	53693	53704	50 %	50 %	0 %	0 %	479183896
52	NC_021025	TTAATC	2	12	54745	54756	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479183894
53	NC_021025	TGATTT	2	12	58955	58966	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479183969
54	NC_021025	TTTTTC	2	12	61379	61390	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479184662
55	NC_021025	TGTTAT	2	12	61636	61647	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479184662
56	NC_021025	AAAATC	2	12	63808	63819	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479184500
57	NC_021025	TGATTT	2	12	64199	64210	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479184500
58	NC_021025	ATTTTG	2	12	64219	64230	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479184500
59	NC_021025	ATTGTT	2	12	64243	64254	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479184500
60	NC_021025	TCTTTA	2	12	67583	67594	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479184387
61	NC_021025	TTTTAG	2	12	68046	68057	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479183903
62	NC_021025	GGATAT	2	12	69637	69648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479184695
63	NC_021025	TCACAA	2	12	72323	72334	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479184759
64	NC_021025	ATTAAA	2	12	72397	72408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479184759
65	NC_021025	GATATT	2	12	73103	73114	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479184227
66	NC_021025	GTTAAA	2	12	73454	73465	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479184619
67	NC_021025	ATTGCT	2	12	73571	73582	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479184619
68	NC_021025	ATTCTT	2	12	75506	75517	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479184375
69	NC_021025	CTAGAA	2	12	77863	77874	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479184701
70	NC_021025	TTAAAT	2	12	78491	78502	50 %	50 %	0 %	0 %	479184719
71	NC_021025	ATATCC	2	12	81484	81495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479184081
72	NC_021025	ACATCT	2	12	82361	82372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479184482
73	NC_021025	GGATAT	2	12	88797	88808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479184010
74	NC_021025	ATTTAA	2	12	91627	91638	50 %	50 %	0 %	0 %	479184077
75	NC_021025	ATTAAT	2	12	92202	92213	50 %	50 %	0 %	0 %	479184077
76	NC_021025	ATGTTA	2	12	92227	92238	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479184077
77	NC_021025	TGGTAA	2	12	92393	92404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479184077
78	NC_021025	TTTGAG	2	12	93925	93936	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479183927
79	NC_021025	AGCTAA	2	12	94064	94075	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479183927
80	NC_021025	CAAAAA	2	12	94105	94116	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	479183927
81	NC_021025	TGAAAA	2	12	95306	95317	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479183927
82	NC_021025	ATCAAT	2	12	98381	98392	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479184673
83	NC_021025	GTTTTT	2	12	99210	99221	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	479184673
84	NC_021025	TTTAGT	2	12	99422	99433	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479184673
85	NC_021025	AGTTAA	2	12	101000	101011	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479184527
86	NC_021025	CTTTTT	2	12	106645	106656	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479183948
87	NC_021025	CAATAT	2	12	106815	106826	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479183948
88	NC_021025	TTTTGA	2	12	110370	110381	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479184734
89	NC_021025	AGAGGA	2	12	112785	112796	50 %	0 %	50 %	0 %	479184236
90	NC_021025	TTTTAG	2	12	114224	114235	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479183821
91	NC_021025	CTAATA	2	12	114376	114387	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479183821
92	NC_021025	GTTAAA	2	12	114847	114858	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479184428
93	NC_021025	GGATAT	2	12	115317	115328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479184345
94	NC_021025	ATATCC	2	12	119119	119130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479184435
95	NC_021025	TTTTAT	2	12	119992	120003	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	479184058
96	NC_021025	ATATTT	2	12	121604	121615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479184205
97	NC_021025	ATTTTT	2	12	122239	122250	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	479184723
98	NC_021025	GTTGAT	2	12	122665	122676	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479184723
99	NC_021025	CATAAC	2	12	123105	123116	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479183820
100	NC_021025	ATTAGT	2	12	123676	123687	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479183820
101	NC_021025	ATTTTT	2	12	125018	125029	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	479184716
102	NC_021025	AACATC	2	12	125393	125404	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479184716
103	NC_021025	TAAAAA	2	12	127288	127299	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	479184246
104	NC_021025	ATATCC	2	12	130217	130228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479184082
105	NC_021025	TAAAAA	2	12	133767	133778	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	479183924
106	NC_021025	TAAAAA	2	12	138358	138369	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	479184105
107	NC_021025	AAAAGA	2	12	146334	146345	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479184534
108	NC_021025	ATATTG	2	12	146852	146863	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479184534
109	NC_021025	TAATAT	2	12	147649	147660	50 %	50 %	0 %	0 %	479184066
110	NC_021025	TTGGAA	2	12	148509	148520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479184066
111	NC_021025	TTTTAA	2	12	151511	151522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479184507
112	NC_021025	AAAAGT	2	12	151806	151817	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479184507
113	NC_021025	AACTTT	2	12	152118	152129	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479184507
114	NC_021025	ATATCC	2	12	155678	155689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479184293
115	NC_021025	AAGTGA	2	12	157011	157022	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479184471
116	NC_021025	GAATGT	2	12	158531	158542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479184391
117	NC_021025	CTAAAA	2	12	160765	160776	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479184715
118	NC_021025	AGATAA	2	12	161226	161237	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479184645
119	NC_021025	AAAAAC	2	12	163045	163056	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	479184162
120	NC_021025	TAGGAT	2	12	163677	163688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479184162
121	NC_021025	AGATAA	2	12	164026	164037	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479184162
122	NC_021025	TTTATT	2	12	164120	164131	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	479184162
123	NC_021025	TGCTAT	2	12	164320	164331	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479184162
124	NC_021025	AGACAT	2	12	169419	169430	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479184846
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234	NC_021025	TTAAAT	2	12	320545	320556	50 %	50 %	0 %	0 %	479184514
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236	NC_021025	TAATGA	2	12	322862	322873	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479183914
237	NC_021025	AGTATA	2	12	323307	323318	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479183914
238	NC_021025	ATGATA	2	12	324940	324951	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479183848
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