MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 43083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020834	T	6	6	233511	233516	0 %	100 %	0 %	0 %	472335484
4002	NC_020834	TCA	2	6	233566	233571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335484
4003	NC_020834	ATA	2	6	233596	233601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335484
4004	NC_020834	AT	3	6	233608	233613	50 %	50 %	0 %	0 %	472335484
4005	NC_020834	AAC	2	6	233677	233682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335484
4006	NC_020834	GCAG	2	8	233762	233769	25 %	0 %	50 %	25 %	472335484
4007	NC_020834	CGG	2	6	233786	233791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335484
4008	NC_020834	TAC	2	6	233891	233896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335484
4009	NC_020834	TGCA	2	8	233934	233941	25 %	25 %	25 %	25 %	472335484
4010	NC_020834	TGA	2	6	233957	233962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335484
4011	NC_020834	AAG	2	6	233998	234003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335484
4012	NC_020834	CACG	2	8	234035	234042	25 %	0 %	25 %	50 %	472335484
4013	NC_020834	TTA	2	6	234082	234087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335484
4014	NC_020834	TCAC	2	8	234124	234131	25 %	25 %	0 %	50 %	472335484
4015	NC_020834	AC	3	6	234130	234135	50 %	0 %	0 %	50 %	472335484
4016	NC_020834	TCGT	2	8	234175	234182	0 %	50 %	25 %	25 %	472335484
4017	NC_020834	GTT	2	6	234341	234346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335485
4018	NC_020834	T	7	7	234345	234351	0 %	100 %	0 %	0 %	472335485
4019	NC_020834	TTG	2	6	234402	234407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335486
4020	NC_020834	CGCT	2	8	234412	234419	0 %	25 %	25 %	50 %	472335486
4021	NC_020834	CT	3	6	234418	234423	0 %	50 %	0 %	50 %	472335486
4022	NC_020834	CCA	2	6	234447	234452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335486
4023	NC_020834	T	6	6	234519	234524	0 %	100 %	0 %	0 %	472335486
4024	NC_020834	CAT	2	6	234527	234532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335486
4025	NC_020834	GGC	2	6	234537	234542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335486
4026	NC_020834	GTTA	2	8	234558	234565	25 %	50 %	25 %	0 %	472335486
4027	NC_020834	AATC	2	8	234608	234615	50 %	25 %	0 %	25 %	472335486
4028	NC_020834	CCG	2	6	234625	234630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335486
4029	NC_020834	GCGGAA	2	12	234654	234665	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	472335486
4030	NC_020834	GTT	2	6	234705	234710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335486
4031	NC_020834	CAC	2	6	234741	234746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335486
4032	NC_020834	T	7	7	234752	234758	0 %	100 %	0 %	0 %	472335486
4033	NC_020834	GT	3	6	234787	234792	0 %	50 %	50 %	0 %	472335486
4034	NC_020834	TAAG	2	8	234798	234805	50 %	25 %	25 %	0 %	472335486
4035	NC_020834	GGGC	2	8	234841	234848	0 %	0 %	75 %	25 %	472335486
4036	NC_020834	CACT	2	8	234869	234876	25 %	25 %	0 %	50 %	472335486
4037	NC_020834	GGT	2	6	234908	234913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335486
4038	NC_020834	CGG	3	9	234968	234976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335486
4039	NC_020834	CAA	2	6	234977	234982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335486
4040	NC_020834	TTCA	2	8	235005	235012	25 %	50 %	0 %	25 %	472335486
4041	NC_020834	TTGGGT	2	12	235026	235037	0 %	50 %	50 %	0 %	472335486
4042	NC_020834	GC	3	6	235135	235140	0 %	0 %	50 %	50 %	472335486
4043	NC_020834	TCA	2	6	235153	235158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335486
4044	NC_020834	TGGCT	2	10	235220	235229	0 %	40 %	40 %	20 %	472335486
4045	NC_020834	GAA	2	6	235351	235356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335486
4046	NC_020834	CTT	2	6	235403	235408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335486
4047	NC_020834	AAC	2	6	235430	235435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335486
4048	NC_020834	ACC	2	6	235477	235482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335486
4049	NC_020834	T	6	6	235596	235601	0 %	100 %	0 %	0 %	472335486
4050	NC_020834	GCTT	2	8	235624	235631	0 %	50 %	25 %	25 %	472335486
4051	NC_020834	ATC	2	6	235633	235638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335486
4052	NC_020834	TGT	2	6	235641	235646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335486
4053	NC_020834	CGG	2	6	235647	235652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335486
4054	NC_020834	CAG	2	6	235757	235762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335486
4055	NC_020834	GGTC	2	8	235763	235770	0 %	25 %	50 %	25 %	472335486
4056	NC_020834	GTT	2	6	235886	235891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335486
4057	NC_020834	TTG	2	6	235896	235901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335486
4058	NC_020834	TAA	2	6	235944	235949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335486
4059	NC_020834	AAG	2	6	235950	235955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335486
4060	NC_020834	GTTGCC	2	12	235972	235983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335486
4061	NC_020834	GCC	2	6	236002	236007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335486
4062	NC_020834	CCGA	2	8	236014	236021	25 %	0 %	25 %	50 %	472335486
4063	NC_020834	AAT	2	6	236034	236039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335486
4064	NC_020834	ACC	2	6	236121	236126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335486
4065	NC_020834	AGT	2	6	236277	236282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335486
4066	NC_020834	CGGT	2	8	236322	236329	0 %	25 %	50 %	25 %	472335487
4067	NC_020834	ATTT	2	8	236356	236363	25 %	75 %	0 %	0 %	472335487
4068	NC_020834	A	7	7	236387	236393	100 %	0 %	0 %	0 %	472335487
4069	NC_020834	ATC	2	6	236569	236574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335488
4070	NC_020834	CAA	2	6	236631	236636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335488
4071	NC_020834	CGG	2	6	236681	236686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335488
4072	NC_020834	TACGG	2	10	236706	236715	20 %	20 %	40 %	20 %	472335488
4073	NC_020834	TTC	2	6	236732	236737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335488
4074	NC_020834	TAAAGA	2	12	236867	236878	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	472335488
4075	NC_020834	GCAC	2	8	236986	236993	25 %	0 %	25 %	50 %	472335488
4076	NC_020834	TA	3	6	237132	237137	50 %	50 %	0 %	0 %	472335488
4077	NC_020834	AAG	2	6	237166	237171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335488
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4079	NC_020834	GCGT	2	8	237370	237377	0 %	25 %	50 %	25 %	472335488
4080	NC_020834	TGCG	2	8	237482	237489	0 %	25 %	50 %	25 %	472335488
4081	NC_020834	ATT	2	6	237553	237558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335488
4082	NC_020834	AG	3	6	237569	237574	50 %	0 %	50 %	0 %	472335488
4083	NC_020834	CAC	2	6	237623	237628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335488
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4085	NC_020834	TGG	2	6	237685	237690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335488
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4087	NC_020834	GCCC	2	8	237873	237880	0 %	0 %	25 %	75 %	472335488
4088	NC_020834	CCCG	2	8	237898	237905	0 %	0 %	25 %	75 %	472335488
4089	NC_020834	CAT	2	6	237943	237948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335488
4090	NC_020834	TCA	2	6	237964	237969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335488
4091	NC_020834	ACC	2	6	237985	237990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335488
4092	NC_020834	ATG	2	6	237994	237999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335488
4093	NC_020834	TTG	2	6	238077	238082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335488
4094	NC_020834	ATT	2	6	238086	238091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335488
4095	NC_020834	CTGC	2	8	238092	238099	0 %	25 %	25 %	50 %	472335488
4096	NC_020834	TGG	2	6	238173	238178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335488
4097	NC_020834	CCA	2	6	238222	238227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335488
4098	NC_020834	ATTTTA	2	12	238257	238268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335488
4099	NC_020834	GAC	2	6	238401	238406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335488
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4101	NC_020834	ATTGAT	2	12	238923	238934	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	472335489
4102	NC_020834	TAA	2	6	238949	238954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335489
4103	NC_020834	A	6	6	238992	238997	100 %	0 %	0 %	0 %	472335489
4104	NC_020834	CAT	2	6	239013	239018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335489
4105	NC_020834	CAG	2	6	239089	239094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335489
4106	NC_020834	ACC	2	6	239142	239147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335489
4107	NC_020834	CTGA	2	8	239238	239245	25 %	25 %	25 %	25 %	472335489
4108	NC_020834	TAC	2	6	239280	239285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335489
4109	NC_020834	TGGC	2	8	239444	239451	0 %	25 %	50 %	25 %	472335489
4110	NC_020834	ATT	2	6	239491	239496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335489
4111	NC_020834	ACA	2	6	239497	239502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335489
4112	NC_020834	GAC	2	6	239523	239528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335489
4113	NC_020834	AGA	2	6	239648	239653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335489
4114	NC_020834	TTA	2	6	239784	239789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335489
4115	NC_020834	GCTG	2	8	239800	239807	0 %	25 %	50 %	25 %	472335489
4116	NC_020834	AAAT	2	8	239809	239816	75 %	25 %	0 %	0 %	472335489
4117	NC_020834	GTAT	2	8	240062	240069	25 %	50 %	25 %	0 %	472335489
4118	NC_020834	TAT	2	6	240244	240249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335490
4119	NC_020834	TGA	2	6	240271	240276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335490
4120	NC_020834	TGG	2	6	240305	240310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335490
4121	NC_020834	TTC	2	6	240347	240352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335490
4122	NC_020834	ATT	2	6	240376	240381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335490
4123	NC_020834	AG	3	6	240425	240430	50 %	0 %	50 %	0 %	472335490
4124	NC_020834	TC	3	6	240448	240453	0 %	50 %	0 %	50 %	472335490
4125	NC_020834	ATG	2	6	240497	240502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335490
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4246	NC_020834	CAC	2	6	248089	248094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335501
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4492	NC_020834	CTTT	2	8	262251	262258	0 %	75 %	0 %	25 %	472335515
4493	NC_020834	TAAC	2	8	262278	262285	50 %	25 %	0 %	25 %	472335515
4494	NC_020834	TTG	2	6	262320	262325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335515
4495	NC_020834	A	7	7	262360	262366	100 %	0 %	0 %	0 %	472335515
4496	NC_020834	AAAG	2	8	262395	262402	75 %	0 %	25 %	0 %	472335515
4497	NC_020834	T	6	6	262403	262408	0 %	100 %	0 %	0 %	472335515
4498	NC_020834	TCA	2	6	262459	262464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335515
4499	NC_020834	TA	3	6	262531	262536	50 %	50 %	0 %	0 %	472335515
4500	NC_020834	ACA	2	6	262561	262566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335515

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