MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 43083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_020834	TGGT	2	8	88062	88069	0 %	50 %	50 %	0 %	472335329
1503	NC_020834	T	7	7	88069	88075	0 %	100 %	0 %	0 %	472335329
1504	NC_020834	ATG	2	6	88116	88121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335329
1505	NC_020834	GCA	2	6	88185	88190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335329
1506	NC_020834	GATA	2	8	88207	88214	50 %	25 %	25 %	0 %	472335329
1507	NC_020834	TCA	2	6	88251	88256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335329
1508	NC_020834	ATC	2	6	88260	88265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335329
1509	NC_020834	TTG	2	6	88307	88312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335329
1510	NC_020834	ACC	2	6	88316	88321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335329
1511	NC_020834	TCT	2	6	88398	88403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335329
1512	NC_020834	CCAA	2	8	88650	88657	50 %	0 %	0 %	50 %	472335329
1513	NC_020834	CAC	2	6	88760	88765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335329
1514	NC_020834	TGG	2	6	88775	88780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335329
1515	NC_020834	CATC	2	8	88825	88832	25 %	25 %	0 %	50 %	472335329
1516	NC_020834	TTC	2	6	88910	88915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335329
1517	NC_020834	AAT	2	6	88977	88982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335329
1518	NC_020834	TGT	2	6	89076	89081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335329
1519	NC_020834	ACA	2	6	89092	89097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335329
1520	NC_020834	TTC	2	6	89156	89161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335329
1521	NC_020834	GAA	2	6	89210	89215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335329
1522	NC_020834	TA	3	6	89326	89331	50 %	50 %	0 %	0 %	472335329
1523	NC_020834	AGCA	2	8	89364	89371	50 %	0 %	25 %	25 %	472335329
1524	NC_020834	TCA	2	6	89374	89379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335329
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1526	NC_020834	TTGCT	2	10	89789	89798	0 %	60 %	20 %	20 %	472335330
1527	NC_020834	CACT	2	8	90016	90023	25 %	25 %	0 %	50 %	472335330
1528	NC_020834	CAA	2	6	90062	90067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335330
1529	NC_020834	CTG	2	6	90155	90160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335330
1530	NC_020834	T	6	6	90314	90319	0 %	100 %	0 %	0 %	472335331
1531	NC_020834	ATA	2	6	90321	90326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335331
1532	NC_020834	AAGCG	2	10	90394	90403	40 %	0 %	40 %	20 %	472335331
1533	NC_020834	T	6	6	90440	90445	0 %	100 %	0 %	0 %	472335331
1534	NC_020834	CAT	2	6	90506	90511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335331
1535	NC_020834	TAA	2	6	90566	90571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335331
1536	NC_020834	TGA	2	6	90609	90614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335331
1537	NC_020834	TAA	2	6	90686	90691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335331
1538	NC_020834	TTTA	2	8	90801	90808	25 %	75 %	0 %	0 %	472335332
1539	NC_020834	ACC	2	6	91012	91017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335332
1540	NC_020834	CA	3	6	91021	91026	50 %	0 %	0 %	50 %	472335332
1541	NC_020834	CTT	2	6	91056	91061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335332
1542	NC_020834	CTT	2	6	91077	91082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335332
1543	NC_020834	AT	3	6	91097	91102	50 %	50 %	0 %	0 %	472335332
1544	NC_020834	TGT	2	6	91174	91179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335332
1545	NC_020834	CAG	2	6	91218	91223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335332
1546	NC_020834	CTT	2	6	91236	91241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335332
1547	NC_020834	GTA	2	6	91255	91260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335332
1548	NC_020834	AGA	2	6	91284	91289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335332
1549	NC_020834	GGTT	2	8	91463	91470	0 %	50 %	50 %	0 %	472335332
1550	NC_020834	GGA	2	6	91607	91612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335332
1551	NC_020834	TAA	2	6	91633	91638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335332
1552	NC_020834	TCA	2	6	91680	91685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335332
1553	NC_020834	CGGT	2	8	91706	91713	0 %	25 %	50 %	25 %	472335332
1554	NC_020834	AAG	2	6	91729	91734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335332
1555	NC_020834	AGATG	2	10	91747	91756	40 %	20 %	40 %	0 %	472335332
1556	NC_020834	TTG	2	6	91774	91779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335332
1557	NC_020834	AAT	2	6	91811	91816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335332
1558	NC_020834	GCT	2	6	91947	91952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335332
1559	NC_020834	AAT	2	6	91967	91972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335332
1560	NC_020834	GGT	2	6	91990	91995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335332
1561	NC_020834	CAA	2	6	92007	92012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335332
1562	NC_020834	GTT	3	9	92022	92030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335332
1563	NC_020834	TG	3	6	92129	92134	0 %	50 %	50 %	0 %	472335332
1564	NC_020834	GAT	2	6	92145	92150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335332
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1567	NC_020834	TAT	2	6	92427	92432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335333
1568	NC_020834	TA	3	6	92434	92439	50 %	50 %	0 %	0 %	472335333
1569	NC_020834	CTT	2	6	92476	92481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335333
1570	NC_020834	CA	3	6	92612	92617	50 %	0 %	0 %	50 %	472335333
1571	NC_020834	GTTT	2	8	92722	92729	0 %	75 %	25 %	0 %	472335333
1572	NC_020834	ACC	3	9	92867	92875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335333
1573	NC_020834	AAC	2	6	92920	92925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335333
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1576	NC_020834	TAA	2	6	93134	93139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335333
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1582	NC_020834	CAC	2	6	93398	93403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335333
1583	NC_020834	CTT	2	6	93469	93474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335333
1584	NC_020834	TTC	2	6	93512	93517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335333
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1587	NC_020834	GATA	2	8	93650	93657	50 %	25 %	25 %	0 %	472335333
1588	NC_020834	CTT	2	6	93754	93759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335333
1589	NC_020834	AGC	3	9	93818	93826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335333
1590	NC_020834	TAAA	2	8	93827	93834	75 %	25 %	0 %	0 %	472335333
1591	NC_020834	ACC	2	6	93998	94003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335333
1592	NC_020834	TGG	2	6	94006	94011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335333
1593	NC_020834	CA	3	6	94022	94027	50 %	0 %	0 %	50 %	472335333
1594	NC_020834	AATT	2	8	94067	94074	50 %	50 %	0 %	0 %	472335333
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1597	NC_020834	A	6	6	94339	94344	100 %	0 %	0 %	0 %	472335334
1598	NC_020834	AAT	2	6	94394	94399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335335
1599	NC_020834	AAT	2	6	94423	94428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335335
1600	NC_020834	GTTG	2	8	94450	94457	0 %	50 %	50 %	0 %	472335335
1601	NC_020834	ATAA	2	8	94458	94465	75 %	25 %	0 %	0 %	472335335
1602	NC_020834	TAA	2	6	94532	94537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335335
1603	NC_020834	A	7	7	94536	94542	100 %	0 %	0 %	0 %	472335335
1604	NC_020834	AATT	2	8	94559	94566	50 %	50 %	0 %	0 %	472335335
1605	NC_020834	AAGA	2	8	94630	94637	75 %	0 %	25 %	0 %	472335335
1606	NC_020834	AATA	2	8	94711	94718	75 %	25 %	0 %	0 %	472335335
1607	NC_020834	TG	3	6	94750	94755	0 %	50 %	50 %	0 %	472335335
1608	NC_020834	CTG	2	6	94782	94787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335335
1609	NC_020834	GGT	2	6	94934	94939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335335
1610	NC_020834	TAA	2	6	94997	95002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335335
1611	NC_020834	CGG	2	6	95031	95036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335335
1612	NC_020834	TCA	2	6	95088	95093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335335
1613	NC_020834	TGT	2	6	95097	95102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335335
1614	NC_020834	AT	3	6	95103	95108	50 %	50 %	0 %	0 %	472335335
1615	NC_020834	CTG	2	6	95448	95453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335336
1616	NC_020834	TGC	2	6	95470	95475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335336
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1619	NC_020834	A	6	6	95582	95587	100 %	0 %	0 %	0 %	472335336
1620	NC_020834	TTA	2	6	95618	95623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335336
1621	NC_020834	GGT	3	9	95648	95656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335336
1622	NC_020834	GTC	2	6	95760	95765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335336
1623	NC_020834	GCAG	2	8	95813	95820	25 %	0 %	50 %	25 %	472335336
1624	NC_020834	A	6	6	95890	95895	100 %	0 %	0 %	0 %	472335336
1625	NC_020834	GA	3	6	96019	96024	50 %	0 %	50 %	0 %	472335336
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1997	NC_020834	ATG	2	6	119892	119897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335364
1998	NC_020834	ATT	2	6	119922	119927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335364
1999	NC_020834	GTT	2	6	119930	119935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335364
2000	NC_020834	TTA	2	6	120040	120045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335365

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