MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis 7199-99 complete genome

Total Repeats: 3129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020089	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	479053933
2	NC_020089	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	479053934
3	NC_020089	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	479053934
4	NC_020089	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	479053936
5	NC_020089	GCAGC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	40 %	40 %	479053938
6	NC_020089	CGGTG	2	10	9281	9290	0 %	20 %	60 %	20 %	479053938
7	NC_020089	CAGAC	2	10	9799	9808	40 %	0 %	20 %	40 %	479053938
8	NC_020089	CGCAA	2	10	10323	10332	40 %	0 %	20 %	40 %	479053939
9	NC_020089	CGGCG	2	10	10449	10458	0 %	0 %	60 %	40 %	479053939
10	NC_020089	GGCGT	2	10	14154	14163	0 %	20 %	60 %	20 %	479053944
11	NC_020089	GGGCC	2	10	14437	14446	0 %	0 %	60 %	40 %	479053944
12	NC_020089	GCGTT	2	10	15182	15191	0 %	40 %	40 %	20 %	479053945
13	NC_020089	CCAGC	2	10	15722	15731	20 %	0 %	20 %	60 %	479053946
14	NC_020089	ACCGA	2	10	16485	16494	40 %	0 %	20 %	40 %	479053946
15	NC_020089	ATCGG	2	10	16877	16886	20 %	20 %	40 %	20 %	479053946
16	NC_020089	CGGCC	2	10	17886	17895	0 %	0 %	40 %	60 %	479053947
17	NC_020089	TTAGC	2	10	19037	19046	20 %	40 %	20 %	20 %	479053948
18	NC_020089	GGTCC	2	10	19109	19118	0 %	20 %	40 %	40 %	479053948
19	NC_020089	GTCGT	2	10	21628	21637	0 %	40 %	40 %	20 %	479053949
20	NC_020089	ATCAC	2	10	23901	23910	40 %	20 %	0 %	40 %	479053952
21	NC_020089	GCCGG	2	10	24588	24597	0 %	0 %	60 %	40 %	479053952
22	NC_020089	GGCAA	2	10	29283	29292	40 %	0 %	40 %	20 %	479053957
23	NC_020089	CGATC	2	10	30108	30117	20 %	20 %	20 %	40 %	479053958
24	NC_020089	CGACG	2	10	32291	32300	20 %	0 %	40 %	40 %	479053961
25	NC_020089	GCGTC	2	10	32346	32355	0 %	20 %	40 %	40 %	479053961
26	NC_020089	GACAC	2	10	32443	32452	40 %	0 %	20 %	40 %	479053961
27	NC_020089	TCCTG	2	10	37447	37456	0 %	40 %	20 %	40 %	479053967
28	NC_020089	CTCGG	2	10	37540	37549	0 %	20 %	40 %	40 %	479053967
29	NC_020089	GGCGC	2	10	38083	38092	0 %	0 %	60 %	40 %	479053967
30	NC_020089	TGGCC	2	10	38231	38240	0 %	20 %	40 %	40 %	479053967
31	NC_020089	CGGCG	2	10	38763	38772	0 %	0 %	60 %	40 %	479053967
32	NC_020089	GTCCA	2	10	39375	39384	20 %	20 %	20 %	40 %	479053968
33	NC_020089	GCCAA	2	10	41509	41518	40 %	0 %	20 %	40 %	479053970
34	NC_020089	GCACA	2	10	42308	42317	40 %	0 %	20 %	40 %	479053971
35	NC_020089	GGTAC	2	10	44842	44851	20 %	20 %	40 %	20 %	479053973
36	NC_020089	TCGAA	2	10	45074	45083	40 %	20 %	20 %	20 %	479053973
37	NC_020089	GCACC	2	10	46004	46013	20 %	0 %	20 %	60 %	479053973
38	NC_020089	CGGTG	2	10	47038	47047	0 %	20 %	60 %	20 %	479053974
39	NC_020089	TCATG	2	10	47184	47193	20 %	40 %	20 %	20 %	479053974
40	NC_020089	GCAGC	2	10	48578	48587	20 %	0 %	40 %	40 %	479053976
41	NC_020089	CCCGA	2	10	48661	48670	20 %	0 %	20 %	60 %	479053976
42	NC_020089	CAGCG	2	10	49786	49795	20 %	0 %	40 %	40 %	479053977
43	NC_020089	CTCCC	2	10	56220	56229	0 %	20 %	0 %	80 %	479053983
44	NC_020089	CGGCG	2	10	56669	56678	0 %	0 %	60 %	40 %	479053983
45	NC_020089	CGACC	2	10	58201	58210	20 %	0 %	20 %	60 %	479053985
46	NC_020089	CTTCG	2	10	58888	58897	0 %	40 %	20 %	40 %	479053986
47	NC_020089	CGGTG	2	10	59944	59953	0 %	20 %	60 %	20 %	479053989
48	NC_020089	TCAGG	2	10	62430	62439	20 %	20 %	40 %	20 %	479053990
49	NC_020089	GGCGA	2	10	66393	66402	20 %	0 %	60 %	20 %	479053994
50	NC_020089	GGTGT	2	10	68969	68978	0 %	40 %	60 %	0 %	479053996
51	NC_020089	ATCGG	2	10	69606	69615	20 %	20 %	40 %	20 %	479053996
52	NC_020089	CCGCG	2	10	70143	70152	0 %	0 %	40 %	60 %	479053996
53	NC_020089	GGCAA	2	10	70494	70503	40 %	0 %	40 %	20 %	479053996
54	NC_020089	CGACC	2	10	70783	70792	20 %	0 %	20 %	60 %	479053996
55	NC_020089	CGGGT	2	10	71237	71246	0 %	20 %	60 %	20 %	479053996
56	NC_020089	GGTCG	2	10	71297	71306	0 %	20 %	60 %	20 %	479053996
57	NC_020089	TGCCT	2	10	72038	72047	0 %	40 %	20 %	40 %	479053998
58	NC_020089	GTCCA	2	10	72909	72918	20 %	20 %	20 %	40 %	479053999
59	NC_020089	TGACC	2	10	75533	75542	20 %	20 %	20 %	40 %	479054001
60	NC_020089	GCCAA	2	10	75847	75856	40 %	0 %	20 %	40 %	479054001
61	NC_020089	GTCGC	2	10	75924	75933	0 %	20 %	40 %	40 %	479054001
62	NC_020089	GCGCG	2	10	77014	77023	0 %	0 %	60 %	40 %	479054002
63	NC_020089	CACGA	2	10	79889	79898	40 %	0 %	20 %	40 %	479054004
64	NC_020089	GAGCA	2	10	82427	82436	40 %	0 %	40 %	20 %	479054006
65	NC_020089	GCCGG	2	10	82526	82535	0 %	0 %	60 %	40 %	479054006
66	NC_020089	GCGAC	2	10	82602	82611	20 %	0 %	40 %	40 %	479054006
67	NC_020089	ATCCG	2	10	83372	83381	20 %	20 %	20 %	40 %	479054007
68	NC_020089	CACCG	2	10	84152	84161	20 %	0 %	20 %	60 %	479054008
69	NC_020089	TGGTC	2	10	86287	86296	0 %	40 %	40 %	20 %	479054010
70	NC_020089	GCTGG	2	10	86924	86933	0 %	20 %	60 %	20 %	479054011
71	NC_020089	TGGGT	2	10	89962	89971	0 %	40 %	60 %	0 %	479054016
72	NC_020089	TCGCC	2	10	90169	90178	0 %	20 %	20 %	60 %	479054016
73	NC_020089	GGGCC	2	10	91142	91151	0 %	0 %	60 %	40 %	479054017
74	NC_020089	GGCCG	2	10	92461	92470	0 %	0 %	60 %	40 %	479054018
75	NC_020089	GCGCC	2	10	93113	93122	0 %	0 %	40 %	60 %	479054018
76	NC_020089	GCTTG	2	10	95145	95154	0 %	40 %	40 %	20 %	479054020
77	NC_020089	CGTGT	2	10	95577	95586	0 %	40 %	40 %	20 %	479054021
78	NC_020089	AGATC	2	10	95656	95665	40 %	20 %	20 %	20 %	479054021
79	NC_020089	CGGCG	2	10	99237	99246	0 %	0 %	60 %	40 %	479054024
80	NC_020089	GCGGT	2	10	100313	100322	0 %	20 %	60 %	20 %	479054025
81	NC_020089	GCGCC	2	10	103145	103154	0 %	0 %	40 %	60 %	479054027
82	NC_020089	GGTGG	2	10	103833	103842	0 %	20 %	80 %	0 %	479054028
83	NC_020089	GGCTT	2	10	104846	104855	0 %	40 %	40 %	20 %	479054029
84	NC_020089	CTGGC	2	10	105568	105577	0 %	20 %	40 %	40 %	479054030
85	NC_020089	GCACA	2	10	106689	106698	40 %	0 %	20 %	40 %	479054030
86	NC_020089	CTGAA	2	10	109019	109028	40 %	20 %	20 %	20 %	479054033
87	NC_020089	ATCGC	2	10	109514	109523	20 %	20 %	20 %	40 %	479054033
88	NC_020089	TCTGA	2	10	110848	110857	20 %	40 %	20 %	20 %	479054035
89	NC_020089	CGGTC	2	10	111123	111132	0 %	20 %	40 %	40 %	479054035
90	NC_020089	GACCA	2	10	112261	112270	40 %	0 %	20 %	40 %	479054035
91	NC_020089	GGCTG	2	10	114825	114834	0 %	20 %	60 %	20 %	479054035
92	NC_020089	CCGCG	2	10	118745	118754	0 %	0 %	40 %	60 %	479054036
93	NC_020089	TCGTG	2	10	122698	122707	0 %	40 %	40 %	20 %	479054038
94	NC_020089	CCGGA	2	10	124479	124488	20 %	0 %	40 %	40 %	479054040
95	NC_020089	TGCGC	2	10	126952	126961	0 %	20 %	40 %	40 %	479054041
96	NC_020089	GCGAG	2	10	127463	127472	20 %	0 %	60 %	20 %	479054041
97	NC_020089	GGGGT	2	10	128472	128481	0 %	20 %	80 %	0 %	479054041
98	NC_020089	CCCAC	2	10	129034	129043	20 %	0 %	0 %	80 %	479054041
99	NC_020089	CCGGC	2	10	129544	129553	0 %	0 %	40 %	60 %	479054041
100	NC_020089	TGCGG	2	10	129954	129963	0 %	20 %	60 %	20 %	479054041
101	NC_020089	ATCAC	2	10	131433	131442	40 %	20 %	0 %	40 %	479054043
102	NC_020089	ATCGG	2	10	131481	131490	20 %	20 %	40 %	20 %	479054043
103	NC_020089	CGGGC	2	10	132572	132581	0 %	0 %	60 %	40 %	479054043
104	NC_020089	GCGAT	2	10	134377	134386	20 %	20 %	40 %	20 %	479054045
105	NC_020089	GTTCG	2	10	134598	134607	0 %	40 %	40 %	20 %	479054045
106	NC_020089	CCTGG	2	10	134990	134999	0 %	20 %	40 %	40 %	479054045
107	NC_020089	GGCCC	2	10	135096	135105	0 %	0 %	40 %	60 %	479054045
108	NC_020089	CGTTG	2	10	135608	135617	0 %	40 %	40 %	20 %	479054045
109	NC_020089	CGACC	2	10	135680	135689	20 %	0 %	20 %	60 %	479054045
110	NC_020089	GAGAT	2	10	138700	138709	40 %	20 %	40 %	0 %	479054049
111	NC_020089	CGGCG	2	10	140854	140863	0 %	0 %	60 %	40 %	479054050
112	NC_020089	TGCGG	2	10	141487	141496	0 %	20 %	60 %	20 %	479054051
113	NC_020089	CGCTG	2	10	142194	142203	0 %	20 %	40 %	40 %	479054052
114	NC_020089	GTTGC	2	10	142740	142749	0 %	40 %	40 %	20 %	479054052
115	NC_020089	CCGAT	2	10	143488	143497	20 %	20 %	20 %	40 %	479054052
116	NC_020089	ATCGC	2	10	144179	144188	20 %	20 %	20 %	40 %	479054053
117	NC_020089	AACCG	2	10	144918	144927	40 %	0 %	20 %	40 %	479054053
118	NC_020089	CCGCC	2	10	145505	145514	0 %	0 %	20 %	80 %	479054053
119	NC_020089	CCGCC	2	10	146148	146157	0 %	0 %	20 %	80 %	479054054
120	NC_020089	ATCGG	2	10	149632	149641	20 %	20 %	40 %	20 %	479054058
121	NC_020089	TCGTC	2	10	154770	154779	0 %	40 %	20 %	40 %	479054061
122	NC_020089	CACGC	2	10	155234	155243	20 %	0 %	20 %	60 %	479054061
123	NC_020089	ATTCT	2	10	156078	156087	20 %	60 %	0 %	20 %	479054062
124	NC_020089	AGGCG	2	10	156606	156615	20 %	0 %	60 %	20 %	479054062
125	NC_020089	TGACC	2	10	159610	159619	20 %	20 %	20 %	40 %	479054065
126	NC_020089	CGGCG	2	10	159856	159865	0 %	0 %	60 %	40 %	479054065
127	NC_020089	GCACC	2	10	160026	160035	20 %	0 %	20 %	60 %	479054066
128	NC_020089	CCGCA	2	10	161204	161213	20 %	0 %	20 %	60 %	479054067
129	NC_020089	CGCGG	2	10	161283	161292	0 %	0 %	60 %	40 %	479054067
130	NC_020089	CGGTT	2	10	161610	161619	0 %	40 %	40 %	20 %	479054067
131	NC_020089	GCCGG	2	10	162071	162080	0 %	0 %	60 %	40 %	479054068
132	NC_020089	GCGCG	2	10	162193	162202	0 %	0 %	60 %	40 %	479054068
133	NC_020089	CTGGG	2	10	164407	164416	0 %	20 %	60 %	20 %	479054070
134	NC_020089	GCCGG	2	10	165000	165009	0 %	0 %	60 %	40 %	479054071
135	NC_020089	GTTGG	2	10	166969	166978	0 %	40 %	60 %	0 %	479054073
136	NC_020089	GCGTG	2	10	168135	168144	0 %	20 %	60 %	20 %	479054076
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138	NC_020089	CCGCC	2	10	170059	170068	0 %	0 %	20 %	80 %	479054077
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142	NC_020089	CCCGA	2	10	174901	174910	20 %	0 %	20 %	60 %	479054081
143	NC_020089	TGGTC	2	10	175558	175567	0 %	40 %	40 %	20 %	479054082
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148	NC_020089	GCCGA	2	10	179344	179353	20 %	0 %	40 %	40 %	479054085
149	NC_020089	TTCAT	2	10	180520	180529	20 %	60 %	0 %	20 %	479054086
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169	NC_020089	GTGCG	2	10	217237	217246	0 %	20 %	60 %	20 %	479054121
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173	NC_020089	GAATC	2	10	220687	220696	40 %	20 %	20 %	20 %	479054125
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175	NC_020089	GCGTC	2	10	222143	222152	0 %	20 %	40 %	40 %	479054126
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177	NC_020089	GCCGC	2	10	222756	222765	0 %	0 %	40 %	60 %	479054127
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242	NC_020089	AGCGC	2	10	330351	330360	20 %	0 %	40 %	40 %	479054210
243	NC_020089	GGGAC	2	10	331256	331265	20 %	0 %	60 %	20 %	479054212
244	NC_020089	CCGGC	2	10	332117	332126	0 %	0 %	40 %	60 %	479054213
245	NC_020089	AGTTC	2	10	333392	333401	20 %	40 %	20 %	20 %	479054215
246	NC_020089	CCCAC	2	10	335672	335681	20 %	0 %	0 %	80 %	479054216
247	NC_020089	CTCGA	2	10	336395	336404	20 %	20 %	20 %	40 %	479054216
248	NC_020089	AGCCC	2	10	341126	341135	20 %	0 %	20 %	60 %	479054218
249	NC_020089	CTCGA	2	10	342247	342256	20 %	20 %	20 %	40 %	479054218
250	NC_020089	CGCGG	2	10	343929	343938	0 %	0 %	60 %	40 %	479054219
251	NC_020089	TGCCG	2	10	344374	344383	0 %	20 %	40 %	40 %	479054220
252	NC_020089	CCGGA	2	10	345083	345092	20 %	0 %	40 %	40 %	479054220
253	NC_020089	GCGCC	2	10	345880	345889	0 %	0 %	40 %	60 %	479054221
254	NC_020089	GCCCG	2	10	348777	348786	0 %	0 %	40 %	60 %	479054222
255	NC_020089	GCCCG	2	10	349708	349717	0 %	0 %	40 %	60 %	479054223
256	NC_020089	CGGTT	2	10	352051	352060	0 %	40 %	40 %	20 %	479054223
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258	NC_020089	GTGGC	2	10	353404	353413	0 %	20 %	60 %	20 %	479054225
259	NC_020089	GGGCT	2	10	354028	354037	0 %	20 %	60 %	20 %	479054225
260	NC_020089	ACACC	2	10	359015	359024	40 %	0 %	0 %	60 %	479054230
261	NC_020089	TGACG	2	10	361077	361086	20 %	20 %	40 %	20 %	479054232
262	NC_020089	CGCGC	2	10	366437	366446	0 %	0 %	40 %	60 %	479054238
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